Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000468890
• Subject: NM_020865.3
• Aligned Length: 3024
• Identities: 2935
• Gaps: 87

Alignment

Query    1  ATGAGTTATGACTACCATCAGAACTGGGGCCGTGATGGGGGTCCCCGCAGCTCCGGTGGGGGCTATGGAGGGGG  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGAGTTATGACTACCATCAGAACTGGGGCCGTGATGGGGGTCCCCGCAGCTCCGGTGGGGGCTATGGAGGGGG  74

Query   75  GCCAGCAGGGGGTCATGGAGGTAACCGAGGCTCCGGAGGAGGCGGCGGCGGCGGAGGGGGTGGTCGAGGCGGCA  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  GCCAGCAGGGGGTCATGGAGGTAACCGAGGCTCCGGAGGAGGCGGCGGCGGCGGAGGGGGTGGTCGAGGCGGCA  148

Query  149  GGGGCCGGCATCCCGGGCACCTGAAAGGCCGCGAAATCGGCATGTGGTACGCGAAAAAACAGGGGCAGAAGAAC  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  GGGGCCGGCATCCCGGGCACCTGAAAGGCCGCGAAATCGGCATGTGGTACGCGAAAAAACAGGGGCAGAAGAAC  222

Query  223  AAGGAAGCGGAGAGGCAAGAGAGAGCTGTAGTACACATGGATGAACGACGAGAAGAACAAATTGTACAGTTACT  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  AAGGAAGCGGAGAGGCAAGAGAGAGCTGTAGTACACATGGATGAACGACGAGAAGAACAAATTGTACAGTTACT  296

Query  297  GAATTCTGTTCAAGCGAAGAATGATAAAGAGTCAGAAGCACAGATATCCTGGTTTGCTCCTGAGGATCATGGAT  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  GAATTCTGTTCAAGCGAAGAATGATAAAGAGTCAGAAGCACAGATATCCTGGTTTGCTCCTGAGGATCATGGAT  370

Query  371  ACGGTACTGAAGTTTCTACTAAGAACACACCATGCTCAGAGAACAAACTTGACATCCAGGAAAAGAAGTTGATA  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  ACGGTACTGAAGTTTCTACTAAGAACACACCATGCTCAGAGAACAAACTTGACATCCAGGAAAAGAAGTTGATA  444

Query  445  AATCAAGAAAAAAAAATGTTTAGAATCAGGAACAGATCATATATTGACCGAGATTCTGAGTATCTCTTGCAAGA  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  AATCAAGAAAAAAAAATGTTTAGAATCAGGAACAGATCATATATTGACCGAGATTCTGAGTATCTCTTGCAAGA  518

Query  519  AAATGAACCAGATGGAACTTTAGACCAAAAATTATTGGAAGATTTACAAAAGAAAAAAAATGACCTTCGGTATA  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  AAATGAACCAGATGGAACTTTAGACCAAAAATTATTGGAAGATTTACAAAAGAAAAAAAATGACCTTCGGTATA  592

Query  593  TTGAAATGCAGCATTTCAGAGAAAAGCTGCCTTCGTATGGAATGCAAAAGGAATTGGTAAATTTAATTGATAAC  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  TTGAAATGCAGCATTTCAGAGAAAAGCTGCCTTCGTATGGAATGCAAAAGGAATTGGTAAATTTAATTGATAAC  666

Query  667  CATCAGGTAACAGTAATAAGTGGTGAAACTGGTTGTGGCAAAACCACTCAAGTTACTCAGTTCATTTTGGATAA  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  CATCAGGTAACAGTAATAAGTGGTGAAACTGGTTGTGGCAAAACCACTCAAGTTACTCAGTTCATTTTGGATAA  740

Query  741  CTACATTGAAAGAGGAAAAGGATCTGCTTGCAGAATAGTTTGTACTCAGCCAAGAAGAATTAGTGCCATTTCAG  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  CTACATTGAAAGAGGAAAAGGATCTGCTTGCAGAATAGTTTGTACTCAGCCAAGAAGAATTAGTGCCATTTCAG  814

Query  815  TTGCGGAAAGAGTAGCTGCAGAAAGGGCAGAATCTTGTGGCAGTGGTAATAGTACTGGATATCAAATTCGTCTC  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  TTGCGGAAAGAGTAGCTGCAGAAAGGGCAGAATCTTGTGGCAGTGGTAATAGTACTGGATATCAAATTCGTCTC  888

Query  889  CAGAGTCGGTTGCCAAGGAAACAGGGTTCTATCTTATACTGTACAACAGGAATCATCCTTCAGTGGCTCCAGTC  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  CAGAGTCGGTTGCCAAGGAAACAGGGTTCTATCTTATACTGTACAACAGGAATCATCCTTCAGTGGCTCCAGTC  962

