Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000468535
- Subject:
- XM_017001621.1
- Aligned Length:
- 3837
- Identities:
- 3716
- Gaps:
- 117
Alignment
Query 1 ATGGCTTCCTCCAACCCTCCTCCACAGCCTGCCATAGGAGATCAGCTGGTTCCAGGAGTCCCAGGCCCCTCCTC 74
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGGCTTCCTCCAACCCTCCTCCACAGCCTGCCATAGGAGATCAGCTGGTTCCAGGAGTCCCAGGCCCCTCCTC 74
Query 75 TGAGGCAGAGGACGACCCAGGAGAGGCGTTTGAGTTTGATGACAGTGATGATGAAGAGGACACCAGCGCAGCCC 148
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 TGAGGCAGAGGACGACCCAGGAGAGGCGTTTGAGTTTGATGACAGTGATGATGAAGAGGACACCAGCGCAGCCC 148
Query 149 TGGGCGTCCCCAGCCTTGCTCCTGAGAGGGACACAGACCCCCCACTGATCCACTTGGACTCCATCCCTGTCACT 222
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149 TGGGCGTCCCCAGCCTTGCTCCTGAGAGGGACACAGACCCCCCACTGATCCACTTGGACTCCATCCCTGTCACT 222
Query 223 GACCCAGACCCAGCAGCTGCTCCACCCGGCACAGGGGTGCCAGCCTGGGTGAGCAATGGGGATGCAGCGGACGC 296
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 GACCCAGACCCAGCAGCTGCTCCACCCGGCACAGGGGTGCCAGCCTGGGTGAGCAATGGGGATGCAGCGGACGC 296
Query 297 AGCCTTCTCCGGGGCCCGGCACTCCAGCTGGAAGCGGAAGAGTTCCCGTCGCATTGACCGGTTCACTTTCCCCG 370
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 AGCCTTCTCCGGGGCCCGGCACTCCAGCTGGAAGCGGAAGAGTTCCCGTCGCATTGACCGGTTCACTTTCCCCG 370
Query 371 CCCTGGAAGAGGATGTGATTTATGACGACGTCCCCTGCGAGAGCCCAGATGCGCATCAGCCCGGGGCAGAGAGG 444
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371 CCCTGGAAGAGGATGTGATTTATGACGACGTCCCCTGCGAGAGCCCAGATGCGCATCAGCCCGGGGCAGAGAGG 444
Query 445 AACCTGCTCTACGAGGATGCGCACCGGGCTGGGGCCCCTCGGCAGGCGGAGGACCTAGGCTGGAGCTCCAGTGA 518
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 AACCTGCTCTACGAGGATGCGCACCGGGCTGGGGCCCCTCGGCAGGCGGAGGACCTAGGCTGGAGCTCCAGTGA 518
Query 519 GTTCGAGAGCTACAGCGAGGACTCGGGGGAGGAGGCCAAGCCGGAGGTCGAGGTCGAGCCCGCCAAGCACCGAG 592
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519 GTTCGAGAGCTACAGCGAGGACTCGGGGGAGGAGGCCAAGCCGGAGGTCGAGGTCGAGCCCGCCAAGCACCGAG 592
Query 593 TGTCCTTCCAGCCC------------------------------------------------------------ 606
||||||||||||||
Sbjct 593 TGTCCTTCCAGCCCAAGCTTTCTCCAGACCTGACTAGGCTAAAGGAGAGATACGCCAGGACTAAGAGAGACATC 666
Query 607 ---------------------------------------------------------AAGATGACCCAGCTCAT 623
|||||||||||||||||
Sbjct 667 TTGGCTTTGAGAGTTGGGGGGAGAGACATGCAGGAGCTGAAGCACAAGTACGATTGTAAGATGACCCAGCTCAT 740
Query 624 GAAGGCCGCCAAGAGCGGGACCAAGGATGGGCTGGAGAAGACACGGATGGCCGTGATGCGCAAAGTCTCCTTCC 697
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741 GAAGGCCGCCAAGAGCGGGACCAAGGATGGGCTGGAGAAGACACGGATGGCCGTGATGCGCAAAGTCTCCTTCC 814
