Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000468783
• Subject: NM_001350534.1
• Aligned Length: 2811
• Identities: 2675
• Gaps: 135

Alignment

Query    1  ATGGTGCCCTGGGTGCGGACGATGGGGCAGAAGCTGAAGCAGCGGCTGCGACTGGACGTGGGACGCGAGATCTG  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGTGCCCTGGGTGCGGACGATGGGGCAGAAGCTGAAGCAGCGGCTGCGACTGGACGTGGGACGCGAGATCTG  74

Query   75  CCGCCAGTACCCGCTGTTCTGCTTCCTGCTGCTCTGTCTCAGCGCCGCCTCCCTGCTTCTTAACAGGTATATTC  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  CCGCCAGTACCCGCTGTTCTGCTTCCTGCTGCTCTGTCTCAGCGCCGCCTCCCTGCTTCTTAACAGGTATATTC  148

Query  149  ATATTTTAATGATCTTCTGGTCATTTGTTGCTGGAGTTGTCACATTCTACTGCTCACTAGGACCTGATTCTCTC  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  ATATTTTAATGATCTTCTGGTCATTTGTTGCTGGAGTTGTCACATTCTACTGCTCACTAGGACCTGATTCTCTC  222

Query  223  TTACCAAATATATTCTTCACAATAAAATACAAACCCAAGCAGTTAGGACTTCAGGAATTATTTCCTCAAGGTCA  296
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  TTACCAAATATATTCTTCACAATAAAATACAAACCCA---AGTTAGGACTTCAGGAATTATTTCCTCAAGGTCA  293

Query  297  TAGCTGTGCTGTTTGTGGTAAAGTGAAATGTAAACGACATAGGCCTTCTTTGCTACTTGAAAACTACCAGCCAT  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  294  TAGCTGTGCTGTTTGTGGTAAAGTGAAATGTAAACGACATAGGCCTTCTTTGCTACTTGAAAACTACCAGCCAT  367

Query  371  GGCTAGACCTGAAAATTTCTTCCAAGGTTGATGCATCTCTCTCAG-----------------------------  415
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                             
Sbjct  368  GGCTAGACCTGAAAATTTCTTCCAAGGTTGATGCATCTCTCTCAGAGGTTCTTGAATTAGTGTTGGAAAACTTT  441

Query  416  --------------------------------------------------------------------------  415
                                                                                      
Sbjct  442  GTTTATCCGTGGTACAGGGATGTGACAGATGATGAATCCTTTGTTGATGAACTGAGAATAACATTACGTTTTTT  515

Query  416  -----------------------------AGGTGGATATTCCATCTATTATAACCAAGAAACTATTAAAAGCAG  460
                                         |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  516  TGCATCTGTCTTAATAAGAAGGATTCACAAGGTGGATATTCCATCTATTATAACCAAGAAACTATTAAAAGCAG  589

Query  461  CAATGAAGCATATAGAAGTGATAGTTAAAGCCAGACAGAAAGTAAAAAATACAGAGTTTTTACAGCAAGCTGCT  534
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  590  CAATGAAGCATATAGAAGTGATAGTTAAAGCCAGACAGAAAGTAAAAAATACAGAGTTTTTACAGCAAGCTGCT  663

Query  535  TTAGAAGAATATGGTCCAGAGCTTCATGTTGCTTTGAGAAGTCGAAGAGATGAATTGCACTATTTAAGGAAACT  608
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  664  TTAGAAGAATATGGTCCAGAGCTTCATGTTGCTTTGAGAAGTCGAAGAGATGAATTGCACTATTTAAGGAAACT  737

Query  609  TACTGAACTGCTTTTTCCTTATATTTTGCCTCCTAAAGCAACAGACTGCAGATCTCTGACCTTACTTATAAGAG  682
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  738  TACTGAACTGCTTTTTCCTTATATTTTGCCTCCTAAAGCAACAGACTGCAGATCTCTGACCTTACTTATAAGAG  811

Query  683  AGATTCTGTCTGGCTCTGTGTTCCTTCCTTCTTTGGATTTCCTAGCTGATCCAGATACTGTGAATCATTTGCTT  756
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  812  AGATTCTGTCTGGCTCTGTGTTCCTTCCTTCTTTGGATTTCCTAGCTGATCCAGATACTGTGAATCATTTGCTT  885

Query  757  ATCATCTTCATAGATGACAGTCCACCTGAAAAAGCAACTGAACCGGCTTCTCCTTTGGTTCCATTCTTGCAGAA  830
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  886  ATCATCTTCATAGATGACAGTCCACCTGAAAAAGCAACTGAACCGGCTTCTCCTTTGGTTCCATTCTTGCAGAA  959

