Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000468783
• Subject: NR_146776.1
• Aligned Length: 3872
• Identities: 2678
• Gaps: 1193

Alignment

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct    1  GTGCTGTAGTTTCTTCCGGGCTCCCTACAACCTTCTTCCCTCTCCTCCGCAATACAGGCAGTTACTGGGTGCTG  74

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct   75  GGGCTGTCCTTTGATTTCCGGAAATGGCCGGTCGCCAGTGTTGTCAGAGTTTCCACGGAAGACTGCGCGCTACT  148

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct  149  CCGGCCAGGAGGGCGGAGCGGCGAGACGCTAGAGGCTTTGCGCTGGGTGACGACTTCGGGCACGTTCTACGGCC  222

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct  223  GTTCCTCTGGTCGGCTGGGGACCGCGGCCGCGCACGCGCGGCGGGGGGCGTGGGGCTGGGCCCAGCCGGACGCG  296

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct  297  ACCTCAGCCTGCGGCGGCTAACTGCCGGTAGGCGTCTGTGTGCGCCGCCAAGTCGGTGGGGCGGGGACGCGAGG  370

Query    1  --------------------------------------------------------------------ATGGTG  6
                                                                                ||||||
Sbjct  371  TGTGGATGGGGGGTCGCCTTGACCTCTGCCTCAGCCAGTAGCGCAGTCTCGGCCTCGCCGTTACGGAGATGGTG  444

Query    7  CCCTGGGTGCGGACGATGGGGCAGAAGCTGAAGCAGCGGCTGCGACTGGACGTGGGACGCGAGATCTGCCGCCA  80
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  CCCTGGGTGCGGACGATGGGGCAGAAGCTGAAGCAGCGGCTGCGACTGGACGTGGGACGCGAGATCTGCCGCCA  518

Query   81  GTACCCGCTGTTCTGCTTCCTGCTGCTCTGTCTCAGCGCCGCCTCCCTGCTTCTTAACAGGTATATTCATATTT  154
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  GTACCCGCTGTTCTGCTTCCTGCTGCTCTGTCTCAGCGCCGCCTCCCTGCTTCTTAACAGGTATATTCATATTT  592

Query  155  TAATGATCTTCTGGTCATTTGTTGCTGGAGTTGTCACATTCTACTGCTCACTAGGACCTGATTCTCTCTTACCA  228
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  TAATGATCTTCTGGTCATTTGTTGCTGGAGTTGTCACATTCTACTGCTCACTAGGACCTGATTCTCTCTTACCA  666

Query  229  AATATATTCTTCACAATAAAATACAAACCCAAGCAGTTAGGACTTCAGGAATTATTTCCTCAAGGTCATAGCTG  302
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  AATATATTCTTCACAATAAAATACAAACCCAAGCAGTTAGGACTTCAGGAATTATTTCCTCAAGGTCATAGCTG  740

Query  303  TGCTGTTTGTGGTAAAGTGAAATGTAAACGACATAGGCCTTCTTTGCTACTTGAAAACTACCAGCCATGGCTAG  376
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  TGCTGTTTGTGGTAAAGTGAAATGTAAACGACATAGGCCTTCTTTGCTACTTGAAAACTACCAGCCATGGCTAG  814

Query  377  ACCTGAAAATTTCTTCCAAGGTTGATGCATCTCTCTCAGAGGTGGATATTCCATCTATTATAACCAAGAAACTA  450
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  ACCTGAAAATTTCTTCCAAGGTTGATGCATCTCTCTCAGAGGTGGATATTCCATCTATTATAACCAAGAAACTA  888

Query  451  TTAAAAGCAGCAATGAAGCATATAGAAGTGATAGTTAAAGCCAGACAGAAAGTAAAAAATACAGAGTTTTTACA  524
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  TTAAAAGCAGCAATGAAGCATATAGAAGTGATAGTTAAAGCCAGACAGAAAGTAAAAAATACAGAGTTTTTACA  962

Query  525  GCAAGCTGCTTTAGAAGAATATGGTCCAGAGCTTCATGTTGCTTTGAGAAGTCGAAGAGATGAATTGCACTATT  598
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  GCAAGCTGCTTTAGAAGAATATGGTCCAGAGCTTCATGTTGCTTTGAGAAGTCGAAGAGATGAATTGCACTATT  1036

