Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000468535
• Subject: XR_001737276.1
• Aligned Length: 3969
• Identities: 3356
• Gaps: 536

Alignment

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct    1  ACTGGGCTGAAGCACAGGTTGTGAGCCAGTGACTTGTCTCAGTAGCTGAAACTGCAGCCCTGACTCCAGCTAAT  74

Query    1  --------------------------------------------------------------------ATGGCT  6
                                                                                ||||||
Sbjct   75  GCGATTTCTGGTCTTCTTTCCACAGGTGTGTAGCTGGGACGGTGCTGGTCTGAGCTGGACCTTGTCTGATGGCT  148

Query    7  TCCTCCAACCCTCCTCCACAGCCTGCCATAGGAGATCAGCTGGTTCCAGGAGTCCCAGGCCCCTCCTCTGAGGC  80
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  TCCTCCAACCCTCCTCCACAGCCTGCCATAGGAGATCAGCTGGTTCCAGGAGTCCCAGGCCCCTCCTCTGAGGC  222

Query   81  AGAGGACGACCCAGGAGAGGCGTTTGAGTTTGATGACAGTGATGATGAAGAGGACACCAGCGCAGCCCTGGGCG  154
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  AGAGGACGACCCAGGAGAGGCGTTTGAGTTTGATGACAGTGATGATGAAGAGGACACCAGCGCAGCCCTGGGCG  296

Query  155  TCCCCAGCCTTGCTCCTGAGAGGGACACAGACCCCCCACTGATCCACTTGGACTCCATCCCTGTCACTGACCCA  228
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  TCCCCAGCCTTGCTCCTGAGAGGGACACAGACCCCCCACTGATCCACTTGGACTCCATCCCTGTCACTGACCCA  370

Query  229  GACCCAGCAGCTGCTCCACCCGGCACAGGGGTGCCAGCCTGGGTGAGCAATGGGGATGCAGCGGACGCAGCCTT  302
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  GACCCAGCAGCTGCTCCACCCGGCACAGGGGTGCCAGCCTGGGTGAGCAATGGGGATGCAGCGGACGCAGCCTT  444

Query  303  CTCCGGGGCCCGGCACTCCAGCTGGAAGCGGAAGAGTTCCCGTCGCATTGACCGGTTCACTTTCCCCGCCCTGG  376
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  CTCCGGGGCCCGGCACTCCAGCTGGAAGCGGAAGAGTTCCCGTCGCATTGACCGGTTCACTTTCCCCGCCCTGG  518

Query  377  AAGAGGATGTGATTTATGACGACGTCCCCTGCGAGAGCCCAGATGCGCATCAGCCCGGGGCAGAGAGGAACCTG  450
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  AAGAGGATGTGATTTATGACGACGTCCCCTGCGAGAGCCCAGATGCGCATCAGCCCGGGGCAGAGAGGAACCTG  592

Query  451  CTCTACGAGGATGCGCACCGGGCTGGGGCCCCTCGGCAGGCGGAGGACCTAGGCTGGAGCTCCAGTGAGTTCGA  524
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  CTCTACGAGGATGCGCACCGGGCTGGGGCCCCTCGGCAGGCGGAGGACCTAGGCTGGAGCTCCAGTGAGTTCGA  666

Query  525  GAGCTACAGCGAGGACTCGGGGGAGGAGGCCAAGCCGGAGGTCGAGGTCGAGCCCGCCAAGCACCGAGTGTCCT  598
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  GAGCTACAGCGAGGACTCGGGGGAGGAGGCCAAGCCGGAGGTCGAGGTCGAGCCCGCCAAGCACCGAGTGTCCT  740

Query  599  TCCAGCCCAAGATGACCCAGCTCATGAAGGCCGCCAAGAGCGGGACCAAGGATGGGCTGGAGAAGACACGGATG  672
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  TCCAGCCCAAGATGACCCAGCTCATGAAGGCCGCCAAGAGCGGGACCAAGGATGGGCTGGAGAAGACACGGATG  814

