Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000468783
• Subject: NM_001350532.1
• Aligned Length: 2901
• Identities: 2678
• Gaps: 222

Alignment

Query    1  ATGGTGCCCTGGGTGCGGACGATGGGGCAGAAGCTGAAGCAGCGGCTGCGACTGGACGTGGGACGCGAGATCTG  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGTGCCCTGGGTGCGGACGATGGGGCAGAAGCTGAAGCAGCGGCTGCGACTGGACGTGGGACGCGAGATCTG  74

Query   75  CCGCCAGTACCCGCTGTTCTGCTTCCTGCTGCTCTGTCTCAGCGCCGCCTCCCTGCTTCTTAA-----------  137
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||           
Sbjct   75  CCGCCAGTACCCGCTGTTCTGCTTCCTGCTGCTCTGTCTCAGCGCCGCCTCCCTGCTTCTTAACAGACTTACAG  148

Query  138  ----------------------------------------------------CAGGTATATTCATATTTTAATG  159
                                                                ||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  AGGTACCTCCTTGGTGGTGTTGGATAAAATCTGGAAGAATTCTCTGGATTACCAGGTATATTCATATTTTAATG  222

Query  160  ATCTTCTGGTCATTTGTTGCTGGAGTTGTCACATTCTACTGCTCACTAGGACCTGATTCTCTCTTACCAAATAT  233
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  ATCTTCTGGTCATTTGTTGCTGGAGTTGTCACATTCTACTGCTCACTAGGACCTGATTCTCTCTTACCAAATAT  296

Query  234  ATTCTTCACAATAAAATACAAACCCAAGCAGTTAGGACTTCAGGAATTATTTCCTCAAGGTCATAGCTGTGCTG  307
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  ATTCTTCACAATAAAATACAAACCCAAGCAGTTAGGACTTCAGGAATTATTTCCTCAAGGTCATAGCTGTGCTG  370

Query  308  TTTGTGGTAAAGTGAAATGTAAACGACATAGGCCTTCTTTGCTACTTGAAAACTACCAGCCATGGCTAGACCTG  381
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  TTTGTGGTAAAGTGAAATGTAAACGACATAGGCCTTCTTTGCTACTTGAAAACTACCAGCCATGGCTAGACCTG  444

Query  382  AAAATTTCTTCCAAGGTTGATGCATCTCTCTCAG----------------------------------------  415
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||                                        
Sbjct  445  AAAATTTCTTCCAAGGTTGATGCATCTCTCTCAGAGGTTCTTGAATTAGTGTTGGAAAACTTTGTTTATCCGTG  518

Query  416  --------------------------------------------------------------------------  415
                                                                                      
Sbjct  519  GTACAGGGATGTGACAGATGATGAATCCTTTGTTGATGAACTGAGAATAACATTACGTTTTTTTGCATCTGTCT  592

Query  416  ------------------AGGTGGATATTCCATCTATTATAACCAAGAAACTATTAAAAGCAGCAATGAAGCAT  471
                              ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  TAATAAGAAGGATTCACAAGGTGGATATTCCATCTATTATAACCAAGAAACTATTAAAAGCAGCAATGAAGCAT  666

Query  472  ATAGAAGTGATAGTTAAAGCCAGACAGAAAGTAAAAAATACAGAGTTTTTACAGCAAGCTGCTTTAGAAGAATA  545
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  ATAGAAGTGATAGTTAAAGCCAGACAGAAAGTAAAAAATACAGAGTTTTTACAGCAAGCTGCTTTAGAAGAATA  740

Query  546  TGGTCCAGAGCTTCATGTTGCTTTGAGAAGTCGAAGAGATGAATTGCACTATTTAAGGAAACTTACTGAACTGC  619
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  TGGTCCAGAGCTTCATGTTGCTTTGAGAAGTCGAAGAGATGAATTGCACTATTTAAGGAAACTTACTGAACTGC  814

Query  620  TTTTTCCTTATATTTTGCCTCCTAAAGCAACAGACTGCAGATCTCTGACCTTACTTATAAGAGAGATTCTGTCT  693
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  TTTTTCCTTATATTTTGCCTCCTAAAGCAACAGACTGCAGATCTCTGACCTTACTTATAAGAGAGATTCTGTCT  888

Query  694  GGCTCTGTGTTCCTTCCTTCTTTGGATTTCCTAGCTGATCCAGATACTGTGAATCATTTGCTTATCATCTTCAT  767
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  GGCTCTGTGTTCCTTCCTTCTTTGGATTTCCTAGCTGATCCAGATACTGTGAATCATTTGCTTATCATCTTCAT  962

