Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000468535
- Subject:
- XM_006539204.3
- Aligned Length:
- 3751
- Identities:
- 2759
- Gaps:
- 593
Alignment
Query 1 ATGGCTTCCTCCAACCCTCCTCCACAGCCTGCCATAGGAGATCAGCTGGTTCCAGGAGTCCCAGGCCCCTCCTC 74
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 75 TGAGGCAGAGGACGACCCAGGAGAGGCGTTTGAGTTTGATGACAGTGATGATGAAGAGGACACCAGCGCAGCCC 148
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 149 TGGGCGTCCCCAGCCTTGCTCCTGAGAGGGACACAGACCCCCCACTGATCCACTTGGACTCCATCCCTGTCACT 222
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 223 GACCCAGACCCAGCAGCTGCTCCACCCGGCACAGGGGTGCCAGCCTGGGTGAGCAATGGGGATGCAGCGGACGC 296
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 297 AGCCTTCTCCGGGGCCCGGCACTCCAGCTGGAAGCGGAAGAGTTCCCGTCGCATTGACCGGTTCACTTTCCCCG 370
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 371 CCCTGGAAGAGGATGTGATTTATGACGACGTCCCCTGCGAGAGCCCAGATGCGCATCAGCCCGGGGCAGAGAGG 444
||||.| |||||..||.||| ||||.| |||||
Sbjct 1 ------------ATGTTA-------------------------CCCAGCAGCTCAT------GGGGGA-AGAGG 30
Query 445 AA-CCTGCTCTAC-GAGGATGCGCACCGGGCTGGG-GCCCCTCGGCAGGCGGAGGACCTAGGCTGGAGCTCCAG 515
|| || || |||...||| ||.|||.|||| || ||| |
Sbjct 31 AAGCC------ACGGAGTCAGCG-ACTGGGGTGGGTGC-----------------------GCT---------G 65
Query 516 TGA-GTTCGAGAGCTACA-GCGAGGACTCGGGGGAGGAGGCCAAGCCGGAGGTCGAGGTC-GAGCCCGCCAAGC 586
||| |..|||| ||.|.| |.| |||||.||.|||| |||| ..|||.|||| |
Sbjct 66 TGATGCCCGAG-GCAATATGTG----------------GGCCAGGCAGGAG-----GGTCTTCGCCAGCCA--C 115
Query 587 ACCGAGTGTCCTTCCAGCCCAAGATGACCCAGCTCATGAAGGCCGCCAAGAGCGGGACCAAGGATGGGCTGGAG 660
|| ||| ||.||| .||| .|||||| ||||
Sbjct 116 AC-------CCT--CACCCC--CATG----CGCTCAT-----CCGC---------------------------- 141
Query 661 AAGACACGGATGGCCGTGATGCGCAAAGTCTCCT--------TCCTGCACAGGAAGGACGTCCTCGGTGACTCG 726
||.||||..|.|.| ||||| ||||||.|| ||||||||.
Sbjct 142 ----------TGTCCGTCCTCCTC-----CTCCTCCTCTGTGTCCTGCTCA--------------GGTGACTCA 186
Query 727 GAGGAGGAGGACATGGGGCTCCTGGAGGTCAGCGTTTCGGACATCAAGCCCCCAGCCCCAGAGCTGGGCCCCAT 800
||.||.||.||.|||||||||||||||||..|.||..|.||||||||.||.||.||.|||||||||||||||||
Sbjct 187 GAAGAAGAAGATATGGGGCTCCTGGAGGTTGGTGTGACAGACATCAAACCTCCCGCGCCAGAGCTGGGCCCCAT 260
Query 801 GCCAGAGGGCCTGAGCCCTCAGCAGGTGGTCCGGAGGCATATCCTGGGCTCCATCGTGCAGAGCGAAGGCAGCT 874
|||.||.|||.||||.||||||||||||||||||||.||.|||||.||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 261 GCCGGATGGCTTGAGTCCTCAGCAGGTGGTCCGGAGACACATCCTAGGCTCCATCGTGCAGAGCGAAGGCAGCT 334
Query 875 ACGTGGAGTCTCTGAAGCGGATACTCCAGGACTACCGCAACCCCCTGATGGAGATGGAGCCCAAGGCGCTGAGC 948
||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||.|||||.||.|||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 335 ACGTGGAGTCACTGAAGCGGATACTCCAGGATTACCGTAACCCACTAATGGAGATGGAGCCCAAGGCGCTGAGC 408
