Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000468708
• Subject: NM_001014424.2
• Aligned Length: 3538
• Identities: 2630
• Gaps: 506

Alignment

Query    1  ATGCGAGGTGGCAAATGCAACATGCTCTCCAGTTTGGGGTGTCTACTTCTCTGTGGAAGTATTACACTAGCCCT  74
                                 |||||||||||..|||||||||||||||||||||||||||||.||||.||.||
Sbjct    1  ---------------------ATGCTCTCCAGCCTGGGGTGTCTACTTCTCTGTGGAAGTATTGCACTTGCTCT  53

Query   75  GGGAAATGCACAGAAATTGCCAAAAGGTAAAAGGCCAAACCTCAAAGTCCACATCAATACCACAAGTGACTCCA  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.|.|.|||||.||||||||||||||.||.|||||||
Sbjct   54  GGGAAATGCACAGAAATTGCCAAAAGGTAAAAAGCCAAGCTTGAAAGTGCACATCAATACCACCAGCGACTCCA  127

Query  149  TCCTCTTGAAGTTCTTGCGTCCAAGTCCAAATGTAAAGCTTGAAGGTCTTCTCCTGGGATATGGCAGCAATGTA  222
            ||||||||||||||.|||||||||.|.||||.||||||||.||||||.|||||||||||||||||||||||||.
Sbjct  128  TCCTCTTGAAGTTCCTGCGTCCAAATGCAAACGTAAAGCTGGAAGGTTTTCTCCTGGGATATGGCAGCAATGTG  201

Query  223  TCACCAAACCAGTACTTCCCTCTTCCCGCTGAAGGGAAATTCACAGAAGCTATAGTTGATGCAGAGCCGAAATA  296
            ||.||||||||||||||||||||||||.|.|||||||||||||||||.|||.|||||||||||||||||||.||
Sbjct  202  TCTCCAAACCAGTACTTCCCTCTTCCCACAGAAGGGAAATTCACAGAGGCTGTAGTTGATGCAGAGCCGAAGTA  275

Query  297  TCTGATAGTTGTGCGACCTGCTCCACCTCCAAGTCAAAAGAAGTCATGTTCAGGTAAAACTCGTTCTCGCAAAC  370
            |||||||||.||.|||||||||||.|||||.||.||.|||||||||||||||||.|||.||||..|||||||||
Sbjct  276  TCTGATAGTCGTACGACCTGCTCCTCCTCCCAGCCAGAAGAAGTCATGTTCAGGGAAATCTCGCCCTCGCAAAC  349

Query  371  CTCTGCAGCTGGTGGTTGGCACTCTGACACCGAGCTCAGTCTTCCTGTCCTGGGGTTTCCTCATCAACCCACAC  444
            |.||.|||||||||||.||.||..||||||||||.||.|||||||||||||||||.||||||||||||||||||
Sbjct  350  CCCTCCAGCTGGTGGTGGGTACGTTGACACCGAGTTCTGTCTTCCTGTCCTGGGGATTCCTCATCAACCCACAC  423

Query  445  CATGACTGGACATTGCCAAGTCACTGTCCCAATGACAGATTTTATACAATTCGCTATCGAGAAAAGGATAAAGA  518
            ||||||||||||||||||||.||||||||||.|||||||||||||||||||||.|||.|||||||.||||||||
Sbjct  424  CATGACTGGACATTGCCAAGCCACTGTCCCAGTGACAGATTTTATACAATTCGATATAGAGAAAAAGATAAAGA  497

Query  519  AAAGAAGTGGATTTTTCAAATCTGTCCAGCCACTGAAACAATTGTGGAAAACCTAAAGCCCAACACAGTTTATG  592
            ||||||.||||||||||||.||||.|||||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||
Sbjct  498  AAAGAAATGGATTTTTCAACTCTGCCCAGCTACTGAAACAATTGTGGAAAATCTAAAGCCCAACACAGTTTATG  571

Query  593  AATTTGGAGTGAAAGACAATGTGGAAGGTGGAATTTGGAGTAAGATTTTCAATCACAAGACTGTTGTTGGAAGT  666
            |||||||.||||||||||||.|.||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||.|||||||||||
Sbjct  572  AATTTGGTGTGAAAGACAATATAGAAGGTGGAATTTGGAGTAAGATTTTCAATCATAAGACTATTGTTGGAAGT  645