Query  673  GCCGTGATGCGCAAAGTCTCCTTCCTGCACAGGAAGGACGTCCTCGGTGACTCGGAGGAGGAGGACATGGGGCT  746
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  GCCGTGATGCGCAAAGTCTCCTTCCTGCACAGGAAGGACGTCCTCGGTGACTCGGAGGAGGAGGACATGGGGCT  888

Query  747  CCTGGAGGTCAGCGTTTCGGACATCAAGCCCCCAGCCCCAGAGCTGGGCCCCATGCCAGAGGGCCTGAGCCCTC  820
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  CCTGGAGGTCAGCGTTTCGGACATCAAGCCCCCAGCCCCAGAGCTGGGCCCCATGCCAGAGGGCCTGAGCCCTC  962

Query  821  AGCAGGTGGTCCGGAGGCATATCCTGGGCTCCATCGTGCAGAGCGAAGGCAGCTACGTGGAGTCTCTGAAGCGG  894
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  AGCAGGTGGTCCGGAGGCATATCCTGGGCTCCATCGTGCAGAGCGAAGGCAGCTACGTGGAGTCTCTGAAGCGG  1036

Query  895  ATACTCCAGGACTACCGCAACCCCCTGATGGAGATGGAGCCCAAGGCGCTGAGCGCCCGCAAGTGCCAGGTGGT  968
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  ATACTCCAGGACTACCGCAACCCCCTGATGGAGATGGAGCCCAAGGCGCTGAGCGCCCGCAAGTGCCAGGTGGT  1110

Query  969  GTTCTTCCGCGTGAAGGAGATCCTGCACTGCCACTCCATGTTCCAGATCGCCCTGTCCTCCCGCGTGGCTGAGT  1042
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  GTTCTTCCGCGTGAAGGAGATCCTGCACTGCCACTCCATGTTCCAGATCGCCCTGTCCTCCCGCGTGGCTGAGT  1184

Query 1043  GGGATTCCACCGAGAAGATCGGGGACCTCTTCGTGGCCTCGTTTTCCAAGTCCATGGTGCTAGATGTGTACAGT  1116
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  GGGATTCCACCGAGAAGATCGGGGACCTCTTCGTGGCCTCGTTTTCCAAGTCCATGGTGCTAGATGTGTACAGT  1258

Query 1117  GACTACGTGAACAACTTCACCAGTGCCATGTCCATCATCAAGAAGGCCTGCCTCACCAAGCCTGCCTTCCTCGA  1190
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  GACTACGTGAACAACTTCACCAGTGCCATGTCCATCATCAAGAAGGCCTGCCTCACCAAGCCTGCCTTCCTCGA  1332

Query 1191  GTTCCTCAAGCGACGGCAGGTGTGCAGCCCAGACCGTGTCACCCTCTACGGGCTGATGGTCAAGCCCATCCAGA  1264
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  GTTCCTCAAGCGACGGCAGGTGTGCAGCCCAGACCGTGTCACCCTCTACGGGCTGATGGTCAAGCCCATCCAGA  1406

Query 1265  GGTTCCCACAGTTCATACTCCTGCTTCAGGACATGCTGAAGAACACCCCCAGGGGCCATCCGGACAGGCTGTCG  1338
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  GGTTCCCACAGTTCATACTCCTGCTTCAGGACATGCTGAAGAACACCCCCAGGGGCCATCCGGACAGGCTGTCG  1480

Query 1339  CTGCAGCTGGCCCTCACAGAGCTGGAGACGCTGGCTGAGAAGCTGAACGAGCAGAAGCGGCTGGCTGACCAGGT  1412
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481  CTGCAGCTGGCCCTCACAGAGCTGGAGACGCTGGCTGAGAAGCTGAACGAGCAGAAGCGGCTGGCTGACCAGGT  1554

Query 1413  GGCTGAGATCCAGCAGCTGACCAAGAGCGTCAGTGACCGCAGCAGCCTCAACAAGCTGTTGACCTCAGGCCAGC  1486
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555  GGCTGAGATCCAGCAGCTGACCAAGAGCGTCAGTGACCGCAGCAGCCTCAACAAGCTGTTGACCTCAGGCCAGC  1628

