Protein Global Alignment

Description

Query:
TRCN0000468708
Subject:
XM_006522255.2
Aligned Length:
1629
Identities:
871
Gaps:
565

Alignment

Query    1  MRGGKCNMLSSLGCLLLCGSITLALGNAQKLPKGKRPNLKVHINTTSDSILLKFLRPSPNVKLEGLLLGYGSNV  74
                   ||||||||||||||.|||||||||||||.|.|||||||||||||||||||..||||||.||||||||
Sbjct    1  -------MLSSLGCLLLCGSIALALGNAQKLPKGKKPSLKVHINTTSDSILLKFLRPNANVKLEGFLLGYGSNV  67

Query   75  SPNQYFPLPAEGKFTEAIVDAEPKYLIVVRPAPPPSQKKSCSGKTRSRKPLQLVVGTLTPSSVFLSWGFLINPH  148
            |||||||||.|||||||.||||||||||||||||||||||||||.|.|||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   68  SPNQYFPLPTEGKFTEAVVDAEPKYLIVVRPAPPPSQKKSCSGKSRPRKPLQLVVGTLTPSSVFLSWGFLINPH  141

Query  149  HDWTLPSHCPNDRFYTIRYREKDKEKKWIFQICPATETIVENLKPNTVYEFGVKDNVEGGIWSKIFNHKTVVGS  222
            ||||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||.|||
Sbjct  142  HDWTLPSHCPSDRFYTIRYREKDKEKKWIFQLCPATETIVENLKPNTVYEFGVKDNIEGGIWSKIFNHKTIVGS  215

Query  223  K-KVNGKIQSTYDQDHTVPAYVPRKLIPITIIKQVIQNVTHKDSAKSPEKAPLGGVILVHLIIPGLNETTVKLP  295
            | ||||||||||||.|.||  |||||||.||||||||||||..|.|||.|.|.||.||||||||||||.|||||
Sbjct  216  KNKVNGKIQSTYDQVHSVP--VPRKLIPLTIIKQVIQNVTHRASTKSPDKTPFGGTILVHLIIPGLNESTVKLP  287

Query  296  ASLMFEISDALKTQLAKNETLALPAESKTPEVEKISARPTTVTPETVPRSTKPTTSSALDVSETTL--------  361
            .|.|.|||||||.|||||||||||||||||||||....|.|||||.|.||||||.|||||..||.|        
Sbjct  288  TSIMLEISDALKAQLAKNETLALPAESKTPEVEKLAGQPVTVTPESVSRSTKPTLSSALDTAETALVLSEKTSE  361

Query  362  -----------------------------------------ASSEKPWIVPTAKISEDSKVLQPQTATYDVFSS  394
                                                     ||||.||.||.||.||||.|.|||||||||.||
Sbjct  362  TARSVLIPEFELPLSTLAPKRFPEFPEAKTAFPLEKPRGSWASSEEPWVVPGAKTSEDSRVVQPQTATYDVISS  435

Query  395  PTTSDEPEISDSYTATSDRILDSIPPKTSRTLEQPRATLAPSETPFVPQKLEIFTSPEMQPTTPAPQQTTSIPS  468
            .|||||.|| ...|||.|.||||.|||||||.|||||||||.|..|.....|||||||..|||.||||||||||
Sbjct  436  STTSDETEI-EIHTATRDPILDSVPPKTSRTAEQPRATLAPIEALFESRNVEIFTSPEVRPTTAAPQQTTSIPS  508

Query  469  TPKRRPRPKPPRTKP---------ERTTSA--------------------------------GTITPKI-----  496
            ||||...|||||.||         ..||.|                                .|.||.|     
Sbjct  509  TPKRQSTPKPPRVKPAPEPETRPSAQTTKAPRKTKKPGHHRLRRPKTTRSPEVPKSKPALEPATVTPEILVPKI  582

Query  497  -----------------------------SKSP-----------------------------------------  500
                                         |..|                                         
Sbjct  583  VPKPPQKPKATRRPEVPQVKPAHEPVTFGSEAPALAIVTTTDIEPVITRTKASVTTLAPKPPRPRTHRQRTKYK  656

Query  501  ---------------------------------------------------------EPTWTTPAPGKT-----  512
                                                                     ||...|.|||.|     
Sbjct  657  TTQSPKIPHSKPADLGPITSEPPLASTTKKVRRPRPKPQTTPHPEVPHTILVPATSLEPFIITEAPGTTLVPKL  730

Query  513  --------------------------------------------------------------------------  512
                                                                                      