Query  667  AAA---AAAGTAAATGGGAAAATCCAAAGTACCTATGACCAAGACCACACAGTGCCAGCATATGTCCCAAGGAA  737
            |||   ||||||||.||||||||||||||.||.||||||||.|.||||.||||||||      |||||.|||||
Sbjct  646  AAAAACAAAGTAAACGGGAAAATCCAAAGCACTTATGACCAGGTCCACTCAGTGCCA------GTCCCGAGGAA  713

Query  738  ACTAATCCCAATAACAATCATCAAGCAAGTGATTCAGAATGTTACTCACAAGGATTCAGCTAAATCCCCAGAAA  811
            .|||||||||.||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||||.||.||||.|.|||||||||||.|
Sbjct  714  GCTAATCCCACTAACGATCATTAAGCAAGTGATTCAGAATGTTACTCACAGGGCTTCAACCAAATCCCCAGACA  787

Query  812  AAGCTCCACTGGGAGGAGTGATACTAGTCCACCTTATTATTCCAGGTCTTAATGAAACTACTGTAAAACTTCCT  885
            |..||||..|.||.|||...|||.||||.||.||.||||||||.||||||||||||.|.||||||||||||||.
Sbjct  788  AGACTCCTTTTGGGGGAACAATATTAGTTCATCTGATTATTCCGGGTCTTAATGAATCCACTGTAAAACTTCCC  861

Query  886  GCATCCCTAATGTTTGAGATTTCAGATGCACTCAAGACACAATTAGCTAAGAATGAAACCTTGGCATTACCTGC  959
            .|||||.|||||.||||||||||.|||||.||||||.||||||||||||||||||||||.|||||.|||||.||
Sbjct  862  ACATCCATAATGCTTGAGATTTCCGATGCTCTCAAGGCACAATTAGCTAAGAATGAAACATTGGCTTTACCAGC  935

Query  960  CGAATCTAAAACACCAGAGGTTGAAAAAATCTCAGCACGACCCA-CAACAGTGACTCCTGAAACAGTTCCAAGA  1032
            .||||||||||||||||||||.||||||.|..|||..| |.||| .||||||||||||.|||.|||||.|||||
Sbjct  936  AGAATCTAAAACACCAGAGGTCGAAAAATTGGCAGGGC-AGCCAGTAACAGTGACTCCGGAATCAGTTTCAAGA  1008

Query 1033  AGCACTAAACCCACTACGTCTAGTGCATTAGA-----------------TGTT----------------TCAGA  1073
            ||||||||.|||||...|||||||||.|||||                 ||.|                |||||
Sbjct 1009  AGCACTAAGCCCACCCTGTCTAGTGCTTTAGACACTGCAGAGACAGCACTGGTCCTCAGTGAGAAGACGTCAGA  1082

Query 1074  AAC----------------------------------------AACACT-------------------------  1082
            |||                                        |.||||                         
Sbjct 1083  AACAGCCCGCTCTGTTCTAATACCTGAGTTTGAATTGCCCTTGAGCACTTTAGCTCCAAAAAGGTTCCCAGAGT  1156

Query 1083  -------------------------------------------------GGCTTCAAGTGAAAAGCCATGGATT  1107
                                                             ||||||||||||..||||||||.|.
Sbjct 1157  TTCCTGAGGCAAAAACAGCCTTCCCATTGGAGAAACCTAGGGGTTCCTGGGCTTCAAGTGAGGAGCCATGGGTG  1230

Query 1108  GTGCCTACAGCTAAAATATCTGAAGATTCCAAAGTTCTGCAGCCTCAAACTGCAACTTATGATGTTTTCTCAAG  1181
            ||.|||..||||||||.||||||||||||||.|||..|.|||||||||||||||||||||||||||.|||||||
Sbjct 1231  GTACCTGGAGCTAAAACATCTGAAGATTCCAGAGTCGTACAGCCTCAAACTGCAACTTATGATGTTATCTCAAG  1304

Query 1182  CCCTACAACATCAGATGAGCCTGAGATATCAGATTCCTACACAGCAACAAGTGATCGTATTCTGGATTCTATCC  1255
            |.|.|||||.||.||||||.||||.||| .||||||  |||||||||||||.||||.|||||||||.|||.|||
Sbjct 1305  CTCAACAACTTCTGATGAGACTGAAATA-GAGATTC--ACACAGCAACAAGAGATCCTATTCTGGACTCTGTCC  1375

