Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000468783
• Subject: NR_146775.1
• Aligned Length: 3768
• Identities: 2635
• Gaps: 1108

Alignment

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct    1  GTGCTGTAGTTTCTTCCGGGCTCCCTACAACCTTCTTCCCTCTCCTCCGCAATACAGGCAGTTACTGGGTGCTG  74

Query    1  ------------------------------------------------------ATGG-----TGC--------  7
                                                                  |.||     |||        
Sbjct   75  GGGCTGTCCTTTGATTTCCGGAAATGGCCGGTCGCCAGTGTTGTCAGAGTTTCCACGGAAGACTGCGCGCTACT  148

Query    8  ----CCTGG-GTGCGGACGATGGGGC-AGAAGCT-GAAGC--AGCGGCTG-----CGACT----GGACGT----  59
                ||.|| |.|||||    |.||| |||.||| ||.||  .|| ||||     |||||    |.||||    
Sbjct  149  CCGGCCAGGAGGGCGGA----GCGGCGAGACGCTAGAGGCTTTGC-GCTGGGTGACGACTTCGGGCACGTTCTA  217

Query   60  ----------------------GGGA-CGCGAGATCTGCCGCCAGTACCCGCTGTTC----TGCTTCCTGCTGC  106
                                  |||| ||||      |||||  |.||.|||.|  |    .||.|...|||| 
Sbjct  218  CGGCCGTTCCTCTGGTCGGCTGGGGACCGCG------GCCGC--GCACGCGCGG--CGGGGGGCGTGGGGCTG-  280

Query  107  TCTGTCTCAG-----CGCCGCCTC--CCTGCTTC--TTAA---CAGGTATATTCATATTTTAATGATCTTCTGG  168
               |.|.|||     |||..||||  |||||..|  .|||   |.|||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  281  ---GGCCCAGCCGGACGCGACCTCAGCCTGCGGCGGCTAACTGCCGGTATATTCATATTTTAATGATCTTCTGG  351

Query  169  TCATTTGTTGCTGGAGTTGTCACATTCTACTGCTCACTAGGACCTGATTCTCTCTTACCAAATATATTCTTCAC  242
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  352  TCATTTGTTGCTGGAGTTGTCACATTCTACTGCTCACTAGGACCTGATTCTCTCTTACCAAATATATTCTTCAC  425

Query  243  AATAAAATACAAACCCAAGCAGTTAGGACTTCAGGAATTATTTCCTCAAGGTCATAGCTGTGCTGTTTGTGGTA  316
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  426  AATAAAATACAAACCCAAGCAGTTAGGACTTCAGGAATTATTTCCTCAAGGTCATAGCTGTGCTGTTTGTGGTA  499

Query  317  AAGTGAAATGTAAACGACATAGGCCTTCTTTGCTACTTGAAAACTACCAGCCATGGCTAGACCTGAAAATTTCT  390
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  500  AAGTGAAATGTAAACGACATAGGCCTTCTTTGCTACTTGAAAACTACCAGCCATGGCTAGACCTGAAAATTTCT  573

Query  391  TCCAAGGTTGATGCATCTCTCTCAG-------------------------------------------------  415
            |||||||||||||||||||||||||                                                 
Sbjct  574  TCCAAGGTTGATGCATCTCTCTCAGAGGTTCTTGAATTAGTGTTGGAAAACTTTGTTTATCCGTGGTACAGGGA  647

Query  416  --------------------------------------------------------------------------  415
                                                                                      
Sbjct  648  TGTGACAGATGATGAATCCTTTGTTGATGAACTGAGAATAACATTACGTTTTTTTGCATCTGTCTTAATAAGAA  721

Query  416  ---------AGGTGGATATTCCATCTATTATAACCAAGAAACTATTAAAAGCAGCAATGAAGCATATAGAAGTG  480
                     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  722  GGATTCACAAGGTGGATATTCCATCTATTATAACCAAGAAACTATTAAAAGCAGCAATGAAGCATATAGAAGTG  795

Query  481  ATAGTTAAAGCCAGACAGAAAGTAAAAAATACAGAGTTTTTACAGCAAGCTGCTTTAGAAGAATATGGTCCAGA  554
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  796  ATAGTTAAAGCCAGACAGAAAGTAAAAAATACAGAGTTTTTACAGCAAGCTGCTTTAGAAGAATATGGTCCAGA  869

