Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000468783
• Subject: NM_153816.6
• Aligned Length: 2838
• Identities: 2678
• Gaps: 159

Alignment

Query    1  ATGGTGCCCTGGGTGCGGACGATGGGGCAGAAGCTGAAGCAGCGGCTGCGACTGGACGTGGGACGCGAGATCTG  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGTGCCCTGGGTGCGGACGATGGGGCAGAAGCTGAAGCAGCGGCTGCGACTGGACGTGGGACGCGAGATCTG  74

Query   75  CCGCCAGTACCCGCTGTTCTGCTTCCTGCTGCTCTGTCTCAGCGCCGCCTCCCTGCTTCTTAACAGGTATATTC  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  CCGCCAGTACCCGCTGTTCTGCTTCCTGCTGCTCTGTCTCAGCGCCGCCTCCCTGCTTCTTAACAGGTATATTC  148

Query  149  ATATTTTAATGATCTTCTGGTCATTTGTTGCTGGAGTTGTCACATTCTACTGCTCACTAGGACCTGATTCTCTC  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  ATATTTTAATGATCTTCTGGTCATTTGTTGCTGGAGTTGTCACATTCTACTGCTCACTAGGACCTGATTCTCTC  222

Query  223  TTACCAAATATATTCTTCACAATAAAATACAAACCCAAGCAGTTAGGACTTCAGGAATTATTTCCTCAAGGTCA  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  TTACCAAATATATTCTTCACAATAAAATACAAACCCAAGCAGTTAGGACTTCAGGAATTATTTCCTCAAGGTCA  296

Query  297  TAGCTGTGCTGTTTGTGGTAAAGTGAAATGTAAACGACATAGGCCTTCTTTGCTACTTGAAAACTACCAGCCAT  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  TAGCTGTGCTGTTTGTGGTAAAGTGAAATGTAAACGACATAGGCCTTCTTTGCTACTTGAAAACTACCAGCCAT  370

Query  371  GGCTAGACCTGAAAATTTCTTCCAAGGTTGATGCATCTCTCTCAG-----------------------------  415
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                             
Sbjct  371  GGCTAGACCTGAAAATTTCTTCCAAGGTTGATGCATCTCTCTCAGAGGTTCTTGAATTAGTGTTGGAAAACTTT  444

Query  416  --------------------------------------------------------------------------  415
                                                                                      
Sbjct  445  GTTTATCCGTGGTACAGGGATGTGACAGATGATGAATCCTTTGTTGATGAACTGAGAATAACATTACGTTTTTT  518

Query  416  -----------------------------AGGTGGATATTCCATCTATTATAACCAAGAAACTATTAAAAGCAG  460
                                         |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  TGCATCTGTCTTAATAAGAAGGATTCACAAGGTGGATATTCCATCTATTATAACCAAGAAACTATTAAAAGCAG  592

Query  461  CAATGAAGCATATAGAAGTGATAGTTAAAGCCAGACAGAAAGTAAAAAATACAGAGTTTTTACAGCAAGCTGCT  534
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  CAATGAAGCATATAGAAGTGATAGTTAAAGCCAGACAGAAAGTAAAAAATACAGAGTTTTTACAGCAAGCTGCT  666

Query  535  TTAGAAGAATATGGTCCAGAGCTTCATGTTGCTTTGAGAAGTCGAAGAGATGAATTGCACTATTTAAGGAAACT  608
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  TTAGAAGAATATGGTCCAGAGCTTCATGTTGCTTTGAGAAGTCGAAGAGATGAATTGCACTATTTAAGGAAACT  740

Query  609  TACTGAACTGCTTTTTCCTTATATTTTGCCTCCTAAAGCAACAGACTGCAGATCTCTGACCTTACTTATAAGAG  682
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  TACTGAACTGCTTTTTCCTTATATTTTGCCTCCTAAAGCAACAGACTGCAGATCTCTGACCTTACTTATAAGAG  814

Query  683  AGATTCTGTCTGGCTCTGTGTTCCTTCCTTCTTTGGATTTCCTAGCTGATCCAGATACTGTGAATCATTTGCTT  756
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  AGATTCTGTCTGGCTCTGTGTTCCTTCCTTCTTTGGATTTCCTAGCTGATCCAGATACTGTGAATCATTTGCTT  888

Query  757  ATCATCTTCATAGATGACAGTCCACCTGAAAAAGCAACTGAACCGGCTTCTCCTTTGGTTCCATTCTTGCAGAA  830
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  ATCATCTTCATAGATGACAGTCCACCTGAAAAAGCAACTGAACCGGCTTCTCCTTTGGTTCCATTCTTGCAGAA  962