Query 1256  CACCTAAAACTTCTAGAACTCTTGAACAGCCAAGGGCAACACTGGCTCCAAGTGAAACACCATTTG-TTCCTCA  1328
            ||||||||||||||||||||..|||||||||||||||||||||||||||||..|||.|...||||| .||| |.
Sbjct 1376  CACCTAAAACTTCTAGAACTGCTGAACAGCCAAGGGCAACACTGGCTCCAATCGAAGCGTTATTTGAATCC-CG  1448

Query 1329  AAAACTGGAAATCTTTACCAGTCCAGAAATGCAGCCTACGACACCTGCTCCCCAGCAAACTACATCTATCCCTT  1402
            |||..||||||||||.||||||||.|||.|||..|||||.||..|||||||.||||||||||||||||||||||
Sbjct 1449  AAATGTGGAAATCTTCACCAGTCCTGAAGTGCGACCTACAACGGCTGCTCCTCAGCAAACTACATCTATCCCTT  1522

Query 1403  CTACACCTAAACGACGCCCCCGGCCCAAACCGCCAAGAACCAAACCTGAAAGAACCACAAGTGCCGGAACAATT  1476
            |.|||||.|||||                                                       ||||| 
Sbjct 1523  CCACACCCAAACG-------------------------------------------------------ACAAT-  1540

Query 1477  ACACCTAAAATTTCTAAAAGCCCTGAACCTACATGGACAACACCGGCTCCCGGTAAAACACAATTTATTTCTCT  1550
                                                 |||||||                              
Sbjct 1541  -------------------------------------CAACACC------------------------------  1547

Query 1551  GAAACCTAAAATCCCTCTCAGCCCAGAAGTGACACACACCAAACCTGCTCCCAAGCAGAC-ACCA-CGTGCTCC  1622
            .|||||              |||.|| |||         |||.|||||.||||.|||||| |||| |.||  ||
Sbjct 1548  CAAACC--------------GCCAAG-AGT---------CAAGCCTGCACCCAGGCAGACAACCAGCATG--CC  1595

Query 1623  TCCTAAGC-CAAAAACATCACCACGCCCAAGAATCCCA-CAAACACAACCAGTTCCTAAGGTGCCCCAGCGTGT  1694
            |||.|||| |||||    ||||||.|.||||.||.||| |||| |.|.|||||||||||||..||||.||.|..
Sbjct 1596  TCCCAAGCTCAAAA----CACCACACTCAAGGATGCCAGCAAA-AGAGCCAGTTCCTAAGGAACCCCTGCATAC  1664

Query 1695  TACTGCAAAACCAAAAACGTCACCAAGTCCAGAAGTGTCATACACCACACCTGCTCCAAAAGATGTGCTCCTTC  1768
            .|||.||||.|||||||.|.||||||||||.||||||.||.||||.|||.|||.|||||||||||..|..|||.
Sbjct 1665  GACTTCAAAGCCAAAAATGCCACCAAGTCCTGAAGTGGCAGACACTACATCTGTTCCAAAAGATGAACGACTTT  1738

Query 1769  CTCATAAACCATACCCTGAGGTCTCTCAGAGCGAACCT------------------------------------  1806
            |.|.|||||||.|.||.||||||.||||.||.|||.||                                    
Sbjct 1739  CCCTTAAACCAGATCCAGAGGTCACTCACAGTGAAACTGTTCTGCCTCCTGTCACCTTTAGAGTTGAGCCACCA  1812

Query 1807  ------------GCTCCTCTAGAGACACGAGGCATCCCTTTTATACCCATGATTTCCCCAAGTCCTAGTCAAGA  1868
                        ||.|||.||||||||||.|||||.|||.|.|||||..|||||||.|||||.|||||||||||
Sbjct 1813  AAGACAACAATAGCACCTTTAGAGACACGGGGCATTCCTCTCATACCTGTGATTTCACCAAGACCTAGTCAAGA  1886

Query 1869  GGAACTACAGACCACTCTGGAAGAAACAGACCAATCCACCCAAGAACCTTTCACAACTAAGATTCCACGAACAA  1942
            |||||||||.|||.|..||||||||||||||||.||.||||||||.|..|||||.|||||||||||||||||||
Sbjct 1887  GGAACTACAAACCGCCATGGAAGAAACAGACCAGTCTACCCAAGAGCTCTTCACGACTAAGATTCCACGAACAA  1960

