Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000468783
• Subject: NM_001350536.1
• Aligned Length: 2706
• Identities: 2678
• Gaps: 27

Alignment

Query    1  ATGGTGCCCTGGGTGCGGACGATGGGGCAGAAGCTGAAGCAGCGGCTGCGACTGGACGTGGGACGCGAGATCTG  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGTGCCCTGGGTGCGGACGATGGGGCAGAAGCTGAAGCAGCGGCTGCGACTGGACGTGGGACGCGAGATCTG  74

Query   75  CCGCCAGTACCCGCTGTTCTGCTTCCTGCTGCTCTGTCTCAGCGCCGCCTCCCTGCTTCTTAACAGGTATATTC  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  CCGCCAGTACCCGCTGTTCTGCTTCCTGCTGCTCTGTCTCAGCGCCGCCTCCCTGCTTCTTAACAGGTATATTC  148

Query  149  ATATTTTAATGATCTTCTGGTCATTTGTTGCTGGAGTTGTCACATTCTACTGCTCACTAGGACCTGATTCTCTC  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  ATATTTTAATGATCTTCTGGTCATTTGTTGCTGGAGTTGTCACATTCTACTGCTCACTAGGACCTGATTCTCTC  222

Query  223  TTACCAAATATATTCTTCACAATAAAATACAAACCCAAGCAGTTAGGACTTCAGGAATTATTTCCTCAAGGTCA  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  TTACCAAATATATTCTTCACAATAAAATACAAACCCAAGCAGTTAGGACTTCAGGAATTATTTCCTCAAGGTCA  296

Query  297  TAGCTGTGCTGTTTGTGGTAAAGTGAAATGTAAACGACATAGGCCTTCTTTGCTACTTGAAAACTACCAGCCAT  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  TAGCTGTGCTGTTTGTGGTAAAGTGAAATGTAAACGACATAGGCCTTCTTTGCTACTTGAAAACTACCAGCCAT  370

Query  371  GGCTAGACCTGAAAATTTCTTCCAAGGTTGATGCATCTCTCTCAGAGGTGGATATTCCATCTATTATAACCAAG  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  GGCTAGACCTGAAAATTTCTTCCAAGGTTGATGCATCTCTCTCAGAGGTGGATATTCCATCTATTATAACCAAG  444

Query  445  AAACTATTAAAAGCAGCAATGAAGCATATAGAAGTGATAGTTAAAGCCAGACAGAAAGTAAAAAATACAGAGTT  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  AAACTATTAAAAGCAGCAATGAAGCATATAGAAGTGATAGTTAAAGCCAGACAGAAAGTAAAAAATACAGAGTT  518

Query  519  TTTACAGCAAGCTGCTTTAGAAGAATATGGTCCAGAGCTTCATGTTGCTTTGAGAAGTCGAAGAGATGAATTGC  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  TTTACAGCAAGCTGCTTTAGAAGAATATGGTCCAGAGCTTCATGTTGCTTTGAGAAGTCGAAGAGATGAATTGC  592

Query  593  ACTATTTAAGGAAACTTACTGAACTGCTTTTTCCTTATATTTTGCCTCCTAAAGCAACAGACTGCAGATCTCTG  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  ACTATTTAAGGAAACTTACTGAACTGCTTTTTCCTTATATTTTGCCTCCTAAAGCAACAGACTGCAGATCTCTG  666

Query  667  ACCTTACTTATAAGAGAGATTCTGTCTGGCTCTGTGTTCCTTCCTTCTTTGGATTTCCTAGCTGATCCAGATAC  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  ACCTTACTTATAAGAGAGATTCTGTCTGGCTCTGTGTTCCTTCCTTCTTTGGATTTCCTAGCTGATCCAGATAC  740

Query  741  TGTGAATCATTTGCTTATCATCTTCATAGATGACAGTCCACCTGAAAAAGCAACTGAACCGGCTTCTCCTTTGG  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  TGTGAATCATTTGCTTATCATCTTCATAGATGACAGTCCACCTGAAAAAGCAACTGAACCGGCTTCTCCTTTGG  814

Query  815  TTCCATTCTTGCAGAAATTTGCAGAACCTAGAAATAAAAAGCCATCTGTGCTGAAGTTAGAATTGAAGCAAATC  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  TTCCATTCTTGCAGAAATTTGCAGAACCTAGAAATAAAAAGCCATCTGTGCTGAAGTTAGAATTGAAGCAAATC  888

