Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000468851
• Subject: XM_006511499.3
• Aligned Length: 3231
• Identities: 2717
• Gaps: 114

Alignment

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct    1  ATGCCGGAACCTTTGGTTCCAAGCGGTGCAACGAGCCGGCAGCACCAAGGATCTTCCGGGGAGGGAAGGCGCAT  74

Query    1  ----ATGGCGGCTGCGCCGGCCTTGAAGCACTGGCGCACCACGCTGGAGCGGGTGGAGAAGTTCGTGTCGCCGC  70
                ||||||||.||||||..|||||||||||||||||||||..|.|||||||||||||||||||||||.|||.
Sbjct   75  CGCCATGGCGGCAGCGCCGTTCTTGAAGCACTGGCGCACCACTTTCGAGCGGGTGGAGAAGTTCGTGTCCCCGA  148

Query   71  TCTACTTTACCGACTGTAACCTCCGCGGCAGGCTTTTTGGGGCCAGCTGCCCTGTGGCTGTGCTCTCCAGCTTC  144
            |||||||.||||||||||||||.|||||||||||.||.||||.|||||||.|.|||.|   .||||||||||||
Sbjct  149  TCTACTTCACCGACTGTAACCTTCGCGGCAGGCTCTTCGGGGACAGCTGCTCGGTGAC---ACTCTCCAGCTTC  219

Query  145  CTGACGCCGGAGAGACTTCCCTACCAGGAGGCAGTCCAGCGGGACTTCCGCCCCGCGCAGGTCGGCGACAGCTT  218
            ||||||||.|||||.||||||||..||.||||.||.||||.|.|||||.||||.||||||||||||||||||||
Sbjct  220  CTGACGCCCGAGAGGCTTCCCTATGAGAAGGCGGTGCAGCAGAACTTCAGCCCTGCGCAGGTCGGCGACAGCTT  293

Query  219  CGGACCCACATGGTGGACCTGCTGGTTCCGGGTGGAGCTGACCATCCCAGAGGCATGGGTGGGCCAGGAAGTTC  292
            |||||||||||||||||||||||||||.|||||.||.|||..||||||.||.|..|||||||||||||||||||
Sbjct  294  CGGACCCACATGGTGGACCTGCTGGTTTCGGGTAGAACTGGTCATCCCTGAAGTTTGGGTGGGCCAGGAAGTTC  367

Query  293  ACCTTTGCTGGGAAAGTGATGGAGAAGGTCTGGTGTGGCGTGATGGAGAACCTGTCCAGGGTTTAACCAAAGAG  366
            |.||||||||||||||.|||||||||.|.||.||.|||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||.
Sbjct  368  ATCTTTGCTGGGAAAGCGATGGAGAAAGCCTTGTCTGGCGTGATGGGGAACCTGTCCAGGGTTTGACCAAAGAA  441

Query  367  GGTGAGAAGACCAGCTATGTCCTGACTGACAGGCTGGGGGAAAGAGACCCCCGAAGCCTCACTCTCTATGTGGA  440
            ||.||.||||||||.||||||||||..||.||||||.|.|.|..||||||.||.|||.|.||||||||||||||
Sbjct  442  GGCGAAAAGACCAGTTATGTCCTGAGCGAGAGGCTGCGAGCATCAGACCCTCGGAGCTTGACTCTCTATGTGGA  515

Query  441  AGTAGCCTGCAATGGGCTCCTGGGGGCCGGGAAGGGAAGCATGATTGCAGCCCCTGACCCTGAGAAGATGTTCC  514
            ||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||
Sbjct  516  AGTAGCCTGCAATGGGCTTCTGGGGGCCGGGAAGGGAAGCATGATCGCAGCCCCTGACCCAGAGAAGATGTTCC  589

Query  515  AGCTGAGCCGGGCTGAGCTAGCTGTGTTCCACCGGGATGTCCACATGCTCCTGGTGGATCTGGAGCTGCTGCTG  588
            |||||||||.||||.|.||.|||||||||||||||||||||||||..|||||||||||.|||||||||.|||||
Sbjct  590  AGCTGAGCCAGGCTAAACTGGCTGTGTTCCACCGGGATGTCCACAGTCTCCTGGTGGACCTGGAGCTGTTGCTG  663

