Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000468783
• Subject: NR_146779.1
• Aligned Length: 4004
• Identities: 2675
• Gaps: 1328

Alignment

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct    1  GTGCTGTAGTTTCTTCCGGGCTCCCTACAACCTTCTTCCCTCTCCTCCGCAATACAGGCAGTTACTGGGTGCTG  74

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct   75  GGGCTGTCCTTTGATTTCCGGAAATGGCCGGTCGCCAGTGTTGTCAGAGTTTCCACGGAAGACTGCGCGCTACT  148

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct  149  CCGGCCAGGAGGGCGGAGCGGCGAGACGCTAGAGGCTTTGCGCTGGGTGACGACTTCGGGCACGTTCTACGGCC  222

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct  223  GTTCCTCTGGTCGGCTGGGGACCGCGGCCGCGCACGCGCGGCGGGGGGCGTGGGGCTGGGCCCAGCCGGACGCG  296

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct  297  ACCTCAGCCTGCGGCGGCTAACTGCCGGTAGGCGTCTGTGTGCGCCGCCAAGTCGGTGGGGCGGGGACGCGAGG  370

Query    1  --------------------------------------------------------------------ATGGTG  6
                                                                                ||||||
Sbjct  371  TGTGGATGGGGGGTCGCCTTGACCTCTGCCTCAGCCAGTAGCGCAGTCTCGGCCTCGCCGTTACGGAGATGGTG  444

Query    7  CCCTGGGTGCGGACGATGGGGCAGAAGCTGAAGCAGCGGCTGCGACTGGACGTGGGACGCGAGATCTGCCGCCA  80
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  CCCTGGGTGCGGACGATGGGGCAGAAGCTGAAGCAGCGGCTGCGACTGGACGTGGGACGCGAGATCTGCCGCCA  518

Query   81  GTACCCGCTGTTCTGCTTCCTGCTGCTCTGTCTCAGCGCCGCCTCCCTGCTTCTTAACAGGTATATTCATATTT  154
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  GTACCCGCTGTTCTGCTTCCTGCTGCTCTGTCTCAGCGCCGCCTCCCTGCTTCTTAACAGGTATATTCATATTT  592

Query  155  TAATGATCTTCTGGTCATTTGTTGCTGGAGTTGTCACATTCTACTGCTCACTAGGACCTGATTCTCTCTTACCA  228
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  TAATGATCTTCTGGTCATTTGTTGCTGGAGTTGTCACATTCTACTGCTCACTAGGACCTGATTCTCTCTTACCA  666

Query  229  AATATATTCTTCACAATAAAATACAAACCCAAGCAGTTAGGACTTCAGGAATTATTTCCTCAAGGTCATAGCTG  302
            |||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  AATATATTCTTCACAATAAAATACAAACCCA---AGTTAGGACTTCAGGAATTATTTCCTCAAGGTCATAGCTG  737

Query  303  TGCTGTTTGTGGTAAAGTGAAATGTAAACGACATAGGCCTTCTTTGCTACTTGAAAACTACCAGCCATGGCTAG  376
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  738  TGCTGTTTGTGGTAAAGTGAAATGTAAACGACATAGGCCTTCTTTGCTACTTGAAAACTACCAGCCATGGCTAG  811

Query  377  ACCTGAAAATTTCTTCCAAGGTTGATGCATCTCTCTCAG-----------------------------------  415
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                                   
Sbjct  812  ACCTGAAAATTTCTTCCAAGGTTGATGCATCTCTCTCAGAGGTTCTTGAATTAGTGTTGGAAAACTTTGTTTAT  885

Query  416  --------------------------------------------------------------------------  415
                                                                                      
Sbjct  886  CCGTGGTACAGGGATGTGACAGATGATGAATCCTTTGTTGATGAACTGAGAATAACATTACGTTTTTTTGCATC  959

Query  416  -----------------------AGGTGGATATTCCATCTATTATAACCAAGAAACTATTAAAAGCAGCAATGA  466
                                   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  960  TGTCTTAATAAGAAGGATTCACAAGGTGGATATTCCATCTATTATAACCAAGAAACTATTAAAAGCAGCAATGA  1033

Query  467  AGCATATAGAAGTGATAGTTAAAGCCAGACAGAAAGTAAAAAATACAGAGTTTTTACAGCAAGCTGCTTTAGAA  540
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1034  AGCATATAGAAGTGATAGTTAAAGCCAGACAGAAAGTAAAAAATACAGAGTTTTTACAGCAAGCTGCTTTAGAA  1107