Query  963  AGACCCGTATTTGTCCAGTGTTAGTCATATCGTACTTGATGAAATCCATGAAAGAAATCTGCAGTCAGATGTTT  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  AGACCCGTATTTGTCCAGTGTTAGTCATATCGTACTTGATGAAATCCATGAAAGAAATCTGCAGTCAGATGTTT  1036

Query 1037  TAATGACTGTTGTTAAAGACCTTCTCAATTTTCGATCTGACTTGAAAGTAATATTGATGAGTGCAACATTGAAT  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  TAATGACTGTTGTTAAAGACCTTCTCAATTTTCGATCTGACTTGAAAGTAATATTGATGAGTGCAACATTGAAT  1110

Query 1111  GCAGAAAAGTTTTCAGAATATTTTGGTAACTGTCCAATGATACATATACCTGGTTTTACCTTTCCGGTTGTGGA  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  GCAGAAAAGTTTTCAGAATATTTTGGTAACTGTCCAATGATACATATACCTGGTTTTACCTTTCCGGTTGTGGA  1184

Query 1185  ATATCTTTTGGAAGATGTAATTGAAAAAATAAGGTATGTTCCAGAACAAAAAGAACACAGATGCCAGTTTAAGA  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||
Sbjct 1185  ATATCTTTTGGAAGATGTAATTGAAAAAATAAGGTATGTTCCAGAACAAAAAGAACACAGATCCCAGTTTAAGA  1258

Query 1259  GGGGTTTCATGCAAGGGCATGTAAATAGACAAGAAAAAGAAGAAAAAGAAGCAATATATAAAGAACGTTGGCCA  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  GGGGTTTCATGCAAGGGCATGTAAATAGACAAGAAAAAGAAGAAAAAGAAGCAATATATAAAGAACGTTGGCCA  1332

Query 1333  GATTATGTAAGGGAACTGCGAAGAAGGTATTCTGCAAGTACTGTAGATGTTATAGAAATGATGGAGGATGATAA  1406
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  GATTATGTAAGGGAACTGCGAAGAAGGTATTCTGCAAGTACTGTAGATGTTATAGAAATGATGGAGGATGATAA  1406

Query 1407  AGTTGATCTGAATTTGATTGTTGCCCTCATCCGATACATTGTTTTGGAAGAAGAGGATGGTGCGATACTGGTCT  1480
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  AGTTGATCTGAATTTGATTGTTGCCCTCATCCGATACATTGTTTTGGAAGAAGAGGATGGTGCGATACTGGTCT  1480

Query 1481  TTCTGCCAGGCTGGGACAATATCAGCACTTTACATGATCTCTTGATGTCACAAGTAATGTTTAAATCAGATAAA  1554
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481  TTCTGCCAGGCTGGGACAATATCAGCACTTTACATGATCTCTTGATGTCACAAGTAATGTTTAAATCAGATAAA  1554

Query 1555  TTTTTAATTATACCTTTACATTCACTGATGCCTACAGTTAACCAGACACAGGTGTTTAAAAGAACCCCTCCTGG  1628
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555  TTTTTAATTATACCTTTACATTCACTGATGCCTACAGTTAACCAGACACAGGTGTTTAAAAGAACCCCTCCTGG  1628

Query 1629  TGTTCGGAAAATAGTAATTGCTACCAACATTGCGGAGACTAGCATTACCATAGATGATGTCGTTTATGTGATAG  1702
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629  TGTTCGGAAAATAGTAATTGCTACCAACATTGCGGAGACTAGCATTACCATAGATGATGTCGTTTATGTGATAG  1702

Query 1703  ATGGAGGAAAAATAAAAGAGACGCATTTTGATACTCAGAACAATAACAGTACAATGTCCGCTGAGTGGGTTAGT  1776
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703  ATGGAGGAAAAATAAAAGAGACGCATTTTGATACTCAGAACAATATCAGTACAATGTCCGCTGAGTGGGTTAGT  1776

Query 1777  AAAGCTAATGCCAAACAGAGAAAAGGTCGAGCTGGAAGAGTTCAACCTGGTCATTGCTATCATCTGTATAATGG  1850
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777  AAAGCTAATGCCAAACAGAGAAAAGGTCGAGCTGGAAGAGTTCAACCTGGTCATTGCTATCATCTGTATAATGG  1850

Query 1851  TCTTAGAGCAAGTCTTCTAGATGACTATCAACTGCCAGAAATTTTGAGAACTCCTTTGGAAGAACTTTGTTTAC  1924
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1851  TCTTAGAGCAAGTCTTCTAGATGACTATCAACTGCCAGAAATTTTGAGAACTCCTTTGGAAGAACTTTGTTTAC  1924

Query 1925  AAATAAAGATTTTAAGGCTAGGTGGAATTGCTTATTTTCTGAGTAGATTAATGGACCCACCATCAAATGAGGCA  1998
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1925  AAATAAAGATTTTAAGGCTAGGTGGAATTGCTTATTTTCTGAGTAGATTAATGGACCCACCATCAAATGAGGCA  1998