Query  589  GGCATAGCCAAGGGCCTCGGGAAGGACAACCAGCGCAGCTTCCAGGCCCTGTACACAGCCAATCAGATGGTGAA  662
            ||..|.|||||||||||||||.||||||.||||||||||||||||||||||.||||||||||.|||||||||||
Sbjct  664  GGTGTGGCCAAGGGCCTCGGGGAGGACAGCCAGCGCAGCTTCCAGGCCCTGCACACAGCCAACCAGATGGTGAA  737

Query  663  CGTGTGTGACCCTGCCCAGCCCGAGACCTTCCCAGTGGCCCAGGCCCTGGCCTCCAGGTTCTTTGGCCAACATG  736
            |.|.|||||||||||.|||||.|||||.|.|||||..|||.|.|||||||||||||.|||||||||||||||||
Sbjct  738  CATATGTGACCCTGCTCAGCCTGAGACTTACCCAGCAGCCAAAGCCCTGGCCTCCAAGTTCTTTGGCCAACATG  811

Query  737  GGGGTGAAAGCCAACACACCATTCATGCCACAGGGCACTGCCACATTGATACAGCCTGGCTTTGGCCCTTCAAA  810
            |.|||||||||||.||.|||||.|||||||..||.|||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.
Sbjct  812  GAGGTGAAAGCCAGCATACCATCCATGCCATGGGACACTGTCACATTGATACAGCCTGGCTTTGGCCCTTCAAG  885

Query  811  GAGACTGTGAGGAAATGTGCCCGGAGCTGGGTGACCGCCCTGCAGCTCATGGAGCGGAACCCTGAGTTCATCTT  884
            ||||||||||||||||||||||||||||||..|||.||..||..|||||||||||.||||.|.||.||||||||
Sbjct  886  GAGACTGTGAGGAAATGTGCCCGGAGCTGGTCGACAGCTGTGACGCTCATGGAGCAGAACACAGACTTCATCTT  959

Query  885  TGCCTGCTCCCAGGCGCAGCAGCTGGAATGGGTGAAGAGCCGCTACCCTGGCCTGTACTCCCGCATCCAGGAGT  958
            |||||||||.|||||.||.||.||.||||||||.|||||||..||||||||.|||.|..||||..|||||||||
Sbjct  960  TGCCTGCTCTCAGGCACAACAACTTGAATGGGTCAAGAGCCAGTACCCTGGTCTGCATGCCCGGCTCCAGGAGT  1033

Query  959  TTGCGTGCCGTGGGCAGTTTGTGCCTGTGGGGGGCACCTGGGTGGAGATGGATGGGAACCTGCCCAGTGGAGAG  1032
            ||||.|||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||.||||||||||||
Sbjct 1034  TTGCCTGCCGAGGACAGTTTGTGCCTGTGGGGGGCACCTGGGTAGAAATGGATGGGAACCTTCCCAGTGGAGAG  1107

Query 1033  GCCATGGTGAGGCAGTTTTTGCAGGGCCAGAACTTCTTTCTGCAGGAGTTTGGGAAGATGTGCTCTGAGTTCTG  1106
            |||||||||||||||||..|||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1108  GCCATGGTGAGGCAGTTCCTGCAGGGCCAGAACTTCTTTCTGCAAGAGTTTGGGAAGATGTGCTCTGAGTTCTG  1181

Query 1107  GCTGCCGGACACCTTTGGCTACTCAGCACAGCTCCCCCAGATCATGCACGGCTGTGGCATCAGGCGCTTTCTCA  1180
            ||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||.||||||.||.|
Sbjct 1182  GCTGCCAGACACGTTTGGCTACTCAGCACAGCTCCCCCAGATCATGCAAGGCTGTGGCATCAAGCGCTTCCTGA  1255

Query 1181  CCCAGAAATTGAGCTGGAATTTGGTGAACTCCTTCCCACACCATACATTTTTCTGGGAGGGCCTGGATGGCTCC  1254
            ||||||||.||||||||||.|||||.||||||||.|||||||||||.||||||||||||||.||||||||||||
Sbjct 1256  CCCAGAAACTGAGCTGGAACTTGGTCAACTCCTTTCCACACCATACCTTTTTCTGGGAGGGGCTGGATGGCTCC  1329

