Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000468783
• Subject: NM_172926.3
• Aligned Length: 2894
• Identities: 2416
• Gaps: 217

Alignment

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct    1  ATGTGGCTCCGCCGCCGGGGTTTGGGGGTGCCCTCCGCCTCTGCCTCTGAGGGCGGCACGTCCTCCCCTGCGTG  74

Query    1  -------ATGGTGCCCTGGGTGCGGACGA--TGGGGCAGAAGCTGAAGCAGCGGCTGCGACTGGACGTGGGACG  65
                   ||||.|.|.|||||||||||||  ||.||  ||.||||||||||||||||||.|||||||||||.||
Sbjct   75  GACTGAGATGGGGTCTTGGGTGCGGACGATCTGCGG--GAGGCTGAAGCAGCGGCTGCGGCTGGACGTGGGGCG  146

Query   66  CGAGATCTGCCGCCAGTACCCGCTGTTCTGCTTCCTGCTGCTCTGTCTCAGCGCCGCCTCCCTGCTTCTTAACA  139
            ||||||.|||||.|||||.||||||||||||||.|||||||||||.|||||||.||||||.|||||.||.||||
Sbjct  147  CGAGATTTGCCGTCAGTATCCGCTGTTCTGCTTTCTGCTGCTCTGCCTCAGCGTCGCCTCGCTGCTCCTCAACA  220

Query  140  GGTATATTCATATTTTAATGATCTTCTGGTCATTTGTTGCTGGAGTTGTCACATTCTACTGCTCACTAGGACCT  213
            |||||.|.|||.|.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||.|||.|||||||.
Sbjct  221  GGTATCTGCATGTCTTAATGATCTTCTGGTCGTTTGTTGCTGGAGTTGTGACATTCTACTGTTCATTAGGACCC  294

Query  214  GATTCTCTCTTACCAAATATATTCTTCACAATAAAATACAAACCCAAGCAGTTAGGACTTCAGGAATTATTTCC  287
            |||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||.||||||||
Sbjct  295  GATTCCCTCTTACCAAATATATTCTTCACAATAAAATACAAACCCAAGCAATTAGGACTTCAAGAGTTATTTCC  368

Query  288  TCAAGGTCATAGCTGTGCTGTTTGTGGTAAAGTGAAATGTAAACGACATAGGCCTTCTTTGCTACTTGAAAACT  361
            .|||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||.||||||||||
Sbjct  369  GCAAGGACATAGCTGTGCTGTTTGTGGTAAAGTGAAATGTAAACGGCATAGGCCTTCCTTGCTCCTTGAAAACT  442

Query  362  ACCAGCCATGGCTAGACCTGAAAATTTCTTCCAAGGTTGATGCATCTCTCTCAG--------------------  415
            |.|||||.|||||||||||||||.|||||||.|||||.||||||||||||||||                    
Sbjct  443  ATCAGCCCTGGCTAGACCTGAAAGTTTCTTCGAAGGTAGATGCATCTCTCTCAGAGGTTCTTGAATTAGTGTTG  516

Query  416  --------------------------------------------------------------------------  415
                                                                                      
Sbjct  517  GAAAACTTTGTCTATCCATGGTACAGGGATGTGACGGATGATGAGTCCTTTGTTGATGAGCTGAGGATCACCTT  590

Query  416  --------------------------------------AGGTGGATATTCCATCTATTATAACCAAGAAACTAT  451
                                                  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  591  ACGGTTTTTTGCATCTGTCTTGGTGCGAAGAATTCACAAGGTGGATATTCCATCTATTATAACCAAGAAACTAT  664

Query  452  TAAAAGCAGCAATGAAGCATATAGAAGTGATAGTTAAAGCCAGACAGAAAGTAAAAAATACAGAGTTTTTACAG  525
            ||||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||.||.||.||||.||||||.
Sbjct  665  TAAAAGCAGCAATGAAACATATAGAAGTGATTGTTAAAGCAAGACAGAAAGTAAAGAACACGGAGTATTTACAA  738

Query  526  CAAGCTGCTTTAGAAGAATATGGTCCAGAGCTTCATGTTGCTTTGAGAAGTCGAAGAGATGAATTGCACTATTT  599
            |||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||..||||||||||||||||||||||.||.|||||
Sbjct  739  CAAGCCGCTTTAGAAGAATATGGTCCAGAGCTTCATGTGGCCCTGAGAAGTCGAAGAGATGAATTACAGTATTT  812

