Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000468535
• Subject: XM_011250340.2
• Aligned Length: 3740
• Identities: 3215
• Gaps: 52

Alignment

Query    1  ATGGCTTCCTCCAACCCTCCTCCACAGCCTGCCATAGGAGATCAGCTGGTTCCAGGAGTCCCAGGCCCCTCCTC  74
            |||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||.||..||||.|||..|.|..||||||||||||.|
Sbjct    1  ATGGCTTCCTCGAACCCTCCTCCACAGCCTGCCATAGGAGCTCCCCTGGCTCCCAGCGCTCCAGGCCCCTCCCC  74

Query   75  TGAGGCAGAGGACGACCCAGGAGAGGCGTTTGAGTTTGATGACAGTGATGATGAAGAGGACACCAGCGCAGCCC  148
            .||||..|||||.|||.|.|||||.||.|||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||.|.|.||
Sbjct   75  CGAGGTGGAGGAGGACTCCGGAGAAGCCTTTGAGTTTGATGACAGTGATGAGGAGGAGGACACCAGCTCTGGCC  148

Query  149  TGGGCGTCCCCAGCCTTGCTCCTGAGAGGGACACAGACCCCCCACTGATCCACTTGGACTCCATCCCTGTCACT  222
            |||..|||||..||||.||.|||||||||||||||||.|||.|.||||||..|||.|||.|..||||.|.|.|.
Sbjct  149  TGGTTGTCCCTGGCCTCGCCCCTGAGAGGGACACAGAGCCCTCGCTGATCTGCTTTGACACTGTCCCGGGCTCA  222

Query  223  GACCCAGACCCAGCAGCTGCTCCACCCGGCACAGGGGTGCCAGC--CTG-GGTGAGCAATGGGGATGCAGCGGA  293
            ||||..||||||||||||||.||||||...||||.||   ||.|  ||| |||.||||||||||||||.|.||.
Sbjct  223  GACCTGGACCCAGCAGCTGCACCACCCCAGACAGAGG---CACCCACTGTGGTCAGCAATGGGGATGCGGTGGG  293

Query  294  CGCAGCCTTCTCCGGGGCCCGGCACTCCAGCTGGAAGCGGAAGAGTTCCCGTCGCATTGACCGGTTCACTTTCC  367
            ||||||..||||.||||.|||||.|||||||||||||||||||||.||.|||||.||||||||.||||||||||
Sbjct  294  CGCAGCGATCTCTGGGGTCCGGCGCTCCAGCTGGAAGCGGAAGAGCTCACGTCGAATTGACCGCTTCACTTTCC  367

Query  368  CCGCCCTGGAAGAGGATGTGATTTATGACGACGTCCCCTGCGAGAGCCCAGATGCGCATCAGCCCGGGGCAGAG  441
            |.||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||.||||||||||||||.|||
Sbjct  368  CTGCCCTGGAGGAAGATGTGATTTATGACGACGTCCCCTGTGAGAGCCCAGACGCCCATCAGCCCGGGGCCGAG  441

Query  442  AGGAACCTGCTCTACGAGGATGCGCACCGGGCTGGGGCCCCTCGGCAGGCGGAGGACCTAGGCTGGAGCTCCAG  515
            .||..|||..|.||||||||||.|||.||.||.||.||.||.||..||.|.||||||||||||||||||||.||
Sbjct  442  CGGGGCCTCGTTTACGAGGATGTGCATCGTGCAGGAGCACCGCGTGAGACCGAGGACCTAGGCTGGAGCTCTAG  515

Query  516  TGAGTTCGAGAGCTACAGCGAGGACTCGGGGGAGGAGGCCAAGCCGGAGGTCGAGGTCGAGCCCGCCAAGCACC  589
            ||||||.||||||||||||||||||||.|||||||||.||||.|||      ||||.|||||||.|.|||||||
Sbjct  516  TGAGTTTGAGAGCTACAGCGAGGACTCTGGGGAGGAGACCAAACCG------GAGGCCGAGCCCACTAAGCACC  583

