Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000468786
• Subject: XM_005255770.2
• Aligned Length: 2487
• Identities: 1953
• Gaps: 534

Alignment

Query    1  ATGGTCCCTGCCTGGCTGTGGCTGCTTTGTGTCTCCGTCCCCCAGGCTCTCCCCAAGGCCCAGCCTGCAGAGCT  74
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query   75  GTCTGTGGAAGTTCCAGAAAACTATGGTGGAAATTTCCCTTTATACCTGACCAAGTTGCCGCTGCCCCGTGAGG  148
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  149  GGGCTGAAGGCCAGATCGTGCTGTCAGGGGACTCAGGCAAGGCAACTGAGGGCCCATTTGCTATGGATCCAGAT  222
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  223  TCTGGCTTCCTGCTGGTGACCAGGGCCCTGGACCGAGAGGAGCAGGCAGAGTACCAGCTACAGGTCACCCTGGA  296
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  297  GATGCAGGATGGACATGTCTTGTGGGGTCCACAGCCTGTGCTTGTGCACGTGAAGGATGAGAATGACCAGGTGC  370
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  371  CCCATTTCTCTCAAGCCATCTACAGAGCTCGGCTGAGCCGGGGTACCAGGCCTGGCATCCCCTTCCTCTTCCTT  444
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  445  GAGGCTTCAGACCGGGATGAGCCAGGCACAGCCAACTCGGATCTTCGATTCCACATCCTGAGCCAGGCTCCAGC  518
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  519  CCAGCCTTCCCCAGACATGTTCCAGCTGGAGCCTCGGCTGGGGGCTCTGGCCCTCAGCCCCAAGGGGAGCACCA  592
                            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ----------------ATGTTCCAGCTGGAGCCTCGGCTGGGGGCTCTGGCCCTCAGCCCCAAGGGGAGCACCA  58

Query  593  GCCTTGACCACGCCCTGGAGAGGACCTACCAGCTGTTGGTACAGGTCAAGGACATGGGTGACCAGGCCTCAGGC  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   59  GCCTTGACCACGCCCTGGAGAGGACCTACCAGCTGTTGGTACAGGTCAAGGACATGGGTGACCAGGCCTCAGGC  132

Query  667  CACCAGGCCACTGCCACCGTGGAAGTCTCCATCATAGAGAGCACCTGGGTGTCCCTAGAGCCTATCCACCTGGC  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  133  CACCAGGCCACTGCCACCGTGGAAGTCTCCATCATAGAGAGCACCTGGGTGTCCCTAGAGCCTATCCACCTGGC  206

Query  741  AGAGAATCTCAAAGTCCTATACCCGCACCACATGGCCCAGGTACACTGGAGTGGGGGTGATGTGCACTATCACC  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  207  AGAGAATCTCAAAGTCCTATACCCGCACCACATGGCCCAGGTACACTGGAGTGGGGGTGATGTGCACTATCACC  280

Query  815  TGGAGAGCCATCCCCCGGGACCCTTTGAAGTGAATGCAGAGGGAAACCTCTACGTGACCAGAGAGCTGGACAGA  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  281  TGGAGAGCCATCCCCCGGGACCCTTTGAAGTGAATGCAGAGGGAAACCTCTACGTGACCAGAGAGCTGGACAGA  354

Query  889  GAAGCCCAGGCTGAGTACCTGCTCCAGGTGCGGGCTCAGAATTCCCATGGCGAGGACTATGCGGCCCCTCTGGA  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  355  GAAGCCCAGGCTGAGTACCTGCTCCAGGTGCGGGCTCAGAATTCCCATGGCGAGGACTATGCGGCCCCTCTGGA  428

Query  963  GCTGCACGTGCTGGTGATGGATGAGAATGACAACGTGCCTATCTGCCCTCCCCGTGACCCCACAGTCAGCATCC  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  429  GCTGCACGTGCTGGTGATGGATGAGAATGACAACGTGCCTATCTGCCCTCCCCGTGACCCCACAGTCAGCATCC  502

Query 1037  CTGAGCTCAGTCCACCAGGTACTGAAGTGACTAGACTGTCAGCAGAGGATGCAGATGCCCCCGGCTCCCCCAAT  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  503  CTGAGCTCAGTCCACCAGGTACTGAAGTGACTAGACTGTCAGCAGAGGATGCAGATGCCCCCGGCTCCCCCAAT  576

Query 1111  TCCCACGTTGTGTATCAGCTCCTGAGCCCTGAGCCTGAGGATGGGGTAGAGGGGAGAGCCTTCCAGGTGGACCC  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  577  TCCCACGTTGTGTATCAGCTCCTGAGCCCTGAGCCTGAGGATGGGGTAGAGGGGAGAGCCTTCCAGGTGGACCC  650

Query 1185  CACTTCAGGCAGTGTGACGCTGGGGGTGCTCCCACTCCGAGCAGGCCAGAACATCCTGCTTCTGGTGCTGGCCA  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  651  CACTTCAGGCAGTGTGACGCTGGGGGTGCTCCCACTCCGAGCAGGCCAGAACATCCTGCTTCTGGTGCTGGCCA  724

Query 1259  TGGACCTGGCAGGCGCAGAGGGTGGCTTCAGCAGCACGTGTGAAGTCGAAGTCGCAGTCACAGATATCAATGAT  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  725  TGGACCTGGCAGGCGCAGAGGGTGGCTTCAGCAGCACGTGTGAAGTCGAAGTCGCAGTCACAGATATCAATGAT  798

Query 1333  CACGCCCCTGAGTTCATCACTTCCCAGATTGGGCCTATAAGCCTCCCTGAGGATGTGGAGCCCGGGACTCTGGT  1406
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  799  CACGCCCCTGAGTTCATCACTTCCCAGATTGGGCCTATAAGCCTCCCTGAGGATGTGGAGCCCGGGACTCTGGT  872

