Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000468783
• Subject: NR_146777.1
• Aligned Length: 4004
• Identities: 2674
• Gaps: 1329

Alignment

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct    1  GTGCTGTAGTTTCTTCCGGGCTCCCTACAACCTTCTTCCCTCTCCTCCGCAATACAGGCAGTTACTGGGTGCTG  74

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct   75  GGGCTGTCCTTTGATTTCCGGAAATGGCCGGTCGCCAGTGTTGTCAGAGTTTCCACGGAAGACTGCGCGCTACT  148

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct  149  CCGGCCAGGAGGGCGGAGCGGCGAGACGCTAGAGGCTTTGCGCTGGGTGACGACTTCGGGCACGTTCTACGGCC  222

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct  223  GTTCCTCTGGTCGGCTGGGGACCGCGGCCGCGCACGCGCGGCGGGGGGCGTGGGGCTGGGCCCAGCCGGACGCG  296

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct  297  ACCTCAGCCTGCGGCGGCTAACTGCCGGTAGGCGTCTGTGTGCGCCGCCAAGTCGGTGGGGCGGGGACGCGAGG  370

Query    1  --------------------------------------------------------------------ATGGTG  6
                                                                                ||||||
Sbjct  371  TGTGGATGGGGGGTCGCCTTGACCTCTGCCTCAGCCAGTAGCGCAGTCTCGGCCTCGCCGTTACGGAGATGGTG  444

Query    7  CCCTGGGTGCGGACGATGGGGCAGAAGCTGAAGCAGCGGCTGCGACTGGACGTGGGACGCGAGATCTGCCGCCA  80
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  CCCTGGGTGCGGACGATGGGGCAGAAGCTGAAGCAGCGGCTGCGACTGGACGTGGGACGCGAGATCTGCCGCCA  518

Query   81  GTACCCGCTGTTCTGCTTCCTGCTGCTCTGTCTCAGCGCCGCCTCCCTGCTTCTTAACAGGTATATTCATATTT  154
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  GTACCCGCTGTTCTGCTTCCTGCTGCTCTGTCTCAGCGCCGCCTCCCTGCTTCTTAACAGGTATATTCATATTT  592

Query  155  TAATGATCTTCTGGTCATTTGTTGCTGGAGTTGTCACATTCTACTGCTCACTAGGACCTGATTCTCTCTTACCA  228
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  TAATGATCTTCTGGTCATTTGTTGCTGGAGTTGTCACATTCTACTGCTCACTAGGACCTGATTCTCTCTTACCA  666

Query  229  AATATATTCTTCACAATAAAATACAAACCCAAGCAGTTAGGACTTCAGGAATTATTTCCTCAAGGTCATAGCTG  302
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  AATATATTCTTCACAATAAAATACAAACCCAAGCAGTTAGGACTTCAGGAATTATTTCCTCAAGGTCATAGCTG  740

Query  303  TGCTGTTTGTGGTAAAGTGAAATGTAAACGACATAGGCCTTCTTTGCTACTTGAAAACTACCAGCCATGGCTAG  376
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  TGCTGTTTGTGGTAAAGTGAAATGTAAACGACATAGGCCTTCTTTGCTACTTGAAAACTACCAGCCATGGCTAG  814

Query  377  ACCTGAAAATTTCTTCCAAGGTTGATGCATCTCTCTCAG-----------------------------------  415
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                                   
Sbjct  815  ACCTGAAAATTTCTTCCAAGGTTGATGCATCTCTCTCAGAGGTTCTTGAATTAGTGTTGGAAAACTTTGTTTAT  888

Query  416  --------------------------------------------------------------------------  415
                                                                                      
Sbjct  889  CCGTGGTACAGGGATGTGACAGATGATGAATCCTTTGTTGATGAACTGAGAATAACATTACGTTTTTTTGCATC  962

Query  416  -----------------------AGGTGGATATTCCATCTATTATAACCAAGAAACTATTAAAAGCAGCAATGA  466
                                   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  TGTCTTAATAAGAAGGATTCACAAGGTGGATATTCCATCTATTATAACCAAGAAACTATTAAAAGCAGCAATGA  1036

Query  467  AGCATATAGAAGTGATAGTTAAAGCCAGACAGAAAGTAAAAAATACAGAGTTTTTACAGCAAGCTGCTTTAGAA  540
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  AGCATATAGAAGTGATAGTTAAAGCCAGACAGAAAGTAAAAAATACAGAGTTTTTACAGCAAGCTGCTTTAGAA  1110