Query  555  GCTTCATGTTGCTTTGAGAAGTCGAAGAGATGAATTGCACTATTTAAGGAAACTTACTGAACTGCTTTTTCCTT  628
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  870  GCTTCATGTTGCTTTGAGAAGTCGAAGAGATGAATTGCACTATTTAAGGAAACTTACTGAACTGCTTTTTCCTT  943

Query  629  ATATTTTGCCTCCTAAAGCAACAGACTGCAGATCTCTGACCTTACTTATAAGAGAGATTCTGTCTGGCTCTGTG  702
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  944  ATATTTTGCCTCCTAAAGCAACAGACTGCAGATCTCTGACCTTACTTATAAGAGAGATTCTGTCTGGCTCTGTG  1017

Query  703  TTCCTTCCTTCTTTGGATTTCCTAGCTGATCCAGATACTGTGAATCATTTGCTTATCATCTTCATAGATGACAG  776
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1018  TTCCTTCCTTCTTTGGATTTCCTAGCTGATCCAGATACTGTGAATCATTTGCTTATCATCTTCATAGATGACAG  1091

Query  777  TCCACCTGAAAAAGCAACTGAACCGGCTTCTCCTTTGGTTCCATTCTTGCAGAAATTTGCAGAACCTAGAAATA  850
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1092  TCCACCTGAAAAAGCAACTGAACCGGCTTCTCCTTTGGTTCCATTCTTGCAGAAATTTGCAGAACCTAGAAATA  1165

Query  851  AAAAGCCATCTGTGCTGAAGTTAGAATTGAAGCAAATCAGAGAGCAACAAGATCTTTTATTTCGTTTTATGAAC  924
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1166  AAAAGCCATCTGTGCTGAAGTTAGAATTGAAGCAAATCAGAGAGCAACAAGATCTTTTATTTCGTTTTATGAAC  1239

Query  925  TTTCTGAAACAAGAAGGCGCAGTGCACGTGTTGCAGTTTTGTTTGACTGTGGAGGAATTTAATGATAGAATTTT  998
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1240  TTTCTGAAACAAGAAGGCGCAGTGCACGTGTTGCAGTTTTGTTTGACTGTGGAGGAATTTAATGATAGAATTTT  1313

Query  999  ACGACCAGAATTATCAAATGATGAAATGCTGTCTCTTCATGAAGAATTGCAGAAGATTTATAAAACATACTGTT  1072
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1314  ACGACCAGAATTATCAAATGATGAAATGCTGTCTCTTCATGAAGAATTGCAGAAGATTTATAAAACATACTGTT  1387

Query 1073  TGGATGAAAGTATTGACAAAATTAGATTTGATCCCTTCATTGTAGAAGAGATTCAAAGAATTGCTGAAGGCCCA  1146
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1388  TGGATGAAAGTATTGACAAAATTAGATTTGATCCCTTCATTGTAGAAGAGATTCAAAGAATTGCTGAAGGCCCA  1461

Query 1147  TACATAGATGTTGTGAAACTTCAAACTATGAGATGTCTTTTTGAAGCATATGAACATGTTCTTTCCCTTTTGGA  1220
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1462  TACATAGATGTTGTGAAACTTCAAACTATGAGATGTCTTTTTGAAGCATATGAACATGTTCTTTCCCTTTTGGA  1535

Query 1221  GAATGTATTTACTCCTATGTTCTGCCATAGTGATGAGTATTTCAGACAACTTTTAAGAGGTGCAGAATCACCAA  1294
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1536  GAATGTATTTACTCCTATGTTCTGCCATAGTGATGAGTATTTCAGACAACTTTTAAGAGGTGCAGAATCACCAA  1609

Query 1295  CACGCAATTCAAAATTGAACA---------------------------GGAACACACAGAAAAGGGGAGAATCA  1341
            |||||||||||||||||||||                           ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1610  CACGCAATTCAAAATTGAACAGAGGTAGCCTAAGTTTGGATGATTTTCGGAACACACAGAAAAGGGGAGAATCA  1683

Query 1342  TTTGGAATCAGCAGAATAGGTAGCAAAATTAAAGGAGTATTCAAAAGTACCACAATGGAGGGAGCTATGTTGCC  1415
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1684  TTTGGAATCAGCAGAATAGGTAGCAAAATTAAAGGAGTATTCAAAAGTACCACAATGGAGGGAGCTATGTTGCC  1757