Query 1487  GGCAGCTGCTCCTGTGTGAGACGTTGACGGAGACCGTGTACGGTGACCGCGGGCAGCTAATTAAGTCCAAGGAG  1560
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629  GGCAGCTGCTCCTGTGTGAGACGTTGACGGAGACCGTGTACGGTGACCGCGGGCAGCTAATTAAGTCCAAGGAG  1702

Query 1561  CGTCGGGTCTTCCTGCTCAACGACATGCTTGTCTGTGCCAACATCAACTTCAAGCCTGCCAACCACAGGGGCCA  1634
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703  CGTCGGGTCTTCCTGCTCAACGACATGCTTGTCTGTGCCAACATCAACTTCAAGCCTGCCAACCACAGGGGCCA  1776

Query 1635  GCTGGAGATCAGCAGCCTGGTGCCCCTGGGGCCCAAGTATGTGGTGAAGTGGAACACGGCGCTGCCCCAGGTGC  1708
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777  GCTGGAGATCAGCAGCCTGGTGCCCCTGGGGCCCAAGTATGTGGTGAAGTGGAACACGGCGCTGCCCCAGGTGC  1850

Query 1709  AGGTGGTGGAGGTGGGCCAGGACGGTGGCACCTATGACAAGGACAATGTGCTCATCCAGCACTCAGGCGCCAAG  1782
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1851  AGGTGGTGGAGGTGGGCCAGGACGGTGGCACCTATGACAAGGACAATGTGCTCATCCAGCACTCAGGCGCCAAG  1924

Query 1783  AAGGCCTCTGCCTCAGGGCAGGCTCAGAATAAGGTGTACCTCGGCCCCCCACGCCTCTTCCAGGAGCTGCAGGA  1856
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1925  AAGGCCTCTGCCTCAGGGCAGGCTCAGAATAAGGTGTACCTCGGCCCCCCACGCCTCTTCCAGGAGCTGCAGGA  1998

Query 1857  CCTGCAGAAGGACCTGGCCGTGGTGGAGCAGATCACGCTTCTCATCAGCACGCTGCACGGCACCTACCAGAACC  1930
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1999  CCTGCAGAAGGACCTGGCCGTGGTGGAGCAGATCACGCTTCTCATCAGCACGCTGCACGGCACCTACCAGAACC  2072

Query 1931  TGAACATGACTGTGGCTCAAGACTGGTGCCTGGCCCTGCAGAGGCTGATGCGGGTGAAGGAGGAAGAGATCCAC  2004
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2073  TGAACATGACTGTGGCTCAAGACTGGTGCCTGGCCCTGCAGAGGCTGATGCGGGTGAAGGAGGAAGAGATCCAC  2146

Query 2005  TCGGCCAACAAGTGCCGTCTCAGGCTCCTGCTTCCTGGGAAACCCGACAAGTCCGGCCGCCCCATTAGCTTCAT  2078
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2147  TCGGCCAACAAGTGCCGTCTCAGGCTCCTGCTTCCTGGGAAACCCGACAAGTCCGGCCGCCCCATTAGCTTCAT  2220

Query 2079  GGTGGTTTTCATCACCCCCAACCCCCTGAGCAAGATTTCCTGGGTCAACAGGTTACATTTGGCCAAAATCGGAC  2152
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2221  GGTGGTTTTCATCACCCCCAACCCCCTGAGCAAGATTTCCTGGGTCAACAGGTTACATTTGGCCAAAATCGGAC  2294

Query 2153  TCCGGGAGGAGAACCAGCCAGGCTGGCTATGCCCGGATGAGGACAAGAAGAGCAAAGCCCCATTCTGGTGCCCG  2226
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2295  TCCGGGAGGAGAACCAGCCAGGCTGGCTATGCCCGGATGAGGACAAGAAGAGCAAAGCCCCATTCTGGTGCCCG  2368

Query 2227  ATCCTGGCCTGCTGCATCCCTGCCTTCTCCTCCCGGGCACTCAGCCTGCAGCTTGGGGCCCTGGTCCACAGTCC  2300
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2369  ATCCTGGCCTGCTGCATCCCTGCCTTCTCCTCCCGGGCACTCAGCCTGCAGCTTGGGGCCCTGGTCCACAGTCC  2442