Query 1943  CTGAACTAGCAAAGACAACTCAGGCGCCACACAGATTTTATA---CTACTGTGAGGCCCAGAACATCTGACAAG  2013
            |||||.|.|||||||||||||||||.|||||||||||..|||   ||.|||||||||||||||.|.|||.||.|
Sbjct 1961  CTGAATTGGCAAAGACAACTCAGGCACCACACAGATTGCATACAGCTCCTGTGAGGCCCAGAATACCTGGCAGG  2034

Query 2014  CCACACATCAGACCTG--------------------------------------------GGG-----------  2032
            |||||...|||.||||                                            |||           
Sbjct 2035  CCACATGGCAGGCCTGCTCTGAACAAAACAACTACAAGGCCTGATAAAACCAAACCCAGAGGGACGTCCCATAA  2108

Query 2033  --------------------TCAAGCAAGCACCCAGGCCATCAGGTGCTGATAGAAATGTATCAGTGGACTCTA  2086
                                .||||||||||||.|.||||.||.||.|||..|||||||..||||||||   |.
Sbjct 2109  AAACGGAGTAGGAACAGGAACCAAGCAAGCACCTAAGCCACCAAGTCCTGGGAGAAATGCGTCAGTGGA---TT  2179

Query 2087  CCCACCCCACTAAAAAGC------------CAGGGACTCGCCGCCCACCCTTGCCACCCAGAC---------CT  2139
            |.||..||||.|.|||.|            |||||||.||.||.||||||.|.||||..||.|         ||
Sbjct 2180  CACATGCCACAAGAAAACCAGGCTCAGTCTCAGGGACGCGTCGTCCACCCATACCACATAGGCATTCGTCCACT  2253

Query 2140  ACACAC-------CCACGA-AGAAAACCTTTACCACCAAATAATGTCACTGGAAAGCCAGGAAGTGCAGGAATC  2205
            |.|| |       ||| || ||||..||||||||.||.|||||||||||.||.|||||||||.||||.|||||.
Sbjct 2254  AGAC-CTGTGTCTCCA-GAGAGAAGGCCTTTACCCCCGAATAATGTCACCGGGAAGCCAGGACGTGCGGGAATT  2325

Query 2206  ATTTCATCAGGCCCAATAACTACACCACCCCTGAGGTCAACAC-CCAGGCCTACTGGAACTCCCTTGGAGAGAA  2278
            .||||.||..|||...||||..|.||||||||||.|.|||||| ||| .||||..|||||..||...|.||||.
Sbjct 2326  GTTTCCTCCAGCCGGGTAACGTCCCCACCCCTGAAGGCAACACTCCA-CCCTATCGGAACAGCCACAGCGAGAC  2398

Query 2279  TAGAGACAGATATAAAGCAACCAACAGTTCCTGCCTCTGGAGAAGAACTGGAAAATATAACTGACTTTAGCTCA  2352
            .||.|.||||...||||.|||||||.|.||||||.||.|.||||||..|.|..|.||.|||||||||.||.|||
Sbjct 2399  CAGGGGCAGAACAAAAGGAACCAACTGCTCCTGCTTCAGAAGAAGAGTTTGGTACTACAACTGACTTCAGTTCA  2472

Query 2353  AG-CCCAACAAGAGAAACTGATCCTCTTGGGAAGCCAAGATTCAAAGGACCTCATGTGCGATACATCCAAAAGC  2425
            || ||||.||| ||||||||||||.|||||||||||.||.||||.|||.||.|||||||||||.||||.|||||
Sbjct 2473  AGTCCCACCAA-AGAAACTGATCCCCTTGGGAAGCCCAGGTTCATAGGTCCCCATGTGCGATATATCCCAAAGC  2545

Query 2426  CTGACAACAGTCCCTGCTCCATTACTGACTCTGTCAAACGGTTCCCCAAAGAGGAGGCCACAGAGGGGAATGCC  2499
            ||||.||||..|||||.|||||.||||||||.||||.|||||||||.|.||||||.|||||.||||||||||||
Sbjct 2546  CTGAAAACAAGCCCTGTTCCATCACTGACTCAGTCAGACGGTTCCCTACAGAGGAAGCCACGGAGGGGAATGCC  2619