Query  831  ATTTGCAGAACCTAGAAATAAAAAGCCATCTGTGCTGAAGTTAGAATTGAAGCAAATCAGAGAGCAACAAGATC  904
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  960  ATTTGCAGAACCTAGAAATAAAAAGCCATCTGTGCTGAAGTTAGAATTGAAGCAAATCAGAGAGCAACAAGATC  1033

Query  905  TTTTATTTCGTTTTATGAACTTTCTGAAACAAGAAGGCGCAGTGCACGTGTTGCAGTTTTGTTTGACTGTGGAG  978
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1034  TTTTATTTCGTTTTATGAACTTTCTGAAACAAGAAGGCGCAGTGCACGTGTTGCAGTTTTGTTTGACTGTGGAG  1107

Query  979  GAATTTAATGATAGAATTTTACGACCAGAATTATCAAATGATGAAATGCTGTCTCTTCATGAAGAATTGCAGAA  1052
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1108  GAATTTAATGATAGAATTTTACGACCAGAATTATCAAATGATGAAATGCTGTCTCTTCATGAAGAATTGCAGAA  1181

Query 1053  GATTTATAAAACATACTGTTTGGATGAAAGTATTGACAAAATTAGATTTGATCCCTTCATTGTAGAAGAGATTC  1126
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1182  GATTTATAAAACATACTGTTTGGATGAAAGTATTGACAAAATTAGATTTGATCCCTTCATTGTAGAAGAGATTC  1255

Query 1127  AAAGAATTGCTGAAGGCCCATACATAGATGTTGTGAAACTTCAAACTATGAGATGTCTTTTTGAAGCATATGAA  1200
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1256  AAAGAATTGCTGAAGGCCCATACATAGATGTTGTGAAACTTCAAACTATGAGATGTCTTTTTGAAGCATATGAA  1329

Query 1201  CATGTTCTTTCCCTTTTGGAGAATGTATTTACTCCTATGTTCTGCCATAGTGATGAGTATTTCAGACAACTTTT  1274
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1330  CATGTTCTTTCCCTTTTGGAGAATGTATTTACTCCTATGTTCTGCCATAGTGATGAGTATTTCAGACAACTTTT  1403

Query 1275  AAGAGGTGCAGAATCACCAACACGCAATTCAAAATTGAACAGGAACACACAGAAAAGGGGAGAATCATTTGGAA  1348
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1404  AAGAGGTGCAGAATCACCAACACGCAATTCAAAATTGAACAGGAACACACAGAAAAGGGGAGAATCATTTGGAA  1477

Query 1349  TCAGCAGAATAGGTAGCAAAATTAAAGGAGTATTCAAAAGTACCACAATGGAGGGAGCTATGTTGCCTAATTAT  1422
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1478  TCAGCAGAATAGGTAGCAAAATTAAAGGAGTATTCAAAAGTACCACAATGGAGGGAGCTATGTTGCCTAATTAT  1551

Query 1423  GGTGTAGCTGAAGGTGAAGATGATTTTATTGAAGAAGGTATTGTTGTAATGGAAGATGATTCTCCAGTGGAGGC  1496
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1552  GGTGTAGCTGAAGGTGAAGATGATTTTATTGAAGAAGGTATTGTTGTAATGGAAGATGATTCTCCAGTGGAGGC  1625

Query 1497  TGTGAGCACACCTAATACTCCCCGAAACCTTGCTGCATGGAAAATTAGCATTCCATATGTAGACTTTTTTGAGG  1570
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1626  TGTGAGCACACCTAATACTCCCCGAAACCTTGCTGCATGGAAAATTAGCATTCCATATGTAGACTTTTTTGAGG  1699

Query 1571  ATCCCTCCTCTGAAAGGAAGGAGAAAAAAGAAAGAATTCCTGTGTTTTGTATTGATGTTGAAAGAAATGATAGA  1644
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1700  ATCCCTCCTCTGAAAGGAAGGAGAAAAAAGAAAGAATTCCTGTGTTTTGTATTGATGTTGAAAGAAATGATAGA  1773

Query 1645  AGAGCAGTTGGACACGAGCCTGAACATTGGTCTGTCTATAGAAGATATCTTGAATTCTATGTACTTGAATCAAA  1718
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1774  AGAGCAGTTGGACACGAGCCTGAACATTGGTCTGTCTATAGAAGATATCTTGAATTCTATGTACTTGAATCAAA  1847

