Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000468783
• Subject: NM_001350547.1
• Aligned Length: 2706
• Identities: 1760
• Gaps: 945

Alignment

Query    1  ATGGTGCCCTGGGTGCGGACGATGGGGCAGAAGCTGAAGCAGCGGCTGCGACTGGACGTGGGACGCGAGATCTG  74
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query   75  CCGCCAGTACCCGCTGTTCTGCTTCCTGCTGCTCTGTCTCAGCGCCGCCTCCCTGCTTCTTAACAGGTATATTC  148
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  149  ATATTTTAATGATCTTCTGGTCATTTGTTGCTGGAGTTGTCACATTCTACTGCTCACTAGGACCTGATTCTCTC  222
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  223  TTACCAAATATATTCTTCACAATAAAATACAAACCCAAGCAGTTAGGACTTCAGGAATTATTTCCTCAAGGTCA  296
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  297  TAGCTGTGCTGTTTGTGGTAAAGTGAAATGTAAACGACATAGGCCTTCTTTGCTACTTGAAAACTACCAGCCAT  370
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  371  GGCTAGACCTGAAAATTTCTTCCAAGGTTGATGCATCTCTCTCAGAGGTGGATATTCCATCTATTATAACCAAG  444
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  445  AAACTATTAAAAGCAGCAATGAAGCATATAGAAGTGATAGTTAAAGCCAGACAGAAAGTAAAAAATACAGAGTT  518
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  519  TTTACAGCAAGCTGCTTTAGAAGAATATGGTCCAGAGCTTCATGTTGCTTTGAGAAGTCGAAGAGATGAATTGC  592
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  593  ACTATTTAAGGAAACTTACTGAACTGCTTTTTCCTTATATTTTGCCTCCTAAAGCAACAGACTGCAGATCTCTG  666
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  667  ACCTTACTTATAAGAGAGATTCTGTCTGGCTCTGTGTTCCTTCCTTCTTTGGATTTCCTAGCTGATCCAGATAC  740
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  741  TGTGAATCATTTGCTTATCATCTTCATAGATGACAGTCCACCTGAAAAAGCAACTGAACCGGCTTCTCCTTTGG  814
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  815  TTCCATTCTTGCAGAAATTTGCAGAACCTAGAAATAAAAAGCCATCTGTGCTGAAGTTAGAATTGAAGCAAATC  888
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  889  AGAGAGCAACAAGATCTTTTATTTCGTTTTATGAACTTTCTGAAACAAGAAGGCGCAGTGCACGTGTTGCAGTT  962
                                          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ------------------------------ATGAACTTTCTGAAACAAGAAGGCGCAGTGCACGTGTTGCAGTT  44

Query  963  TTGTTTGACTGTGGAGGAATTTAATGATAGAATTTTACGACCAGAATTATCAAATGATGAAATGCTGTCTCTTC  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   45  TTGTTTGACTGTGGAGGAATTTAATGATAGAATTTTACGACCAGAATTATCAAATGATGAAATGCTGTCTCTTC  118

Query 1037  ATGAAGAATTGCAGAAGATTTATAAAACATACTGTTTGGATGAAAGTATTGACAAAATTAGATTTGATCCCTTC  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  119  ATGAAGAATTGCAGAAGATTTATAAAACATACTGTTTGGATGAAAGTATTGACAAAATTAGATTTGATCCCTTC  192

Query 1111  ATTGTAGAAGAGATTCAAAGAATTGCTGAAGGCCCATACATAGATGTTGTGAAACTTCAAACTATGAGATGTCT  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  193  ATTGTAGAAGAGATTCAAAGAATTGCTGAAGGCCCATACATAGATGTTGTGAAACTTCAAACTATGAGATGTCT  266

Query 1185  TTTTGAAGCATATGAACATGTTCTTTCCCTTTTGGAGAATGTATTTACTCCTATGTTCTGCCATAGTGATGAGT  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  267  TTTTGAAGCATATGAACATGTTCTTTCCCTTTTGGAGAATGTATTTACTCCTATGTTCTGCCATAGTGATGAGT  340

Query 1259  ATTTCAGACAACTTTTAAGAGGTGCAGAATCACCAACACGCAATTCAAAATTGAACA-----------------  1315
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                 
Sbjct  341  ATTTCAGACAACTTTTAAGAGGTGCAGAATCACCAACACGCAATTCAAAATTGAACAGAGGTAGCCTAAGTTTG  414

Query 1316  ----------GGAACACACAGAAAAGGGGAGAATCATTTGGAATCAGCAGAATAGGTAGCAAAATTAAAGGAGT  1379
                      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  415  GATGATTTTCGGAACACACAGAAAAGGGGAGAATCATTTGGAATCAGCAGAATAGGTAGCAAAATTAAAGGAGT  488

Query 1380  ATTCAAAAGTACCACAATGGAGGGAGCTATGTTGCCTAATTATGGTGTAGCTGAAGGTGAAGATGATTTTATTG  1453
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  489  ATTCAAAAGTACCACAATGGAGGGAGCTATGTTGCCTAATTATGGTGTAGCTGAAGGTGAAGATGATTTTATTG  562

Query 1454  AAGAAGGTATTGTTGTAATGGAAGATGATTCTCCAGTGGAGGCTGTGAGCACACCTAATACTCCCCGAAACCTT  1527
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  563  AAGAAGGTATTGTTGTAATGGAAGATGATTCTCCAGTGGAGGCTGTGAGCACACCTAATACTCCCCGAAACCTT  636