Query  600  AAGGAAACTTACTGAACTGCTTTTTCCTTATATTTTGCCTCCTAAAGCAACAGACTGCAGATCTCTGACCTTAC  673
            ||||||.||||||||..|.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||.||||
Sbjct  813  AAGGAAGCTTACTGAGTTACTTTTTCCTTATATTTTGCCTCCTAAAGCAACAGACTGCAGGTCCCTGACATTAC  886

Query  674  TTATAAGAGAGATTCTGTCTGGCTCTGTGTTCCTTCCTTCTTTGGATTTCCTAGCTGATCCAGATACTGTGAAT  747
            |.||||||||||||||||||||.||||||.|.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||
Sbjct  887  TCATAAGAGAGATTCTGTCTGGTTCTGTGCTTCTTCCTTCTTTGGATTTCCTAGCTGATCCAGATACTGTCAAT  960

Query  748  CATTTGCTTATCATCTTCATAGATGACAGTCCACCTGAAAAAGCAACTGAACCGGCTTCTCCTTTGGTTCCATT  821
            |||||||||||||||||||||||.|||||.||.||||||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||
Sbjct  961  CATTTGCTTATCATCTTCATAGACGACAGCCCTCCTGAAAAAGCAACTGAACCAGCTTCCCCTTTGGTTCCATT  1034

Query  822  CTTGCAGAAATTTGCAGAACCTAGAAATAAAAAGCCATCTGTGCTGAAGTTAGAATTGAAGCAAATCAGAGAGC  895
            |.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||..||||.|||||||||||.|
Sbjct 1035  CCTGCAGAAATTTGCAGAACCTAGAAATAAAAAGCCATCCGTGCTGAAGTTAGAGCTGAAACAAATCAGAGAAC  1108

Query  896  AACAAGATCTTTTATTTCGTTTTATGAACTTTCTGAAACAAGAAGGCGCAGTGCACGTGTTGCAGTTTTGTTTG  969
            |.||.||.|||||.||.||.|||||||||||.||||||||||||||.||.||||||||..|||||||.|||.||
Sbjct 1109  AGCAGGACCTTTTGTTCCGCTTTATGAACTTCCTGAAACAAGAAGGGGCCGTGCACGTCCTGCAGTTCTGTCTG  1182

Query  970  ACTGTGGAGGAATTTAATGATAGAATTTTACGACCAGAATTATCAAATGATGAAATGCTGTCTCTTCATGAAGA  1043
            ||.||.|||||||||||||||||||||||.||.|||||.||||||||||||||||||||.|||||.||||||||
Sbjct 1183  ACAGTCGAGGAATTTAATGATAGAATTTTGCGTCCAGAGTTATCAAATGATGAAATGCTATCTCTCCATGAAGA  1256

Query 1044  ATTGCAGAAGATTTATAAAACATACTGTTTGGATGAAAGTATTGACAAAATTAGATTTGATCCCTTCATTGTAG  1117
            ||||||||||||||||||.||.|||||.|||||||||||.||||||||||||.|.|||||||||||||||||.|
Sbjct 1257  ATTGCAGAAGATTTATAAGACCTACTGCTTGGATGAAAGCATTGACAAAATTCGCTTTGATCCCTTCATTGTCG  1330

Query 1118  AAGAGATTCAAAGAATTGCTGAAGGCCCATACATAGATGTTGTGAAACTTCAAACTATGAGATGTCTTTTTGAA  1191
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||.||||||||||||
Sbjct 1331  AAGAGATTCAAAGAATTGCTGAAGGCCCATACATAGATGTTGTGAAGCTGCAAACTATGAGGTGTCTTTTTGAA  1404

Query 1192  GCATATGAACATGTTCTTTCCCTTTTGGAGAATGTATTTACTCCTATGTTCTGCCATAGTGATGAGTATTTCAG  1265
            ||||||||.||.||.||||||||.||||||||.||.|||||.||.|||||||||||.||||||||||||||.||
Sbjct 1405  GCATATGAGCACGTCCTTTCCCTGTTGGAGAACGTGTTTACCCCCATGTTCTGCCACAGTGATGAGTATTTTAG  1478

