Protein Global Alignment

Description

Query:
TRCN0000468535
Subject:
XM_006539204.3
Aligned Length:
1253
Identities:
949
Gaps:
203

Alignment

Query    1  MASSNPPPQPAIGDQLVPGVPGPSSEAEDDPGEAFEFDDSDDEEDTSAALGVPSLAPERDTDPPLIHLDSIPVT  74
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query   75  DPDPAAAPPGTGVPAWVSNGDAADAAFSGARHSSWKRKSSRRIDRFTFPALEEDVIYDDVPCESPDAHQPGAER  148
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  149  NLLYEDAHRAGAPRQAEDLGWSSSEFESYSEDSGEEAKPEVEVEPAKHRVSFQPKMTQL----------MKAAK  212
                                                      ..|........|....|          |.|..
Sbjct    1  ------------------------------------------MLPSSSWGKRKPRSQRLGWVRCDARGNMWARQ  32

Query  213  SGTKDGLEKTRMAVMRKVSFLHRKDVLGDSEEEDMGLLEVSVSDIKPPAPELGPMPEGLSPQQVVRRHILGSIV  286
            .|................|........|||||||||||||.|.|||||||||||||.|||||||||||||||||
Sbjct   33  EGLRQPHPHPHALIRCPSSSSSSVSCSGDSEEEDMGLLEVGVTDIKPPAPELGPMPDGLSPQQVVRRHILGSIV  106

Query  287  QSEGSYVESLKRILQDYRNPLMEMEPKALSARKCQVVFFRVKEILHCHSMFQIALSSRVAEWDSTEKIGDLFVA  360
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  107  QSEGSYVESLKRILQDYRNPLMEMEPKALSARKCQVVFFRVKEILHCHSMFQIALSSRVAEWDSTEKIGDLFVA  180

Query  361  SFSKSMVLDVYSDYVNNFTSAMSIIKKACLTKPAFLEFLKRRQVCSPDRVTLYGLMVKPIQRFPQFILLLQDML  434
            |||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||.||||||||||||||
Sbjct  181  SFSKSMVLDVYSDYVNNFTNAMSIIKKACLTKPAFLEFLKRRQVCSTDRVTLYGLMVKPVQRFPQFILLLQDML  254

Query  435  KNTPRGHPDRLSLQLALTELETLAEKLNEQKRLADQVAEIQQLTKSVSDRSSLNKLLTSGQRQLLLCETLTETV  508
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  255  KNTPRGHPDRLSLQLALTELETLAEKLNEQKRLADQVAEIQQLTKSVSDRSSLNKLLTSGQRQLLLCETLTETV  328

Query  509  YGDRGQLIKSKERRVFLLNDMLVCANINFKPANHRGQLEISSLVPLGPKYVVKWNTALPQVQVVEVGQDGGTYD  582
            |||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  329  YGDRGQLIKSKERRVFLLNDMLVCANINFKPSNHRGQLEISSLVPLGPKYVVKWNTALPQVQVVEVGQDGGTYD  402

Query  583  KDNVLIQHSGAKKASASGQAQNKVYLGPPRLFQELQDLQKDLAVVEQITLLISTLHGTYQNLNMTVAQDWCLAL  656
            |||.||||.|||||.|.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  403  KDNLLIQHAGAKKATAAGQAQNKVYLGPPRLFQELQDLQKDLAVVEQITLLISTLHGTYQNLNMTVAQDWCLAL  476

Query  657  QRLMRVKEEEIHSANKCRLRLLLPGKPDKSGRPISFMVVFITPNPLSKISWVNRLHLAKIGLREENQPGWLCPD  730
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  477  QRLMRVKEEEIHSANKCRLRLLLPGKPDKSGRPISFMVVFITPNPLSKISWVNRLHLAKIGLREENQPGWLCPD  550

Query  731  EDKKSKAPFWCPILACCIPAFSSRALSLQLGALVHSPVNCPLLGFSAVSTSLPQGYLWVGGGQEGAGGQVEIFS  804
            |||||||||||||||||.||||||.||||||.|||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  551  EDKKSKAPFWCPILACCVPAFSSRTLSLQLGGLVHSPVNSPLLGFSAVSTSLPQGYLWVGGGQEGAGGQVEIFS  624

Query  805  LNRPSPRTVKSFPLAAPVLCMEYIPELEEEAESRDESPTVADPSATVHPTICLGLQDGSILLYSSVDTGTQCLV  878
            |||||||||||||.||||||.||||..|||||...||....|||.|||||.||||||||||||.|||||||||.
Sbjct  625  LNRPSPRTVKSFPVAAPVLCIEYIPDPEEEAEGAEESRAATDPSVTVHPTVCLGLQDGSILLYGSVDTGTQCLA  698

Query  879  SCRSPGLQPVLCLRHSPFHLLAGLQDGTLAAYPRTSGGVLWDLESPPVCLTVGPGPVRTLLSLEDAVWASCGPR  952
            .|.|||.|||||||||||.||||||||||||||||||...|||||||.|.||||||.|||||||||.|||||||
Sbjct  699  TCKSPGPQPVLCLRHSPFYLLAGLQDGTLAAYPRTSGDIPWDLESPPMCITVGPGPIRTLLSLEDAAWASCGPR  772

Query  953  VTVLEATTLQPQQSFEAHQDEAVSVTHMVKAGSGVWMAFSSGTSIRLFHTETLEHLQEINIATRTTFLLPGQKH  1026
            ||||.|.|||.|||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  773  VTVLDAATLQTQQSFEAHQDEAVSVTHMVKAGSGVWMAFSSGSSIRLFHTETLEHLQEINIATRTTFLLPGQKH  846

Query 1027  LCVTSLLICQGLLWVGTDQGVIVLLPVPRLEGIPKITGKGMVSLNGHCGPVAFLAVATSILAPDILRSDQEEAE  1100
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||
Sbjct  847  LCVTSLLICQGLLWVGTDQGVIVLLPVPRLEGIPKITGKGMVSLNGHCGPVAFLAVAMSILAPDILRSDQEEAE  920

Query 1101  GPRAEEDKPDGQAHE--PMPDSHVGRELTRKKGILLQYRLRSTAHLPGPLLSMREPAPADGAALEHSEEDGSIY  1172
            ||.||||||||||||  |.||||..|||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||||||
Sbjct  921  GPQAEEDKPDGQAHETVPGPDSHTARELTRKKGILLQYRLRSTAHLPGPLLSVREPAPADGSALEHSEEDGSIY  994

Query 1173  EMADDPDVWVRSRPCARDAHRKEICSVAIISGGQGYRNFGSALGS-SGRQAPCGETDSTLLIWQVPLML  1240
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|.|. |||.|||.|||||||||||||.|
Sbjct  995  EMADDPDVWVRSRPCARDAHRKEICSVAIISGGQGYRHFGGAPGGLSGRAAPCSETDSTLLIWQVPLAL  1063