Query 1416  TAATTATGGTGTAGCTGAAGGTGAAGATGATTTTATTGAAGAAGGTATTGTTGTAATGGAAGATGATTCTCCAG  1489
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1758  TAATTATGGTGTAGCTGAAGGTGAAGATGATTTTATTGAAGAAGGTATTGTTGTAATGGAAGATGATTCTCCAG  1831

Query 1490  TGGAGGCTGTGAGCACACCTAATACTCCCCGAAACCTTGCTGCATGGAAAATTAGCATTCCATATGTAGACTTT  1563
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1832  TGGAGGCTGTGAGCACACCTAATACTCCCCGAAACCTTGCTGCATGGAAAATTAGCATTCCATATGTAGACTTT  1905

Query 1564  TTTGAGGATCCCTCCTCTGAAAGGAAGGAGAAAAAAGAAAGAATTCCTGTGTTTTGTATTGATGTTGAAAGAAA  1637
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1906  TTTGAGGATCCCTCCTCTGAAAGGAAGGAGAAAAAAGAAAGAATTCCTGTGTTTTGTATTGATGTTGAAAGAAA  1979

Query 1638  TGATAGAAGAGCAGTTGGACACGAGCCTGAACATTGGTCTGTCTATAGAAGATATCTTGAATTCTATGTACTTG  1711
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1980  TGATAGAAGAGCAGTTGGACACGAGCCTGAACATTGGTCTGTCTATAGAAGATATCTTGAATTCTATGTACTTG  2053

Query 1712  AATCAAAACTAACAGAATTTCATGGTGCATTTCCTGATGCCCAGCTTCCTTCTAAGAGGATCATTGGCCCCAAA  1785
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2054  AATCAAAACTAACAGAATTTCATGGTGCATTTCCTGATGCCCAGCTTCCTTCTAAGAGGATCATTGGCCCCAAA  2127

Query 1786  AATTATGAATTCTTAAAGTCAAAGAGGGAAGAGTTCCAAGAATATCTACAGAAACTTCTGCAGCATCCAGAACT  1859
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2128  AATTATGAATTCTTAAAGTCAAAGAGGGAAGAGTTCCAAGAATATCTACAGAAACTTCTGCAGCATCCAGAACT  2201

Query 1860  GAGTAATAGTCAACTTCTGGCAGACTTTCTTTCCCCTAATGGTGGGGAAACACAATTTCTTGATAAGATACTAC  1933
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2202  GAGTAATAGTCAACTTCTGGCAGACTTTCTTTCCCCTAATGGTGGGGAAACACAATTTCTTGATAAGATACTAC  2275

Query 1934  CAGATGTAAATCTTGGGAAAATTATAAAATCTGTTCCTGGAAAACTAATGAAAGAGAAAGGTCAGCATTTGGAA  2007
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2276  CAGATGTAAATCTTGGGAAAATTATAAAATCTGTTCCTGGAAAACTAATGAAAGAGAAAGGTCAGCATTTGGAA  2349

Query 2008  CCTTTTATCATGAATTTCATTAATTCTTGTGAGTCTCCAAAGCCTAAACCAAGTAGACCAGAACTGACCATTCT  2081
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2350  CCTTTTATCATGAATTTCATTAATTCTTGTGAGTCTCCAAAGCCTAAACCAAGTAGACCAGAACTGACCATTCT  2423

Query 2082  CAGCCCTACTTCAGAAAACAACAAGAAGCTTTTCAATGATCTGTTTAAAAATAATGCAAACCGTGCTGAAAATA  2155
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2424  CAGCCCTACTTCAGAAAACAACAAGAAGCTTTTCAATGATCTGTTTAAAAATAATGCAAACCGTGCTGAAAATA  2497

Query 2156  CAGAGAGAAAGCAAAATCAGAATTATTTTATGGAGGTGATGACTGTAGAAGGAGTCTATGATTACCTGATGTAT  2229
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2498  CAGAGAGAAAGCAAAATCAGAATTATTTTATGGAGGTGATGACTGTAGAAGGAGTCTATGATTACCTGATGTAT  2571

Query 2230  GTAGGACGGGTAGTTTTCCAGGTTCCTGACTGGCTTCATCATCTCTTAATGGGAACTCGAATCCTCTTTAAAAA  2303
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2572  GTAGGACGGGTAGTTTTCCAGGTTCCTGACTGGCTTCATCATCTCTTAATGGGAACTCGAATCCTCTTTAAAAA  2645