Query 1407  GGCCATGCTAACAGCCATTGATGCTGACCTCGAGCCCGCCTTCCGCCTCATGGATTTTGCCATTGAGAGGGGAG  1480
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  873  GGCCATGCTAACAGCCATTGATGCTGACCTCGAGCCCGCCTTCCGCCTCATGGATTTTGCCATTGAGAGGGGAG  946

Query 1481  ACACAGAAGGGACTTTTGGCCTGGATTGGGAGCCAGACTCTGGGCATGTTAGACTCAGACTCTGCAAGAACCTC  1554
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  947  ACACAGAAGGGACTTTTGGCCTGGATTGGGAGCCAGACTCTGGGCATGTTAGACTCAGACTCTGCAAGAACCTC  1020

Query 1555  AGTTATGAGGCAGCTCCAAGTCATGAGGTGGTGGTGGTGGTGCAGAGTGTGGCGAAGCTGGTGGGGCCAGGCCC  1628
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1021  AGTTATGAGGCAGCTCCAAGTCATGAGGTGGTGGTGGTGGTGCAGAGTGTGGCGAAGCTGGTGGGGCCAGGCCC  1094

Query 1629  AGGCCCTGGAGCCACCGCCACGGTGACTGTGCTAGTGGAGAGAGTGATGCCACCCCCCAAGTTGGACCAGGAGA  1702
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1095  AGGCCCTGGAGCCACCGCCACGGTGACTGTGCTAGTGGAGAGAGTGATGCCACCCCCCAAGTTGGACCAGGAGA  1168

Query 1703  GCTACGAGGCCAGTGTCCCCATCAGTGCCCCAGCCGGCTCTTTCCTGCTGACCATCCAGCCCTCCGACCCCATC  1776
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1169  GCTACGAGGCCAGTGTCCCCATCAGTGCCCCAGCCGGCTCTTTCCTGCTGACCATCCAGCCCTCCGACCCCATC  1242

Query 1777  AGCCGAACCCTCAGGTTCTCCCTAGTCAATGACTCAGAGGGCTGGCTCTGCATTGAGAAATTCTCCGGGGAGGT  1850
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1243  AGCCGAACCCTCAGGTTCTCCCTAGTCAATGACTCAGAGGGCTGGCTCTGCATTGAGAAATTCTCCGGGGAGGT  1316

Query 1851  GCACACCGCCCAGTCCCTGCAGGGCGCCCAGCCTGGGGACACCTACACGGTGCTTGTGGAGGCCCAGGATACAG  1924
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1317  GCACACCGCCCAGTCCCTGCAGGGCGCCCAGCCTGGGGACACCTACACGGTGCTTGTGGAGGCCCAGGATACAG  1390

Query 1925  ATGAGCCGAGACTGAGCGCTTCTGCACCCCTGGTGATCCACTTCCTAAAGGCCCCTCCTGCCCCAGCCCTGACT  1998
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1391  ATGAGCCGAGACTGAGCGCTTCTGCACCCCTGGTGATCCACTTCCTAAAGGCCCCTCCTGCCCCAGCCCTGACT  1464

Query 1999  CTTGCCCCTGTGCCCTCCCAATACCTCTGCACACCCCGCCAAGACCATGGCTTGATCGTGAGTGGACCCAGCAA  2072
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1465  CTTGCCCCTGTGCCCTCCCAATACCTCTGCACACCCCGCCAAGACCATGGCTTGATCGTGAGTGGACCCAGCAA  1538

Query 2073  GGACCCCGATCTGGCCAGTGGGCACGGTCCCTACAGCTTCACCCTTGGTCCCAACCCCACGGTGCAACGGGATT  2146
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1539  GGACCCCGATCTGGCCAGTGGGCACGGTCCCTACAGCTTCACCCTTGGTCCCAACCCCACGGTGCAACGGGATT  1612

Query 2147  GGCGCCTCCAGACTCTCAATGGTTCCCATGCCTACCTCACCTTGGCCCTGCATTGGGTGGAGCCACGTGAACAC  2220
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1613  GGCGCCTCCAGACTCTCAATGGTTCCCATGCCTACCTCACCTTGGCCCTGCATTGGGTGGAGCCACGTGAACAC  1686

Query 2221  ATAATCCCCGTGGTGGTCAGCCACAATGCCCAGATGTGGCAGCTCCTGGTTCGAGTGATCGTGTGTCGCTGCAA  2294
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1687  ATAATCCCCGTGGTGGTCAGCCACAATGCCCAGATGTGGCAGCTCCTGGTTCGAGTGATCGTGTGTCGCTGCAA  1760

Query 2295  CGTGGAGGGGCAGTGCATGCGCAAGGTGGGCCGCATGAAGGGCATGCCCACGAAGCTGTCGGCAGTGGGCATCC  2368
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1761  CGTGGAGGGGCAGTGCATGCGCAAGGTGGGCCGCATGAAGGGCATGCCCACGAAGCTGTCGGCAGTGGGCATCC  1834

Query 2369  TTGTAGGCACCCTGGTAGCAATAGGAATCTTCCTCATCCTCATTTTCACCCACTGGACCATGTCAAGGAAGAAG  2442
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1835  TTGTAGGCACCCTGGTAGCAATAGGAATCTTCCTCATCCTCATTTTCACCCACTGGACCATGTCAAGGAAGAAG  1908

Query 2443  GACCCGGATCAACCAGCAGACAGCGTGCCCCTGAAGGCGACTGTC  2487
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1909  GACCCGGATCAACCAGCAGACAGCGTGCCCCTGAAGGCGACTGTC  1953