Query  541  GAATATGGTCCAGAGCTTCATGTTGCTTTGAGAAGTCGAAGAGATGAATTGCACTATTTAAGGAAACTTACTGA  614
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  GAATATGGTCCAGAGCTTCATGTTGCTTTGAGAAGTCGAAGAGATGAATTGCACTATTTAAGGAAACTTACTGA  1184

Query  615  ACTGCTTTTTCCTTATATTTTGCCTCCTAAAGCAACAGACTGCAGATCTCTGACCTTACTTATAAGAGAGATTC  688
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  ACTGCTTTTTCCTTATATTTTGCCTCCTAAAGCAACAGACTGCAGATCTCTGACCTTACTTATAAGAGAGATTC  1258

Query  689  TGTCTGGCTCTGTGTTCCTTCCTTCTTTGGATTTCCTAGCTGATCCAGATACTGTGAATCATTTGCTTATCATC  762
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  TGTCTGGCTCTGTGTTCCTTCCTTCTTTGGATTTCCTAGCTGATCCAGATACTGTGAATCATTTGCTTATCATC  1332

Query  763  TTCATAGATGACAGTCCACCTGAAAAAGCAACTGAACCGGCTTCTCCTTTGGTTCCATTCTTGCAGAAATTTGC  836
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  TTCATAGATGACAGTCCACCTGAAAAAGCAACTGAACCGGCTTCTCCTTTGGTTCCATTCTTGCAGAAATTTGC  1406

Query  837  AGAACCTAGAAATAAAAAGCCATCTGTGCTGAAGTTAGAATTGAAGCAAATCAGAGAGCAACAAGATCTTTTAT  910
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  AGAACCTAGAAATAAAAAGCCATCTGTGCTGAAGTTAGAATTGAAGCAAATCAGAGAGCAACAAGATCTTTTAT  1480

Query  911  TTCGTTTTATGAACTTTCTGAAACAAGAAGGCGCAGTGCACGTGTTGCAGTTTTGTTTGACTGTGGAGGAATTT  984
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||
Sbjct 1481  TTCGTTTTATGAACTTTCTGAAACAAGAAGGCGCAGTGCACGTGTTGCAGTTTTGTTTGACT----AGGAATTT  1550

Query  985  AATGATAGAATTTTACGACCAGAATTATCAAATGATGAAATGCTGTCTCTTCATGAAGAATTGCAGAAGATTTA  1058
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1551  AATGATAGAATTTTACGACCAGAATTATCAAATGATGAAATGCTGTCTCTTCATGAAGAATTGCAGAAGATTTA  1624

Query 1059  TAAAACATACTGTTTGGATGAAAGTATTGACAAAATTAGATTTGATCCCTTCATTGTAGAAGAGATTCAAAGAA  1132
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1625  TAAAACATACTGTTTGGATGAAAGTATTGACAAAATTAGATTTGATCCCTTCATTGTAGAAGAGATTCAAAGAA  1698

Query 1133  TTGCTGAAGGCCCATACATAGATGTTGTGAAACTTCAAACTATGAGATGTCTTTTTGAAGCATATGAACATGTT  1206
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1699  TTGCTGAAGGCCCATACATAGATGTTGTGAAACTTCAAACTATGAGATGTCTTTTTGAAGCATATGAACATGTT  1772

Query 1207  CTTTCCCTTTTGGAGAATGTATTTACTCCTATGTTCTGCCATAGTGATGAGTATTTCAGACAACTTTTAAGAGG  1280
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1773  CTTTCCCTTTTGGAGAATGTATTTACTCCTATGTTCTGCCATAGTGATGAGTATTTCAGACAACTTTTAAGAGG  1846

Query 1281  TGCAGAATCACCAACACGCAATTCAAAATTGAACA---------------------------GGAACACACAGA  1327
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||                           ||||||||||||
Sbjct 1847  TGCAGAATCACCAACACGCAATTCAAAATTGAACAGAGGTAGCCTAAGTTTGGATGATTTTCGGAACACACAGA  1920

Query 1328  AAAGGGGAGAATCATTTGGAATCAGCAGAATAGGTAGCAAAATTAAAGGAGTATTCAAAAGTACCACAATGGAG  1401
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1921  AAAGGGGAGAATCATTTGGAATCAGCAGAATAGGTAGCAAAATTAAAGGAGTATTCAAAAGTACCACAATGGAG  1994