Query 2301  TGTCAACTGTCCCCTGCTGGGTTTCTCAGCCGTCAGCACCTCCCTTCCACAGGGCTACCTCTGGGTCGGGGGCG  2374
            ||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2443  TGTCAACTGTCCCCTGCTGGGTTTCTCAGCAGTCAGCACCTCCCTTCCACAGGGCTACCTCTGGGTCGGGGGCG  2516

Query 2375  GACAGGAAGGCGCAGGGGGCCAGGTGGAAATCTTTTCCTTGAACCGGCCCTCGCCCCGCACCGTCAAGTCCTTC  2448
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2517  GACAGGAAGGCGCAGGGGGCCAGGTGGAAATCTTTTCCTTGAACCGGCCCTCGCCCCGCACCGTCAAGTCCTTC  2590

Query 2449  CCACTGGCAGCCCCTGTGCTCTGCATGGAGTATATCCCGGAGCTGGAGGAGGAGGCGGAGAGCAGAGACGAGAG  2522
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2591  CCACTGGCAGCCCCTGTGCTCTGCATGGAGTATATCCCGGAGCTGGAGGAGGAGGCGGAGAGCAGAGACGAGAG  2664

Query 2523  CCCGACAGTTGCTGACCCCTCGGCCACGGTGCATCCAACCATCTGCCTCGGGCTCCAGGATGGCAGCATCCTCC  2596
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2665  CCCGACAGTTGCTGACCCCTCGGCCACGGTGCATCCAACCATCTGCCTCGGGCTCCAGGATGGCAGCATCCTCC  2738

Query 2597  TCTACAGCAGTGTGGACACTGGCACCCAGTGCCTGGTGAGCTGCAGGAGCCCAGGTCTGCAGCCTGTGCTCTGC  2670
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2739  TCTACAGCAGTGTGGACACTGGCACCCAGTGCCTGGTGAGCTGCAGGAGCCCAGGTCTGCAGCCTGTGCTCTGC  2812

Query 2671  CTGCGACACAGCCCCTTCCACCTGCTCGCTGGCCTGCAGGATGGGACCCTTGCTGCTTACCCTCGGACCAGCGG  2744
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2813  CTGCGACACAGCCCCTTCCACCTGCTCGCTGGCCTGCAGGATGGGACCCTTGCTGCTTACCCTCGGACCAGCGG  2886

Query 2745  AGGTGTCCTGTGGGACCTGGAGAGCCCTCCCGTGTGCCTGACTGTGGGGCCCGGGCCTGTCCGCACCCTGTTGA  2818
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2887  AGGTGTCCTGTGGGACCTGGAGAGCCCTCCCGTGTGCCTGACTGTGGGGCCCGGGCCTGTCCGCACCCTGTTGA  2960

Query 2819  GCCTGGAGGATGCCGTGTGGGCCAGCTGTGGGCCCCGGGTCACTGTCCTGGAAGCCACCACCCTGCAGCCTCAG  2892
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2961  GCCTGGAGGATGCCGTGTGGGCCAGCTGTGGGCCCCGGGTCACTGTCCTGGAAGCCACCACCCTGCAGCCTCAG  3034

Query 2893  CAAAGCTTCGAGGCGCACCAGGACGAGGCAGTGAGCGTGACACACATGGTGAAGGCGGGCAGCGGCGTCTGGAT  2966
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3035  CAAAGCTTCGAGGCGCACCAGGACGAGGCAGTGAGCGTGACACACATGGTGAAGGCGGGCAGCGGCGTCTGGAT  3108

Query 2967  GGCCTTCTCCTCCGGCACCTCCATCCGCCTCTTCCACACTGAGACCCTGGAGCATCTGCAAGAGATCAACATCG  3040
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3109  GGCCTTCTCCTCCGGCACCTCCATCCGCCTCTTCCACACTGAGACCCTGGAGCATCTGCAAGAGATCAACATCG  3182

Query 3041  CCACCAGGACCACCTTCCTCCTGCCAGGCCAGAAGCACTTGTGTGTCACCAGCCTCCTGATCTGCCAGGGTCTG  3114
            ||||||||||||||||||||||||||||                       ||||         .||||||.||
Sbjct 3183  CCACCAGGACCACCTTCCTCCTGCCAGG-----------------------GCCT---------GCAGGGTGTG  3224