Query 1266  ACAACTTTTAAGAGGTGCAGAATCACCAACACGCAATTCAAAATTGAACAGGAACACACAGAAAAGGGGAGAAT  1339
            .|||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||.|||||.|||||.|.||||||.|||||.|||||||
Sbjct 1479  GCAACTTTTAAGAGGTGCAGAATCGCCCACACGCAATTCCAAATTCAACAGAAGCACACAAAAAAGAGGAGAAT  1552

Query 1340  CATTTGGAATCAGCAGAATAGGTAGCAAAATTAAAGGAGTATTCAAAAGTACCACAATGGAGGGAGCTATGTTG  1413
            |.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||.|||||||||||||||.||.||
Sbjct 1553  CGTTTGGAATCAGCAGAATAGGTAGCAAAATTAAAGGCGTATTCAAGAGTACGACAATGGAGGGAGCTGTGCTG  1626

Query 1414  CCTAATTATGGTGTAGCTGAAGGTGAAGATGATTTTATTGAAGAAGGTATTGTTGTAATGGAAGATGATTCTCC  1487
            ||||||||.||.||.||||||||.||||||||.||||||||||||||.|||||.||||||||.|||||.|||||
Sbjct 1627  CCTAATTACGGGGTGGCTGAAGGCGAAGATGACTTTATTGAAGAAGGGATTGTGGTAATGGAGGATGACTCTCC  1700

Query 1488  AGTGGAGGCTGTGAGCACACCTAATACTCCCCGAAACCTTGCTGCATGGAAAATTAGCATTCCATATGTAGACT  1561
            |||.||.|||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||||
Sbjct 1701  AGTAGAAGCTGTGAGCACACCTAACACTCCTCGAAACCTTGCTGCCTGGAAAATTAGCATTCCGTATGTAGACT  1774

Query 1562  TTTTTGAGGATCCCTCCTCTGAAAGGAAGGAGAAAAAAGAAAGAATTCCTGTGTTTTGTATTGATGTTGAAAGA  1635
            |||||||.||||||||||||||||||||.|||||.||.||.||||||||||||||||||||.||||||||||||
Sbjct 1775  TTTTTGAAGATCCCTCCTCTGAAAGGAAAGAGAAGAAGGAGAGAATTCCTGTGTTTTGTATCGATGTTGAAAGA  1848

Query 1636  AATGATAGAAGAGCAGTTGGACACGAGCCTGAACATTGGTCTGTCTATAGAAGATATCTTGAATTCTATGTACT  1709
            ||.||.|||.||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||
Sbjct 1849  AACGACAGACGAGCAGTTGGACACGAGCCTGAGCATTGGTCTGTCTATAGAAGATATCTTGAATTCTATGTTCT  1922

Query 1710  TGAATCAAAACTAACAGAATTTCATGGTGCATTTCCTGATGCCCAGCTTCCTTCTAAGAGGATCATTGGCCCCA  1783
            |||||||||||||||||||||||||||..|||||||||||||.||||||||.||.||.||||||||||||||||
Sbjct 1923  TGAATCAAAACTAACAGAATTTCATGGCACATTTCCTGATGCTCAGCTTCCATCCAAAAGGATCATTGGCCCCA  1996

Query 1784  AAAATTATGAATTCTTAAAGTCAAAGAGGGAAGAGTTCCAAGAATATCTACAGAAACTTCTGCAGCATCCAGAA  1857
            ||||.|||||.||.||.|||||.|||||.||.||||||||.||.|||||.|||||||||.|||||||.||.||.
Sbjct 1997  AAAACTATGAGTTTTTGAAGTCGAAGAGAGAGGAGTTCCAGGAGTATCTGCAGAAACTTGTGCAGCACCCGGAG  2070

Query 1858  CTGAGTAATAGTCAACTTCTGGCAGACTTTCTTTCCCCTAATGGTGGGGAAACACAATTTCTTGATAAGATACT  1931
            ||||||||.||.||.||||||||.||||||||.|||||.||.||||||||.|||||.|||||.|||||||||||
Sbjct 2071  CTGAGTAACAGCCAGCTTCTGGCTGACTTTCTCTCCCCCAACGGTGGGGAGACACAGTTTCTAGATAAGATACT  2144

Query 1932  ACCAGATGTAAATCTTGGGAAAATTATAAAATCTGTTCCTGGAAAACTAATGAAAGAGAAAGGTCAGCATTTGG  2005
            .|||||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2145  TCCAGATGTAAATCTTGGAAAAATTATAAAGTCTGTTCCTGGGAAACTAATGAAAGAGAAAGGTCAGCATTTGG  2218