Query  590  GAGTGTCCTTCCAGCCCAAGATGACCCAGCTCATGAAGGCCGCCAAGAGCGGGACCAAGGATGGGCTGGAGAAG  663
            |||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||
Sbjct  584  GAGGGTCCTTCCAGCCCAAGATGACCCAGCTCATGAAGGCCGCCAAGAGCGGGACCAGGGATGGGCTGGAGAAG  657

Query  664  ACACGGATGGCCGTGATGCGCAAAGTCTCCTTCCTGCACAGGAAGGACGTCCTCGGTGACTCGGAGGAGGAGGA  737
            ||.|||||||||||.|||||.|||||||||||.|||||.|||||.||.||||||||||||||.||.||.||.||
Sbjct  658  ACCCGGATGGCCGTCATGCGAAAAGTCTCCTTTCTGCATAGGAAAGATGTCCTCGGTGACTCAGAAGAAGAAGA  731

Query  738  CATGGGGCTCCTGGAGGTCAGCGTTTCGGACATCAAGCCCCCAGCCCCAGAGCTGGGCCCCATGCCAGAGGGCC  811
            .|||||||||||||||||..|.||..|.||||||||.||.||.||.||||||||||||||||||||.||.|||.
Sbjct  732  TATGGGGCTCCTGGAGGTTGGTGTGACAGACATCAAACCTCCCGCGCCAGAGCTGGGCCCCATGCCGGATGGCT  805

Query  812  TGAGCCCTCAGCAGGTGGTCCGGAGGCATATCCTGGGCTCCATCGTGCAGAGCGAAGGCAGCTACGTGGAGTCT  885
            ||||.||||||||||||||||||||.||.|||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.
Sbjct  806  TGAGTCCTCAGCAGGTGGTCCGGAGACACATCCTAGGCTCCATCGTGCAGAGCGAAGGCAGCTACGTGGAGTCA  879

Query  886  CTGAAGCGGATACTCCAGGACTACCGCAACCCCCTGATGGAGATGGAGCCCAAGGCGCTGAGCGCCCGCAAGTG  959
            ||||||||||||||||||||.|||||.|||||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  880  CTGAAGCGGATACTCCAGGATTACCGTAACCCACTAATGGAGATGGAGCCCAAGGCGCTGAGCGCCCGCAAGTG  953

Query  960  CCAGGTGGTGTTCTTCCGCGTGAAGGAGATCCTGCACTGCCACTCCATGTTCCAGATCGCCCTGTCCTCCCGCG  1033
            .|||||||||||||||||||||||||||||.||.||.||.||||||||||||||||||||.|||||||||||||
Sbjct  954  TCAGGTGGTGTTCTTCCGCGTGAAGGAGATTCTACATTGTCACTCCATGTTCCAGATCGCTCTGTCCTCCCGCG  1027

Query 1034  TGGCTGAGTGGGATTCCACCGAGAAGATCGGGGACCTCTTCGTGGCCTCGTTTTCCAAGTCCATGGTGCTAGAT  1107
            ||||.||||||||.|||||.||||||||.||.||||||||.|||||.||.||.||||||||||||||.||||||
Sbjct 1028  TGGCCGAGTGGGACTCCACAGAGAAGATTGGAGACCTCTTTGTGGCTTCATTCTCCAAGTCCATGGTCCTAGAT  1101

Query 1108  GTGTACAGTGACTACGTGAACAACTTCACCAGTGCCATGTCCATCATCAAGAAGGCCTGCCTCACCAAGCCTGC  1181
            ||.|||||.|||||.||||||||||||||||..||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||
Sbjct 1102  GTATACAGCGACTATGTGAACAACTTCACCAACGCCATGTCCATCATCAAGAAGGCCTGTCTCACCAAGCCAGC  1175

Query 1182  CTTCCTCGAGTTCCTCAAGCGACGGCAGGTGTGCAGCCCAGACCGTGTCACCCTCTACGGGCTGATGGTCAAGC  1255
            .|||||.|||||.||||||||.||||||||||||||..|.|||||.|||||||||||.|||.|||||||.||.|
Sbjct 1176  GTTCCTTGAGTTTCTCAAGCGGCGGCAGGTGTGCAGTACGGACCGAGTCACCCTCTATGGGTTGATGGTGAAAC  1249