Query 698 TGCACAGGAAGGACGTCCTCGGTGACTCGGAGGAGGAGGACATGGGGCTCCTGGAGGTCAGCGTTTCGGACATC 771
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 815 TGCACAGGAAGGACGTCCTCGGTGACTCGGAGGAGGAGGACATGGGGCTCCTGGAGGTCAGCGTTTCGGACATC 888
Query 772 AAGCCCCCAGCCCCAGAGCTGGGCCCCATGCCAGAGGGCCTGAGCCCTCAGCAGGTGGTCCGGAGGCATATCCT 845
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 889 AAGCCCCCAGCCCCAGAGCTGGGCCCCATGCCAGAGGGCCTGAGCCCTCAGCAGGTGGTCCGGAGGCATATCCT 962
Query 846 GGGCTCCATCGTGCAGAGCGAAGGCAGCTACGTGGAGTCTCTGAAGCGGATACTCCAGGACTACCGCAACCCCC 919
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 963 GGGCTCCATCGTGCAGAGCGAAGGCAGCTACGTGGAGTCTCTGAAGCGGATACTCCAGGACTACCGCAACCCCC 1036
Query 920 TGATGGAGATGGAGCCCAAGGCGCTGAGCGCCCGCAAGTGCCAGGTGGTGTTCTTCCGCGTGAAGGAGATCCTG 993
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037 TGATGGAGATGGAGCCCAAGGCGCTGAGCGCCCGCAAGTGCCAGGTGGTGTTCTTCCGCGTGAAGGAGATCCTG 1110
Query 994 CACTGCCACTCCATGTTCCAGATCGCCCTGTCCTCCCGCGTGGCTGAGTGGGATTCCACCGAGAAGATCGGGGA 1067
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111 CACTGCCACTCCATGTTCCAGATCGCCCTGTCCTCCCGCGTGGCTGAGTGGGATTCCACCGAGAAGATCGGGGA 1184
Query 1068 CCTCTTCGTGGCCTCGTTTTCCAAGTCCATGGTGCTAGATGTGTACAGTGACTACGTGAACAACTTCACCAGTG 1141
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185 CCTCTTCGTGGCCTCGTTTTCCAAGTCCATGGTGCTAGATGTGTACAGTGACTACGTGAACAACTTCACCAGTG 1258
Query 1142 CCATGTCCATCATCAAGAAGGCCTGCCTCACCAAGCCTGCCTTCCTCGAGTTCCTCAAGCGACGGCAGGTGTGC 1215
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259 CCATGTCCATCATCAAGAAGGCCTGCCTCACCAAGCCTGCCTTCCTCGAGTTCCTCAAGCGACGGCAGGTGTGC 1332
Query 1216 AGCCCAGACCGTGTCACCCTCTACGGGCTGATGGTCAAGCCCATCCAGAGGTTCCCACAGTTCATACTCCTGCT 1289
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333 AGCCCAGACCGTGTCACCCTCTACGGGCTGATGGTCAAGCCCATCCAGAGGTTCCCACAGTTCATACTCCTGCT 1406
Query 1290 TCAGGACATGCTGAAGAACACCCCCAGGGGCCATCCGGACAGGCTGTCGCTGCAGCTGGCCCTCACAGAGCTGG 1363
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407 TCAGGACATGCTGAAGAACACCCCCAGGGGCCATCCGGACAGGCTGTCGCTGCAGCTGGCCCTCACAGAGCTGG 1480
Query 1364 AGACGCTGGCTGAGAAGCTGAACGAGCAGAAGCGGCTGGCTGACCAGGTGGCTGAGATCCAGCAGCTGACCAAG 1437
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481 AGACGCTGGCTGAGAAGCTGAACGAGCAGAAGCGGCTGGCTGACCAGGTGGCTGAGATCCAGCAGCTGACCAAG 1554
Query 1438 AGCGTCAGTGACCGCAGCAGCCTCAACAAGCTGTTGACCTCAGGCCAGCGGCAGCTGCTCCTGTGTGAGACGTT 1511
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555 AGCGTCAGTGACCGCAGCAGCCTCAACAAGCTGTTGACCTCAGGCCAGCGGCAGCTGCTCCTGTGTGAGACGTT 1628
Query 1512 GACGGAGACCGTGTACGGTGACCGCGGGCAGCTAATTAAGTCCAAGGAGCGTCGGGTCTTCCTGCTCAACGACA 1585