Query 949 GCCCGCAAGTGCCAGGTGGTGTTCTTCCGCGTGAAGGAGATCCTGCACTGCCACTCCATGTTCCAGATCGCCCT 1022
|||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||.||.||.||||||||||||||||||||.||
Sbjct 409 GCCCGCAAGTGTCAGGTGGTGTTCTTCCGCGTGAAGGAGATTCTACATTGTCACTCCATGTTCCAGATCGCTCT 482
Query 1023 GTCCTCCCGCGTGGCTGAGTGGGATTCCACCGAGAAGATCGGGGACCTCTTCGTGGCCTCGTTTTCCAAGTCCA 1096
|||||||||||||||.||||||||.|||||.||||||||.||.||||||||.|||||.||.||.||||||||||
Sbjct 483 GTCCTCCCGCGTGGCCGAGTGGGACTCCACAGAGAAGATTGGAGACCTCTTTGTGGCTTCATTCTCCAAGTCCA 556
Query 1097 TGGTGCTAGATGTGTACAGTGACTACGTGAACAACTTCACCAGTGCCATGTCCATCATCAAGAAGGCCTGCCTC 1170
||||.||||||||.|||||.|||||.||||||||||||||||..||||||||||||||||||||||||||.|||
Sbjct 557 TGGTCCTAGATGTATACAGCGACTATGTGAACAACTTCACCAACGCCATGTCCATCATCAAGAAGGCCTGTCTC 630
Query 1171 ACCAAGCCTGCCTTCCTCGAGTTCCTCAAGCGACGGCAGGTGTGCAGCCCAGACCGTGTCACCCTCTACGGGCT 1244
||||||||.||.|||||.|||||.||||||||.||||||||||||||..|.|||||.|||||||||||.|||.|
Sbjct 631 ACCAAGCCAGCGTTCCTTGAGTTTCTCAAGCGGCGGCAGGTGTGCAGTACGGACCGAGTCACCCTCTATGGGTT 704
Query 1245 GATGGTCAAGCCCATCCAGAGGTTCCCACAGTTCATACTCCTGCTTCAGGACATGCTGAAGAACACCCCCAGGG 1318
||||||.||.||..|.|||||.||.|||||||||||.|||||.||.||||||||||||||||||||.|||.|||
Sbjct 705 GATGGTGAAACCTGTTCAGAGATTTCCACAGTTCATCCTCCTACTCCAGGACATGCTGAAGAACACTCCCCGGG 778
Query 1319 GCCATCCGGACAGGCTGTCGCTGCAGCTGGCCCTCACAGAGCTGGAGACGCTGGCTGAGAAGCTGAACGAGCAG 1392
||||.||.||||||.|||||||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 779 GCCACCCTGACAGGTTGTCGCTGCAGCTAGCCCTCACGGAGCTGGAGACGCTGGCTGAGAAGCTGAACGAGCAG 852
Query 1393 AAGCGGCTGGCTGACCAGGTGGCTGAGATCCAGCAGCTGACCAAGAGCGTCAGTGACCGCAGCAGCCTCAACAA 1466
||||||.||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 853 AAGCGGTTGGCCGACCAGGTGGCTGAGATCCAGCAGCTGACCAAGAGTGTCAGTGACCGCAGCAGCCTCAACAA 926
Query 1467 GCTGTTGACCTCAGGCCAGCGGCAGCTGCTCCTGTGTGAGACGTTGACGGAGACCGTGTACGGTGACCGCGGGC 1540
||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||..||||.|||||.|||||.||.|||||.||||
Sbjct 927 GCTGTTGACCTCTGGCCAGCGGCAGCTGCTTCTGTGTGAGACACTGACTGAGACGGTGTATGGAGACCGAGGGC 1000
Query 1541 AGCTAATTAAGTCCAAGGAGCGTCGGGTCTTCCTGCTCAACGACATGCTTGTCTGTGCCAACATCAACTTCAAG 1614
||||.||.||||||||||||||..||||||||||||||||.||||||||.|||||.||||||||||||||||||
Sbjct 1001 AGCTGATCAAGTCCAAGGAGCGCAGGGTCTTCCTGCTCAATGACATGCTGGTCTGCGCCAACATCAACTTCAAG 1074
Query 1615 CCTGCCAACCACAGGGGCCAGCTGGAGATCAGCAGCCTGGTGCCCCTGGGGCCCAAGTATGTGGTGAAGTGGAA 1688
||..|||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||.||||||||||||||.||||||||||||||
Sbjct 1075 CCCTCCAACCACAGGGGCCAGCTAGAGATCAGCAGCCTGGTACCTCTGGGGCCCAAGTACGTGGTGAAGTGGAA 1148
Query 1689 CACGGCGCTGCCCCAGGTGCAGGTGGTGGAGGTGGGCCAGGACGGTGGCACCTATGACAAGGACAATGTGCTCA 1762
|||.||.|||||.||||||||||||||.||||||||.|||||.|||||||||||.|||||.||||||.||||||
Sbjct 1149 CACAGCTCTGCCTCAGGTGCAGGTGGTAGAGGTGGGTCAGGATGGTGGCACCTACGACAAAGACAATCTGCTCA 1222
