Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000468999
• Subject: NM_001360494.1
• Aligned Length: 1394
• Identities: 1226
• Gaps: 79

Alignment

Query    1  ATGGAAACTGAACAGCCAGAAGAAACCTTCCCTAACACTGAAACCAATGGTGAATTTGGTAAACGCCCTGCAGA  74
            |||||.||.|||||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGAGACCGAACAGCCAGAAGAAACCTTCCCCAACACCGAAACCAATGGTGAATTTGGTAAACGCCCTGCAGA  74

Query   75  AGATATGGAAGAGGAACAAGCATTTAAAAGATCTAGAAACACTGATGAGATGGTTGAATTACGCATTCTGCTTC  148
            |||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||||||.||||||
Sbjct   75  AGATATGGAAGAGGAGCAAGCCTTTAAAAGATCTAGAAATACTGATGAGATGGTTGAATTGCGCATTTTGCTTC  148

Query  149  AGAGCAAGAATGCTGGGGCAGTGATTGGAAAAGGAGGCAAGAATATTAAGGCTCTCCGTACAGACTACAATGCC  222
            ||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  AGAGCAAGAATGCTGGAGCAGTGATTGGAAAAGGAGGCAAGAATATTAAGGCTCTCCGTACAGACTACAATGCC  222

Query  223  AGTGTTTCAGTCCCAGACAGCAGTGGCCCCGAGCGCATATTGAGTATCAGTGCTGATATTGAAACAATTGGAGA  296
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||.||.||||||||
Sbjct  223  AGTGTTTCAGTCCCAGACAGCAGTGGCCCCGAGCGCATACTGAGTATCAGTGCTGATATTGAGACGATTGGAGA  296

Query  297  AATTCTGAAGAAAATCATCCCTACCTTGGAAGAGGGCCTGCAGTTGCCATCACCCGCTGCAACCAGCCAGCTCC  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||                                        
Sbjct  297  AATTCTGAAGAAAATCATCCCTACCTTGGAAGAG----------------------------------------  330

Query  371  CGCTCGAATCTGATGCTGTGGAATGCTTAAATTACCAACACTATAAAGGAAGTGACTTTGACTGCGAGTTGAGG  444
                                            ||||||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||.
Sbjct  331  --------------------------------TACCAACATTATAAAGGAAGTGACTTTGATTGCGAGTTGAGA  372

Query  445  CTGTTGATTCATCAGAGTCTAGCAGGAGGAATTATTGGGGTCAAAGGTGCTAAAATCAAAGAACTTCGAGAGAA  518
            ||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||.||
Sbjct  373  CTGTTGATTCATCAGAGTCTGGCAGGAGGAATAATTGGTGTTAAAGGTGCTAAAATCAAAGAACTTCGAGAAAA  446

Query  519  CACTCAAACCACCATCAAGCTTTTCCAGGAATGCTGTCCTCATTCCACTGACAGAGTTGTTCTTATTGGAGGAA  592
            ||||||.||.||.|||||||||||||||||.|||||.|||||.||.||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  447  CACTCAGACAACAATCAAGCTTTTCCAGGAGTGCTGCCCTCACTCTACTGACAGAGTTGTTCTTATTGGAGGAA  520

Query  593  AACCCGATAGGGTTGTAGAGTGCATAAAGATCATCCTTGATCTTATATCTGAGTCTCCCATCAAAGGACGTGCA  666
            ||||.||||||||||||||.|||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  521  AACCTGATAGGGTTGTAGAATGCATCAAGATCATCCTTGACCTTATATCTGAGTCTCCCATCAAAGGACGTGCA  594

Query  667  CAGCCTTATGATCCCAATTTTTACGATGAAACCTATGATTATGGTGGTTTTACAATGATGTTTGATGACCGTCG  740
            ||.||||||||||||||.|||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||
Sbjct  595  CAACCTTATGATCCCAACTTTTATGATGAGACCTATGATTATGGTGGTTTTACAATGATGTTTGATGACCGCCG  668

Query  741  CGGACGCCCAGTGGGATTTCCCATGCGGGGAAGAGGTGGTTTTGACAGAATGCCTCCTGGTCGGGGTGGGCGTC  814
            .|||||.||.||||||||.||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  669  AGGACGACCTGTGGGATTCCCCATGAGGGGAAGAGGTGGTTTTGACAGAATGCCTCCTGGTCGGGGTGGGCGTC  742

Query  815  CCATGCCTCCATCTAGAAGAGATTATGATGATATGAGCCCTCGTCGAGGACCACCTCCCCCTCCTCCCGGACGA  888
            ||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||.||.||.||.||.|||
Sbjct  743  CCATGCCTCCTTCTAGAAGAGATTATGATGATATGAGCCCTCGTCGAGGACCTCCACCACCACCACCTGGTCGA  816

Query  889  GGCGGCCGGGGTGGTAGCAGAGCTCGGAATCTTCCTCTTCCTCCACCACCACCACCTAGAGGGGGAGACCTCAT  962
            ||.|||||||||||.||||||||.||||||||.|||||||||||.|||||||||||.|||||||||||.||.||
Sbjct  817  GGTGGCCGGGGTGGCAGCAGAGCCCGGAATCTGCCTCTTCCTCCTCCACCACCACCCAGAGGGGGAGATCTAAT  890

Query  963  GGCCTATGACAGAAGAGGGAGACCTGGAGACCGTTACGACGGCATGGTTGGTTTCAGTGCTGATGAAACTTGGG  1036
            |||.||||||||||||||.||.|||||||||||.||.||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||
Sbjct  891  GGCTTATGACAGAAGAGGAAGGCCTGGAGACCGCTATGATGGCATGGTTGGGTTCAGTGCTGATGAAACTTGGG  964

Query 1037  ACTCTGCAATAGATACATGGAGCCCATCAGAATGGCAGATGGCTTATGAACCACAGGGTGGCTCCGGATATGAT  1110
            |.||||||||.||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||.||||||||.
Sbjct  965  ATTCTGCAATTGACACATGGAGCCCATCAGAATGGCAAATGGCTTATGAACCACAGGGTGGTTCTGGATATGAC  1038

Query 1111  TATTCCTATGCAGGGGGTCGTGGCTCATATGGTGATCTTGGTGGACCTATTATTACTACACAAGTAACTATTCC  1184
            |||||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||
Sbjct 1039  TATTCTTATGCAGGGGGCCGTGGCTCATATGGTGATCTTGGCGGACCTATTATCACTACACAAGTAACTATTCC  1112

Query 1185  CAAAGATTTGGCTGGATCTATTATTGGCAAAGGTGGTCAGCGGATTAAACAAATCCGTCATGAGTCGGGAGCTT  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||.|||||.|
Sbjct 1113  CAAAGATTTGGCTGGATCTATTATTGGCAAAGGTGGTCAGCGGATTAAACAAATTCGTCATGAATCTGGAGCAT  1186

Query 1259  CGATCAAAATTGATGAGCCTTTAGAAGGATCCGAAGATCGGATCATTACCATTACAGGAACACAGGACCAGATA  1332
            |.||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1187  CAATCAAAATTGATGAACCTTTAGAAGGATCTGAAGATCGGATCATTACCATTACAGGAACACAGGACCAGATA  1260

Query 1333  CAGAATGCACAGTATTTGCTGCAGAACAGTGTGAAGCAGTAT-----TCTGGAAAGTTTTTC  1389
            |||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||     |.|.|||.|.||.  
Sbjct 1261  CAGAACGCACAGTATTTGCTGCAGAACAGTGTGAAGCAGTATGCAGATGTTGAAGGATTC--  1320