Query  768  AGATGACAGTCCACCTGAAAAAGCAACTGAACCGGCTTCTCCTTTGGTTCCATTCTTGCAGAAATTTGCAGAAC  841
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  AGATGACAGTCCACCTGAAAAAGCAACTGAACCGGCTTCTCCTTTGGTTCCATTCTTGCAGAAATTTGCAGAAC  1036

Query  842  CTAGAAATAAAAAGCCATCTGTGCTGAAGTTAGAATTGAAGCAAATCAGAGAGCAACAAGATCTTTTATTTCGT  915
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  CTAGAAATAAAAAGCCATCTGTGCTGAAGTTAGAATTGAAGCAAATCAGAGAGCAACAAGATCTTTTATTTCGT  1110

Query  916  TTTATGAACTTTCTGAAACAAGAAGGCGCAGTGCACGTGTTGCAGTTTTGTTTGACTGTGGAGGAATTTAATGA  989
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  TTTATGAACTTTCTGAAACAAGAAGGCGCAGTGCACGTGTTGCAGTTTTGTTTGACTGTGGAGGAATTTAATGA  1184

Query  990  TAGAATTTTACGACCAGAATTATCAAATGATGAAATGCTGTCTCTTCATGAAGAATTGCAGAAGATTTATAAAA  1063
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  TAGAATTTTACGACCAGAATTATCAAATGATGAAATGCTGTCTCTTCATGAAGAATTGCAGAAGATTTATAAAA  1258

Query 1064  CATACTGTTTGGATGAAAGTATTGACAAAATTAGATTTGATCCCTTCATTGTAGAAGAGATTCAAAGAATTGCT  1137
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  CATACTGTTTGGATGAAAGTATTGACAAAATTAGATTTGATCCCTTCATTGTAGAAGAGATTCAAAGAATTGCT  1332

Query 1138  GAAGGCCCATACATAGATGTTGTGAAACTTCAAACTATGAGATGTCTTTTTGAAGCATATGAACATGTTCTTTC  1211
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  GAAGGCCCATACATAGATGTTGTGAAACTTCAAACTATGAGATGTCTTTTTGAAGCATATGAACATGTTCTTTC  1406

Query 1212  CCTTTTGGAGAATGTATTTACTCCTATGTTCTGCCATAGTGATGAGTATTTCAGACAACTTTTAAGAGGTGCAG  1285
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  CCTTTTGGAGAATGTATTTACTCCTATGTTCTGCCATAGTGATGAGTATTTCAGACAACTTTTAAGAGGTGCAG  1480

Query 1286  AATCACCAACACGCAATTCAAAATTGAACA---------------------------GGAACACACAGAAAAGG  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||                           |||||||||||||||||
Sbjct 1481  AATCACCAACACGCAATTCAAAATTGAACAGAGGTAGCCTAAGTTTGGATGATTTTCGGAACACACAGAAAAGG  1554

Query 1333  GGAGAATCATTTGGAATCAGCAGAATAGGTAGCAAAATTAAAGGAGTATTCAAAAGTACCACAATGGAGGGAGC  1406
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555  GGAGAATCATTTGGAATCAGCAGAATAGGTAGCAAAATTAAAGGAGTATTCAAAAGTACCACAATGGAGGGAGC  1628

Query 1407  TATGTTGCCTAATTATGGTGTAGCTGAAGGTGAAGATGATTTTATTGAAGAAGGTATTGTTGTAATGGAAGATG  1480
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629  TATGTTGCCTAATTATGGTGTAGCTGAAGGTGAAGATGATTTTATTGAAGAAGGTATTGTTGTAATGGAAGATG  1702

Query 1481  ATTCTCCAGTGGAGGCTGTGAGCACACCTAATACTCCCCGAAACCTTGCTGCATGGAAAATTAGCATTCCATAT  1554
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703  ATTCTCCAGTGGAGGCTGTGAGCACACCTAATACTCCCCGAAACCTTGCTGCATGGAAAATTAGCATTCCATAT  1776

Query 1555  GTAGACTTTTTTGAGGATCCCTCCTCTGAAAGGAAGGAGAAAAAAGAAAGAATTCCTGTGTTTTGTATTGATGT  1628
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777  GTAGACTTTTTTGAGGATCCCTCCTCTGAAAGGAAGGAGAAAAAAGAAAGAATTCCTGTGTTTTGTATTGATGT  1850

Query 1629  TGAAAGAAATGATAGAAGAGCAGTTGGACACGAGCCTGAACATTGGTCTGTCTATAGAAGATATCTTGAATTCT  1702
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1851  TGAAAGAAATGATAGAAGAGCAGTTGGACACGAGCCTGAACATTGGTCTGTCTATAGAAGATATCTTGAATTCT  1924