Query 1719  ACTAACAGAATTTCATGGTGCATTTCCTGATGCCCAGCTTCCTTCTAAGAGGATCATTGGCCCCAAAAATTATG  1792
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1848  ACTAACAGAATTTCATGGTGCATTTCCTGATGCCCAGCTTCCTTCTAAGAGGATCATTGGCCCCAAAAATTATG  1921

Query 1793  AATTCTTAAAGTCAAAGAGGGAAGAGTTCCAAGAATATCTACAGAAACTTCTGCAGCATCCAGAACTGAGTAAT  1866
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1922  AATTCTTAAAGTCAAAGAGGGAAGAGTTCCAAGAATATCTACAGAAACTTCTGCAGCATCCAGAACTGAGTAAT  1995

Query 1867  AGTCAACTTCTGGCAGACTTTCTTTCCCCTAATGGTGGGGAAACACAATTTCTTGATAAGATACTACCAGATGT  1940
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1996  AGTCAACTTCTGGCAGACTTTCTTTCCCCTAATGGTGGGGAAACACAATTTCTTGATAAGATACTACCAGATGT  2069

Query 1941  AAATCTTGGGAAAATTATAAAATCTGTTCCTGGAAAACTAATGAAAGAGAAAGGTCAGCATTTGGAACCTTTTA  2014
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2070  AAATCTTGGGAAAATTATAAAATCTGTTCCTGGAAAACTAATGAAAGAGAAAGGTCAGCATTTGGAACCTTTTA  2143

Query 2015  TCATGAATTTCATTAATTCTTGTGAGTCTCCAAAGCCTAAACCAAGTAGACCAGAACTGACCATTCTCAGCCCT  2088
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2144  TCATGAATTTCATTAATTCTTGTGAGTCTCCAAAGCCTAAACCAAGTAGACCAGAACTGACCATTCTCAGCCCT  2217

Query 2089  ACTTCAGAAAACAACAAGAAGCTTTTCAATGATCTGTTTAAAAATAATGCAAACCGTGCTGAAAATACAGAGAG  2162
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2218  ACTTCAGAAAACAACAAGAAGCTTTTCAATGATCTGTTTAAAAATAATGCAAACCGTGCTGAAAATACAGAGAG  2291

Query 2163  AAAGCAAAATCAGAATTATTTTATGGAGGTGATGACTGTAGAAGGAGTCTATGATTACCTGATGTATGTAGGAC  2236
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2292  AAAGCAAAATCAGAATTATTTTATGGAGGTGATGACTGTAGAAGGAGTCTATGATTACCTGATGTATGTAGGAC  2365

Query 2237  GGGTAGTTTTCCAGGTTCCTGACTGGCTTCATCATCTCTTAATGGGAACTCGAATCCTCTTTAAAAACACCCTG  2310
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2366  GGGTAGTTTTCCAGGTTCCTGACTGGCTTCATCATCTCTTAATGGGAACTCGAATCCTCTTTAAAAACACCCTG  2439

Query 2311  GAAATGTATACTGATTACTATCTTCAGTGTAAACTAGAACAGCTATTTCAGGAGCACCGTTTGGTCTCACTCAT  2384
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2440  GAAATGTATACTGATTACTATCTTCAGTGTAAACTAGAACAGCTATTTCAGGAGCACCGTTTGGTCTCACTCAT  2513

Query 2385  AACACTTCTCAGAGATGCTATATTCTGTGAAAACACTGAACCTCGCTCTCTCCAAGATAAGCAAAAAGGAGCAA  2458
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2514  AACACTTCTCAGAGATGCTATATTCTGTGAAAACACTGAACCTCGCTCTCTCCAAGATAAGCAAAAAGGAGCAA  2587

Query 2459  AACAGACTTTTGAAGAAATGATGAATTACATTCCAGATCTGTTAGTCAAGTGTATTGGTGAAGAAACCAAGTAT  2532
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2588  AACAGACTTTTGAAGAAATGATGAATTACATTCCAGATCTGTTAGTCAAGTGTATTGGTGAAGAAACCAAGTAT  2661

Query 2533  GAAAGCATCAGACTTCTGTTTGATGGCTTACAGCAACCAGTACTCAACAAGCAGCTGACTTATGTTTTATTGGA  2606
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2662  GAAAGCATCAGACTTCTGTTTGATGGCTTACAGCAACCAGTACTCAACAAGCAGCTGACTTATGTTTTATTGGA  2735

Query 2607  CATTGTGATACAGGAACTGTTTCCAGAGCTCAATAAGGTACAAAAGGAAGTTACCTCTGTGACATTTTGGATG  2679
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||
Sbjct 2736  CATTGTGATACAGGAACTGTTTCCAGAGCTCAATAAGGTACAAAAGGAAGTTACCTCTGTGACATCTTGGATG  2808