Query 3115  CTCTGGGTGGGCACTGACCAGGGTGTCATCGTCCTGCTGCCCGTGCCTCGGCTGGAAG--GCATCCCCAAGATC  3186
            ||           .|||||      |||||                       .||||  |||  ||||    |
Sbjct 3225  CT-----------GTGACC------TCATC-----------------------TGAAGAAGCA--CCCA----C  3252

Query 3187  ACAGGGAAAGGCATGGTCTCACTCAATGGGCACTGTGGGCCTGTGGCCTTCCTGGCTGTGGCTACCAGCATCCT  3260
            ||                         |||||    ||.||||.||       |||||       |||||    
Sbjct 3253  AC-------------------------GGGCA----GGCCCTGAGG-------GGCTG-------CAGCA----  3279

Query 3261  GGCCCCTGACATCCTGCGGAGTGACCAGGAGGAGGCT-GAGGGGCCCCGGGCTGAGGAGGACAAGCCAGACGGG  3333
                              |||..|||..||.|...|| ||   ||||                           
Sbjct 3280  ------------------GAGCCACCTCGATGCCTCTCGA---GCCC---------------------------  3305

Query 3334  CAGGCACACGAGCCC-----ATGCC------CGACAGCCACGTGGGCCGAGAGCTGACCCGCAAGAAGGGCATC  3396
                |||.|| ||||     |||||      |..||.|.||    .||||    ||       |||||      
Sbjct 3306  ----CACCCG-GCCCTACTTATGCCTTCCATCTGCACCAAC----ACCGA----TG-------AGAAG------  3353

Query 3397  CTCTTGCAGTACCGCCTGCGCTCCACCGCACACCTCCCGGGCCCGCTGCTCTCCATGCGGGAGCCGGCGCCTGC  3470
              ||||||              ||.||.||..|.||||.||  ...|||||        |.|||.|||      
Sbjct 3354  --CTTGCA--------------CCTCCCCAGTCTTCCCTGG--TTTTGCTC--------GTAGCTGGC------  3395

Query 3471  TGATGGCGCAGCTTTGGAGCACAGCGAGGA--------GGACGGCTCCATTTACGAGATGGCCGACGACC---C  3533
               ||||       ||||.|.|.||..|||        ||||..| ||.||      .||.|.||.||||   |
Sbjct 3396  ---TGGC-------TGGATCCCTGCATGGATTGCCCTTGGACAAC-CCTTT------GTGCCGGATGACCTGGC  3452

Query 3534  CGACGT---CTGGGTGCGCAGCCGGCCCTGCGCCCGCGACGCCCACCG-CAAGGAGATTTGCTCTGTGG-----  3598
            ||.|||   .||.|.|||||                       |||.| |.|||.|.|.||| ||||||     
Sbjct 3453  CGCCGTGTATTGAGAGCGCA-----------------------CACAGACCAGGCGCTGTGC-CTGTGGTGTTC  3502

Query 3599  --CCATCAT--CTCCGGCGGGCAGGGCTACCGCAACTTT---------------------------GGCAGCGC  3641
              |||  ||  .||||...|||||      |.|.|||||                           ||.||.||
Sbjct 3503  CCCCA--ATGCATCCGTATGGCAG------CCCCACTTTACACAGGCGGAAACTGAGGCTGGTTAGGGGAGTGC  3568

Query 3642  TCTG-GGCAGCA----GTGG--------GAGGCAGGC------CCCGTGTGGGGAGACGGACAGCACCCTCCTC  3696
            ||.| .||||.|    ||||        .||||||||      |.|.||||       .|.||.||.||||||.
Sbjct 3569  TCAGCTGCAGGACCTCGTGGCCAGACCCCAGGCAGGCCAGAAGCACTTGTG-------TGTCACCAGCCTCCTG  3635

Query 3697  ATCTGGCAGG---TGCCCTTGATG----CTA----------------  3720
            |||||.||||   |||.||.|.||    ||.                
Sbjct 3636  ATCTGCCAGGGTCTGCTCTGGGTGGGCACTGACCAGGGTGTCATCGT  3682