Query 1256  CCATCCAGAGGTTCCCACAGTTCATACTCCTGCTTCAGGACATGCTGAAGAACACCCCCAGGGGCCATCCGGAC  1329
            |..|.|||||.||.|||||||||||.|||||.||.||||||||||||||||||||.|||.|||||||.||.|||
Sbjct 1250  CTGTTCAGAGATTTCCACAGTTCATCCTCCTACTCCAGGACATGCTGAAGAACACTCCCCGGGGCCACCCTGAC  1323

Query 1330  AGGCTGTCGCTGCAGCTGGCCCTCACAGAGCTGGAGACGCTGGCTGAGAAGCTGAACGAGCAGAAGCGGCTGGC  1403
            |||.|||||||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||
Sbjct 1324  AGGTTGTCGCTGCAGCTAGCCCTCACGGAGCTGGAGACGCTGGCTGAGAAGCTGAACGAGCAGAAGCGGTTGGC  1397

Query 1404  TGACCAGGTGGCTGAGATCCAGCAGCTGACCAAGAGCGTCAGTGACCGCAGCAGCCTCAACAAGCTGTTGACCT  1477
            .|||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1398  CGACCAGGTGGCTGAGATCCAGCAGCTGACCAAGAGTGTCAGTGACCGCAGCAGCCTCAACAAGCTGTTGACCT  1471

Query 1478  CAGGCCAGCGGCAGCTGCTCCTGTGTGAGACGTTGACGGAGACCGTGTACGGTGACCGCGGGCAGCTAATTAAG  1551
            |.|||||||||||||||||.|||||||||||..||||.|||||.|||||.||.|||||.||||||||.||.|||
Sbjct 1472  CTGGCCAGCGGCAGCTGCTTCTGTGTGAGACACTGACTGAGACGGTGTATGGAGACCGAGGGCAGCTGATCAAG  1545

Query 1552  TCCAAGGAGCGTCGGGTCTTCCTGCTCAACGACATGCTTGTCTGTGCCAACATCAACTTCAAGCCTGCCAACCA  1625
            |||||||||||..||||||||||||||||.||||||||.|||||.|||||||||||||||||            
Sbjct 1546  TCCAAGGAGCGCAGGGTCTTCCTGCTCAATGACATGCTGGTCTGCGCCAACATCAACTTCAA------------  1607

Query 1626  CAGGGGCCAGCTGGAGATCAGCAGCCTGGTGCCCCTGGGGCCCAAGTATGTGGTGAAGTGGAACACGGCGCTGC  1699
               |||||||||.|||||||||||||||||.||.||||||||||||||.|||||||||||||||||.||.||||
Sbjct 1608  ---GGGCCAGCTAGAGATCAGCAGCCTGGTACCTCTGGGGCCCAAGTACGTGGTGAAGTGGAACACAGCTCTGC  1678

Query 1700  CCCAGGTGCAGGTGGTGGAGGTGGGCCAGGACGGTGGCACCTATGACAAGGACAATGTGCTCATCCAGCACTCA  1773
            |.||||||||||||||.||||||||.|||||.|||||||||||.|||||.||||||.|||||||||||||..|.
Sbjct 1679  CTCAGGTGCAGGTGGTAGAGGTGGGTCAGGATGGTGGCACCTACGACAAAGACAATCTGCTCATCCAGCATGCT  1752

Query 1774  GGCGCCAAGAAGGCCTCTGCCTCAGGGCAGGCTCAGAATAAGGTGTACCTCGGCCCCCCACGCCTCTTCCAGGA  1847
            ||.||||||||||||.||||..||||||||||.|||||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||
Sbjct 1753  GGAGCCAAGAAGGCCACTGCTGCAGGGCAGGCCCAGAACAAGGTGTACCTGGGCCCCCCACGCCTCTTCCAGGA  1826

Query 1848  GCTGCAGGACCTGCAGAAGGACCTGGCCGTGGTGGAGCAGATCACGCTTCTCATCAGCACGCTGCACGGCACCT  1921
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||..||||.|||||.|
Sbjct 1827  GCTGCAGGACCTGCAGAAGGACCTGGCCGTGGTGGAGCAGATCACCCTCCTCATCAGCACCTTGCATGGCACTT  1900