Query 1703  ATGTACTTGAATCAAAACTAACAGAATTTCATGGTGCATTTCCTGATGCCCAGCTTCCTTCTAAGAGGATCATT  1776
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1925  ATGTACTTGAATCAAAACTAACAGAATTTCATGGTGCATTTCCTGATGCCCAGCTTCCTTCTAAGAGGATCATT  1998

Query 1777  GGCCCCAAAAATTATGAATTCTTAAAGTCAAAGAGGGAAGAGTTCCAAGAATATCTACAGAAACTTCTGCAGCA  1850
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1999  GGCCCCAAAAATTATGAATTCTTAAAGTCAAAGAGGGAAGAGTTCCAAGAATATCTACAGAAACTTCTGCAGCA  2072

Query 1851  TCCAGAACTGAGTAATAGTCAACTTCTGGCAGACTTTCTTTCCCCTAATGGTGGGGAAACACAATTTCTTGATA  1924
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2073  TCCAGAACTGAGTAATAGTCAACTTCTGGCAGACTTTCTTTCCCCTAATGGTGGGGAAACACAATTTCTTGATA  2146

Query 1925  AGATACTACCAGATGTAAATCTTGGGAAAATTATAAAATCTGTTCCTGGAAAACTAATGAAAGAGAAAGGTCAG  1998
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2147  AGATACTACCAGATGTAAATCTTGGGAAAATTATAAAATCTGTTCCTGGAAAACTAATGAAAGAGAAAGGTCAG  2220

Query 1999  CATTTGGAACCTTTTATCATGAATTTCATTAATTCTTGTGAGTCTCCAAAGCCTAAACCAAGTAGACCAGAACT  2072
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2221  CATTTGGAACCTTTTATCATGAATTTCATTAATTCTTGTGAGTCTCCAAAGCCTAAACCAAGTAGACCAGAACT  2294

Query 2073  GACCATTCTCAGCCCTACTTCAGAAAACAACAAGAAGCTTTTCAATGATCTGTTTAAAAATAATGCAAACCGTG  2146
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2295  GACCATTCTCAGCCCTACTTCAGAAAACAACAAGAAGCTTTTCAATGATCTGTTTAAAAATAATGCAAACCGTG  2368

Query 2147  CTGAAAATACAGAGAGAAAGCAAAATCAGAATTATTTTATGGAGGTGATGACTGTAGAAGGAGTCTATGATTAC  2220
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2369  CTGAAAATACAGAGAGAAAGCAAAATCAGAATTATTTTATGGAGGTGATGACTGTAGAAGGAGTCTATGATTAC  2442

Query 2221  CTGATGTATGTAGGACGGGTAGTTTTCCAGGTTCCTGACTGGCTTCATCATCTCTTAATGGGAACTCGAATCCT  2294
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2443  CTGATGTATGTAGGACGGGTAGTTTTCCAGGTTCCTGACTGGCTTCATCATCTCTTAATGGGAACTCGAATCCT  2516

Query 2295  CTTTAAAAACACCCTGGAAATGTATACTGATTACTATCTTCAGTGTAAACTAGAACAGCTATTTCAGGAGCACC  2368
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2517  CTTTAAAAACACCCTGGAAATGTATACTGATTACTATCTTCAGTGTAAACTAGAACAGCTATTTCAGGAGCACC  2590

Query 2369  GTTTGGTCTCACTCATAACACTTCTCAGAGATGCTATATTCTGTGAAAACACTGAACCTCGCTCTCTCCAAGAT  2442
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2591  GTTTGGTCTCACTCATAACACTTCTCAGAGATGCTATATTCTGTGAAAACACTGAACCTCGCTCTCTCCAAGAT  2664

Query 2443  AAGCAAAAAGGAGCAAAACAGACTTTTGAAGAAATGATGAATTACATTCCAGATCTGTTAGTCAAGTGTATTGG  2516
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2665  AAGCAAAAAGGAGCAAAACAGACTTTTGAAGAAATGATGAATTACATTCCAGATCTGTTAGTCAAGTGTATTGG  2738

Query 2517  TGAAGAAACCAAGTATGAAAGCATCAGACTTCTGTTTGATGGCTTACAGCAACCAGTACTCAACAAGCAGCTGA  2590
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2739  TGAAGAAACCAAGTATGAAAGCATCAGACTTCTGTTTGATGGCTTACAGCAACCAGTACTCAACAAGCAGCTGA  2812

Query 2591  CTTATGTTTTATTGGACATTGTGATACAGGAACTGTTTCCAGAGCTCAATAAGGTACAAAAGGAAGTTACCTCT  2664
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2813  CTTATGTTTTATTGGACATTGTGATACAGGAACTGTTTCCAGAGCTCAATAAGGTACAAAAGGAAGTTACCTCT  2886

Query 2665  GTGACATTTTGGATG  2679
            |||||||.|||||||
Sbjct 2887  GTGACATCTTGGATG  2901