Query 1402  GGAGCTATGTTGCCTAATTATGGTGTAGCTGAAGGTGAAGATGATTTTATTGAAGAAGGTATTGTTGTAATGGA  1475
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1995  GGAGCTATGTTGCCTAATTATGGTGTAGCTGAAGGTGAAGATGATTTTATTGAAGAAGGTATTGTTGTAATGGA  2068

Query 1476  AGATGATTCTCCAGTGGAGGCTGTGAGCACACCTAATACTCCCCGAAACCTTGCTGCATGGAAAATTAGCATTC  1549
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2069  AGATGATTCTCCAGTGGAGGCTGTGAGCACACCTAATACTCCCCGAAACCTTGCTGCATGGAAAATTAGCATTC  2142

Query 1550  CATATGTAGACTTTTTTGAGGATCCCTCCTCTGAAAGGAAGGAGAAAAAAGAAAGAATTCCTGTGTTTTGTATT  1623
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2143  CATATGTAGACTTTTTTGAGGATCCCTCCTCTGAAAGGAAGGAGAAAAAAGAAAGAATTCCTGTGTTTTGTATT  2216

Query 1624  GATGTTGAAAGAAATGATAGAAGAGCAGTTGGACACGAGCCTGAACATTGGTCTGTCTATAGAAGATATCTTGA  1697
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2217  GATGTTGAAAGAAATGATAGAAGAGCAGTTGGACACGAGCCTGAACATTGGTCTGTCTATAGAAGATATCTTGA  2290

Query 1698  ATTCTATGTACTTGAATCAAAACTAACAGAATTTCATGGTGCATTTCCTGATGCCCAGCTTCCTTCTAAGAGGA  1771
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2291  ATTCTATGTACTTGAATCAAAACTAACAGAATTTCATGGTGCATTTCCTGATGCCCAGCTTCCTTCTAAGAGGA  2364

Query 1772  TCATTGGCCCCAAAAATTATGAATTCTTAAAGTCAAAGAGGGAAGAGTTCCAAGAATATCTACAGAAACTTCTG  1845
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2365  TCATTGGCCCCAAAAATTATGAATTCTTAAAGTCAAAGAGGGAAGAGTTCCAAGAATATCTACAGAAACTTCTG  2438

Query 1846  CAGCATCCAGAACTGAGTAATAGTCAACTTCTGGCAGACTTTCTTTCCCCTAATGGTGGGGAAACACAATTTCT  1919
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2439  CAGCATCCAGAACTGAGTAATAGTCAACTTCTGGCAGACTTTCTTTCCCCTAATGGTGGGGAAACACAATTTCT  2512

Query 1920  TGATAAGATACTACCAGATGTAAATCTTGGGAAAATTATAAAATCTGTTCCTGGAAAACTAATGAAAGAGAAAG  1993
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2513  TGATAAGATACTACCAGATGTAAATCTTGGGAAAATTATAAAATCTGTTCCTGGAAAACTAATGAAAGAGAAAG  2586

Query 1994  GTCAGCATTTGGAACCTTTTATCATGAATTTCATTAATTCTTGTGAGTCTCCAAAGCCTAAACCAAGTAGACCA  2067
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2587  GTCAGCATTTGGAACCTTTTATCATGAATTTCATTAATTCTTGTGAGTCTCCAAAGCCTAAACCAAGTAGACCA  2660

Query 2068  GAACTGACCATTCTCAGCCCTACTTCAGAAAACAACAAGAAGCTTTTCAATGATCTGTTTAAAAATAATGCAAA  2141
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2661  GAACTGACCATTCTCAGCCCTACTTCAGAAAACAACAAGAAGCTTTTCAATGATCTGTTTAAAAATAATGCAAA  2734

Query 2142  CCGTGCTGAAAATACAGAGAGAAAGCAAAATCAGAATTATTTTATGGAGGTGATGACTGTAGAAGGAGTCTATG  2215
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2735  CCGTGCTGAAAATACAGAGAGAAAGCAAAATCAGAATTATTTTATGGAGGTGATGACTGTAGAAGGAGTCTATG  2808

Query 2216  ATTACCTGATGTATGTAGGACGGGTAGTTTTCCAGGTTCCTGACTGGCTTCATCATCTCTTAATGGGAACTCGA  2289
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2809  ATTACCTGATGTATGTAGGACGGGTAGTTTTCCAGGTTCCTGACTGGCTTCATCATCTCTTAATGGGAACTCGA  2882