Query 1763 TCCAGCACTCAGGCGCCAAGAAGGCCTCTGCCTCAGGGCAGGCTCAGAATAAGGTGTACCTCGGCCCCCCACGC 1836
|||||||..|.||.||||||||||||.||||..||||||||||.|||||.|||||||||||.||||||||||||
Sbjct 1223 TCCAGCATGCTGGAGCCAAGAAGGCCACTGCTGCAGGGCAGGCCCAGAACAAGGTGTACCTGGGCCCCCCACGC 1296
Query 1837 CTCTTCCAGGAGCTGCAGGACCTGCAGAAGGACCTGGCCGTGGTGGAGCAGATCACGCTTCTCATCAGCACGCT 1910
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||..|
Sbjct 1297 CTCTTCCAGGAGCTGCAGGACCTGCAGAAGGACCTGGCCGTGGTGGAGCAGATCACCCTCCTCATCAGCACCTT 1370
Query 1911 GCACGGCACCTACCAGAACCTGAACATGACTGTGGCTCAAGACTGGTGCCTGGCCCTGCAGAGGCTGATGCGGG 1984
|||.|||||.||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||||
Sbjct 1371 GCATGGCACTTACCAGAATCTGAACATGACTGTGGCCCAAGACTGGTGCCTGGCGCTGCAGAGGCTGATGCGGG 1444
Query 1985 TGAAGGAGGAAGAGATCCACTCGGCCAACAAGTGCCGTCTCAGGCTCCTGCTTCCTGGGAAACCCGACAAGTCC 2058
||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||.||.|||||.|||||.||.|||||.||.||||||||.
Sbjct 1445 TGAAGGAGGAGGAGATTCACTCGGCCAACAAGTGCCGCCTGAGGCTGCTGCTCCCCGGGAAGCCAGACAAGTCT 1518
Query 2059 GGCCGCCCCATTAGCTTCATGGTGGTTTTCATCACCCCCAACCCCCTGAGCAAGATTTCCTGGGTCAACAGGTT 2132
|||||.|||||.||.|||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||
Sbjct 1519 GGCCGGCCCATCAGTTTCATGGTGGTCTTCATCACCCCGAACCCCCTGAGCAAGATTTCCTGGGTCAACAGATT 1592
Query 2133 ACATTTGGCCAAAATCGGACTCCGGGAGGAGAACCAGCCAGGCTGGCTATGCCCGGATGAGGACAAGAAGAGCA 2206
|||.|||||.||.||.|||||..|||||||||||||||||||.|||||.||.||.||||||||||||||.||||
Sbjct 1593 ACACTTGGCAAAGATTGGACTAAGGGAGGAGAACCAGCCAGGATGGCTGTGTCCCGATGAGGACAAGAAAAGCA 1666
Query 2207 AAGCCCCATTCTGGTGCCCGATCCTGGCCTGCTGCATCCCTGCCTTCTCCTCCCGGGCACTCAGCCTGCAGCTT 2280
|||||||.|||||||||||.|||||||||||||||.||||.||.||||||||||||.|.|||||.|||||||||
Sbjct 1667 AAGCCCCGTTCTGGTGCCCCATCCTGGCCTGCTGCGTCCCCGCTTTCTCCTCCCGGACCCTCAGTCTGCAGCTT 1740
Query 2281 GGGGCCCTGGTCCACAGTCCTGTCAACTGTCCCCTGCTGGGTTTCTCAGCCGTCAGCACCTCCCTTCCACAGGG 2354
||||.||||||||||||||||||.||||.||||||||||||.|||||.||.||||||||.||||||||||||||
Sbjct 1741 GGGGGCCTGGTCCACAGTCCTGTTAACTCTCCCCTGCTGGGCTTCTCGGCGGTCAGCACTTCCCTTCCACAGGG 1814
Query 2355 CTACCTCTGGGTCGGGGGCGGACAGGAAGGCGCAGGGGGCCAGGTGGAAATCTTTTCCTTGAACCGGCCCTCGC 2428
||||||.|||||.||.||.||.|||||.||.||.||.|||||||||||.|||||.|||.||||||||||.||.|
Sbjct 1815 CTACCTTTGGGTTGGCGGTGGTCAGGAGGGTGCTGGTGGCCAGGTGGAGATCTTCTCCCTGAACCGGCCTTCAC 1888
Query 2429 CCCGCACCGTCAAGTCCTTCCCACTGGCAGCCCCTGTGCTCTGCATGGAGTATATCCCGGAGCTGGAGGAGGAG 2502
|.|||||.|||||||||||||||.||||.|||||||||||||||||.||||||||.||.||.|.||||||||||
Sbjct 1889 CGCGCACGGTCAAGTCCTTCCCAGTGGCGGCCCCTGTGCTCTGCATAGAGTATATTCCAGATCCGGAGGAGGAG 1962
Query 2503 GCGGA--GAGCAGAGACGAGAGCCCGACAGTTGCTGACCCCTCGGCCACGGTGCATCCAACCATCTGCCTCGGG 2574
||.|| |.|||||| |||||||.|.|||...|.||.|||||||.|||.||||||||.||..|||||||.||.
