Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000468783
• Subject: NR_146774.1
• Aligned Length: 3768
• Identities: 2632
• Gaps: 1111

Alignment

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct    1  GTGCTGTAGTTTCTTCCGGGCTCCCTACAACCTTCTTCCCTCTCCTCCGCAATACAGGCAGTTACTGGGTGCTG  74

Query    1  ------------------------------------------------------ATGG-----TGC--------  7
                                                                  |.||     |||        
Sbjct   75  GGGCTGTCCTTTGATTTCCGGAAATGGCCGGTCGCCAGTGTTGTCAGAGTTTCCACGGAAGACTGCGCGCTACT  148

Query    8  ----CCTGG-GTGCGGACGATGGGGC-AGAAGCT-GAAGC--AGCGGCTG-----CGACT----GGACGT----  59
                ||.|| |.|||||    |.||| |||.||| ||.||  .|| ||||     |||||    |.||||    
Sbjct  149  CCGGCCAGGAGGGCGGA----GCGGCGAGACGCTAGAGGCTTTGC-GCTGGGTGACGACTTCGGGCACGTTCTA  217

Query   60  ----------------------GGGA-CGCGAGATCTGCCGCCAGTACCCGCTGTTC----TGCTTCCTGCTGC  106
                                  |||| ||||      |||||  |.||.|||.|  |    .||.|...|||| 
Sbjct  218  CGGCCGTTCCTCTGGTCGGCTGGGGACCGCG------GCCGC--GCACGCGCGG--CGGGGGGCGTGGGGCTG-  280

Query  107  TCTGTCTCAG-----CGCCGCCTC--CCTGCTTC--TTAA---CAGGTATATTCATATTTTAATGATCTTCTGG  168
               |.|.|||     |||..||||  |||||..|  .|||   |.|||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  281  ---GGCCCAGCCGGACGCGACCTCAGCCTGCGGCGGCTAACTGCCGGTATATTCATATTTTAATGATCTTCTGG  351

Query  169  TCATTTGTTGCTGGAGTTGTCACATTCTACTGCTCACTAGGACCTGATTCTCTCTTACCAAATATATTCTTCAC  242
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  352  TCATTTGTTGCTGGAGTTGTCACATTCTACTGCTCACTAGGACCTGATTCTCTCTTACCAAATATATTCTTCAC  425

Query  243  AATAAAATACAAACCCAAGCAGTTAGGACTTCAGGAATTATTTCCTCAAGGTCATAGCTGTGCTGTTTGTGGTA  316
            |||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  426  AATAAAATACAAACCCA---AGTTAGGACTTCAGGAATTATTTCCTCAAGGTCATAGCTGTGCTGTTTGTGGTA  496

Query  317  AAGTGAAATGTAAACGACATAGGCCTTCTTTGCTACTTGAAAACTACCAGCCATGGCTAGACCTGAAAATTTCT  390
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  497  AAGTGAAATGTAAACGACATAGGCCTTCTTTGCTACTTGAAAACTACCAGCCATGGCTAGACCTGAAAATTTCT  570

Query  391  TCCAAGGTTGATGCATCTCTCTCAG-------------------------------------------------  415
            |||||||||||||||||||||||||                                                 
Sbjct  571  TCCAAGGTTGATGCATCTCTCTCAGAGGTTCTTGAATTAGTGTTGGAAAACTTTGTTTATCCGTGGTACAGGGA  644

Query  416  --------------------------------------------------------------------------  415
                                                                                      
Sbjct  645  TGTGACAGATGATGAATCCTTTGTTGATGAACTGAGAATAACATTACGTTTTTTTGCATCTGTCTTAATAAGAA  718

Query  416  ---------AGGTGGATATTCCATCTATTATAACCAAGAAACTATTAAAAGCAGCAATGAAGCATATAGAAGTG  480
                     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  719  GGATTCACAAGGTGGATATTCCATCTATTATAACCAAGAAACTATTAAAAGCAGCAATGAAGCATATAGAAGTG  792

Query  481  ATAGTTAAAGCCAGACAGAAAGTAAAAAATACAGAGTTTTTACAGCAAGCTGCTTTAGAAGAATATGGTCCAGA  554
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  793  ATAGTTAAAGCCAGACAGAAAGTAAAAAATACAGAGTTTTTACAGCAAGCTGCTTTAGAAGAATATGGTCCAGA  866