Query  831  ATTTGCAGAACCTAGAAATAAAAAGCCATCTGTGCTGAAGTTAGAATTGAAGCAAATCAGAGAGCAACAAGATC  904
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  ATTTGCAGAACCTAGAAATAAAAAGCCATCTGTGCTGAAGTTAGAATTGAAGCAAATCAGAGAGCAACAAGATC  1036

Query  905  TTTTATTTCGTTTTATGAACTTTCTGAAACAAGAAGGCGCAGTGCACGTGTTGCAGTTTTGTTTGACTGTGGAG  978
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  TTTTATTTCGTTTTATGAACTTTCTGAAACAAGAAGGCGCAGTGCACGTGTTGCAGTTTTGTTTGACTGTGGAG  1110

Query  979  GAATTTAATGATAGAATTTTACGACCAGAATTATCAAATGATGAAATGCTGTCTCTTCATGAAGAATTGCAGAA  1052
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  GAATTTAATGATAGAATTTTACGACCAGAATTATCAAATGATGAAATGCTGTCTCTTCATGAAGAATTGCAGAA  1184

Query 1053  GATTTATAAAACATACTGTTTGGATGAAAGTATTGACAAAATTAGATTTGATCCCTTCATTGTAGAAGAGATTC  1126
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  GATTTATAAAACATACTGTTTGGATGAAAGTATTGACAAAATTAGATTTGATCCCTTCATTGTAGAAGAGATTC  1258

Query 1127  AAAGAATTGCTGAAGGCCCATACATAGATGTTGTGAAACTTCAAACTATGAGATGTCTTTTTGAAGCATATGAA  1200
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  AAAGAATTGCTGAAGGCCCATACATAGATGTTGTGAAACTTCAAACTATGAGATGTCTTTTTGAAGCATATGAA  1332

Query 1201  CATGTTCTTTCCCTTTTGGAGAATGTATTTACTCCTATGTTCTGCCATAGTGATGAGTATTTCAGACAACTTTT  1274
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  CATGTTCTTTCCCTTTTGGAGAATGTATTTACTCCTATGTTCTGCCATAGTGATGAGTATTTCAGACAACTTTT  1406

Query 1275  AAGAGGTGCAGAATCACCAACACGCAATTCAAAATTGAACA---------------------------GGAACA  1321
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                           ||||||
Sbjct 1407  AAGAGGTGCAGAATCACCAACACGCAATTCAAAATTGAACAGAGGTAGCCTAAGTTTGGATGATTTTCGGAACA  1480

Query 1322  CACAGAAAAGGGGAGAATCATTTGGAATCAGCAGAATAGGTAGCAAAATTAAAGGAGTATTCAAAAGTACCACA  1395
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481  CACAGAAAAGGGGAGAATCATTTGGAATCAGCAGAATAGGTAGCAAAATTAAAGGAGTATTCAAAAGTACCACA  1554

Query 1396  ATGGAGGGAGCTATGTTGCCTAATTATGGTGTAGCTGAAGGTGAAGATGATTTTATTGAAGAAGGTATTGTTGT  1469
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555  ATGGAGGGAGCTATGTTGCCTAATTATGGTGTAGCTGAAGGTGAAGATGATTTTATTGAAGAAGGTATTGTTGT  1628

Query 1470  AATGGAAGATGATTCTCCAGTGGAGGCTGTGAGCACACCTAATACTCCCCGAAACCTTGCTGCATGGAAAATTA  1543
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629  AATGGAAGATGATTCTCCAGTGGAGGCTGTGAGCACACCTAATACTCCCCGAAACCTTGCTGCATGGAAAATTA  1702

Query 1544  GCATTCCATATGTAGACTTTTTTGAGGATCCCTCCTCTGAAAGGAAGGAGAAAAAAGAAAGAATTCCTGTGTTT  1617
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703  GCATTCCATATGTAGACTTTTTTGAGGATCCCTCCTCTGAAAGGAAGGAGAAAAAAGAAAGAATTCCTGTGTTT  1776

Query 1618  TGTATTGATGTTGAAAGAAATGATAGAAGAGCAGTTGGACACGAGCCTGAACATTGGTCTGTCTATAGAAGATA  1691
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777  TGTATTGATGTTGAAAGAAATGATAGAAGAGCAGTTGGACACGAGCCTGAACATTGGTCTGTCTATAGAAGATA  1850

Query 1692  TCTTGAATTCTATGTACTTGAATCAAAACTAACAGAATTTCATGGTGCATTTCCTGATGCCCAGCTTCCTTCTA  1765
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1851  TCTTGAATTCTATGTACTTGAATCAAAACTAACAGAATTTCATGGTGCATTTCCTGATGCCCAGCTTCCTTCTA  1924

