Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000468820
• Subject: XM_006511722.2
• Aligned Length: 1542
• Identities: 1354
• Gaps: 45

Alignment

Query    1  ATGCCGTTTGGGTGTGTGACTCTGGGCGACAAGAAGAACTATAACCAGCCATCGGAGGTGACTGACAGATATGA  74
            ||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGCCGTTTGGGTGTGTGACTCTGGGTGACAAGAAGAACTATAACCAGCCATCGGAAGTGACTGACAGATATGA  74

Query   75  TTTGGGACAGGTCATCAAGACTGAGGAGTTTTGTGAAATCTTCCGGGCCAAGGACAAGACGACAGGCAAGCTGC  148
            ..|||||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||||
Sbjct   75  CCTGGGACAAGTCATCAAGACTGAGGAGTTCTGTGAAATCTTCCGGGCCAAGGACAAGACAACGGGCAAGCTGC  148

Query  149  ACACCTGCAAGAAGTTCCAGAAGCGGGACGGCCGCAAGGTGCGGAAAGCTGCCAAGAACGAGATAGGCATCCTC  222
            |||||||.|||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||.||.||||||||||||||.||.||||||
Sbjct  149  ACACCTGTAAGAAGTTCCAGAAGCGTGATGGCCGCAAGGTGCGGAAGGCAGCCAAGAACGAGATTGGAATCCTC  222

Query  223  AAGATGGTGAAGCATCCCAACATCCTACAGCTGGTGGATGTGTTTGTGACCCGCAAGGAGTACTTTATCTTCCT  296
            ||||||||||||||.|||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||.|||||.||
Sbjct  223  AAGATGGTGAAGCACCCCAACATCCTGCAGCTGGTAGATGTGTTTGTGACCCGCAAGGAATACTTCATCTTTCT  296

Query  297  GGAGCTGGCCACGGGGAGGGAGGTGTTTGACTGGATCCTGGACCAGGGCTACTACTCGGAGCGAGACACAAGCA  370
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||
Sbjct  297  GGAGCTGGCCACGGGGAGGGAGGTGTTTGACTGGATCCTGGACCAGGGCTACTACTCGGAGCGAGACACGAGCA  370

Query  371  ACGTGGTACGGCAAGTCCTGGAGGCCGTGGCCTATTTGCACTCACTCAAGATCGTGCACAGGAATCTCAAGCTG  444
            |||||||.|||||.|||.|||||||.||||||||.||||||||.||||||||.|||||||||||.|||||||||
Sbjct  371  ACGTGGTGCGGCAGGTCTTGGAGGCTGTGGCCTACTTGCACTCGCTCAAGATTGTGCACAGGAACCTCAAGCTG  444

Query  445  GAGAACCTGGTTTACTACAACCGGCTGAAGAACTCGAAGATTGTCATCAGTGACTTCCATCTGGCTAAGCTAGA  518
            ||.|||||.||.|||||||||.|||||||||||||.||||||||||||||.|||||.||.||||||||||||||
Sbjct  445  GAAAACCTAGTGTACTACAACAGGCTGAAGAACTCAAAGATTGTCATCAGCGACTTTCACCTGGCTAAGCTAGA  518

Query  519  AAATGGCCTCATCAAGGAGCCCTGTGGGACCCCCGAGTATCTGGCCCCAGAGGTGGTAGGCCGGCAGCGGTATG  592
            .||||||||.|||||||||||||||||.|||||.|||||||||||.|||||.||||||||.|||||.|||||.|
Sbjct  519  GAATGGCCTTATCAAGGAGCCCTGTGGAACCCCGGAGTATCTGGCACCAGAAGTGGTAGGACGGCAACGGTACG  592

Query  593  GACGCCCTGTGGACTGCTGGGCCATTGGAGTCATCATGTACATCCTGCTTTCAGGCAATCCACCTTTCTATGAG  666
            |.||||||||.|||||.|||||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||.||.||.|||||.|||
Sbjct  593  GTCGCCCTGTAGACTGTTGGGCCATTGGCGTCATCATGTATATCCTGCTTTCAGGCAACCCGCCCTTCTACGAG  666

Query  667  GAGGTGGAAGAAGATGATTATGAGAACCATGATAAGAATCTCTTCCGCAAGATCCTGGCTGGTGACTATGAGTT  740
            |||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  GAGGTGGAAGAAGATGACTATGAGAACCACGATAAGAATCTCTTCCGCAAGATCCTGGCTGGTGACTATGAGTT  740

Query  741  TGACTCTCCATATTGGGATGATATTTCGCAGGCAGCCAAAGACCTGGTCACAAGGCTGATGGAGGTGGAGCAAG  814
            |||||||||.||.|||||.||||||||.||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  TGACTCTCCGTACTGGGACGATATTTCTCAAGCAGCCAAAGACCTGGTCACCAGGCTGATGGAGGTGGAGCAAG  814