Query 2304  CACCCTGGAAATGTATACTGATTACTATCTTCAGTGTAAACTAGAACAGCTATTTCAGGAGCACCGTTTGGTCT  2377
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2646  CACCCTGGAAATGTATACTGATTACTATCTTCAGTGTAAACTAGAACAGCTATTTCAGGAGCACCGTTTGGTCT  2719

Query 2378  CACTCATAACACTTCTCAGAGATGCTATATTCTGTGAAAACACTGAACCTCGCTCTCTCCAAGATAAGCAAAAA  2451
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2720  CACTCATAACACTTCTCAGAGATGCTATATTCTGTGAAAACACTGAACCTCGCTCTCTCCAAGATAAGCAAAAA  2793

Query 2452  GGAGCAAAACAGACTTTTGAAGAAATGATGAATTACATTCC---------------------------------  2492
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                                 
Sbjct 2794  GGAGCAAAACAGACTTTTGAAGAAATGATGAATTACATTCCAGCATTTCTCAGAGTTTGCATTATGCCTTGTGC  2867

Query 2493  --------------------------------------------------------------------------  2492
                                                                                      
Sbjct 2868  ATTGTGAATCTCCAAAAATGGGATACATGATACTGCATTTGTCAACTTGACCATAGAAACCTCTTATCCAGGAG  2941

Query 2493  --------------------------------------------------------------------------  2492
                                                                                      
Sbjct 2942  CCTCTTATAGAAACACTGGTTTGGGGAGTATTGATTTGCAGTTTTTGCCTAGTATCTGGGAAACAGGGTGGTGA  3015

Query 2493  -------------------------------------------------------------------------A  2493
                                                                                     |
Sbjct 3016  TTTTGCTTTATGATCCAGTTAATGGTGAGTCACTTTATAATATAAAATTATTTCACATTTGGCCTTTTTGTTTA  3089

Query 2494  GATCTGTTAGTCAAGTGTATTGGTGAAGAAACCAAGTATGAAAGCATCAGACTTCTGTTTGATGGCTTACAGCA  2567
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3090  GATCTGTTAGTCAAGTGTATTGGTGAAGAAACCAAGTATGAAAGCATCAGACTTCTGTTTGATGGCTTACAGCA  3163

Query 2568  ACCAGTACTCAACAAGCAGCTGACTTATGTTTTATTGGACATTGTGATACAGGAACTGTTTCCAGAGCTCAATA  2641
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3164  ACCAGTACTCAACAAGCAGCTGACTTATGTTTTATTGGACATTGTGATACAGGAACTGTTTCCAGAGCTCAATA  3237

Query 2642  AGGTACAAAAGGAAGTTACCTCTGTGACATTTTGGATG------------------------------------  2679
            ||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||                                    
Sbjct 3238  AGGTACAAAAGGAAGTTACCTCTGTGACATCTTGGATGTAAACACTTGGATTTGGTATAGAATAACCCATTGAA  3311

Query 2680  --------------------------------------------------------------------------  2679
                                                                                      
Sbjct 3312  ATTTCTGCTGTGCGAGGGTGGTAGAAATTTACTTTTTTGGGTATATTCTTATATATATTATGTACATCGCTGTC  3385

Query 2680  --------------------------------------------------------------------------  2679
                                                                                      
Sbjct 3386  TGAAATTTTAGTTATTTTTTGTTTTTAATAAAGACTAACACAAACTTAATGATTAAAAGTGATTGAGTCTCATA  3459

Query 2680  --------------------------------------------------------------------------  2679
                                                                                      
Sbjct 3460  GTCTTTCATTTGCTAGCTGTGATCCAAATTTTATTAGAACATAAGTCACTTGTTATTGCCATTTTTAAAAGAGA  3533

Query 2680  --------------------------------------------------------------------------  2679
                                                                                      
Sbjct 3534  AAATTCATAATGATGTTATGGCAAACAGATAAGACTGATAAACTTCGTATTGTATAGCTTTGAAAATAATTATG  3607

Query 2680  --------------------------------------------------------------------------  2679
                                                                                      
Sbjct 3608  CCTAGTATGGAGAAACAGGAATAAGATCTGATTTTCTTAGAGTTAATATATTTTAGTAGATTGGTTTTCCTTTT  3681

Query 2680  --------------------------------------------------------------------  2679
                                                                                
Sbjct 3682  TTTTATTTTGTACATAGTTAACTGTGTATCTATAAATAAAGCATCCTATATGAGTTTTTAATAATAAA  3749