Query  541  GAATATGGTCCAGAGCTTCATGTTGCTTTGAGAAGTCGAAGAGATGAATTGCACTATTTAAGGAAACTTACTGA  614
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1108  GAATATGGTCCAGAGCTTCATGTTGCTTTGAGAAGTCGAAGAGATGAATTGCACTATTTAAGGAAACTTACTGA  1181

Query  615  ACTGCTTTTTCCTTATATTTTGCCTCCTAAAGCAACAGACTGCAGATCTCTGACCTTACTTATAAGAGAGATTC  688
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1182  ACTGCTTTTTCCTTATATTTTGCCTCCTAAAGCAACAGACTGCAGATCTCTGACCTTACTTATAAGAGAGATTC  1255

Query  689  TGTCTGGCTCTGTGTTCCTTCCTTCTTTGGATTTCCTAGCTGATCCAGATACTGTGAATCATTTGCTTATCATC  762
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1256  TGTCTGGCTCTGTGTTCCTTCCTTCTTTGGATTTCCTAGCTGATCCAGATACTGTGAATCATTTGCTTATCATC  1329

Query  763  TTCATAGATGACAGTCCACCTGAAAAAGCAACTGAACCGGCTTCTCCTTTGGTTCCATTCTTGCAGAAATTTGC  836
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1330  TTCATAGATGACAGTCCACCTGAAAAAGCAACTGAACCGGCTTCTCCTTTGGTTCCATTCTTGCAGAAATTTGC  1403

Query  837  AGAACCTAGAAATAAAAAGCCATCTGTGCTGAAGTTAGAATTGAAGCAAATCAGAGAGCAACAAGATCTTTTAT  910
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1404  AGAACCTAGAAATAAAAAGCCATCTGTGCTGAAGTTAGAATTGAAGCAAATCAGAGAGCAACAAGATCTTTTAT  1477

Query  911  TTCGTTTTATGAACTTTCTGAAACAAGAAGGCGCAGTGCACGTGTTGCAGTTTTGTTTGACTGTGGAGGAATTT  984
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1478  TTCGTTTTATGAACTTTCTGAAACAAGAAGGCGCAGTGCACGTGTTGCAGTTTTGTTTGACTGTGGAGGAATTT  1551

Query  985  AATGATAGAATTTTACGACCAGAATTATCAAATGATGAAATGCTGTCTCTTCATGAAGAATTGCAGAAGATTTA  1058
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1552  AATGATAGAATTTTACGACCAGAATTATCAAATGATGAAATGCTGTCTCTTCATGAAGAATTGCAGAAGATTTA  1625

Query 1059  TAAAACATACTGTTTGGATGAAAGTATTGACAAAATTAGATTTGATCCCTTCATTGTAGAAGAGATTCAAAGAA  1132
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1626  TAAAACATACTGTTTGGATGAAAGTATTGACAAAATTAGATTTGATCCCTTCATTGTAGAAGAGATTCAAAGAA  1699

Query 1133  TTGCTGAAGGCCCATACATAGATGTTGTGAAACTTCAAACTATGAGATGTCTTTTTGAAGCATATGAACATGTT  1206
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1700  TTGCTGAAGGCCCATACATAGATGTTGTGAAACTTCAAACTATGAGATGTCTTTTTGAAGCATATGAACATGTT  1773

Query 1207  CTTTCCCTTTTGGAGAATGTATTTACTCCTATGTTCTGCCATAGTGATGAGTATTTCAGACAACTTTTAAGAGG  1280
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1774  CTTTCCCTTTTGGAGAATGTATTTACTCCTATGTTCTGCCATAGTGATGAGTATTTCAGACAACTTTTAAGAGG  1847

Query 1281  TGCAGAATCACCAACACGCAATTCAAAATTGAACA---------------------------GGAACACACAGA  1327
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||                           ||||||||||||
Sbjct 1848  TGCAGAATCACCAACACGCAATTCAAAATTGAACAGAGGTAGCCTAAGTTTGGATGATTTTCGGAACACACAGA  1921

Query 1328  AAAGGGGAGAATCATTTGGAATCAGCAGAATAGGTAGCAAAATTAAAGGAGTATTCAAAAGTACCACAATGGAG  1401
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1922  AAAGGGGAGAATCATTTGGAATCAGCAGAATAGGTAGCAAAATTAAAGGAGTATTCAAAAGTACCACAATGGAG  1995