Query  599  TAAGGAAACTTACTGAACTGCTTTTTCCTTATATTTTGCCTCCTAAAGCAACAGACTGCAGATCTCTGACCTTA  672
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  TAAGGAAACTTACTGAACTGCTTTTTCCTTATATTTTGCCTCCTAAAGCAACAGACTGCAGATCTCTGACCTTA  1110

Query  673  CTTATAAGAGAGATTCTGTCTGGCTCTGTGTTCCTTCCTTCTTTGGATTTCCTAGCTGATCCAGATACTGTGAA  746
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  CTTATAAGAGAGATTCTGTCTGGCTCTGTGTTCCTTCCTTCTTTGGATTTCCTAGCTGATCCAGATACTGTGAA  1184

Query  747  TCATTTGCTTATCATCTTCATAGATGACAGTCCACCTGAAAAAGCAACTGAACCGGCTTCTCCTTTGGTTCCAT  820
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  TCATTTGCTTATCATCTTCATAGATGACAGTCCACCTGAAAAAGCAACTGAACCGGCTTCTCCTTTGGTTCCAT  1258

Query  821  TCTTGCAGAAATTTGCAGAACCTAGAAATAAAAAGCCATCTGTGCTGAAGTTAGAATTGAAGCAAATCAGAGAG  894
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  TCTTGCAGAAATTTGCAGAACCTAGAAATAAAAAGCCATCTGTGCTGAAGTTAGAATTGAAGCAAATCAGAGAG  1332

Query  895  CAACAAGATCTTTTATTTCGTTTTATGAACTTTCTGAAACAAGAAGGCGCAGTGCACGTGTTGCAGTTTTGTTT  968
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  CAACAAGATCTTTTATTTCGTTTTATGAACTTTCTGAAACAAGAAGGCGCAGTGCACGTGTTGCAGTTTTGTTT  1406

Query  969  GACTGTGGAGGAATTTAATGATAGAATTTTACGACCAGAATTATCAAATGATGAAATGCTGTCTCTTCATGAAG  1042
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  GACTGTGGAGGAATTTAATGATAGAATTTTACGACCAGAATTATCAAATGATGAAATGCTGTCTCTTCATGAAG  1480

Query 1043  AATTGCAGAAGATTTATAAAACATACTGTTTGGATGAAAGTATTGACAAAATTAGATTTGATCCCTTCATTGTA  1116
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481  AATTGCAGAAGATTTATAAAACATACTGTTTGGATGAAAGTATTGACAAAATTAGATTTGATCCCTTCATTGTA  1554

Query 1117  GAAGAGATTCAAAGAATTGCTGAAGGCCCATACATAGATGTTGTGAAACTTCAAACTATGAGATGTCTTTTTGA  1190
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555  GAAGAGATTCAAAGAATTGCTGAAGGCCCATACATAGATGTTGTGAAACTTCAAACTATGAGATGTCTTTTTGA  1628

Query 1191  AGCATATGAACATGTTCTTTCCCTTTTGGAGAATGTATTTACTCCTATGTTCTGCCATAGTGATGAGTATTTCA  1264
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629  AGCATATGAACATGTTCTTTCCCTTTTGGAGAATGTATTTACTCCTATGTTCTGCCATAGTGATGAGTATTTCA  1702

Query 1265  GACAACTTTTAAGAGGTGCAGAATCACCAACACGCAATTCAAAATTGAACA-----------------------  1315
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                       
Sbjct 1703  GACAACTTTTAAGAGGTGCAGAATCACCAACACGCAATTCAAAATTGAACAGAGGTAGCCTAAGTTTGGATGAT  1776

Query 1316  ----GGAACACACAGAAAAGGGGAGAATCATTTGGAATCAGCAGAATAGGTAGCAAAATTAAAGGAGTATTCAA  1385
                ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777  TTTCGGAACACACAGAAAAGGGGAGAATCATTTGGAATCAGCAGAATAGGTAGCAAAATTAAAGGAGTATTCAA  1850

Query 1386  AAGTACCACAATGGAGGGAGCTATGTTGCCTAATTATGGTGTAGCTGAAGGTGAAGATGATTTTATTGAAGAAG  1459
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1851  AAGTACCACAATGGAGGGAGCTATGTTGCCTAATTATGGTGTAGCTGAAGGTGAAGATGATTTTATTGAAGAAG  1924