Query  889  AGAGAGCAACAAGATCTTTTATTTCGTTTTATGAACTTTCTGAAACAAGAAGGCGCAGTGCACGTGTTGCAGTT  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  AGAGAGCAACAAGATCTTTTATTTCGTTTTATGAACTTTCTGAAACAAGAAGGCGCAGTGCACGTGTTGCAGTT  962

Query  963  TTGTTTGACTGTGGAGGAATTTAATGATAGAATTTTACGACCAGAATTATCAAATGATGAAATGCTGTCTCTTC  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  TTGTTTGACTGTGGAGGAATTTAATGATAGAATTTTACGACCAGAATTATCAAATGATGAAATGCTGTCTCTTC  1036

Query 1037  ATGAAGAATTGCAGAAGATTTATAAAACATACTGTTTGGATGAAAGTATTGACAAAATTAGATTTGATCCCTTC  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  ATGAAGAATTGCAGAAGATTTATAAAACATACTGTTTGGATGAAAGTATTGACAAAATTAGATTTGATCCCTTC  1110

Query 1111  ATTGTAGAAGAGATTCAAAGAATTGCTGAAGGCCCATACATAGATGTTGTGAAACTTCAAACTATGAGATGTCT  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  ATTGTAGAAGAGATTCAAAGAATTGCTGAAGGCCCATACATAGATGTTGTGAAACTTCAAACTATGAGATGTCT  1184

Query 1185  TTTTGAAGCATATGAACATGTTCTTTCCCTTTTGGAGAATGTATTTACTCCTATGTTCTGCCATAGTGATGAGT  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  TTTTGAAGCATATGAACATGTTCTTTCCCTTTTGGAGAATGTATTTACTCCTATGTTCTGCCATAGTGATGAGT  1258

Query 1259  ATTTCAGACAACTTTTAAGAGGTGCAGAATCACCAACACGCAATTCAAAATTGAACA-----------------  1315
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                 
Sbjct 1259  ATTTCAGACAACTTTTAAGAGGTGCAGAATCACCAACACGCAATTCAAAATTGAACAGAGGTAGCCTAAGTTTG  1332

Query 1316  ----------GGAACACACAGAAAAGGGGAGAATCATTTGGAATCAGCAGAATAGGTAGCAAAATTAAAGGAGT  1379
                      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  GATGATTTTCGGAACACACAGAAAAGGGGAGAATCATTTGGAATCAGCAGAATAGGTAGCAAAATTAAAGGAGT  1406

Query 1380  ATTCAAAAGTACCACAATGGAGGGAGCTATGTTGCCTAATTATGGTGTAGCTGAAGGTGAAGATGATTTTATTG  1453
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  ATTCAAAAGTACCACAATGGAGGGAGCTATGTTGCCTAATTATGGTGTAGCTGAAGGTGAAGATGATTTTATTG  1480

Query 1454  AAGAAGGTATTGTTGTAATGGAAGATGATTCTCCAGTGGAGGCTGTGAGCACACCTAATACTCCCCGAAACCTT  1527
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481  AAGAAGGTATTGTTGTAATGGAAGATGATTCTCCAGTGGAGGCTGTGAGCACACCTAATACTCCCCGAAACCTT  1554

Query 1528  GCTGCATGGAAAATTAGCATTCCATATGTAGACTTTTTTGAGGATCCCTCCTCTGAAAGGAAGGAGAAAAAAGA  1601
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555  GCTGCATGGAAAATTAGCATTCCATATGTAGACTTTTTTGAGGATCCCTCCTCTGAAAGGAAGGAGAAAAAAGA  1628

Query 1602  AAGAATTCCTGTGTTTTGTATTGATGTTGAAAGAAATGATAGAAGAGCAGTTGGACACGAGCCTGAACATTGGT  1675
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629  AAGAATTCCTGTGTTTTGTATTGATGTTGAAAGAAATGATAGAAGAGCAGTTGGACACGAGCCTGAACATTGGT  1702

Query 1676  CTGTCTATAGAAGATATCTTGAATTCTATGTACTTGAATCAAAACTAACAGAATTTCATGGTGCATTTCCTGAT  1749
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703  CTGTCTATAGAAGATATCTTGAATTCTATGTACTTGAATCAAAACTAACAGAATTTCATGGTGCATTTCCTGAT  1776

Query 1750  GCCCAGCTTCCTTCTAAGAGGATCATTGGCCCCAAAAATTATGAATTCTTAAAGTCAAAGAGGGAAGAGTTCCA  1823
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777  GCCCAGCTTCCTTCTAAGAGGATCATTGGCCCCAAAAATTATGAATTCTTAAAGTCAAAGAGGGAAGAGTTCCA  1850