Query 2500  ACCAGCCCACCACAGAACCCACCCACCAACCTCACTGTGGTCACCGTGGAAGGGTGCCCCTCATTTGTCATCTT  2573
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||.||||||||||||||||||||
Sbjct 2620  ACCAGCCCACCACAGAACCCACCCACCAACCTCACTGTGGTCACTGTCGAAGGCTGCCCCTCATTTGTCATCTT  2693

Query 2574  GGACTGGGAAAAGCCACTAAATGACACTGTCACTGAATATGAAGTTATATCCAGAGAAAATGGGTCATTCAGTG  2647
            ||||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2694  GGACTGGGAAAAACCTCTAAATGACACTGTCACTGAATATGAAGTCATATCCAGAGAAAATGGGTCATTCAGTG  2767

Query 2648  GGAAGAACAAGTCCATTCAAATGACAAATCAGACATTTTCCACAGTAGAAAATCTGAAACCAAACACGAGTTAT  2721
            ||||||||||||||||||||||.||.|||||.||.||.||.|||||||||||.|||||||||.|.||.||.|||
Sbjct 2768  GGAAGAACAAGTCCATTCAAATTACCAATCAAACGTTCTCTACAGTAGAAAACCTGAAACCAGATACAAGCTAT  2841

Query 2722  GAATTCCAGGTGAAACCCAAAAACCCGCTTGGTGAAGGCCCGGTCAGCAACACAGTGGCATTCAGTACTGAATC  2795
            |||||||||||||||||||||||.||.||||||||.|||||.|.|||||||||.||.||.||||||||||||||
Sbjct 2842  GAATTCCAGGTGAAACCCAAAAATCCACTTGGTGAGGGCCCCGCCAGCAACACGGTAGCGTTCAGTACTGAATC  2915

Query 2796  AGCGGACCCAAGAGTGAGTGAGCCAGTTTCTGCAGGAAGAGATGCCATCTGGACTGAAAGACCCTTTAATTCAG  2869
            |||.|||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||
Sbjct 2916  AGCTGACCCAAGAGTGAGTGAGCCAATTTCTGCAGGAAGAGATGCCATCTGGACTGAAAGACCTTTTAACTCAG  2989

Query 2870  ACTCTTACTCAGAGTGTAAGGGCAAACAATATGTCAAAAGGACATGGTATAAAAAATTTGTAGGAGTGCAGCTG  2943
            |||||||||||||.||.||.||||||||.|||||.||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||.
Sbjct 2990  ACTCTTACTCAGAATGCAAAGGCAAACAGTATGTTAAAAGGACGTGGTATAAAAAATTTGTCGGAGTGCAGCTA  3063

Query 2944  TGCAACTCTCTCAGATACAAGATTTACTTGAGCGACTCCCTCACAGGAAAATTTTATAACATAGGTGATCAGAG  3017
            ||.|||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||.||.|||||.||||||||.||||||||
Sbjct 3064  TGTAACTCTCTCAGATACAAGATTTATTTGAGCGATTCCCTCACAGGCAAGTTTTACAACATAGGAGATCAGAG  3137

Query 3018  GGGCCATGGAGAAGATCACTGCCAGTTTGTGGATTCATTTTTAGATGGACGCACTGGGCAGCAACTCACTTCTG  3091
            ||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||.|||||||||||.||||
Sbjct 3138  GGGCCACGGAGAAGATCACTGCCAGTTTGTGGATTCATTTTTAGATGGTCGCACAGGACAGCAACTCACCTCTG  3211

Query 3092  ACCAGTTACCAATCAAAGAAGGTTATTTCAGAGCAGTTCGCCAGGAACCTGTCCAATTTGGAGAAATAGGTGGT  3165
            |.||||||||.|.|||||||||.|||||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3212  AACAGTTACCCACCAAAGAAGGCTATTTCAGAGCTGTTCGTCAGGAACCTGTCCAATTTGGAGAAATAGGTGGT  3285

Query 3166  CACACCCAAATCAATTATGTTCAGTGGTATGAATGTGGGACTACAATTCCTGGAAAATGG  3225
            ||.|||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||.||||||||||||
Sbjct 3286  CATACCCAAATCAATTATGTCCAGTGGTATGAATGTGGGACCACAATACCTGGAAAATGG  3345