Query 1922  ACCAGAACCTGAACATGACTGTGGCTCAAGACTGGTGCCTGGCCCTGCAGAGGCTGATGCGGGTGAAGGAGGAA  1995
            |||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.
Sbjct 1901  ACCAGAATCTGAACATGACTGTGGCCCAAGACTGGTGCCTGGCGCTGCAGAGGCTGATGCGGGTGAAGGAGGAG  1974

Query 1996  GAGATCCACTCGGCCAACAAGTGCCGTCTCAGGCTCCTGCTTCCTGGGAAACCCGACAAGTCCGGCCGCCCCAT  2069
            |||||.||||||||||||||||||||.||.|||||.|||||.||.|||||.||.||||||||.|||||.|||||
Sbjct 1975  GAGATTCACTCGGCCAACAAGTGCCGCCTGAGGCTGCTGCTCCCCGGGAAGCCAGACAAGTCTGGCCGGCCCAT  2048

Query 2070  TAGCTTCATGGTGGTTTTCATCACCCCCAACCCCCTGAGCAAGATTTCCTGGGTCAACAGGTTACATTTGGCCA  2143
            .||.|||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||.|
Sbjct 2049  CAGTTTCATGGTGGTCTTCATCACCCCGAACCCCCTGAGCAAGATTTCCTGGGTCAACAGATTACACTTGGCAA  2122

Query 2144  AAATCGGACTCCGGGAGGAGAACCAGCCAGGCTGGCTATGCCCGGATGAGGACAAGAAGAGCAAAGCCCCATTC  2217
            |.||.|||||..|||||||||||||||||||.|||||.||.||.||||||||||||||.|||||||||||.|||
Sbjct 2123  AGATTGGACTAAGGGAGGAGAACCAGCCAGGATGGCTGTGTCCCGATGAGGACAAGAAAAGCAAAGCCCCGTTC  2196

Query 2218  TGGTGCCCGATCCTGGCCTGCTGCATCCCTGCCTTCTCCTCCCGGGCACTCAGCCTGCAGCTTGGGGCCCTGGT  2291
            ||||||||.|||||||||||||||.||||.||.||||||||||||.|.|||||.|||||||||||||.||||||
Sbjct 2197  TGGTGCCCCATCCTGGCCTGCTGCGTCCCCGCTTTCTCCTCCCGGACCCTCAGTCTGCAGCTTGGGGGCCTGGT  2270

Query 2292  CCACAGTCCTGTCAACTGTCCCCTGCTGGGTTTCTCAGCCGTCAGCACCTCCCTTCCACAGGGCTACCTCTGGG  2365
            ||||||||||||.||||.||||||||||||.|||||.||.||||||||.||||||||||||||||||||.||||
Sbjct 2271  CCACAGTCCTGTTAACTCTCCCCTGCTGGGCTTCTCGGCGGTCAGCACTTCCCTTCCACAGGGCTACCTTTGGG  2344

Query 2366  TCGGGGGCGGACAGGAAGGCGCAGGGGGCCAGGTGGAAATCTTTTCCTTGAACCGGCCCTCGCCCCGCACCGTC  2439
            |.||.||.||.|||||.||.||.||.|||||||||||.|||||.|||.||||||||||.||.||.|||||.|||
Sbjct 2345  TTGGCGGTGGTCAGGAGGGTGCTGGTGGCCAGGTGGAGATCTTCTCCCTGAACCGGCCTTCACCGCGCACGGTC  2418

Query 2440  AAGTCCTTCCCACTGGCAGCCCCTGTGCTCTGCATGGAGTATATCCCGGAGCTGGAGGAGGAGGCGGA--GAGC  2511
            ||||||||||||.||||.|||||||||||||||||.||||||||.||.||.|.||||||||||||.||  |.||
Sbjct 2419  AAGTCCTTCCCAGTGGCGGCCCCTGTGCTCTGCATAGAGTATATTCCAGATCCGGAGGAGGAGGCTGAGGGTGC  2492