Query 1824  AGAATATCTACAGAAACTTCTGCAGCATCCAGAACTGAGTAATAGTCAACTTCTGGCAGACTTTCTTTCCCCTA  1897
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1851  AGAATATCTACAGAAACTTCTGCAGCATCCAGAACTGAGTAATAGTCAACTTCTGGCAGACTTTCTTTCCCCTA  1924

Query 1898  ATGGTGGGGAAACACAATTTCTTGATAAGATACTACCAGATGTAAATCTTGGGAAAATTATAAAATCTGTTCCT  1971
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1925  ATGGTGGGGAAACACAATTTCTTGATAAGATACTACCAGATGTAAATCTTGGGAAAATTATAAAATCTGTTCCT  1998

Query 1972  GGAAAACTAATGAAAGAGAAAGGTCAGCATTTGGAACCTTTTATCATGAATTTCATTAATTCTTGTGAGTCTCC  2045
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1999  GGAAAACTAATGAAAGAGAAAGGTCAGCATTTGGAACCTTTTATCATGAATTTCATTAATTCTTGTGAGTCTCC  2072

Query 2046  AAAGCCTAAACCAAGTAGACCAGAACTGACCATTCTCAGCCCTACTTCAGAAAACAACAAGAAGCTTTTCAATG  2119
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2073  AAAGCCTAAACCAAGTAGACCAGAACTGACCATTCTCAGCCCTACTTCAGAAAACAACAAGAAGCTTTTCAATG  2146

Query 2120  ATCTGTTTAAAAATAATGCAAACCGTGCTGAAAATACAGAGAGAAAGCAAAATCAGAATTATTTTATGGAGGTG  2193
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2147  ATCTGTTTAAAAATAATGCAAACCGTGCTGAAAATACAGAGAGAAAGCAAAATCAGAATTATTTTATGGAGGTG  2220

Query 2194  ATGACTGTAGAAGGAGTCTATGATTACCTGATGTATGTAGGACGGGTAGTTTTCCAGGTTCCTGACTGGCTTCA  2267
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2221  ATGACTGTAGAAGGAGTCTATGATTACCTGATGTATGTAGGACGGGTAGTTTTCCAGGTTCCTGACTGGCTTCA  2294

Query 2268  TCATCTCTTAATGGGAACTCGAATCCTCTTTAAAAACACCCTGGAAATGTATACTGATTACTATCTTCAGTGTA  2341
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2295  TCATCTCTTAATGGGAACTCGAATCCTCTTTAAAAACACCCTGGAAATGTATACTGATTACTATCTTCAGTGTA  2368

Query 2342  AACTAGAACAGCTATTTCAGGAGCACCGTTTGGTCTCACTCATAACACTTCTCAGAGATGCTATATTCTGTGAA  2415
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2369  AACTAGAACAGCTATTTCAGGAGCACCGTTTGGTCTCACTCATAACACTTCTCAGAGATGCTATATTCTGTGAA  2442

Query 2416  AACACTGAACCTCGCTCTCTCCAAGATAAGCAAAAAGGAGCAAAACAGACTTTTGAAGAAATGATGAATTACAT  2489
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2443  AACACTGAACCTCGCTCTCTCCAAGATAAGCAAAAAGGAGCAAAACAGACTTTTGAAGAAATGATGAATTACAT  2516

Query 2490  TCCAGATCTGTTAGTCAAGTGTATTGGTGAAGAAACCAAGTATGAAAGCATCAGACTTCTGTTTGATGGCTTAC  2563
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2517  TCCAGATCTGTTAGTCAAGTGTATTGGTGAAGAAACCAAGTATGAAAGCATCAGACTTCTGTTTGATGGCTTAC  2590

Query 2564  AGCAACCAGTACTCAACAAGCAGCTGACTTATGTTTTATTGGACATTGTGATACAGGAACTGTTTCCAGAGCTC  2637
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2591  AGCAACCAGTACTCAACAAGCAGCTGACTTATGTTTTATTGGACATTGTGATACAGGAACTGTTTCCAGAGCTC  2664

Query 2638  AATAAGGTACAAAAGGAAGTTACCTCTGTGACATTTTGGATG  2679
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||
Sbjct 2665  AATAAGGTACAAAAGGAAGTTACCTCTGTGACATCTTGGATG  2706