Query 1255  CGTGTACTGGTCCACTTCCCACCTGGCGACTCCTATGGGATGCAGGGCAGCGTGGAGGAGGTGCTGAAGACCGT  1328
            ||.||.||||||||||||||||||||.|||||.|||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||.||
Sbjct 1330  CGAGTGCTGGTCCACTTCCCACCTGGAGACTCATATGGAATGCAGGGCAGTGTGGAGGAGGTGCTGAAGACTGT  1403

Query 1329  GGCCAACAACCGGGACAAGGGGCGGGCCAACCACAGTGCCTTCCTCTTTGGCTTTGGGGATGGGGGTGGTGGCC  1402
            |.|||||||||||||||||||||||.||||||||||||.|||||||||.|||||.|||||||||||.|||||||
Sbjct 1404  GACCAACAACCGGGACAAGGGGCGGACCAACCACAGTGGCTTCCTCTTCGGCTTCGGGGATGGGGGAGGTGGCC  1477

Query 1403  CCACCCAGACCATGCTGGACCGCCTGAAGCGCCTGAGCAATACGGATGGGCTGCCCAGGGTGCAGCTATCTTCT  1476
            ||||.|||||||||.|||||||..|||||||.||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1478  CCACACAGACCATGTTGGACCGATTGAAGCGGCTGAGCAACACTGATGGGCTGCCCAGGGTGCAGCTATCTTCT  1551

Query 1477  CCAAGACAGCTCTTCTCAGCACTGGAGAGTGACTCAGAGCAGCTGTGCACGTGGGTTGGGGAGCTCTTCTTGGA  1550
            ||..|.|||||||||.|.|||||||||||.|||||||..|||||||||||.||||||||.||.||||||.||||
Sbjct 1552  CCTGGCCAGCTCTTCACGGCACTGGAGAGAGACTCAGGACAGCTGTGCACATGGGTTGGAGAACTCTTCCTGGA  1625

Query 1551  GCTGCACAATGGCACATACACCACCCATGCCCAGATCAAGAAGGGGAACCGGGAATGTGAGCGGATCCTGCACG  1624
            .||||||||||||||.|||||.||.|||||||||.||||||||||||||.|.||||||||||.|||.||.||.|
Sbjct 1626  ACTGCACAATGGCACCTACACTACGCATGCCCAGCTCAAGAAGGGGAACAGAGAATGTGAGCAGATTCTTCATG  1699

Query 1625  ACGTGGAGCTGCTCAGTAGCCTGGCCCTGGCCCGCAGTGCCCAGTTCCTATACCCAGCAGCCCAGCTGCAGCAC  1698
            ||||||||.|||||||.|||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||
Sbjct 1700  ACGTGGAGGTGCTCAGCAGCCTGGCCCTAGCCCGAAGTGCCCAGTTCCTATACCCGGCAGCCCAGCTGCAGCAC  1773

Query 1699  CTCTGGAGGCTCCTTCTTCTGAACCAGTTCCATGATGTGGTGACTGGAAGCTGCATCCAGATGGTGGCAGAGGA  1772
            ||||||||||||||.||.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||.||||||||||.||
Sbjct 1774  CTCTGGAGGCTCCTGCTCCTCAACCAGTTCCATGATGTGGTGACTGGAAGCTGCATTCAGCTGGTGGCAGAAGA  1847

Query 1773  AGCCATGTGCCATTATGAAGACATCCGTTCCCATGGCAATACACTGCTCAGCGCTGCAGCCGCAGCCCTGTGTG  1846
            .||||||..|.|.|||||||||||||||||.||||||||..||||||||||.|||||||||||||||.||||||
Sbjct 1848  TGCCATGAACTACTATGAAGACATCCGTTCTCATGGCAACCCACTGCTCAGTGCTGCAGCCGCAGCCTTGTGTG  1921

Query 1847  CTGGGGAGCCAGGTCCTGAGGGCCTCCTCATCGTCAACACACTGCCCTGGAAGCGGATCGAAGTGATGGCCCTG  1920
            |.||||||||||||||..|||||||||||||..||||||||||||||||||||||.|..||||||.||||.|||
Sbjct 1922  CCGGGGAGCCAGGTCCCAAGGGCCTCCTCATTATCAACACACTGCCCTGGAAGCGCACTGAAGTGTTGGCACTG  1995