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629 GACGGAGACCGTGTACGGTGACCGCGGGCAGCTAATTAAGTCCAAGGAGCGTCGGGTCTTCCTGCTCAACGACA 1702
Query 1586 TGCTTGTCTGTGCCAACATCAACTTCAAGCCTGCCAACCACAGGGGCCAGCTGGAGATCAGCAGCCTGGTGCCC 1659
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703 TGCTTGTCTGTGCCAACATCAACTTCAAGCCTGCCAACCACAGGGGCCAGCTGGAGATCAGCAGCCTGGTGCCC 1776
Query 1660 CTGGGGCCCAAGTATGTGGTGAAGTGGAACACGGCGCTGCCCCAGGTGCAGGTGGTGGAGGTGGGCCAGGACGG 1733
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777 CTGGGGCCCAAGTATGTGGTGAAGTGGAACACGGCGCTGCCCCAGGTGCAGGTGGTGGAGGTGGGCCAGGACGG 1850
Query 1734 TGGCACCTATGACAAGGACAATGTGCTCATCCAGCACTCAGGCGCCAAGAAGGCCTCTGCCTCAGGGCAGGCTC 1807
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1851 TGGCACCTATGACAAGGACAATGTGCTCATCCAGCACTCAGGCGCCAAGAAGGCCTCTGCCTCAGGGCAGGCTC 1924
Query 1808 AGAATAAGGTGTACCTCGGCCCCCCACGCCTCTTCCAGGAGCTGCAGGACCTGCAGAAGGACCTGGCCGTGGTG 1881
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1925 AGAATAAGGTGTACCTCGGCCCCCCACGCCTCTTCCAGGAGCTGCAGGACCTGCAGAAGGACCTGGCCGTGGTG 1998
Query 1882 GAGCAGATCACGCTTCTCATCAGCACGCTGCACGGCACCTACCAGAACCTGAACATGACTGTGGCTCAAGACTG 1955
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1999 GAGCAGATCACGCTTCTCATCAGCACGCTGCACGGCACCTACCAGAACCTGAACATGACTGTGGCTCAAGACTG 2072
Query 1956 GTGCCTGGCCCTGCAGAGGCTGATGCGGGTGAAGGAGGAAGAGATCCACTCGGCCAACAAGTGCCGTCTCAGGC 2029
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2073 GTGCCTGGCCCTGCAGAGGCTGATGCGGGTGAAGGAGGAAGAGATCCACTCGGCCAACAAGTGCCGTCTCAGGC 2146
Query 2030 TCCTGCTTCCTGGGAAACCCGACAAGTCCGGCCGCCCCATTAGCTTCATGGTGGTTTTCATCACCCCCAACCCC 2103
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2147 TCCTGCTTCCTGGGAAACCCGACAAGTCCGGCCGCCCCATTAGCTTCATGGTGGTTTTCATCACCCCCAACCCC 2220
Query 2104 CTGAGCAAGATTTCCTGGGTCAACAGGTTACATTTGGCCAAAATCGGACTCCGGGAGGAGAACCAGCCAGGCTG 2177
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2221 CTGAGCAAGATTTCCTGGGTCAACAGGTTACATTTGGCCAAAATCGGACTCCGGGAGGAGAACCAGCCAGGCTG 2294
Query 2178 GCTATGCCCGGATGAGGACAAGAAGAGCAAAGCCCCATTCTGGTGCCCGATCCTGGCCTGCTGCATCCCTGCCT 2251
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2295 GCTATGCCCGGATGAGGACAAGAAGAGCAAAGCCCCATTCTGGTGCCCGATCCTGGCCTGCTGCATCCCTGCCT 2368
Query 2252 TCTCCTCCCGGGCACTCAGCCTGCAGCTTGGGGCCCTGGTCCACAGTCCTGTCAACTGTCCCCTGCTGGGTTTC 2325
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2369 TCTCCTCCCGGGCACTCAGCCTGCAGCTTGGGGCCCTGGTCCACAGTCCTGTCAACTGTCCCCTGCTGGGTTTC 2442
Query 2326 TCAGCCGTCAGCACCTCCCTTCCACAGGGCTACCTCTGGGTCGGGGGCGGACAGGAAGGCGCAGGGGGCCAGGT 2399
