Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000468783
• Subject: NR_146778.1
• Aligned Length: 4004
• Identities: 2678
• Gaps: 1325

Alignment

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct    1  GTGCTGTAGTTTCTTCCGGGCTCCCTACAACCTTCTTCCCTCTCCTCCGCAATACAGGCAGTTACTGGGTGCTG  74

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct   75  GGGCTGTCCTTTGATTTCCGGAAATGGCCGGTCGCCAGTGTTGTCAGAGTTTCCACGGAAGACTGCGCGCTACT  148

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct  149  CCGGCCAGGAGGGCGGAGCGGCGAGACGCTAGAGGCTTTGCGCTGGGTGACGACTTCGGGCACGTTCTACGGCC  222

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct  223  GTTCCTCTGGTCGGCTGGGGACCGCGGCCGCGCACGCGCGGCGGGGGGCGTGGGGCTGGGCCCAGCCGGACGCG  296

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct  297  ACCTCAGCCTGCGGCGGCTAACTGCCGGTAGGCGTCTGTGTGCGCCGCCAAGTCGGTGGGGCGGGGACGCGAGG  370

Query    1  --------------------------------------------------------------------ATGGTG  6
                                                                                ||||||
Sbjct  371  TGTGGATGGGGGGTCGCCTTGACCTCTGCCTCAGCCAGTAGCGCAGTCTCGGCCTCGCCGTTACGGAGATGGTG  444

Query    7  CCCTGGGTGCGGACGATGGGGCAGAAGCTGAAGCAGCGGCTGCGACTGGACGTGGGACGCGAGATCTGCCGCCA  80
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  CCCTGGGTGCGGACGATGGGGCAGAAGCTGAAGCAGCGGCTGCGACTGGACGTGGGACGCGAGATCTGCCGCCA  518

Query   81  GTACCCGCTGTTCTGCTTCCTGCTGCTCTGTCTCAGCGCCGCCTCCCTGCTTCTTAACAGGTATATTCATATTT  154
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  GTACCCGCTGTTCTGCTTCCTGCTGCTCTGTCTCAGCGCCGCCTCCCTGCTTCTTAACAGGTATATTCATATTT  592

Query  155  TAATGATCTTCTGGTCATTTGTTGCTGGAGTTGTCACATTCTACTGCTCACTAGGACCTGATTCTCTCTTACCA  228
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  TAATGATCTTCTGGTCATTTGTTGCTGGAGTTGTCACATTCTACTGCTCACTAGGACCTGATTCTCTCTTACCA  666

Query  229  AATATATTCTTCACAATAAAATACAAACCCAAGCAGTTAGGACTTCAGGAATTATTTCCTCAAGGTCATAGCTG  302
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  AATATATTCTTCACAATAAAATACAAACCCAAGCAGTTAGGACTTCAGGAATTATTTCCTCAAGGTCATAGCTG  740

Query  303  TGCTGTTTGTGGTAAAGTGAAATGTAAACGACATAGGCCTTCTTTGCTACTTGAAAACTACCAGCCATGGCTAG  376
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  TGCTGTTTGTGGTAAAGTGAAATGTAAACGACATAGGCCTTCTTTGCTACTTGAAAACTACCAGCCATGGCTAG  814

Query  377  ACCTGAAAATTTCTTCCAAGGTTGATGCATCTCTCTCAG-----------------------------------  415
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                                   
Sbjct  815  ACCTGAAAATTTCTTCCAAGGTTGATGCATCTCTCTCAGAGGTTCTTGAATTAGTGTTGGAAAACTTTGTTTAT  888

Query  416  --------------------------------------------------------------------------  415
                                                                                      
Sbjct  889  CCGTGGTACAGGGATGTGACAGATGATGAATCCTTTGTTGATGAACTGAGAATAACATTACGTTTTTTTGCATC  962

Query  416  -----------------------AGGTGGATATTCCATCTATTATAACCAAGAAACTATTAAAAGCAGCAATGA  466
                                   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  TGTCTTAATAAGAAGGATTCACAAGGTGGATATTCCATCTATTATAACCAAGAAACTATTAAAAGCAGCAATGA  1036

Query  467  AGCATATAGAAGTGATAGTTAAAGCCAGACAGAAAGTAAAAAATACAGAGTTTTTACAGCAAGCTGCTTTAGAA  540
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  AGCATATAGAAGTGATAGTTAAAGCCAGACAGAAAGTAAAAAATACAGAGTTTTTACAGCAAGCTGCTTTAGAA  1110