Query 2006  AACCTTTTATCATGAATTTCATTAATTCTTGTGAGTCTCCAAAGCCTAAACCAAGTAGACCAGAACTGACCATT  2079
            |.||.||.|||||||.|||||||||||||||.||.|||||.||.||||||||.|||.|.|||||||||||.|||
Sbjct 2219  AGCCATTCATCATGAGTTTCATTAATTCTTGCGAATCTCCCAAACCTAAACCGAGTCGGCCAGAACTGACGATT  2292

Query 2080  CTCAGCCCTACTTCAGAAAACAACAAGAAGCTTTTCAATGATCTGTTTAAAAATAATGCAAACCGTGCTGAAAA  2153
            ||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||.|||||.||
Sbjct 2293  CTCAGCCCCACTTCCGAAAACAACAAGAAGCTTTTCAACGATCTGTTTAAGAATAATGCAAACCGCGCTGAGAA  2366

Query 2154  TACAGAGAGAAAGCAAAATCAGAATTATTTTATGGAGGTGATGACTGTAGAAGGAGTCTATGATTACCTGATGT  2227
            .||||||.||||||||||||||||.||.||.|||||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||||
Sbjct 2367  CACAGAGCGAAAGCAAAATCAGAACTACTTCATGGAGGTGATGACTGTGGACGGAGTCTATGATTACCTGATGT  2440

Query 2228  ATGTAGGACGGGTAGTTTTCCAGGTTCCTGACTGGCTTCATCATCTCTTAATGGGAACTCGAATCCTCTTTAAA  2301
            |||||||.||.||||||||.||.||.||.|||||||||||||||||..|||||||||||||||||||||||||.
Sbjct 2441  ATGTAGGGCGAGTAGTTTTTCAAGTCCCAGACTGGCTTCATCATCTTCTAATGGGAACTCGAATCCTCTTTAAG  2514

Query 2302  AACACCCTGGAAATGTATACTGATTACTATCTTCAGTGTAAACTAGAACAGCTATTTCAGGAGCACCGTTTGGT  2375
            |||||||||||||||||.||.||.|||||.||.|||||.||.||.||.|||||.||||||||||||||..||||
Sbjct 2515  AACACCCTGGAAATGTACACAGACTACTACCTCCAGTGCAAGCTGGAGCAGCTGTTTCAGGAGCACCGGCTGGT  2588

Query 2376  CTCACTCATAACACTTCTCAGAGATGCTATATTCTGTGAAAACACTGAACCTCGCTCTCTCCAAGATAAGCAAA  2449
            |||.|||||.||.||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2589  CTCCCTCATCACCCTTCTCAGAGATGCTATATTTTGTGAAAATACTGAACCTCGCTCTCTCCAAGATAAGCAAA  2662

Query 2450  AAGGAGCAAAACAGACTTTTGAAGAAATGATGAATTACATTCCAGATCTGTTAGTCAAGTGTATTGGTGAAGAA  2523
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||.|||||||||
Sbjct 2663  AAGGAGCAAAACAGACTTTTGAAGAAATGATGAATTACATTCCAGATCTGATAGTCAAGTGTATCGGTGAAGAA  2736

Query 2524  ACCAAGTATGAAAGCATCAGACTTCTGTTTGATGGCTTACAGCAACCAGTACTCAACAAGCAGCTGACTTATGT  2597
            ||||||||.||||||||||||||.||||||||||||.|.|||||.|||||.|||||||||||||||||.|||||
Sbjct 2737  ACCAAGTACGAAAGCATCAGACTCCTGTTTGATGGCCTGCAGCAGCCAGTGCTCAACAAGCAGCTGACCTATGT  2810

Query 2598  TTTATTGGACATTGTGATACAGGAACTGTTTCCAGAGCTCAATAAGGTACAAAAGGAAGTTACCTCTGTGACAT  2671
            .||..|||||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||.||||||..||||||
Sbjct 2811  GTTGCTGGACATTGTGATACAGGAGCTGTTTCCAGAGCTAAATAAGGTACAAAAGGAAGCTACCTCCATGACAT  2884

Query 2672  TTTGGATG  2679
            ..||||||
Sbjct 2885  CCTGGATG  2892