Sbjct  731  PQQPDYPHPKPKTTRSPAASPTELVPTPVFEPVTPLKEDPVTTIVPITDLERVTDLETPVAFRTEAPGTTLASK  804

Query  513  -----------------------------------------QFISLKPKIPL----------------------  523
                                                     ....|.|....                      
Sbjct  805  ISQRTHRPRPRPRPRPRPRPRPKATLSPQAPETKTVPAVVLEPVTLRPEVQVTTLAPQKTQKKHRPSPKPKPVP  878

Query  524  SPEVTHTKPA---PKQTPRAPPKPKTSPRP--------------------------------------------  550
            |||||..|||   ||.|.|..|||.|.|.|                                            
Sbjct  879  SPEVTESKPAPKTPKRTRRPRPKPQTTPTPETPLTKPVAATDLEPSALSTEVPATVVLATALTPVTLRTKAPKT  952

Query  551  --------------------------------------------------------------------------  550
                                                                                      
Sbjct  953  TTLAPNVQRTRRPHPRPKTTASTGVSESKSAPTELQSLVLKPVTSPSLEIIQSQSVSDDLELVAFSTESPQKTI  1026

Query  551  -----------------RIPQTQPVPKVPQRVTAKPKTSPSPEVSYTTPAPKDVLLPHKPYPEVSQSEP-----  602
                             |.|...||||.|...|.|||..|||||..||..|||..|..||.|||..||.     
Sbjct 1027  APRQTTSMPPKLKTPHSRMPAKEPVPKEPLHTTSKPKMPPSPEVADTTSVPKDERLSLKPDPEVTHSETVLPPV  1100

Query  603  -----------APLETRGIPFIPMISPSPSQEELQTTLEETDQSTQEPFTTKIPRTTELAKTTQAPHRFYTT-V  664
                       |||||||||.||.|||.||||||||..|||||||||.||||||||||||||||||||..|. |
Sbjct 1101  TFRVEPPKTTIAPLETRGIPLIPVISPRPSQEELQTAMEETDQSTQELFTTKIPRTTELAKTTQAPHRLHTAPV  1174

Query  665  RPRTSDKPHIRP-------------------------GVKQAPRPSGADRNVSVDSTHPTKKP----GTRRPPL  709
            |||....||.||                         |.||||.|....||.|||| |.|.||    ||||||.
Sbjct 1175  RPRIPGRPHGRPALNKTTTRPDKTKPRGTSHKNGVGTGTKQAPKPPSPGRNASVDS-HATRKPGSVSGTRRPPI  1247

Query  710  P-----PRPTHPRRKPLPPNNVTGKPGSAGIISSGPITTPPLRSTPRPTGTPLERIETDIKQPTVPASGEELEN  778
            |     .||..|.|.||||||||||||.|||.||...|.|||..|..|.||...|.....|.||.|||.||...
Sbjct 1248  PHRHSSTRPVSPERRPLPPNNVTGKPGRAGIVSSSRVTSPPLKATLHPIGTATARPGAEQKEPTAPASEEEFGT  1321

Query  779  ITDFSSSPTRETDPLGKPRFKGPHVRYIQKPDNSPCSITDSVKRFPKEEATEGNATSPPQNPPTNLTVVTVEGC  852
            .||||||||.||||||||||.|||||||.||.|.||||||||.|||.|||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1322  TTDFSSSPTKETDPLGKPRFIGPHVRYIPKPENKPCSITDSVRRFPTEEATEGNATSPPQNPPTNLTVVTVEGC  1395

Query  853  PSFVILDWEKPLNDTVTEYEVISRENGSFSGKNKSIQMTNQTFSTVENLKPNTSYEFQVKPKNPLGEGPVSNTV  926
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||.|||||||||||||||||.||||
Sbjct 1396  PSFVILDWEKPLNDTVTEYEVISRENGSFSGKNKSIQITNQTFSTVENLKPDTSYEFQVKPKNPLGEGPASNTV  1469

Query  927  AFSTESADPRVSEPVSAGRDAIWTERPFNSDSYSECKGKQYVKRTWYKKFVGVQLCNSLRYKIYLSDSLTGKFY  1000
            ||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1470  AFSTESADPRVSEPISAGRDAIWTERPFNSDSYSECKGKQYVKRTWYKKFVGVQLCNSLRYKIYLSDSLTGKFY  1543

Query 1001  NIGDQRGHGEDHCQFVDSFLDGRTGQQLTSDQLPIKEGYFRAVRQEPVQFGEIGGHTQINYVQWYECGTTIPGK  1074
            ||||||||||||||||||||||||||||||.|||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1544  NIGDQRGHGEDHCQFVDSFLDGRTGQQLTSEQLPTKEGYFRAVRQEPVQFGEIGGHTQINYVQWYECGTTIPGK  1617

Query 1075  W  1075
            |
Sbjct 1618  W  1618