Query  541  GAATATGGTCCAGAGCTTCATGTTGCTTTGAGAAGTCGAAGAGATGAATTGCACTATTTAAGGAAACTTACTGA  614
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  GAATATGGTCCAGAGCTTCATGTTGCTTTGAGAAGTCGAAGAGATGAATTGCACTATTTAAGGAAACTTACTGA  1184

Query  615  ACTGCTTTTTCCTTATATTTTGCCTCCTAAAGCAACAGACTGCAGATCTCTGACCTTACTTATAAGAGAGATTC  688
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  ACTGCTTTTTCCTTATATTTTGCCTCCTAAAGCAACAGACTGCAGATCTCTGACCTTACTTATAAGAGAGATTC  1258

Query  689  TGTCTGGCTCTGTGTTCCTTCCTTCTTTGGATTTCCTAGCTGATCCAGATACTGTGAATCATTTGCTTATCATC  762
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  TGTCTGGCTCTGTGTTCCTTCCTTCTTTGGATTTCCTAGCTGATCCAGATACTGTGAATCATTTGCTTATCATC  1332

Query  763  TTCATAGATGACAGTCCACCTGAAAAAGCAACTGAACCGGCTTCTCCTTTGGTTCCATTCTTGCAGAAATTTGC  836
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  TTCATAGATGACAGTCCACCTGAAAAAGCAACTGAACCGGCTTCTCCTTTGGTTCCATTCTTGCAGAAATTTGC  1406

Query  837  AGAACCTAGAAATAAAAAGCCATCTGTGCTGAAGTTAGAATTGAAGCAAATCAGAGAGCAACAAGATCTTTTAT  910
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  AGAACCTAGAAATAAAAAGCCATCTGTGCTGAAGTTAGAATTGAAGCAAATCAGAGAGCAACAAGATCTTTTAT  1480

Query  911  TTCGTTTTATGAACTTTCTGAAACAAGAAGGCGCAGTGCACGTGTTGCAGTTTTGTTTGACTGTGGAGGAATTT  984
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481  TTCGTTTTATGAACTTTCTGAAACAAGAAGGCGCAGTGCACGTGTTGCAGTTTTGTTTGACTGTGGAGGAATTT  1554

Query  985  AATGATAGAATTTTACGACCAGAATTATCAAATGATGAAATGCTGTCTCTTCATGAAGAATTGCAGAAGATTTA  1058
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555  AATGATAGAATTTTACGACCAGAATTATCAAATGATGAAATGCTGTCTCTTCATGAAGAATTGCAGAAGATTTA  1628

Query 1059  TAAAACATACTGTTTGGATGAAAGTATTGACAAAATTAGATTTGATCCCTTCATTGTAGAAGAGATTCAAAGAA  1132
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629  TAAAACATACTGTTTGGATGAAAGTATTGACAAAATTAGATTTGATCCCTTCATTGTAGAAGAGATTCAAAGAA  1702

Query 1133  TTGCTGAAGGCCCATACATAGATGTTGTGAAACTTCAAACTATGAGATGTCTTTTTGAAGCATATGAACATGTT  1206
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703  TTGCTGAAGGCCCATACATAGATGTTGTGAAACTTCAAACTATGAGATGTCTTTTTGAAGCATATGAACATGTT  1776

Query 1207  CTTTCCCTTTTGGAGAATGTATTTACTCCTATGTTCTGCCATAGTGATGAGTATTTCAGACAACTTTTAAGAGG  1280
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777  CTTTCCCTTTTGGAGAATGTATTTACTCCTATGTTCTGCCATAGTGATGAGTATTTCAGACAACTTTTAAGAGG  1850

Query 1281  TGCAGAATCACCAACACGCAATTCAAAATTGAACA---------------------------GGAACACACAGA  1327
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||                           ||||||||||||
Sbjct 1851  TGCAGAATCACCAACACGCAATTCAAAATTGAACAGAGGTAGCCTAAGTTTGGATGATTTTCGGAACACACAGA  1924

Query 1328  AAAGGGGAGAATCATTTGGAATCAGCAGAATAGGTAGCAAAATTAAAGGAGTATTCAAAAGTACCACAATGGAG  1401
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1925  AAAGGGGAGAATCATTTGGAATCAGCAGAATAGGTAGCAAAATTAAAGGAGTATTCAAAAGTACCACAATGGAG  1998