Query  555  GCTTCATGTTGCTTTGAGAAGTCGAAGAGATGAATTGCACTATTTAAGGAAACTTACTGAACTGCTTTTTCCTT  628
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  867  GCTTCATGTTGCTTTGAGAAGTCGAAGAGATGAATTGCACTATTTAAGGAAACTTACTGAACTGCTTTTTCCTT  940

Query  629  ATATTTTGCCTCCTAAAGCAACAGACTGCAGATCTCTGACCTTACTTATAAGAGAGATTCTGTCTGGCTCTGTG  702
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  941  ATATTTTGCCTCCTAAAGCAACAGACTGCAGATCTCTGACCTTACTTATAAGAGAGATTCTGTCTGGCTCTGTG  1014

Query  703  TTCCTTCCTTCTTTGGATTTCCTAGCTGATCCAGATACTGTGAATCATTTGCTTATCATCTTCATAGATGACAG  776
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1015  TTCCTTCCTTCTTTGGATTTCCTAGCTGATCCAGATACTGTGAATCATTTGCTTATCATCTTCATAGATGACAG  1088

Query  777  TCCACCTGAAAAAGCAACTGAACCGGCTTCTCCTTTGGTTCCATTCTTGCAGAAATTTGCAGAACCTAGAAATA  850
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1089  TCCACCTGAAAAAGCAACTGAACCGGCTTCTCCTTTGGTTCCATTCTTGCAGAAATTTGCAGAACCTAGAAATA  1162

Query  851  AAAAGCCATCTGTGCTGAAGTTAGAATTGAAGCAAATCAGAGAGCAACAAGATCTTTTATTTCGTTTTATGAAC  924
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1163  AAAAGCCATCTGTGCTGAAGTTAGAATTGAAGCAAATCAGAGAGCAACAAGATCTTTTATTTCGTTTTATGAAC  1236

Query  925  TTTCTGAAACAAGAAGGCGCAGTGCACGTGTTGCAGTTTTGTTTGACTGTGGAGGAATTTAATGATAGAATTTT  998
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1237  TTTCTGAAACAAGAAGGCGCAGTGCACGTGTTGCAGTTTTGTTTGACTGTGGAGGAATTTAATGATAGAATTTT  1310

Query  999  ACGACCAGAATTATCAAATGATGAAATGCTGTCTCTTCATGAAGAATTGCAGAAGATTTATAAAACATACTGTT  1072
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1311  ACGACCAGAATTATCAAATGATGAAATGCTGTCTCTTCATGAAGAATTGCAGAAGATTTATAAAACATACTGTT  1384

Query 1073  TGGATGAAAGTATTGACAAAATTAGATTTGATCCCTTCATTGTAGAAGAGATTCAAAGAATTGCTGAAGGCCCA  1146
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1385  TGGATGAAAGTATTGACAAAATTAGATTTGATCCCTTCATTGTAGAAGAGATTCAAAGAATTGCTGAAGGCCCA  1458

Query 1147  TACATAGATGTTGTGAAACTTCAAACTATGAGATGTCTTTTTGAAGCATATGAACATGTTCTTTCCCTTTTGGA  1220
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1459  TACATAGATGTTGTGAAACTTCAAACTATGAGATGTCTTTTTGAAGCATATGAACATGTTCTTTCCCTTTTGGA  1532

Query 1221  GAATGTATTTACTCCTATGTTCTGCCATAGTGATGAGTATTTCAGACAACTTTTAAGAGGTGCAGAATCACCAA  1294
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1533  GAATGTATTTACTCCTATGTTCTGCCATAGTGATGAGTATTTCAGACAACTTTTAAGAGGTGCAGAATCACCAA  1606

Query 1295  CACGCAATTCAAAATTGAACA---------------------------GGAACACACAGAAAAGGGGAGAATCA  1341
            |||||||||||||||||||||                           ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1607  CACGCAATTCAAAATTGAACAGAGGTAGCCTAAGTTTGGATGATTTTCGGAACACACAGAAAAGGGGAGAATCA  1680

Query 1342  TTTGGAATCAGCAGAATAGGTAGCAAAATTAAAGGAGTATTCAAAAGTACCACAATGGAGGGAGCTATGTTGCC  1415
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1681  TTTGGAATCAGCAGAATAGGTAGCAAAATTAAAGGAGTATTCAAAAGTACCACAATGGAGGGAGCTATGTTGCC  1754