Query 1528  GCTGCATGGAAAATTAGCATTCCATATGTAGACTTTTTTGAGGATCCCTCCTCTGAAAGGAAGGAGAAAAAAGA  1601
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  637  GCTGCATGGAAAATTAGCATTCCATATGTAGACTTTTTTGAGGATCCCTCCTCTGAAAGGAAGGAGAAAAAAGA  710

Query 1602  AAGAATTCCTGTGTTTTGTATTGATGTTGAAAGAAATGATAGAAGAGCAGTTGGACACGAGCCTGAACATTGGT  1675
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  711  AAGAATTCCTGTGTTTTGTATTGATGTTGAAAGAAATGATAGAAGAGCAGTTGGACACGAGCCTGAACATTGGT  784

Query 1676  CTGTCTATAGAAGATATCTTGAATTCTATGTACTTGAATCAAAACTAACAGAATTTCATGGTGCATTTCCTGAT  1749
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  785  CTGTCTATAGAAGATATCTTGAATTCTATGTACTTGAATCAAAACTAACAGAATTTCATGGTGCATTTCCTGAT  858

Query 1750  GCCCAGCTTCCTTCTAAGAGGATCATTGGCCCCAAAAATTATGAATTCTTAAAGTCAAAGAGGGAAGAGTTCCA  1823
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  859  GCCCAGCTTCCTTCTAAGAGGATCATTGGCCCCAAAAATTATGAATTCTTAAAGTCAAAGAGGGAAGAGTTCCA  932

Query 1824  AGAATATCTACAGAAACTTCTGCAGCATCCAGAACTGAGTAATAGTCAACTTCTGGCAGACTTTCTTTCCCCTA  1897
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  933  AGAATATCTACAGAAACTTCTGCAGCATCCAGAACTGAGTAATAGTCAACTTCTGGCAGACTTTCTTTCCCCTA  1006

Query 1898  ATGGTGGGGAAACACAATTTCTTGATAAGATACTACCAGATGTAAATCTTGGGAAAATTATAAAATCTGTTCCT  1971
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1007  ATGGTGGGGAAACACAATTTCTTGATAAGATACTACCAGATGTAAATCTTGGGAAAATTATAAAATCTGTTCCT  1080

Query 1972  GGAAAACTAATGAAAGAGAAAGGTCAGCATTTGGAACCTTTTATCATGAATTTCATTAATTCTTGTGAGTCTCC  2045
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1081  GGAAAACTAATGAAAGAGAAAGGTCAGCATTTGGAACCTTTTATCATGAATTTCATTAATTCTTGTGAGTCTCC  1154

Query 2046  AAAGCCTAAACCAAGTAGACCAGAACTGACCATTCTCAGCCCTACTTCAGAAAACAACAAGAAGCTTTTCAATG  2119
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1155  AAAGCCTAAACCAAGTAGACCAGAACTGACCATTCTCAGCCCTACTTCAGAAAACAACAAGAAGCTTTTCAATG  1228

Query 2120  ATCTGTTTAAAAATAATGCAAACCGTGCTGAAAATACAGAGAGAAAGCAAAATCAGAATTATTTTATGGAGGTG  2193
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1229  ATCTGTTTAAAAATAATGCAAACCGTGCTGAAAATACAGAGAGAAAGCAAAATCAGAATTATTTTATGGAGGTG  1302

Query 2194  ATGACTGTAGAAGGAGTCTATGATTACCTGATGTATGTAGGACGGGTAGTTTTCCAGGTTCCTGACTGGCTTCA  2267
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1303  ATGACTGTAGAAGGAGTCTATGATTACCTGATGTATGTAGGACGGGTAGTTTTCCAGGTTCCTGACTGGCTTCA  1376

Query 2268  TCATCTCTTAATGGGAACTCGAATCCTCTTTAAAAACACCCTGGAAATGTATACTGATTACTATCTTCAGTGTA  2341
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1377  TCATCTCTTAATGGGAACTCGAATCCTCTTTAAAAACACCCTGGAAATGTATACTGATTACTATCTTCAGTGTA  1450

Query 2342  AACTAGAACAGCTATTTCAGGAGCACCGTTTGGTCTCACTCATAACACTTCTCAGAGATGCTATATTCTGTGAA  2415
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1451  AACTAGAACAGCTATTTCAGGAGCACCGTTTGGTCTCACTCATAACACTTCTCAGAGATGCTATATTCTGTGAA  1524

Query 2416  AACACTGAACCTCGCTCTCTCCAAGATAAGCAAAAAGGAGCAAAACAGACTTTTGAAGAAATGATGAATTACAT  2489
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1525  AACACTGAACCTCGCTCTCTCCAAGATAAGCAAAAAGGAGCAAAACAGACTTTTGAAGAAATGATGAATTACAT  1598

Query 2490  TCCAGATCTGTTAGTCAAGTGTATTGGTGAAGAAACCAAGTATGAAAGCATCAGACTTCTGTTTGATGGCTTAC  2563
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1599  TCCAGATCTGTTAGTCAAGTGTATTGGTGAAGAAACCAAGTATGAAAGCATCAGACTTCTGTTTGATGGCTTAC  1672

Query 2564  AGCAACCAGTACTCAACAAGCAGCTGACTTATGTTTTATTGGACATTGTGATACAGGAACTGTTTCCAGAGCTC  2637
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1673  AGCAACCAGTACTCAACAAGCAGCTGACTTATGTTTTATTGGACATTGTGATACAGGAACTGTTTCCAGAGCTC  1746

Query 2638  AATAAGGTACAAAAGGAAGTTACCTCTGTGACATTTTGGATG  2679
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||
Sbjct 1747  AATAAGGTACAAAAGGAAGTTACCTCTGTGACATCTTGGATG  1788