Query 1402  GGAGCTATGTTGCCTAATTATGGTGTAGCTGAAGGTGAAGATGATTTTATTGAAGAAGGTATTGTTGTAATGGA  1475
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1999  GGAGCTATGTTGCCTAATTATGGTGTAGCTGAAGGTGAAGATGATTTTATTGAAGAAGGTATTGTTGTAATGGA  2072

Query 1476  AGATGATTCTCCAGTGGAGGCTGTGAGCACACCTAATACTCCCCGAAACCTTGCTGCATGGAAAATTAGCATTC  1549
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2073  AGATGATTCTCCAGTGGAGGCTGTGAGCACACCTAATACTCCCCGAAACCTTGCTGCATGGAAAATTAGCATTC  2146

Query 1550  CATATGTAGACTTTTTTGAGGATCCCTCCTCTGAAAGGAAGGAGAAAAAAGAAAGAATTCCTGTGTTTTGTATT  1623
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2147  CATATGTAGACTTTTTTGAGGATCCCTCCTCTGAAAGGAAGGAGAAAAAAGAAAGAATTCCTGTGTTTTGTATT  2220

Query 1624  GATGTTGAAAGAAATGATAGAAGAGCAGTTGGACACGAGCCTGAACATTGGTCTGTCTATAGAAGATATCTTGA  1697
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2221  GATGTTGAAAGAAATGATAGAAGAGCAGTTGGACACGAGCCTGAACATTGGTCTGTCTATAGAAGATATCTTGA  2294

Query 1698  ATTCTATGTACTTGAATCAAAACTAACAGAATTTCATGGTGCATTTCCTGATGCCCAGCTTCCTTCTAAGAGGA  1771
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2295  ATTCTATGTACTTGAATCAAAACTAACAGAATTTCATGGTGCATTTCCTGATGCCCAGCTTCCTTCTAAGAGGA  2368

Query 1772  TCATTGGCCCCAAAAATTATGAATTCTTAAAGTCAAAGAGGGAAGAGTTCCAAGAATATCTACAGAAACTTCTG  1845
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2369  TCATTGGCCCCAAAAATTATGAATTCTTAAAGTCAAAGAGGGAAGAGTTCCAAGAATATCTACAGAAACTTCTG  2442

Query 1846  CAGCATCCAGAACTGAGTAATAGTCAACTTCTGGCAGACTTTCTTTCCCCTAATGGTGGGGAAACACAATTTCT  1919
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2443  CAGCATCCAGAACTGAGTAATAGTCAACTTCTGGCAGACTTTCTTTCCCCTAATGGTGGGGAAACACAATTTCT  2516

Query 1920  TGATAAGATACTACCAGATGTAAATCTTGGGAAAATTATAAAATCTGTTCCTGGAAAACTAATGAAAGAGAAAG  1993
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2517  TGATAAGATACTACCAGATGTAAATCTTGGGAAAATTATAAAATCTGTTCCTGGAAAACTAATGAAAGAGAAAG  2590

Query 1994  GTCAGCATTTGGAACCTTTTATCATGAATTTCATTAATTCTTGTGAGTCTCCAAAGCCTAAACCAAGTAGACCA  2067
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2591  GTCAGCATTTGGAACCTTTTATCATGAATTTCATTAATTCTTGTGAGTCTCCAAAGCCTAAACCAAGTAGACCA  2664

Query 2068  GAACTGACCATTCTCAGCCCTACTTCAGAAAACAACAAGAAGCTTTTCAATGATCTGTTTAAAAATAATGCAAA  2141
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2665  GAACTGACCATTCTCAGCCCTACTTCAGAAAACAACAAGAAGCTTTTCAATGATCTGTTTAAAAATAATGCAAA  2738

Query 2142  CCGTGCTGAAAATACAGAGAGAAAGCAAAATCAGAATTATTTTATGGAGGTGATGACTGTAGAAGGAGTCTATG  2215
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2739  CCGTGCTGAAAATACAGAGAGAAAGCAAAATCAGAATTATTTTATGGAGGTGATGACTGTAGAAGGAGTCTATG  2812

Query 2216  ATTACCTGATGTATGTAGGACGGGTAGTTTTCCAGGTTCCTGACTGGCTTCATCATCTCTTAATGGGAACTCGA  2289
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2813  ATTACCTGATGTATGTAGGACGGGTAGTTTTCCAGGTTCCTGACTGGCTTCATCATCTCTTAATGGGAACTCGA  2886