Sbjct 1963 GCTGAGGGTGCAGAG--GAGAGCCGGGCAGCCACCGATCCCTCGGTCACAGTGCATCCCACTGTCTGCCTTGGA 2034
Query 2575 CTCCAGGATGGCAGCATCCTCCTCTACAGCAGTGTGGACACTGGCACCCAGTGCCTGGTGAGCTGCAGGAGCCC 2648
||.|||||||||||||||||.||.||..|||||||||||||.||.|||||||||||||..|.|||||.||||||
Sbjct 2035 CTGCAGGATGGCAGCATCCTACTGTATGGCAGTGTGGACACGGGTACCCAGTGCCTGGCCACCTGCAAGAGCCC 2108
Query 2649 AGGTCTGCAGCCTGTGCTCTGCCTGCGACACAGCCCCTTCCACCTGCTCGCTGGCCTGCAGGATGGGACCCTTG 2722
|||.|.|||||||||||||||||||||.||||||||.|||.|||||||.||.|||||.|||||.||||||||.|
Sbjct 2109 AGGCCCGCAGCCTGTGCTCTGCCTGCGTCACAGCCCTTTCTACCTGCTTGCCGGCCTCCAGGACGGGACCCTCG 2182
Query 2723 CTGCTTACCCTCGGACCAGCGGAGGTG----TCCTGTGGGACCTGGAGAGCCCTCCCGTGTGCCTGACTGTGGG 2792
||||.||.|||||||||| |.|||| ||| .|||||||||||||||||||||.|||||.|.||||||||
Sbjct 2183 CTGCCTATCCTCGGACCA---GTGGTGACATTCC-CTGGGACCTGGAGAGCCCTCCCATGTGCATAACTGTGGG 2252
Query 2793 GCCCGGGCCTGTCCGCACCCTGTTGAGCCTGGAGGATGCCGTGTGGGCCAGCTGTGGGCCCCGGGTCACTGTCC 2866
.||.|||||..|.||.||.|||.||||||||||.|||||.|..|||||||||||.|||||..||||||||||.|
Sbjct 2253 CCCAGGGCCGATTCGAACACTGCTGAGCCTGGAAGATGCTGCATGGGCCAGCTGCGGGCCGAGGGTCACTGTAC 2326
Query 2867 TGGAAGCCACCACCCTGCAGCCTCAGCAAAGCTTCGAGGCGCACCAGGACGAGGCAGTGAGCGTGACACACATG 2940
|.||.|||.||||..||||..||||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||.||.||.||||||
Sbjct 2327 TAGATGCCGCCACTTTGCAAACTCAGCAAAGCTTCGAGGCGCACCAGGATGAGGCGGTGAGTGTCACTCACATG 2400
Query 2941 GTGAAGGCGGGCAGCGGCGTCTGGATGGCCTTCTCCTCCGGCACCTCCATCCGCCTCTTCCACACTGAGACCCT 3014
|||||.||.||||||||.||||||||||||||||||||.|||.|.||||||||||||||.|||||.|||||.||
Sbjct 2401 GTGAAAGCCGGCAGCGGTGTCTGGATGGCCTTCTCCTCTGGCTCTTCCATCCGCCTCTTTCACACGGAGACTCT 2474
Query 3015 GGAGCATCTGCAAGAGATCAACATCGCCACCAGGACCACCTTCCTCCTGCCAGGCCAGAAGCACTTGTGTGTCA 3088
||||||.||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||.|.|||||||
Sbjct 2475 GGAGCACCTTCAGGAGATCAACATCGCCACCAGGACCACCTTCCTCCTGCCAGGCCAAAAGCACCTATGTGTCA 2548
Query 3089 CCAGCCTCCTGATCTGCCAGGGTCTGCTCTGGGTGGGCACTGACCAGGGTGTCATCGTCCTGCTGCCCGTGCCT 3162
||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||||||.||||.||.||.