Query 2512  AGAGACGAGAGCCCGACAGTTGCTGACCCCTCGGCCACGGTGCATCCAACCATCTGCCTCGGGCTCCAGGATGG  2585
            ||||  |||||||.|.|||...|.||.|||||||.|||.||||||||.||..|||||||.||.||.||||||||
Sbjct 2493  AGAG--GAGAGCCGGGCAGCCACCGATCCCTCGGTCACAGTGCATCCCACTGTCTGCCTTGGACTGCAGGATGG  2564

Query 2586  CAGCATCCTCCTCTACAGCAGTGTGGACACTGGCACCCAGTGCCTGGTGAGCTGCAGGAGCCCAGGTCTGCAGC  2659
            |||||||||.||.||..|||||||||||||.||.|||||||||||||..|.|||||.|||||||||.|.|||||
Sbjct 2565  CAGCATCCTACTGTATGGCAGTGTGGACACGGGTACCCAGTGCCTGGCCACCTGCAAGAGCCCAGGCCCGCAGC  2638

Query 2660  CTGTGCTCTGCCTGCGACACAGCCCCTTCCACCTGCTCGCTGGCCTGCAGGATGGGACCCTTGCTGCTTACCCT  2733
            ||||||||||||||||.||||||||.|||.|||||||.||.|||||.|||||.||||||||.|||||.||.|||
Sbjct 2639  CTGTGCTCTGCCTGCGTCACAGCCCTTTCTACCTGCTTGCCGGCCTCCAGGACGGGACCCTCGCTGCCTATCCT  2712

Query 2734  CGGACCAGCGGAGGTG----TCCTGTGGGACCTGGAGAGCCCTCCCGTGTGCCTGACTGTGGGGCCCGGGCCTG  2803
            |||||||   |.||||    ||| .|||||||||||||||||||||.|||||.|.||||||||.||.|||||..
Sbjct 2713  CGGACCA---GTGGTGACATTCC-CTGGGACCTGGAGAGCCCTCCCATGTGCATAACTGTGGGCCCAGGGCCGA  2782

Query 2804  TCCGCACCCTGTTGAGCCTGGAGGATGCCGTGTGGGCCAGCTGTGGGCCCCGGGTCACTGTCCTGGAAGCCACC  2877
            |.||.||.|||.||||||||||.|||||.|..|||||||||||.|||||..||||||||||.||.||.|||.||
Sbjct 2783  TTCGAACACTGCTGAGCCTGGAAGATGCTGCATGGGCCAGCTGCGGGCCGAGGGTCACTGTACTAGATGCCGCC  2856

Query 2878  ACCCTGCAGCCTCAGCAAAGCTTCGAGGCGCACCAGGACGAGGCAGTGAGCGTGACACACATGGTGAAGGCGGG  2951
            ||..||||..||||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||.||.||.|||||||||||.||.||
Sbjct 2857  ACTTTGCAAACTCAGCAAAGCTTCGAGGCGCACCAGGATGAGGCGGTGAGTGTCACTCACATGGTGAAAGCCGG  2930

Query 2952  CAGCGGCGTCTGGATGGCCTTCTCCTCCGGCACCTCCATCCGCCTCTTCCACACTGAGACCCTGGAGCATCTGC  3025
            ||||||.||||||||||||||||||||.|||.|.||||||||||||||.|||||.|||||.||||||||.||.|
Sbjct 2931  CAGCGGTGTCTGGATGGCCTTCTCCTCTGGCTCTTCCATCCGCCTCTTTCACACGGAGACTCTGGAGCACCTTC  3004

Query 3026  AAGAGATCAACATCGCCACCAGGACCACCTTCCTCCTGCCAGGCCAGAAGCACTTGTGTGTCACCAGCCTCCTG  3099
            |.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||.|.|||||||||||||||||.
Sbjct 3005  AGGAGATCAACATCGCCACCAGGACCACCTTCCTCCTGCCAGGCCAAAAGCACCTATGTGTCACCAGCCTCCTC  3078