Query 1402  GGAGCTATGTTGCCTAATTATGGTGTAGCTGAAGGTGAAGATGATTTTATTGAAGAAGGTATTGTTGTAATGGA  1475
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1996  GGAGCTATGTTGCCTAATTATGGTGTAGCTGAAGGTGAAGATGATTTTATTGAAGAAGGTATTGTTGTAATGGA  2069

Query 1476  AGATGATTCTCCAGTGGAGGCTGTGAGCACACCTAATACTCCCCGAAACCTTGCTGCATGGAAAATTAGCATTC  1549
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2070  AGATGATTCTCCAGTGGAGGCTGTGAGCACACCTAATACTCCCCGAAACCTTGCTGCATGGAAAATTAGCATTC  2143

Query 1550  CATATGTAGACTTTTTTGAGGATCCCTCCTCTGAAAGGAAGGAGAAAAAAGAAAGAATTCCTGTGTTTTGTATT  1623
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2144  CATATGTAGACTTTTTTGAGGATCCCTCCTCTGAAAGGAAGGAGAAAAAAGAAAGAATTCCTGTGTTTTGTATT  2217

Query 1624  GATGTTGAAAGAAATGATAGAAGAGCAGTTGGACACGAGCCTGAACATTGGTCTGTCTATAGAAGATATCTTGA  1697
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2218  GATGTTGAAAGAAATGATAGAAGAGCAGTTGGACACGAGCCTGAACATTGGTCTGTCTATAGAAGATATCTTGA  2291

Query 1698  ATTCTATGTACTTGAATCAAAACTAACAGAATTTCATGGTGCATTTCCTGATGCCCAGCTTCCTTCTAAGAGGA  1771
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2292  ATTCTATGTACTTGAATCAAAACTAACAGAATTTCATGGTGCATTTCCTGATGCCCAGCTTCCTTCTAAGAGGA  2365

Query 1772  TCATTGGCCCCAAAAATTATGAATTCTTAAAGTCAAAGAGGGAAGAGTTCCAAGAATATCTACAGAAACTTCTG  1845
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2366  TCATTGGCCCCAAAAATTATGAATTCTTAAAGTCAAAGAGGGAAGAGTTCCAAGAATATCTACAGAAACTTCTG  2439

Query 1846  CAGCATCCAGAACTGAGTAATAGTCAACTTCTGGCAGACTTTCTTTCCCCTAATGGTGGGGAAACACAATTTCT  1919
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2440  CAGCATCCAGAACTGAGTAATAGTCAACTTCTGGCAGACTTTCTTTCCCCTAATGGTGGGGAAACACAATTTCT  2513

Query 1920  TGATAAGATACTACCAGATGTAAATCTTGGGAAAATTATAAAATCTGTTCCTGGAAAACTAATGAAAGAGAAAG  1993
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2514  TGATAAGATACTACCAGATGTAAATCTTGGGAAAATTATAAAATCTGTTCCTGGAAAACTAATGAAAGAGAAAG  2587

Query 1994  GTCAGCATTTGGAACCTTTTATCATGAATTTCATTAATTCTTGTGAGTCTCCAAAGCCTAAACCAAGTAGACCA  2067
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2588  GTCAGCATTTGGAACCTTTTATCATGAATTTCATTAATTCTTGTGAGTCTCCAAAGCCTAAACCAAGTAGACCA  2661

Query 2068  GAACTGACCATTCTCAGCCCTACTTCAGAAAACAACAAGAAGCTTTTCAATGATCTGTTTAAAAATAATGCAAA  2141
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2662  GAACTGACCATTCTCAGCCCTACTTCAGAAAACAACAAGAAGCTTTTCAATGATCTGTTTAAAAATAATGCAAA  2735

Query 2142  CCGTGCTGAAAATACAGAGAGAAAGCAAAATCAGAATTATTTTATGGAGGTGATGACTGTAGAAGGAGTCTATG  2215
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2736  CCGTGCTGAAAATACAGAGAGAAAGCAAAATCAGAATTATTTTATGGAGGTGATGACTGTAGAAGGAGTCTATG  2809

Query 2216  ATTACCTGATGTATGTAGGACGGGTAGTTTTCCAGGTTCCTGACTGGCTTCATCATCTCTTAATGGGAACTCGA  2289
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2810  ATTACCTGATGTATGTAGGACGGGTAGTTTTCCAGGTTCCTGACTGGCTTCATCATCTCTTAATGGGAACTCGA  2883