Query 2290  ATCCTCTTTAAAAACACCCTGGAAATGTATACTGATTACTATCTTCAGTGTAAACTAGAACAGCTATTTCAGGA  2363
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2883  ATCCTCTTTAAAAACACCCTGGAAATGTATACTGATTACTATCTTCAGTGTAAACTAGAACAGCTATTTCAGGA  2956

Query 2364  GCACCGTTTGGTCTCACTCATAACACTTCTCAGAGATGCTATATTCTGTGAAAACACTGAACCTCGCTCTCTCC  2437
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2957  GCACCGTTTGGTCTCACTCATAACACTTCTCAGAGATGCTATATTCTGTGAAAACACTGAACCTCGCTCTCTCC  3030

Query 2438  AAGATAAGCAAAAAGGAGCAAAACAGACTTTTGAAGAAATGATGAATTACATTCC-------------------  2492
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                   
Sbjct 3031  AAGATAAGCAAAAAGGAGCAAAACAGACTTTTGAAGAAATGATGAATTACATTCCAGCATTTCTCAGAGTTTGC  3104

Query 2493  --------------------------------------------------------------------------  2492
                                                                                      
Sbjct 3105  ATTATGCCTTGTGCATTGTGAATCTCCAAAAATGGGATACATGATACTGCATTTGTCAACTTGACCATAGAAAC  3178

Query 2493  --------------------------------------------------------------------------  2492
                                                                                      
Sbjct 3179  CTCTTATCCAGGAGCCTCTTATAGAAACACTGGTTTGGGGAGTATTGATTTGCAGTTTTTGCCTAGTATCTGGG  3252

Query 2493  --------------------------------------------------------------------------  2492
                                                                                      
Sbjct 3253  AAACAGGGTGGTGATTTTGCTTTATGATCCAGTTAATGGTGAGTCACTTTATAATATAAAATTATTTCACATTT  3326

Query 2493  -------------AGATCTGTTAGTCAAGTGTATTGGTGAAGAAACCAAGTATGAAAGCATCAGACTTCTGTTT  2553
                         |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3327  GGCCTTTTTGTTTAGATCTGTTAGTCAAGTGTATTGGTGAAGAAACCAAGTATGAAAGCATCAGACTTCTGTTT  3400

Query 2554  GATGGCTTACAGCAACCAGTACTCAACAAGCAGCTGACTTATGTTTTATTGGACATTGTGATACAGGAACTGTT  2627
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3401  GATGGCTTACAGCAACCAGTACTCAACAAGCAGCTGACTTATGTTTTATTGGACATTGTGATACAGGAACTGTT  3474

Query 2628  TCCAGAGCTCAATAAGGTACAAAAGGAAGTTACCTCTGTGACATTTTGGATG----------------------  2679
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||                      
Sbjct 3475  TCCAGAGCTCAATAAGGTACAAAAGGAAGTTACCTCTGTGACATCTTGGATGTAAACACTTGGATTTGGTATAG  3548

Query 2680  --------------------------------------------------------------------------  2679
                                                                                      
Sbjct 3549  AATAACCCATTGAAATTTCTGCTGTGCGAGGGTGGTAGAAATTTACTTTTTTGGGTATATTCTTATATATATTA  3622

Query 2680  --------------------------------------------------------------------------  2679
                                                                                      
Sbjct 3623  TGTACATCGCTGTCTGAAATTTTAGTTATTTTTTGTTTTTAATAAAGACTAACACAAACTTAATGATTAAAAGT  3696

Query 2680  --------------------------------------------------------------------------  2679
                                                                                      
Sbjct 3697  GATTGAGTCTCATAGTCTTTCATTTGCTAGCTGTGATCCAAATTTTATTAGAACATAAGTCACTTGTTATTGCC  3770

Query 2680  --------------------------------------------------------------------------  2679
                                                                                      
Sbjct 3771  ATTTTTAAAAGAGAAAATTCATAATGATGTTATGGCAAACAGATAAGACTGATAAACTTCGTATTGTATAGCTT  3844

Query 2680  --------------------------------------------------------------------------  2679
                                                                                      
Sbjct 3845  TGAAAATAATTATGCCTAGTATGGAGAAACAGGAATAAGATCTGATTTTCTTAGAGTTAATATATTTTAGTAGA  3918

Query 2680  --------------------------------------------------------------------------  2679
                                                                                      
Sbjct 3919  TTGGTTTTCCTTTTTTTTATTTTGTACATAGTTAACTGTGTATCTATAAATAAAGCATCCTATATGAGTTTTTA  3992

Query 2680  --------  2679
                    
Sbjct 3993  ATAATAAA  4000