Sbjct 2549 CCAGCCTCCTCATCTGCCAGGGTCTGCTCTGGGTAGGCACTGACCAGGGTGTCATTGTCCTGTTGCCTGTACCC 2622
Query 3163 CGGCTGGAAGGCATCCCCAAGATCACAGGGAAAGGCATGGTCTCACTCAATGGGCACTGTGGGCCTGTGGCCTT 3236
||.|||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||.||||||||.|||||||||||
Sbjct 2623 CGACTGGAGGGCATCCCCAAGATCACAGGGAAAGGCATGGTGTCTCTCAATGGTCACTGTGGACCTGTGGCCTT 2696
Query 3237 CCTGGCTGTGGCTACCAGCATCCTGGCCCCTGACATCCTGCGGAGTGACCAGGAGGAGGCTGAGGGGCCCCGGG 3310
||||||||||||.|..||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||.||.|.||
Sbjct 2697 CCTGGCTGTGGCCATGAGCATCCTGGCCCCTGACATCCTGCGGAGTGACCAGGAAGAGGCCGAGGGACCGCAGG 2770
Query 3311 CTGAGGAGGACAAGCCAGACGGGCAGGCACA------CGAGCCCATGCCCGACAGCCACGTGGGCCGAGAGCTG 3378
|.||||||||||||||||||||||||||.|| ||.|||...|||.|||||||||...|..||.||||||
Sbjct 2771 CCGAGGAGGACAAGCCAGACGGGCAGGCTCATGAAACCGTGCCTGGGCCTGACAGCCACACAGCTCGGGAGCTG 2844
Query 3379 ACCCGCAAGAAGGGCATCCTCTTGCAGTACCGCCTGCGCTCCACCGCACACCT-CCCGGGCCCGCTGCTCTCCA 3451
|||||||||||.||||||||..|.||.||||||||.||||||||.||.||||| ||||||||| |||.|.||..
Sbjct 2845 ACCCGCAAGAAAGGCATCCTGCTCCAATACCGCCTACGCTCCACGGCCCACCTCCCCGGGCCC-CTGTTGTCTG 2917
Query 3452 TGCGGGAGCCGGCGCCTGCTGATGGCGCAGCTTTGGAGCACAGCGAGGAGGACGGCTCCATTTACGAGATGGCC 3525
||||||||||.||.|||||.||||||.|.|||.||||.|||||.|||||||||||.|||||.||||||||||||
Sbjct 2918 TGCGGGAGCCAGCACCTGCCGATGGCTCGGCTCTGGAACACAGTGAGGAGGACGGGTCCATCTACGAGATGGCC 2991
Query 3526 GACGACCCCGACGTCTGGGTGCGCAGCCGGCCCTGCGCCCGCGACGCCCACCGCAAGGAGATTTGCTCTGTGGC 3599
||.|||||.|||||||||||.||.|||||||||||.|||||.||.|||||||||||||||||.|||||||||||
Sbjct 2992 GATGACCCTGACGTCTGGGTCCGGAGCCGGCCCTGTGCCCGTGATGCCCACCGCAAGGAGATCTGCTCTGTGGC 3065
Query 3600 CATCATCTCCGGCGGGCAGGGCTACCGCAACTTTGGCAGCGCTC----TGGGCAGCAGTGGGAGGCAGGCCCCG 3669
.||||||||.||.||.||.|||||||||.|.||.|||.|.|||| |||.|.| ||||||.||..|||||||
Sbjct 3066 TATCATCTCTGGTGGACAAGGCTACCGCCATTTCGGCGGTGCTCCAGGTGGCCTG-AGTGGGCGGGCGGCCCCG 3138
Query 3670 TGTGGGGAGACGGACAGCACCCTCCTCATCTGGCAGGTGCCCTTGATGCTA 3720
||..|.|||||.||||||||.||.|||||||||||||||||||||...|||
Sbjct 3139 TGCAGCGAGACAGACAGCACACTTCTCATCTGGCAGGTGCCCTTGGCTCTA 3189