|||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2443 TCAGCAGTCAGCACCTCCCTTCCACAGGGCTACCTCTGGGTCGGGGGCGGACAGGAAGGCGCAGGGGGCCAGGT 2516
Query 2400 GGAAATCTTTTCCTTGAACCGGCCCTCGCCCCGCACCGTCAAGTCCTTCCCACTGGCAGCCCCTGTGCTCTGCA 2473
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2517 GGAAATCTTTTCCTTGAACCGGCCCTCGCCCCGCACCGTCAAGTCCTTCCCACTGGCAGCCCCTGTGCTCTGCA 2590
Query 2474 TGGAGTATATCCCGGAGCTGGAGGAGGAGGCGGAGAGCAGAGACGAGAGCCCGACAGTTGCTGACCCCTCGGCC 2547
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2591 TGGAGTATATCCCGGAGCTGGAGGAGGAGGCGGAGAGCAGAGACGAGAGCCCGACAGTTGCTGACCCCTCGGCC 2664
Query 2548 ACGGTGCATCCAACCATCTGCCTCGGGCTCCAGGATGGCAGCATCCTCCTCTACAGCAGTGTGGACACTGGCAC 2621
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2665 ACGGTGCATCCAACCATCTGCCTCGGGCTCCAGGATGGCAGCATCCTCCTCTACAGCAGTGTGGACACTGGCAC 2738
Query 2622 CCAGTGCCTGGTGAGCTGCAGGAGCCCAGGTCTGCAGCCTGTGCTCTGCCTGCGACACAGCCCCTTCCACCTGC 2695
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2739 CCAGTGCCTGGTGAGCTGCAGGAGCCCAGGTCTGCAGCCTGTGCTCTGCCTGCGACACAGCCCCTTCCACCTGC 2812
Query 2696 TCGCTGGCCTGCAGGATGGGACCCTTGCTGCTTACCCTCGGACCAGCGGAGGTGTCCTGTGGGACCTGGAGAGC 2769
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2813 TCGCTGGCCTGCAGGATGGGACCCTTGCTGCTTACCCTCGGACCAGCGGAGGTGTCCTGTGGGACCTGGAGAGC 2886
Query 2770 CCTCCCGTGTGCCTGACTGTGGGGCCCGGGCCTGTCCGCACCCTGTTGAGCCTGGAGGATGCCGTGTGGGCCAG 2843
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2887 CCTCCCGTGTGCCTGACTGTGGGGCCCGGGCCTGTCCGCACCCTGTTGAGCCTGGAGGATGCCGTGTGGGCCAG 2960
Query 2844 CTGTGGGCCCCGGGTCACTGTCCTGGAAGCCACCACCCTGCAGCCTCAGCAAAGCTTCGAGGCGCACCAGGACG 2917
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2961 CTGTGGGCCCCGGGTCACTGTCCTGGAAGCCACCACCCTGCAGCCTCAGCAAAGCTTCGAGGCGCACCAGGACG 3034
Query 2918 AGGCAGTGAGCGTGACACACATGGTGAAGGCGGGCAGCGGCGTCTGGATGGCCTTCTCCTCCGGCACCTCCATC 2991
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3035 AGGCAGTGAGCGTGACACACATGGTGAAGGCGGGCAGCGGCGTCTGGATGGCCTTCTCCTCCGGCACCTCCATC 3108
Query 2992 CGCCTCTTCCACACTGAGACCCTGGAGCATCTGCAAGAGATCAACATCGCCACCAGGACCACCTTCCTCCTGCC 3065
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3109 CGCCTCTTCCACACTGAGACCCTGGAGCATCTGCAAGAGATCAACATCGCCACCAGGACCACCTTCCTCCTGCC 3182
Query 3066 AGGCCAGAAGCACTTGTGTGTCACCAGCCTCCTGATCTGCCAGGGTCTGCTCTGGGTGGGCACTGACCAGGGTG 3139
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3183 AGGCCAGAAGCACTTGTGTGTCACCAGCCTCCTGATCTGCCAGGGTCTGCTCTGGGTGGGCACTGACCAGGGTG 3256
Query 3140 TCATCGTCCTGCTGCCCGTGCCTCGGCTGGAAGGCATCCCCAAGATCACAGGGAAAGGCATGGTCTCACTCAAT 3213
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.