Query 1766  AGAGGATCATTGGCCCCAAAAATTATGAATTCTTAAAGTCAAAGAGGGAAGAGTTCCAAGAATATCTACAGAAA  1839
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1925  AGAGGATCATTGGCCCCAAAAATTATGAATTCTTAAAGTCAAAGAGGGAAGAGTTCCAAGAATATCTACAGAAA  1998

Query 1840  CTTCTGCAGCATCCAGAACTGAGTAATAGTCAACTTCTGGCAGACTTTCTTTCCCCTAATGGTGGGGAAACACA  1913
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1999  CTTCTGCAGCATCCAGAACTGAGTAATAGTCAACTTCTGGCAGACTTTCTTTCCCCTAATGGTGGGGAAACACA  2072

Query 1914  ATTTCTTGATAAGATACTACCAGATGTAAATCTTGGGAAAATTATAAAATCTGTTCCTGGAAAACTAATGAAAG  1987
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2073  ATTTCTTGATAAGATACTACCAGATGTAAATCTTGGGAAAATTATAAAATCTGTTCCTGGAAAACTAATGAAAG  2146

Query 1988  AGAAAGGTCAGCATTTGGAACCTTTTATCATGAATTTCATTAATTCTTGTGAGTCTCCAAAGCCTAAACCAAGT  2061
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2147  AGAAAGGTCAGCATTTGGAACCTTTTATCATGAATTTCATTAATTCTTGTGAGTCTCCAAAGCCTAAACCAAGT  2220

Query 2062  AGACCAGAACTGACCATTCTCAGCCCTACTTCAGAAAACAACAAGAAGCTTTTCAATGATCTGTTTAAAAATAA  2135
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2221  AGACCAGAACTGACCATTCTCAGCCCTACTTCAGAAAACAACAAGAAGCTTTTCAATGATCTGTTTAAAAATAA  2294

Query 2136  TGCAAACCGTGCTGAAAATACAGAGAGAAAGCAAAATCAGAATTATTTTATGGAGGTGATGACTGTAGAAGGAG  2209
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2295  TGCAAACCGTGCTGAAAATACAGAGAGAAAGCAAAATCAGAATTATTTTATGGAGGTGATGACTGTAGAAGGAG  2368

Query 2210  TCTATGATTACCTGATGTATGTAGGACGGGTAGTTTTCCAGGTTCCTGACTGGCTTCATCATCTCTTAATGGGA  2283
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2369  TCTATGATTACCTGATGTATGTAGGACGGGTAGTTTTCCAGGTTCCTGACTGGCTTCATCATCTCTTAATGGGA  2442

Query 2284  ACTCGAATCCTCTTTAAAAACACCCTGGAAATGTATACTGATTACTATCTTCAGTGTAAACTAGAACAGCTATT  2357
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2443  ACTCGAATCCTCTTTAAAAACACCCTGGAAATGTATACTGATTACTATCTTCAGTGTAAACTAGAACAGCTATT  2516

Query 2358  TCAGGAGCACCGTTTGGTCTCACTCATAACACTTCTCAGAGATGCTATATTCTGTGAAAACACTGAACCTCGCT  2431
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2517  TCAGGAGCACCGTTTGGTCTCACTCATAACACTTCTCAGAGATGCTATATTCTGTGAAAACACTGAACCTCGCT  2590

Query 2432  CTCTCCAAGATAAGCAAAAAGGAGCAAAACAGACTTTTGAAGAAATGATGAATTACATTCCAGATCTGTTAGTC  2505
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2591  CTCTCCAAGATAAGCAAAAAGGAGCAAAACAGACTTTTGAAGAAATGATGAATTACATTCCAGATCTGTTAGTC  2664

Query 2506  AAGTGTATTGGTGAAGAAACCAAGTATGAAAGCATCAGACTTCTGTTTGATGGCTTACAGCAACCAGTACTCAA  2579
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2665  AAGTGTATTGGTGAAGAAACCAAGTATGAAAGCATCAGACTTCTGTTTGATGGCTTACAGCAACCAGTACTCAA  2738

Query 2580  CAAGCAGCTGACTTATGTTTTATTGGACATTGTGATACAGGAACTGTTTCCAGAGCTCAATAAGGTACAAAAGG  2653
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2739  CAAGCAGCTGACTTATGTTTTATTGGACATTGTGATACAGGAACTGTTTCCAGAGCTCAATAAGGTACAAAAGG  2812

Query 2654  AAGTTACCTCTGTGACATTTTGGATG  2679
            ||||||||||||||||||.|||||||
Sbjct 2813  AAGTTACCTCTGTGACATCTTGGATG  2838