Query 1999  GTGTTACTCTCCATAAGACACCTGATGGAGCTGAACGCTTTGGATAAACAAGAAGAATTGACACCTCTTGGAGT  2072
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1999  GTGTTACTCTCCATAAGACACCTGATGGAGCTGAACGCTTTGGATAAACAAGAAGAATTGACACCTCTTGGAGT  2072

Query 2073  CCACTTGGCACGATTACCCGTTGAGCCACATATTGGAAAAATGATTCTTTTTGGAGCACTGTTCTGCTGCTTAG  2146
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2073  CCACTTGGCACGATTACCCGTTGAGCCACATATTGGAAAAATGATTCTTTTTGGAGCACTGTTCTGCTGCTTAG  2146

Query 2147  ACCCAGTACTCACTATTGCTGCTAGTCTCAGTTTCAAAGATCCATTTGTCATTCCACT----------------  2204
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                
Sbjct 2147  ACCCAGTACTCACTATTGCTGCTAGTCTCAGTTTCAAAGATCCATTTGTCATTCCACTGGGAAAAGAAAAGATT  2220

Query 2205  -----------------------------------------------------------------------GGG  2207
                                                                                   |||
Sbjct 2221  GCAGATGCAAGAAGAAAGGAATTGGCAAAGGATACTAGAAGTGATCACTTAACAGTTGTGAATGCGTTTGAGGG  2294

Query 2208  CTGGGAAGAGGCTAGGCGACGTGGTTTCAGATACGAAAAGGACTATTGCTGGGAATATTTTCTGTCTTCAAACA  2281
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2295  CTGGGAAGAGGCTAGGCGACGTGGTTTCAGATACGAAAAGGACTATTGCTGGGAATATTTTCTGTCTTCAAACA  2368

Query 2282  CACTGCAGATGCTGCATAACATGAAAGGACAGTTTGCTGAGCATCTTCTTGGAGCTGGATTTGTAAGCAGTAGA  2355
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2369  CACTGCAGATGCTGCATAACATGAAAGGACAGTTTGCTGAGCATCTTCTTGGAGCTGGATTTGTAAGCAGTAGA  2442

Query 2356  AATCCTAAAGATCCAGAATCTAATATAAATTCAGATAATGAGAAGATAATTAAAGCTGTCATCTGTGCTGGTTT  2429
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2443  AATCCTAAAGATCCAGAATCTAATATAAATTCAGATAATGAGAAGATAATTAAAGCTGTCATCTGTGCTGGTTT  2516

Query 2430  ATATCCCAAAGTTGCTAAAATTCGACTAAATTTGGGTAAAAAAAGAAAAATGGTAAAAGTTTACACAAAAACCG  2503
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2517  ATATCCCAAAGTTGCTAAAATTCGACTAAATTTGGGTAAAAAAAGAAAAATGGTAAAAGTTTACACAAAAACCG  2590

Query 2504  ATGGCCTGGTTGCTGTTCATCCTAAATCTGTTAATGTGGAGCAAACAGACTTTCACTACAACTGGCTTATCTAT  2577
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2591  ATGGCCTGGTTGCTGTTCATCCTAAATCTGTTAATGTGGAGCAAACAGACTTTCACTACAACTGGCTTATCTAT  2664

Query 2578  CACCTAAAGATGAGAACAAGCAGTATATACTTGTATGACTGCACAGAGGTTTCCCCATACTGTCTCTTGTTTTT  2651
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2665  CACCTAAAGATGAGAACAAGCAGTATATACTTGTATGACTGCACAGAGGTTTCCCCATACTGTCTCTTGTTTTT  2738

Query 2652  TGGAGGTGACATTTCCATCCAGAAGGATAACGATCAGGAAACTATTGCTGTAGATGAGTGGATTGTATTTCAGT  2725
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2739  TGGAGGTGACATTTCCATCCAGAAGGATAACGATCAGGAAACTATTGCTGTAGATGAGTGGATTGTATTTCAGT  2812

Query 2726  CTCCAGCAAGAATTGCCCATCTTGTTAAGGAATTAAGAAAGGAACTAGATATTCTTCTGCAAGAGAAGATTGAA  2799
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2813  CTCCAGCAAGAATTGCCCATCTTGTTAAGGAATTAAGAAAGGAACTAGATATTCTTCTGCAAGAGAAGATTGAA  2886

Query 2800  AGTCCTCATCCTGTAGACTGGAATGACACTAAATCCAGAGACTGTGCAGTACTGTCAGCTATTATAGACTTGAT  2873
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2887  AGTCCTCATCCTGTAGACTGGAATGACACTAAATCCAGAGACTGTGCAGTACTGTCAGCTATTATAGACTTGAT  2960

Query 2874  CAAAACACAGGAAAAGGCAACTCCCAGGAACTTTCCGCCACGATTCCAGGATGGATATTACAGC  2937
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2961  CAAAACACAGGAAAAGGCAACTCCCAGGAACTTTCCGCCACGATTCCAGGATGGATATTACAGC  3024