Query 2290  ATCCTCTTTAAAAACACCCTGGAAATGTATACTGATTACTATCTTCAGTGTAAACTAGAACAGCTATTTCAGGA  2363
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2887  ATCCTCTTTAAAAACACCCTGGAAATGTATACTGATTACTATCTTCAGTGTAAACTAGAACAGCTATTTCAGGA  2960

Query 2364  GCACCGTTTGGTCTCACTCATAACACTTCTCAGAGATGCTATATTCTGTGAAAACACTGAACCTCGCTCTCTCC  2437
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2961  GCACCGTTTGGTCTCACTCATAACACTTCTCAGAGATGCTATATTCTGTGAAAACACTGAACCTCGCTCTCTCC  3034

Query 2438  AAGATAAGCAAAAAGGAGCAAAACAGACTTTTGAAGAAATGATGAATTACATTCC-------------------  2492
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                   
Sbjct 3035  AAGATAAGCAAAAAGGAGCAAAACAGACTTTTGAAGAAATGATGAATTACATTCCAGCATTTCTCAGAGTTTGC  3108

Query 2493  --------------------------------------------------------------------------  2492
                                                                                      
Sbjct 3109  ATTATGCCTTGTGCATTGTGAATCTCCAAAAATGGGATACATGATACTGCATTTGTCAACTTGACCATAGAAAC  3182

Query 2493  --------------------------------------------------------------------------  2492
                                                                                      
Sbjct 3183  CTCTTATCCAGGAGCCTCTTATAGAAACACTGGTTTGGGGAGTATTGATTTGCAGTTTTTGCCTAGTATCTGGG  3256

Query 2493  --------------------------------------------------------------------------  2492
                                                                                      
Sbjct 3257  AAACAGGGTGGTGATTTTGCTTTATGATCCAGTTAATGGTGAGTCACTTTATAATATAAAATTATTTCACATTT  3330

Query 2493  -------------AGATCTGTTAGTCAAGTGTATTGGTGAAGAAACCAAGTATGAAAGCATCAGACTTCTGTTT  2553
                         |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3331  GGCCTTTTTGTTTAGATCTGTTAGTCAAGTGTATTGGTGAAGAAACCAAGTATGAAAGCATCAGACTTCTGTTT  3404

Query 2554  GATGGCTTACAGCAACCAGTACTCAACAAGCAGCTGACTTATGTTTTATTGGACATTGTGATACAGGAACTGTT  2627
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3405  GATGGCTTACAGCAACCAGTACTCAACAAGCAGCTGACTTATGTTTTATTGGACATTGTGATACAGGAACTGTT  3478

Query 2628  TCCAGAGCTCAATAAGGTACAAAAGGAAGTTACCTCTGTGACATTTTGGATG----------------------  2679
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||                      
Sbjct 3479  TCCAGAGCTCAATAAGGTACAAAAGGAAGTTACCTCTGTGACATCTTGGATGTAAACACTTGGATTTGGTATAG  3552

Query 2680  --------------------------------------------------------------------------  2679
                                                                                      
Sbjct 3553  AATAACCCATTGAAATTTCTGCTGTGCGAGGGTGGTAGAAATTTACTTTTTTGGGTATATTCTTATATATATTA  3626

Query 2680  --------------------------------------------------------------------------  2679
                                                                                      
Sbjct 3627  TGTACATCGCTGTCTGAAATTTTAGTTATTTTTTGTTTTTAATAAAGACTAACACAAACTTAATGATTAAAAGT  3700

Query 2680  --------------------------------------------------------------------------  2679
                                                                                      
Sbjct 3701  GATTGAGTCTCATAGTCTTTCATTTGCTAGCTGTGATCCAAATTTTATTAGAACATAAGTCACTTGTTATTGCC  3774

Query 2680  --------------------------------------------------------------------------  2679
                                                                                      
Sbjct 3775  ATTTTTAAAAGAGAAAATTCATAATGATGTTATGGCAAACAGATAAGACTGATAAACTTCGTATTGTATAGCTT  3848

Query 2680  --------------------------------------------------------------------------  2679
                                                                                      
Sbjct 3849  TGAAAATAATTATGCCTAGTATGGAGAAACAGGAATAAGATCTGATTTTCTTAGAGTTAATATATTTTAGTAGA  3922

Query 2680  --------------------------------------------------------------------------  2679
                                                                                      
Sbjct 3923  TTGGTTTTCCTTTTTTTTATTTTGTACATAGTTAACTGTGTATCTATAAATAAAGCATCCTATATGAGTTTTTA  3996

Query 2680  --------  2679
                    
Sbjct 3997  ATAATAAA  4004