Query 1460  GTATTGTTGTAATGGAAGATGATTCTCCAGTGGAGGCTGTGAGCACACCTAATACTCCCCGAAACCTTGCTGCA  1533
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1925  GTATTGTTGTAATGGAAGATGATTCTCCAGTGGAGGCTGTGAGCACACCTAATACTCCCCGAAACCTTGCTGCA  1998

Query 1534  TGGAAAATTAGCATTCCATATGTAGACTTTTTTGAGGATCCCTCCTCTGAAAGGAAGGAGAAAAAAGAAAGAAT  1607
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1999  TGGAAAATTAGCATTCCATATGTAGACTTTTTTGAGGATCCCTCCTCTGAAAGGAAGGAGAAAAAAGAAAGAAT  2072

Query 1608  TCCTGTGTTTTGTATTGATGTTGAAAGAAATGATAGAAGAGCAGTTGGACACGAGCCTGAACATTGGTCTGTCT  1681
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2073  TCCTGTGTTTTGTATTGATGTTGAAAGAAATGATAGAAGAGCAGTTGGACACGAGCCTGAACATTGGTCTGTCT  2146

Query 1682  ATAGAAGATATCTTGAATTCTATGTACTTGAATCAAAACTAACAGAATTTCATGGTGCATTTCCTGATGCCCAG  1755
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2147  ATAGAAGATATCTTGAATTCTATGTACTTGAATCAAAACTAACAGAATTTCATGGTGCATTTCCTGATGCCCAG  2220

Query 1756  CTTCCTTCTAAGAGGATCATTGGCCCCAAAAATTATGAATTCTTAAAGTCAAAGAGGGAAGAGTTCCAAGAATA  1829
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2221  CTTCCTTCTAAGAGGATCATTGGCCCCAAAAATTATGAATTCTTAAAGTCAAAGAGGGAAGAGTTCCAAGAATA  2294

Query 1830  TCTACAGAAACTTCTGCAGCATCCAGAACTGAGTAATAGTCAACTTCTGGCAGACTTTCTTTCCCCTAATGGTG  1903
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2295  TCTACAGAAACTTCTGCAGCATCCAGAACTGAGTAATAGTCAACTTCTGGCAGACTTTCTTTCCCCTAATGGTG  2368

Query 1904  GGGAAACACAATTTCTTGATAAGATACTACCAGATGTAAATCTTGGGAAAATTATAAAATCTGTTCCTGGAAAA  1977
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2369  GGGAAACACAATTTCTTGATAAGATACTACCAGATGTAAATCTTGGGAAAATTATAAAATCTGTTCCTGGAAAA  2442

Query 1978  CTAATGAAAGAGAAAGGTCAGCATTTGGAACCTTTTATCATGAATTTCATTAATTCTTGTGAGTCTCCAAAGCC  2051
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2443  CTAATGAAAGAGAAAGGTCAGCATTTGGAACCTTTTATCATGAATTTCATTAATTCTTGTGAGTCTCCAAAGCC  2516

Query 2052  TAAACCAAGTAGACCAGAACTGACCATTCTCAGCCCTACTTCAGAAAACAACAAGAAGCTTTTCAATGATCTGT  2125
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2517  TAAACCAAGTAGACCAGAACTGACCATTCTCAGCCCTACTTCAGAAAACAACAAGAAGCTTTTCAATGATCTGT  2590

Query 2126  TTAAAAATAATGCAAACCGTGCTGAAAATACAGAGAGAAAGCAAAATCAGAATTATTTTATGGAGGTGATGACT  2199
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2591  TTAAAAATAATGCAAACCGTGCTGAAAATACAGAGAGAAAGCAAAATCAGAATTATTTTATGGAGGTGATGACT  2664

Query 2200  GTAGAAGGAGTCTATGATTACCTGATGTATGTAGGACGGGTAGTTTTCCAGGTTCCTGACTGGCTTCATCATCT  2273
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2665  GTAGAAGGAGTCTATGATTACCTGATGTATGTAGGACGGGTAGTTTTCCAGGTTCCTGACTGGCTTCATCATCT  2738

Query 2274  CTTAATGGGAACTCGAATCCTCTTTAAAAACACCCTGGAAATGTATACTGATTACTATCTTCAGTGTAAACTAG  2347
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2739  CTTAATGGGAACTCGAATCCTCTTTAAAAACACCCTGGAAATGTATACTGATTACTATCTTCAGTGTAAACTAG  2812