Query 3100  ATCTGCCAGGGTCTGCTCTGGGTGGGCACTGACCAGGGTGTCATCGTCCTGCTGCCCGTGCCTCGGCTGGAAGG  3173
            |||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||||||.||||.||.||.||.|||||.||
Sbjct 3079  ATCTGCCAGGGTCTGCTCTGGGTAGGCACTGACCAGGGTGTCATTGTCCTGTTGCCTGTACCCCGACTGGAGGG  3152

Query 3174  CATCCCCAAGATCACAGGGAAAGGCATGGTCTCACTCAATGGGCACTGTGGGCCTGTGGCCTTCCTGGCTGTGG  3247
            ||||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||||
Sbjct 3153  CATCCCCAAGATCACAGGGAAAGGCATGGTGTCTCTCAATGGTCACTGTGGACCTGTGGCCTTCCTGGCTGTGG  3226

Query 3248  CTACCAGCATCCTGGCCCCTGACATCCTGCGGAGTGACCAGGAGGAGGCTGAGGGGCCCCGGGCTGAGGAGGAC  3321
            |.|..||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||.||.|.|||.|||||||||
Sbjct 3227  CCATGAGCATCCTGGCCCCTGACATCCTGCGGAGTGACCAGGAAGAGGCCGAGGGACCGCAGGCCGAGGAGGAC  3300

Query 3322  AAGCCAGACGGGCAGGCACA------CGAGCCCATGCCCGACAGCCACGTGGGCCGAGAGCTGACCCGCAAGAA  3389
            |||||||||||||||||.||      ||.|||...|||.|||||||||...|..||.|||||||||||||||||
Sbjct 3301  AAGCCAGACGGGCAGGCTCATGAAACCGTGCCTGGGCCTGACAGCCACACAGCTCGGGAGCTGACCCGCAAGAA  3374

Query 3390  GGGCATCCTCTTGCAGTACCGCCTGCGCTCCACCGCACACCT-CCCGGGCCCGCTGCTCTCCATGCGGGAGCCG  3462
            .||||||||..|.||.||||||||.||||||||.||.||||| ||||||||| |||.|.||..||||||||||.
Sbjct 3375  AGGCATCCTGCTCCAATACCGCCTACGCTCCACGGCCCACCTCCCCGGGCCC-CTGTTGTCTGTGCGGGAGCCA  3447

Query 3463  GCGCCTGCTGATGGCGCAGCTTTGGAGCACAGCGAGGAGGACGGCTCCATTTACGAGATGGCCGACGACCCCGA  3536
            ||.|||||.||||||.|.|||.||||.|||||.|||||||||||.|||||.||||||||||||||.|||||.||
Sbjct 3448  GCACCTGCCGATGGCTCGGCTCTGGAACACAGTGAGGAGGACGGGTCCATCTACGAGATGGCCGATGACCCTGA  3521

Query 3537  CGTCTGGGTGCGCAGCCGGCCCTGCGCCCGCGACGCCCACCGCAAGGAGATTTGCTCTGTGGCCATCATCTCCG  3610
            |||||||||.||.|||||||||||.|||||.||.|||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||.|
Sbjct 3522  CGTCTGGGTCCGGAGCCGGCCCTGTGCCCGTGATGCCCACCGCAAGGAGATCTGCTCTGTGGCTATCATCTCTG  3595

Query 3611  GCGGGCAGGGCTACCGCAACTTTGGCAGCGCTC----TGGGCAGCAGTGGGAGGCAGGCCCCGTGTGGGGAGAC  3680
            |.||.||.|||||||||.|.||.|||.|.||||    |||.|.| ||||||.||..|||||||||..|.|||||
Sbjct 3596  GTGGACAAGGCTACCGCCATTTCGGCGGTGCTCCAGGTGGCCTG-AGTGGGCGGGCGGCCCCGTGCAGCGAGAC  3668

Query 3681  GGACAGCACCCTCCTCATCTGGCAGGTGCCCTTGATGCTA  3720
            .||||||||.||.|||||||||||||||||||||...|||
Sbjct 3669  AGACAGCACACTTCTCATCTGGCAGGTGCCCTTGGCTCTA  3708