Sbjct 3257 TCATCGTCCTGCTGCCCGTGCCTCGGCTGGAAGGCATCCCCAAGATCACAGGGAAAGGCATGGTCTCACTCAAC 3330
Query 3214 GGGCACTGTGGGCCTGTGGCCTTCCTGGCTGTGGCTACCAGCATCCTGGCCCCTGACATCCTGCGGAGTGACCA 3287
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3331 GGGCACTGTGGGCCTGTGGCCTTCCTGGCTGTGGCTACCAGCATCCTGGCCCCTGACATCCTGCGGAGTGACCA 3404
Query 3288 GGAGGAGGCTGAGGGGCCCCGGGCTGAGGAGGACAAGCCAGACGGGCAGGCACACGAGCCCATGCCCGACAGCC 3361
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||
Sbjct 3405 GGAGGAGGCTGAGGGGCCCCGGGCTGAGGAGGACAAGCCAGACGGGCAGGCACACGAGCCCATGCCCGATAGCC 3478
Query 3362 ACGTGGGCCGAGAGCTGACCCGCAAGAAGGGCATCCTCTTGCAGTACCGCCTGCGCTCCACCGCACACCTCCCG 3435
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3479 ACGTGGGCCGAGAGCTGACCCGCAAGAAGGGCATCCTCTTGCAGTACCGCCTGCGCTCCACCGCACACCTCCCG 3552
Query 3436 GGCCCGCTGCTCTCCATGCGGGAGCCGGCGCCTGCTGATGGCGCAGCTTTGGAGCACAGCGAGGAGGACGGCTC 3509
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3553 GGCCCGCTGCTCTCCATGCGGGAGCCGGCGCCTGCTGATGGCGCAGCTTTGGAGCACAGCGAGGAGGACGGCTC 3626
Query 3510 CATTTACGAGATGGCCGACGACCCCGACGTCTGGGTGCGCAGCCGGCCCTGCGCCCGCGACGCCCACCGCAAGG 3583
||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3627 CATTTACGAGATGGCCGACGACCCCGACATCTGGGTGCGCAGCCGGCCCTGCGCCCGCGACGCCCACCGCAAGG 3700
Query 3584 AGATTTGCTCTGTGGCCATCATCTCCGGCGGGCAGGGCTACCGCAACTTTGGCAGCGCTCTGGGCAGCAGTGGG 3657
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3701 AGATTTGCTCTGTGGCCATCATCTCCGGCGGGCAGGGCTACCGCAACTTTGGCAGCGCTCTGGGCAGCAGTGGG 3774
Query 3658 AGGCAGGCCCCGTGTGGGGAGACGGACAGCACCCTCCTCATCTGGCAGGTGCCCTTGATGCTA 3720
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3775 AGGCAGGCCCCGTGTGGGGAGACGGACAGCACCCTCCTCATCTGGCAGGTGCCCTTGATGCTA 3837