Query 2348  AACAGCTATTTCAGGAGCACCGTTTGGTCTCACTCATAACACTTCTCAGAGATGCTATATTCTGTGAAAACACT  2421
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2813  AACAGCTATTTCAGGAGCACCGTTTGGTCTCACTCATAACACTTCTCAGAGATGCTATATTCTGTGAAAACACT  2886

Query 2422  GAACCTCGCTCTCTCCAAGATAAGCAAAAAGGAGCAAAACAGACTTTTGAAGAAATGATGAATTACATTCC---  2492
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   
Sbjct 2887  GAACCTCGCTCTCTCCAAGATAAGCAAAAAGGAGCAAAACAGACTTTTGAAGAAATGATGAATTACATTCCAGC  2960

Query 2493  --------------------------------------------------------------------------  2492
                                                                                      
Sbjct 2961  ATTTCTCAGAGTTTGCATTATGCCTTGTGCATTGTGAATCTCCAAAAATGGGATACATGATACTGCATTTGTCA  3034

Query 2493  --------------------------------------------------------------------------  2492
                                                                                      
Sbjct 3035  ACTTGACCATAGAAACCTCTTATCCAGGAGCCTCTTATAGAAACACTGGTTTGGGGAGTATTGATTTGCAGTTT  3108

Query 2493  --------------------------------------------------------------------------  2492
                                                                                      
Sbjct 3109  TTGCCTAGTATCTGGGAAACAGGGTGGTGATTTTGCTTTATGATCCAGTTAATGGTGAGTCACTTTATAATATA  3182

Query 2493  -----------------------------AGATCTGTTAGTCAAGTGTATTGGTGAAGAAACCAAGTATGAAAG  2537
                                         |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3183  AAATTATTTCACATTTGGCCTTTTTGTTTAGATCTGTTAGTCAAGTGTATTGGTGAAGAAACCAAGTATGAAAG  3256

Query 2538  CATCAGACTTCTGTTTGATGGCTTACAGCAACCAGTACTCAACAAGCAGCTGACTTATGTTTTATTGGACATTG  2611
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3257  CATCAGACTTCTGTTTGATGGCTTACAGCAACCAGTACTCAACAAGCAGCTGACTTATGTTTTATTGGACATTG  3330

Query 2612  TGATACAGGAACTGTTTCCAGAGCTCAATAAGGTACAAAAGGAAGTTACCTCTGTGACATTTTGGATG------  2679
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||      
Sbjct 3331  TGATACAGGAACTGTTTCCAGAGCTCAATAAGGTACAAAAGGAAGTTACCTCTGTGACATCTTGGATGTAAACA  3404

Query 2680  --------------------------------------------------------------------------  2679
                                                                                      
Sbjct 3405  CTTGGATTTGGTATAGAATAACCCATTGAAATTTCTGCTGTGCGAGGGTGGTAGAAATTTACTTTTTTGGGTAT  3478

Query 2680  --------------------------------------------------------------------------  2679
                                                                                      
Sbjct 3479  ATTCTTATATATATTATGTACATCGCTGTCTGAAATTTTAGTTATTTTTTGTTTTTAATAAAGACTAACACAAA  3552

Query 2680  --------------------------------------------------------------------------  2679
                                                                                      
Sbjct 3553  CTTAATGATTAAAAGTGATTGAGTCTCATAGTCTTTCATTTGCTAGCTGTGATCCAAATTTTATTAGAACATAA  3626

Query 2680  --------------------------------------------------------------------------  2679
                                                                                      
Sbjct 3627  GTCACTTGTTATTGCCATTTTTAAAAGAGAAAATTCATAATGATGTTATGGCAAACAGATAAGACTGATAAACT  3700

Query 2680  --------------------------------------------------------------------------  2679
                                                                                      
Sbjct 3701  TCGTATTGTATAGCTTTGAAAATAATTATGCCTAGTATGGAGAAACAGGAATAAGATCTGATTTTCTTAGAGTT  3774

Query 2680  --------------------------------------------------------------------------  2679
                                                                                      
Sbjct 3775  AATATATTTTAGTAGATTGGTTTTCCTTTTTTTTATTTTGTACATAGTTAACTGTGTATCTATAAATAAAGCAT  3848

Query 2680  ------------------------  2679
                                    
Sbjct 3849  CCTATATGAGTTTTTAATAATAAA  3872