Query 2290  ATCCTCTTTAAAAACACCCTGGAAATGTATACTGATTACTATCTTCAGTGTAAACTAGAACAGCTATTTCAGGA  2363
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2884  ATCCTCTTTAAAAACACCCTGGAAATGTATACTGATTACTATCTTCAGTGTAAACTAGAACAGCTATTTCAGGA  2957

Query 2364  GCACCGTTTGGTCTCACTCATAACACTTCTCAGAGATGCTATATTCTGTGAAAACACTGAACCTCGCTCTCTCC  2437
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2958  GCACCGTTTGGTCTCACTCATAACACTTCTCAGAGATGCTATATTCTGTGAAAACACTGAACCTCGCTCTCTCC  3031

Query 2438  AAGATAAGCAAAAAGGAGCAAAACAGACTTTTGAAGAAATGATGAATTACATTCC-------------------  2492
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                   
Sbjct 3032  AAGATAAGCAAAAAGGAGCAAAACAGACTTTTGAAGAAATGATGAATTACATTCCAGCATTTCTCAGAGTTTGC  3105

Query 2493  --------------------------------------------------------------------------  2492
                                                                                      
Sbjct 3106  ATTATGCCTTGTGCATTGTGAATCTCCAAAAATGGGATACATGATACTGCATTTGTCAACTTGACCATAGAAAC  3179

Query 2493  --------------------------------------------------------------------------  2492
                                                                                      
Sbjct 3180  CTCTTATCCAGGAGCCTCTTATAGAAACACTGGTTTGGGGAGTATTGATTTGCAGTTTTTGCCTAGTATCTGGG  3253

Query 2493  --------------------------------------------------------------------------  2492
                                                                                      
Sbjct 3254  AAACAGGGTGGTGATTTTGCTTTATGATCCAGTTAATGGTGAGTCACTTTATAATATAAAATTATTTCACATTT  3327

Query 2493  -------------AGATCTGTTAGTCAAGTGTATTGGTGAAGAAACCAAGTATGAAAGCATCAGACTTCTGTTT  2553
                         |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3328  GGCCTTTTTGTTTAGATCTGTTAGTCAAGTGTATTGGTGAAGAAACCAAGTATGAAAGCATCAGACTTCTGTTT  3401

Query 2554  GATGGCTTACAGCAACCAGTACTCAACAAGCAGCTGACTTATGTTTTATTGGACATTGTGATACAGGAACTGTT  2627
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3402  GATGGCTTACAGCAACCAGTACTCAACAAGCAGCTGACTTATGTTTTATTGGACATTGTGATACAGGAACTGTT  3475

Query 2628  TCCAGAGCTCAATAAGGTACAAAAGGAAGTTACCTCTGTGACATTTTGGATG----------------------  2679
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||                      
Sbjct 3476  TCCAGAGCTCAATAAGGTACAAAAGGAAGTTACCTCTGTGACATCTTGGATGTAAACACTTGGATTTGGTATAG  3549

Query 2680  --------------------------------------------------------------------------  2679
                                                                                      
Sbjct 3550  AATAACCCATTGAAATTTCTGCTGTGCGAGGGTGGTAGAAATTTACTTTTTTGGGTATATTCTTATATATATTA  3623

Query 2680  --------------------------------------------------------------------------  2679
                                                                                      
Sbjct 3624  TGTACATCGCTGTCTGAAATTTTAGTTATTTTTTGTTTTTAATAAAGACTAACACAAACTTAATGATTAAAAGT  3697

Query 2680  --------------------------------------------------------------------------  2679
                                                                                      
Sbjct 3698  GATTGAGTCTCATAGTCTTTCATTTGCTAGCTGTGATCCAAATTTTATTAGAACATAAGTCACTTGTTATTGCC  3771

Query 2680  --------------------------------------------------------------------------  2679
                                                                                      
Sbjct 3772  ATTTTTAAAAGAGAAAATTCATAATGATGTTATGGCAAACAGATAAGACTGATAAACTTCGTATTGTATAGCTT  3845

Query 2680  --------------------------------------------------------------------------  2679
                                                                                      
Sbjct 3846  TGAAAATAATTATGCCTAGTATGGAGAAACAGGAATAAGATCTGATTTTCTTAGAGTTAATATATTTTAGTAGA  3919

Query 2680  --------------------------------------------------------------------------  2679
                                                                                      
Sbjct 3920  TTGGTTTTCCTTTTTTTTATTTTGTACATAGTTAACTGTGTATCTATAAATAAAGCATCCTATATGAGTTTTTA  3993

Query 2680  --------  2679
                    
Sbjct 3994  ATAATAAA  4001