Nucleotide Global Alignment

Description

Query:
TRCN0000468820
Subject:
NM_001320147.2
Aligned Length:
1503
Identities:
1410
Gaps:
93

Alignment

Query    1  ATGCCGTTTGGGTGTGTGACTCTGGGCGACAAGAAGAACTATAACCAGCCATCGGAGGTGACTGACAGATATGA  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGCCGTTTGGGTGTGTGACTCTGGGCGACAAGAAGAACTATAACCAGCCATCGGAGGTGACTGACAGATATGA  74

Query   75  TTTGGGACAGGTCATCAAGACTGAGGAGTTTTGTGAAATCTTCCGGGCCAAGGACAAGACGACAGGCAAGCTGC  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  TTTGGGACAGGTCATCAAGACTGAGGAGTTTTGTGAAATCTTCCGGGCCAAGGACAAGACGACAGGCAAGCTGC  148

Query  149  ACACCTGCAAGAAGTTCCAGAAGCGGGACGGCCGCAAGGTGCGGAAAGCTGCCAAGAACGAGATAGGCATCCTC  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  ACACCTGCAAGAAGTTCCAGAAGCGGGACGGCCGCAAGGTGCGGAAAGCTGCCAAGAACGAGATAGGCATCCTC  222

Query  223  AAGATGGTGAAGCATCCCAACATCCTACAGCTGGTGGATGTGTTTGTGACCCGCAAGGAGTACTTTATCTTCCT  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  AAGATGGTGAAGCATCCCAACATCCTACAGCTGGTGGATGTGTTTGTGACCCGCAAGGAGTACTTTATCTTCCT  296

Query  297  GGAGCTGGCCACGGGGAGGGAGGTGTTTGACTGGATCCTGGACCAGGGCTACTACTCGGAGCGAGACACAAGCA  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  GGAGCTGGCCACGGGGAGGGAGGTGTTTGACTGGATCCTGGACCAGGGCTACTACTCGGAGCGAGACACAAGCA  370

Query  371  ACGTGGTACGGCAAGTCCTGGAGGCCGTGGCCTATTTGCACTCACTCAAGATCGTGCACAGGAATCTCAAGCTG  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  ACGTGGTACGGCAAGTCCTGGAGGCCGTGGCCTATTTGCACTCACTCAAGATCGTGCACAGGAATCTCAAGCTG  444

Query  445  GAGAACCTGGTTTACTACAACCGGCTGAAGAACTCGAAGATTGTCATCAGTGACTTCCATCTGGCTAAGCTAGA  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  GAGAACCTGGTTTACTACAACCGGCTGAAGAACTCGAAGATTGTCATCAGTGACTTCCATCTGGCTAAGCTAGA  518

Query  519  AAATGGCCTCATCAAGGAGCCCTGTGGGACCCCCGAGTATCTGGCCCCAGAGGTGGTAGGCCGGCAGCGGTATG  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  AAATGGCCTCATCAAGGAGCCCTGTGGGACCCCCGAGTATCTGGCCCCAGAGGTGGTAGGCCGGCAGCGGTATG  592

Query  593  GACGCCCTGTGGACTGCTGGGCCATTGGAGTCATCATGTACATCCTGCTTTCAGGCAATCCACCTTTCTATGAG  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  GACGCCCTGTGGACTGCTGGGCCATTGGAGTCATCATGTACATCCTGCTTTCAGGCAATCCACCTTTCTATGAG  666

Query  667  GAGGTGGAAGAAGATGATTATGAGAACCATGATAAGAATCTCTTCCGCAAGATCCTGGCTGGTGACTATGAGTT  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  GAGGTGGAAGAAGATGATTATGAGAACCATGATAAGAATCTCTTCCGCAAGATCCTGGCTGGTGACTATGAGTT  740

Query  741  TGACTCTCCATATTGGGATGATATTTCGCAGGCAGCCAAAGACCTGGTCACAAGGCTGATGGAGGTGGAGCAAG  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  TGACTCTCCATATTGGGATGATATTTCGCAGGCAGCCAAAGACCTGGTCACAAGGCTGATGGAGGTGGAGCAAG  814

Query  815  ACCAGCGGATCACTGCAGAAGAGGCCATCTCCCATGAGTGGATTTCTGGCAATGCTGCTTCTGATAAGAACATC  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  ACCAGCGGATCACTGCAGAAGAGGCCATCTCCCATGAGTGGATTTCTGGCAATGCTGCTTCTGATAAGAACATC  888

Query  889  AAGGATGGTGTCTGTGCCCAGATTGAAAAGAACTTTGCCAGGGCCAAGTGGAAGAAGGCTGTCCGAGTGACCAC  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  AAGGATGGTGTCTGTGCCCAGATTGAAAAGAACTTTGCCAGGGCCAAGTGGAAGAAGGCTGTCCGAGTGACCAC  962

Query  963  CCTCATGAAACGGCTCCGGGCACCAGAGCAGTCCAGCACGGCTGCAGCCCAGTCGGCCTCAGCCACAGACACTG  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  CCTCATGAAACGGCTCCGGGCACCAGAGCAGTCCAGCACGGCTGCAGCCCAGTCGGCCTCAGCCACAGACACTG  1036

Query 1037  CCACCCCCGGGGCTGCAGGTGGGGCCACAGCTGCAGCTGCGAGTGGAGCTACCTCAGCCCCTGAGGGTGATGCT  1110
            ||||||||||||||                                                            
Sbjct 1037  CCACCCCCGGGGCT------------------------------------------------------------  1050

Query 1111  GCTCGTGCTGCAAAGAGTGATAATGTGGCCCCCGCAGACCGTAGTGCCACCCCAGCCACAGATGGAAGTGCCAC  1184
                                             |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1051  ---------------------------------GCAGACCGTAGTGCCACCCCAGCCACAGATGGAAGTGCCAC  1091

Query 1185  CCCAGCCACTGATGGCAGTGTCACCCCAGCCACCGATGGAAGCATCACTCCAGCCACTGATGGGAGTGTCACCC  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1092  CCCAGCCACTGATGGCAGTGTCACCCCAGCCACCGATGGAAGCATCACTCCAGCCACTGATGGGAGTGTCACCC  1165

Query 1259  CAGCCACTGACAGGAGCGCTACTCCAGCCACTGATGGGAGAGCCACACCAGCCACAGAAGAGAGCACTGTGCCC  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1166  CAGCCACTGACAGGAGCGCTACTCCAGCCACTGATGGGAGAGCCACACCAGCCACAGAAGAGAGCACTGTGCCC  1239

Query 1333  ACCACCCAAAGCAGTGCCATGCTGGCCACCAAGGCAGCTGCCACCCCTGAGCCGGCTATGGCCCAGCCGGACAG  1406
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1240  ACCACCCAAAGCAGTGCCATGCTGGCCACCAAGGCAGCTGCCACCCCTGAGCCGGCTATGGCCCAGCCGGACAG  1313

Query 1407  CACAGCCCCAGAGGGCGCCACAGGCCAGGCTCCACCCTCTAGTAAAGGGGAAGAGGCTGCTGGTTATGCCCAGG  1480
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1314  CACAGCCCCAGAGGGCGCCACAGGCCAGGCTCCACCCTCTAGTAAAGGGGAAGAGGCTGCTGGTTATGCCCAGG  1387

Query 1481  AGTCTCAAAGGGAGGAGGCCAGC  1503
            |||||||||||||||||||||||
Sbjct 1388  AGTCTCAAAGGGAGGAGGCCAGC  1410