Query 1416  TAATTATGGTGTAGCTGAAGGTGAAGATGATTTTATTGAAGAAGGTATTGTTGTAATGGAAGATGATTCTCCAG  1489
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1755  TAATTATGGTGTAGCTGAAGGTGAAGATGATTTTATTGAAGAAGGTATTGTTGTAATGGAAGATGATTCTCCAG  1828

Query 1490  TGGAGGCTGTGAGCACACCTAATACTCCCCGAAACCTTGCTGCATGGAAAATTAGCATTCCATATGTAGACTTT  1563
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1829  TGGAGGCTGTGAGCACACCTAATACTCCCCGAAACCTTGCTGCATGGAAAATTAGCATTCCATATGTAGACTTT  1902

Query 1564  TTTGAGGATCCCTCCTCTGAAAGGAAGGAGAAAAAAGAAAGAATTCCTGTGTTTTGTATTGATGTTGAAAGAAA  1637
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1903  TTTGAGGATCCCTCCTCTGAAAGGAAGGAGAAAAAAGAAAGAATTCCTGTGTTTTGTATTGATGTTGAAAGAAA  1976

Query 1638  TGATAGAAGAGCAGTTGGACACGAGCCTGAACATTGGTCTGTCTATAGAAGATATCTTGAATTCTATGTACTTG  1711
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1977  TGATAGAAGAGCAGTTGGACACGAGCCTGAACATTGGTCTGTCTATAGAAGATATCTTGAATTCTATGTACTTG  2050

Query 1712  AATCAAAACTAACAGAATTTCATGGTGCATTTCCTGATGCCCAGCTTCCTTCTAAGAGGATCATTGGCCCCAAA  1785
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2051  AATCAAAACTAACAGAATTTCATGGTGCATTTCCTGATGCCCAGCTTCCTTCTAAGAGGATCATTGGCCCCAAA  2124

Query 1786  AATTATGAATTCTTAAAGTCAAAGAGGGAAGAGTTCCAAGAATATCTACAGAAACTTCTGCAGCATCCAGAACT  1859
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2125  AATTATGAATTCTTAAAGTCAAAGAGGGAAGAGTTCCAAGAATATCTACAGAAACTTCTGCAGCATCCAGAACT  2198

Query 1860  GAGTAATAGTCAACTTCTGGCAGACTTTCTTTCCCCTAATGGTGGGGAAACACAATTTCTTGATAAGATACTAC  1933
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2199  GAGTAATAGTCAACTTCTGGCAGACTTTCTTTCCCCTAATGGTGGGGAAACACAATTTCTTGATAAGATACTAC  2272

Query 1934  CAGATGTAAATCTTGGGAAAATTATAAAATCTGTTCCTGGAAAACTAATGAAAGAGAAAGGTCAGCATTTGGAA  2007
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2273  CAGATGTAAATCTTGGGAAAATTATAAAATCTGTTCCTGGAAAACTAATGAAAGAGAAAGGTCAGCATTTGGAA  2346

Query 2008  CCTTTTATCATGAATTTCATTAATTCTTGTGAGTCTCCAAAGCCTAAACCAAGTAGACCAGAACTGACCATTCT  2081
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2347  CCTTTTATCATGAATTTCATTAATTCTTGTGAGTCTCCAAAGCCTAAACCAAGTAGACCAGAACTGACCATTCT  2420

Query 2082  CAGCCCTACTTCAGAAAACAACAAGAAGCTTTTCAATGATCTGTTTAAAAATAATGCAAACCGTGCTGAAAATA  2155
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2421  CAGCCCTACTTCAGAAAACAACAAGAAGCTTTTCAATGATCTGTTTAAAAATAATGCAAACCGTGCTGAAAATA  2494

Query 2156  CAGAGAGAAAGCAAAATCAGAATTATTTTATGGAGGTGATGACTGTAGAAGGAGTCTATGATTACCTGATGTAT  2229
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2495  CAGAGAGAAAGCAAAATCAGAATTATTTTATGGAGGTGATGACTGTAGAAGGAGTCTATGATTACCTGATGTAT  2568

Query 2230  GTAGGACGGGTAGTTTTCCAGGTTCCTGACTGGCTTCATCATCTCTTAATGGGAACTCGAATCCTCTTTAAAAA  2303
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2569  GTAGGACGGGTAGTTTTCCAGGTTCCTGACTGGCTTCATCATCTCTTAATGGGAACTCGAATCCTCTTTAAAAA  2642