Query 1921  CCCAAACCGGGCGGGGCCCACAGCCT-------------AGCCCTGGTGACAGTGCCCAGCATGGGCTATGCTC  1981
            |||||.||..|.|||||.||||||||             ||||||||||||||||||.||.||.|||||.||||
Sbjct 1996  CCCAAGCCTTGTGGGGCTCACAGCCTAGGCCTTGTCCCCAGCCCTGGTGACAGTGCCAAGTATTGGCTACGCTC  2069

Query 1982  CTGTTCCTCCCCCCACCTCACTGCAGCCCCTGCTGCCCCAGCAGCCTGTGTTCGTAGTGCAAG-----------  2044
            |||.|||..||||.||.||||||||||||||.||.|||||||||||||||||.||..||||.|           
Sbjct 2070  CTGCTCCCACCCCTACTTCACTGCAGCCCCTCCTCCCCCAGCAGCCTGTGTTTGTGATGCAGGAGGTAAGACCC  2143

Query 2045  ---------AGACTGATGGCTCCGTGACTCTGGACAATGGCATCATCCGAGTGAAGCTGGACCCAACTGGTCGC  2109
                     |||||||.||.||.||||||.|||||||.|||||||||||.||||..|||||.||||||||..|.
Sbjct 2144  TCCCCTCCAAGACTGACGGTTCTGTGACTTTGGACAACGGCATCATCCGGGTGAGACTGGATCCAACTGGCTGT  2217

Query 2110  CTGACGTCCTTGGTCCTGGTGGCCTCTGGCAGGGAGGCCATTGCTGAGGGCGCCGTGGGGAACCAGTTTGTGCT  2183
            ||.||.|||.|||||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||.|||.|||||||||||||||||.|
Sbjct 2218  CTTACCTCCCTGGTCCTGGTGGCTTCTGGCAGGGAAGCCATTGCTGAGGGAGCCCTGGGGAACCAGTTTGTGTT  2291

Query 2184  ATTTGATGATGTCCCCTTGTACTGGGATGCATGGGACGTCATGGACTACCACCTGGAGACACGGAAGCCTGTGC  2257
            .|||||||||||.||.||||||||||||||||||||.||||||||.|||||.||.|||||||||||||||||||
Sbjct 2292  GTTTGATGATGTGCCATTGTACTGGGATGCATGGGATGTCATGGATTACCATCTAGAGACACGGAAGCCTGTGC  2365

Query 2258  TGGGCCAGGCAGGGACCCTGGCAGTGGGCACCGAGGGCGGCCTGCGGGGCAGCGCCTGGTTCTTGCTACAGATC  2331
            |||||||||||||||||||||||||||||||.||.||.|||||.||||||||.|||||||||.||||.||||||
Sbjct 2366  TGGGCCAGGCAGGGACCCTGGCAGTGGGCACTGAAGGTGGCCTCCGGGGCAGTGCCTGGTTCCTGCTCCAGATC  2439

Query 2332  AGCCCCAACAGTCGGCTTAGCCAGGAGGTTGTGCTGGACGTTGGCTGCCCCTATGTCCGCTTCCACACCGAGGT  2405
            |||||||||||.|||||.|||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||
Sbjct 2440  AGCCCCAACAGCCGGCTCAGCCAGGAGGTTGTGCTAGATGTTGGCTGCCCCTATGTCCGCTTCCACACTGAGGT  2513

Query 2406  ACACTGGCATGAGGCCCACAAGTTCCTGAAGGTGGAGTTCCCTGCTCGCGTGCGGAGTTCCCAGGCCACCTATG  2479
            .||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|..|.|||||..|||||||.|||||||
Sbjct 2514  GCACTGGCACGAGGCCCACAAGTTCCTGAAGGTGGAGTTCCCTGCTAGAATACGGAGCCCCCAGGCTACCTATG  2587