Query  815  ACCAGCGGATCACTGCAGAAGAGGCCATCTCCCATGAGTGGATTTCTGGCAATGCTGCTTCTGATAAGAACATC  888
            |||||||||||||.||||||||||||||||||||.||.||||||||.|||||.||.||||||||||||||||||
Sbjct  815  ACCAGCGGATCACCGCAGAAGAGGCCATCTCCCACGAATGGATTTCCGGCAACGCGGCTTCTGATAAGAACATC  888

Query  889  AAGGATGGTGTCTGTGCCCAGATTGAAAAGAACTTTGCCAGGGCCAAGTGGAAGAAGGCTGTCCGAGTGACCAC  962
            ||||||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  AAGGATGGCGTCTGTGCCCAGATTGAGAAGAACTTTGCCAGAGCCAAGTGGAAGAAGGCTGTCCGAGTGACCAC  962

Query  963  CCTCATGAAACGGCTCCGGGCACCAGAGCAGTCCAGCACGGCTGCAGCCCAGTCGGCCTCAGCCACAGACACTG  1036
            .||||||||.|||||||||||||||||||||||..|.||.||.||..|||||||.||.|      |||||.|||
Sbjct  963  TCTCATGAAGCGGCTCCGGGCACCAGAGCAGTCTGGAACAGCGGCGACCCAGTCTGCTT------CAGACGCTG  1030

Query 1037  CCACCCCCGGGGCTGCAGGTGGGGCCA---------------CAGCTGCAGCTGCGAGTGGAGCTACCTCAGCC  1095
            ||||.||.||||||||.||||||||||               |||||||||||||..||||||||.||||||||
Sbjct 1031  CCACTCCTGGGGCTGCTGGTGGGGCCATCGCTGCTGCAGCTGCAGCTGCAGCTGCAGGTGGAGCTGCCTCAGCC  1104

Query 1096  CCT------------------------GAGGGTGATGCTGCTCGTGCTGCAAAGAGTGATAATGTGGCCCCCGC  1145
            .||                        |||||||.|||||...|||||||.|||||.|||.|..|.|||.|.||
Sbjct 1105  TCTGGGGCCAGTGCTACTGCAGCCACAGAGGGTGGTGCTGGGTGTGCTGCCAAGAGCGATGACATAGCCTCTGC  1178

Query 1146  AGACCGTAGTGCCACCCCAGCCACAGATGGAAGTGCCACCCCAGCCACTGATGGCAGTGTCACCCCAGCCACCG  1219
            |||.||||||||.||.||||||||||||||.||.|||||.||||||||.||||||||.||||||||||||||.|
Sbjct 1179  AGATCGTAGTGCTACACCAGCCACAGATGGCAGCGCCACTCCAGCCACAGATGGCAGCGTCACCCCAGCCACGG  1252

Query 1220  ATGGAAGCATCACTCCAGCCACTGATGGGAGTGTCACCCCAGCCACTGACAGGAGCGCTACTCCAGCCACTGAT  1293
            ||||.||||||||.|||||||||||.|||||||||||.|||||.||||||||.||||||||.|||||.||||||
Sbjct 1253  ATGGCAGCATCACCCCAGCCACTGACGGGAGTGTCACTCCAGCTACTGACAGAAGCGCTACACCAGCTACTGAT  1326

Query 1294  GGGAGAGCCACACCAGCCACAGAAGAGAGCACTGTGCCCACCACCCAAAGCAGTGCCATGCTGGCCACCAAGGC  1367
            ||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||.||||.||||||||||||.|||..||..|.|||||
Sbjct 1327  GGCAGAGCCACACCAGCCACAGAAGAGAGCACAGTGCCCGCCACTCAAAGCAGTGCCCTGCCAGCTGCAAAGGC  1400

Query 1368  AGCTGCCACCCCTGAGCCGGCTATGGCCCAGCCGGACAGCACAGCCCCAGAGGGCGCCACAGGCCAGGCTCCAC  1441
            |||.||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||.||||||.|||||||||||||||||||
Sbjct 1401  AGCAGCCACCCCTGAGCCGGCTGTGGCCCAGCCGGACAGCACAGCCCTAGAGGGTGCCACAGGCCAGGCTCCAC  1474

Query 1442  CCTCTAGTAAAGGGGAAGAGGCTGCTGGTTATGCCCAGGAGTCTCAAAGGGAGGAGGCCAGC  1503
            |||||||||||||.|||||||||.||||.|.|||||||||||||||.||||.||||.|.|||
Sbjct 1475  CCTCTAGTAAAGGAGAAGAGGCTACTGGATGTGCCCAGGAGTCTCAGAGGGTGGAGACGAGC  1536