Query 2304  CACCCTGGAAATGTATACTGATTACTATCTTCAGTGTAAACTAGAACAGCTATTTCAGGAGCACCGTTTGGTCT  2377
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2643  CACCCTGGAAATGTATACTGATTACTATCTTCAGTGTAAACTAGAACAGCTATTTCAGGAGCACCGTTTGGTCT  2716

Query 2378  CACTCATAACACTTCTCAGAGATGCTATATTCTGTGAAAACACTGAACCTCGCTCTCTCCAAGATAAGCAAAAA  2451
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2717  CACTCATAACACTTCTCAGAGATGCTATATTCTGTGAAAACACTGAACCTCGCTCTCTCCAAGATAAGCAAAAA  2790

Query 2452  GGAGCAAAACAGACTTTTGAAGAAATGATGAATTACATTCC---------------------------------  2492
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                                 
Sbjct 2791  GGAGCAAAACAGACTTTTGAAGAAATGATGAATTACATTCCAGCATTTCTCAGAGTTTGCATTATGCCTTGTGC  2864

Query 2493  --------------------------------------------------------------------------  2492
                                                                                      
Sbjct 2865  ATTGTGAATCTCCAAAAATGGGATACATGATACTGCATTTGTCAACTTGACCATAGAAACCTCTTATCCAGGAG  2938

Query 2493  --------------------------------------------------------------------------  2492
                                                                                      
Sbjct 2939  CCTCTTATAGAAACACTGGTTTGGGGAGTATTGATTTGCAGTTTTTGCCTAGTATCTGGGAAACAGGGTGGTGA  3012

Query 2493  -------------------------------------------------------------------------A  2493
                                                                                     |
Sbjct 3013  TTTTGCTTTATGATCCAGTTAATGGTGAGTCACTTTATAATATAAAATTATTTCACATTTGGCCTTTTTGTTTA  3086

Query 2494  GATCTGTTAGTCAAGTGTATTGGTGAAGAAACCAAGTATGAAAGCATCAGACTTCTGTTTGATGGCTTACAGCA  2567
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3087  GATCTGTTAGTCAAGTGTATTGGTGAAGAAACCAAGTATGAAAGCATCAGACTTCTGTTTGATGGCTTACAGCA  3160

Query 2568  ACCAGTACTCAACAAGCAGCTGACTTATGTTTTATTGGACATTGTGATACAGGAACTGTTTCCAGAGCTCAATA  2641
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3161  ACCAGTACTCAACAAGCAGCTGACTTATGTTTTATTGGACATTGTGATACAGGAACTGTTTCCAGAGCTCAATA  3234

Query 2642  AGGTACAAAAGGAAGTTACCTCTGTGACATTTTGGATG------------------------------------  2679
            ||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||                                    
Sbjct 3235  AGGTACAAAAGGAAGTTACCTCTGTGACATCTTGGATGTAAACACTTGGATTTGGTATAGAATAACCCATTGAA  3308

Query 2680  --------------------------------------------------------------------------  2679
                                                                                      
Sbjct 3309  ATTTCTGCTGTGCGAGGGTGGTAGAAATTTACTTTTTTGGGTATATTCTTATATATATTATGTACATCGCTGTC  3382

Query 2680  --------------------------------------------------------------------------  2679
                                                                                      
Sbjct 3383  TGAAATTTTAGTTATTTTTTGTTTTTAATAAAGACTAACACAAACTTAATGATTAAAAGTGATTGAGTCTCATA  3456

Query 2680  --------------------------------------------------------------------------  2679
                                                                                      
Sbjct 3457  GTCTTTCATTTGCTAGCTGTGATCCAAATTTTATTAGAACATAAGTCACTTGTTATTGCCATTTTTAAAAGAGA  3530

Query 2680  --------------------------------------------------------------------------  2679
                                                                                      
Sbjct 3531  AAATTCATAATGATGTTATGGCAAACAGATAAGACTGATAAACTTCGTATTGTATAGCTTTGAAAATAATTATG  3604

Query 2680  --------------------------------------------------------------------------  2679
                                                                                      
Sbjct 3605  CCTAGTATGGAGAAACAGGAATAAGATCTGATTTTCTTAGAGTTAATATATTTTAGTAGATTGGTTTTCCTTTT  3678

Query 2680  --------------------------------------------------------------------  2679
                                                                                
Sbjct 3679  TTTTATTTTGTACATAGTTAACTGTGTATCTATAAATAAAGCATCCTATATGAGTTTTTAATAATAAA  3746