Query 2480  AGATCCAGTTTGGGCACCTGCAGCGACCTACCCACTACAATACCTCTTGGGACTGGGCTCGATTTGAGGTGTGG  2553
            |||||||||||||||||||.|||.|.||.||.|||.||||.||||||||||||||||||||.|..|||||||||
Sbjct 2588  AGATCCAGTTTGGGCACCTCCAGAGGCCGACGCACAACAACACCTCTTGGGACTGGGCTCGCTACGAGGTGTGG  2661

Query 2554  GCCCATCGCTGGATGGATCTGTCAGAACACGGCTTTGGGCTGGCCCTGCTCAACGACTGCAAGTATGGCGCGTC  2627
            ||.||.||||||||.||||||||.||....|.||||||||||||||||||||||.|||||||||||||.||.||
Sbjct 2662  GCTCACCGCTGGATAGATCTGTCCGAGTGTGACTTTGGGCTGGCCCTGCTCAACAACTGCAAGTATGGAGCATC  2735

Query 2628  AGTGCGAGGCAGCATCCTCAGCCTCTCGCTCTTGCGGGCGCCTAAAGCCCCGGACGCTACTGCTGACACGGGGC  2701
            |||.|||||||.|.|||||||||||||.||.|||||.||.||.||.||.||.||||||||||||||||.|||||
Sbjct 2736  AGTACGAGGCAACGTCCTCAGCCTCTCACTGTTGCGTGCACCCAAGGCTCCAGACGCTACTGCTGACATGGGGC  2809

Query 2702  GCCACGAGTTCACCTATGCACTGATGCCGCACAAGGGCTCTTTCCAGGATGCTGGCGTTATCCAAGCTGCCTAC  2775
            ||||.||.|||||.||.||..|||||||.|||||||||||.|||||.||.|||||.||.|||||.|||||||||
Sbjct 2810  GCCATGAATTCACTTACGCTTTGATGCCACACAAGGGCTCCTTCCAAGAAGCTGGTGTCATCCATGCTGCCTAC  2883

Query 2776  AGCCTAAACTTCCCCCTGTTGGCTCTGCCAGCCCCCAGCCCAGCGCCCGCCACCTCCTGGAGTGCGTTTTCCGT  2849
            |.|||.|||||.||||||.||||.|||||.||.||..||||.||.||.|.||||.||||||||||.|||||.||
Sbjct 2884  AACCTCAACTTTCCCCTGCTGGCACTGCCGGCTCCAGGCCCGGCCCCTGACACCACCTGGAGTGCCTTTTCTGT  2957

Query 2850  GTCTTCACCCGCGGTCGTATTGGAGACCGTCAAGCAGGCGGAGAGCAGCCCCCAGCGCCGCTCGCTGGTCCTGA  2923
            |||||||||.||.||.||..||||||||.||||||||||.|||||..|||..||||.||||.|.|||||.||.|
Sbjct 2958  GTCTTCACCAGCAGTAGTGCTGGAGACCATCAAGCAGGCTGAGAGGTGCCATCAGCACCGCACACTGGTTCTAA  3031

Query 2924  GGCTGTATGAGGCCCACGGCAGCCACGTGGACTGCTGGCTGCACTTGTCGCTGCCGGTTCAGGAGGCCATCCTC  2997
            |||||||.|||||.||.||||||||.||||||||||||||||||..||||.||||.|||||||||||||.|||.
Sbjct 3032  GGCTGTACGAGGCTCATGGCAGCCATGTGGACTGCTGGCTGCACACGTCGTTGCCTGTTCAGGAGGCCACCCTT  3105

Query 2998  TGCGATCTCTTGGAGCGACCAGACCCTGCTGGCCACTTGACCCTTCGGGACAACCGCCTGAAGCTCACCTTTTC  3071
            ||.||.|||.||||||..|.||||||..||||.|||.|..||||.|.|||||||||.|||||||||||.|||||
Sbjct 3106  TGTGACCTCCTGGAGCAGCGAGACCCCACTGGTCACCTTTCCCTCCAGGACAACCGTCTGAAGCTCACTTTTTC  3179

Query 3072  TCCCTTCCAAGTGCTGTCCCTGTTGCTCGTGCTTCAGCCTCCGCCACAC  3120
            |||||||||||||...|||||.|||||.|||||||||.||||.|||.||
Sbjct 3180  TCCCTTCCAAGTGAGATCCCTATTGCTTGTGCTTCAGTCTCCACCAAAC  3228