Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000468999
- Subject:
- XM_005251963.4
- Aligned Length:
- 1394
- Identities:
- 1310
- Gaps:
- 79
Alignment
Query 1 ATGGAAACTGAACAGCCAGAAGAAACCTTCCCTAACACTGAAACCAATGGTGAATTTGGTAAACGCCCTGCAGA 74
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGGAAACTGAACAGCCAGAAGAAACCTTCCCTAACACTGAAACCAATGGTGAATTTGGTAAACGCCCTGCAGA 74
Query 75 AGATATGGAAGAGGAACAAGCATTTAAAAGATCTAGAAACACTGATGAGATGGTTGAATTACGCATTCTGCTTC 148
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 AGATATGGAAGAGGAACAAGCATTTAAAAGATCTAGAAACACTGATGAGATGGTTGAATTACGCATTCTGCTTC 148
Query 149 AGAGCAAGAATGCTGGGGCAGTGATTGGAAAAGGAGGCAAGAATATTAAGGCTCTCCGTACAGACTACAATGCC 222
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149 AGAGCAAGAATGCTGGGGCAGTGATTGGAAAAGGAGGCAAGAATATTAAGGCTCTCCGTACAGACTACAATGCC 222
Query 223 AGTGTTTCAGTCCCAGACAGCAGTGGCCCCGAGCGCATATTGAGTATCAGTGCTGATATTGAAACAATTGGAGA 296
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 AGTGTTTCAGTCCCAGACAGCAGTGGCCCCGAGCGCATATTGAGTATCAGTGCTGATATTGAAACAATTGGAGA 296
Query 297 AATTCTGAAGAAAATCATCCCTACCTTGGAAGAGGGCCTGCAGTTGCCATCACCCGCTGCAACCAGCCAGCTCC 370
||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 AATTCTGAAGAAAATCATCCCTACCTTGGAAGAG---------------------------------------- 330
Query 371 CGCTCGAATCTGATGCTGTGGAATGCTTAAATTACCAACACTATAAAGGAAGTGACTTTGACTGCGAGTTGAGG 444
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 331 --------------------------------TACCAACACTATAAAGGAAGTGACTTTGACTGCGAGTTGAGG 372
Query 445 CTGTTGATTCATCAGAGTCTAGCAGGAGGAATTATTGGGGTCAAAGGTGCTAAAATCAAAGAACTTCGAGAGAA 518
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 373 CTGTTGATTCATCAGAGTCTAGCAGGAGGAATTATTGGGGTCAAAGGTGCTAAAATCAAAGAACTTCGAGAGAA 446
Query 519 CACTCAAACCACCATCAAGCTTTTCCAGGAATGCTGTCCTCATTCCACTGACAGAGTTGTTCTTATTGGAGGAA 592
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 447 CACTCAAACCACCATCAAGCTTTTCCAGGAATGCTGTCCTCATTCCACTGACAGAGTTGTTCTTATTGGAGGAA 520
Query 593 AACCCGATAGGGTTGTAGAGTGCATAAAGATCATCCTTGATCTTATATCTGAGTCTCCCATCAAAGGACGTGCA 666
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 521 AACCCGATAGGGTTGTAGAGTGCATAAAGATCATCCTTGATCTTATATCTGAGTCTCCCATCAAAGGACGTGCA 594
Query 667 CAGCCTTATGATCCCAATTTTTACGATGAAACCTATGATTATGGTGGTTTTACAATGATGTTTGATGACCGTCG 740
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 595 CAGCCTTATGATCCCAATTTTTACGATGAAACCTATGATTATGGTGGTTTTACAATGATGTTTGATGACCGTCG 668
Query 741 CGGACGCCCAGTGGGATTTCCCATGCGGGGAAGAGGTGGTTTTGACAGAATGCCTCCTGGTCGGGGTGGGCGTC 814
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 669 CGGACGCCCAGTGGGATTTCCCATGCGGGGAAGAGGTGGTTTTGACAGAATGCCTCCTGGTCGGGGTGGGCGTC 742
Query 815 CCATGCCTCCATCTAGAAGAGATTATGATGATATGAGCCCTCGTCGAGGACCACCTCCCCCTCCTCCCGGACGA 888
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 743 CCATGCCTCCATCTAGAAGAGATTATGATGATATGAGCCCTCGTCGAGGACCACCTCCCCCTCCTCCCGGACGA 816
Query 889 GGCGGCCGGGGTGGTAGCAGAGCTCGGAATCTTCCTCTTCCTCCACCACCACCACCTAGAGGGGGAGACCTCAT 962
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 817 GGCGGCCGGGGTGGTAGCAGAGCTCGGAATCTTCCTCTTCCTCCACCACCACCACCTAGAGGGGGAGACCTCAT 890
Query 963 GGCCTATGACAGAAGAGGGAGACCTGGAGACCGTTACGACGGCATGGTTGGTTTCAGTGCTGATGAAACTTGGG 1036
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 891 GGCCTATGACAGAAGAGGGAGACCTGGAGACCGTTACGACGGCATGGTTGGTTTCAGTGCTGATGAAACTTGGG 964
Query 1037 ACTCTGCAATAGATACATGGAGCCCATCAGAATGGCAGATGGCTTATGAACCACAGGGTGGCTCCGGATATGAT 1110
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 965 ACTCTGCAATAGATACATGGAGCCCATCAGAATGGCAGATGGCTTATGAACCACAGGGTGGCTCCGGATATGAT 1038
Query 1111 TATTCCTATGCAGGGGGTCGTGGCTCATATGGTGATCTTGGTGGACCTATTATTACTACACAAGTAACTATTCC 1184
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1039 TATTCCTATGCAGGGGGTCGTGGCTCATATGGTGATCTTGGTGGACCTATTATTACTACACAAGTAACTATTCC 1112
Query 1185 CAAAGATTTGGCTGGATCTATTATTGGCAAAGGTGGTCAGCGGATTAAACAAATCCGTCATGAGTCGGGAGCTT 1258
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1113 CAAAGATTTGGCTGGATCTATTATTGGCAAAGGTGGTCAGCGGATTAAACAAATCCGTCATGAGTCGGGAGCTT 1186
Query 1259 CGATCAAAATTGATGAGCCTTTAGAAGGATCCGAAGATCGGATCATTACCATTACAGGAACACAGGACCAGATA 1332
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1187 CGATCAAAATTGATGAGCCTTTAGAAGGATCCGAAGATCGGATCATTACCATTACAGGAACACAGGACCAGATA 1260
Query 1333 CAGAATGCACAGTATTTGCTGCAGAACAGTGTGAAGCAGTAT-----TCTGGAAAGTTTTTC 1389
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |.|.|||.|.||.
Sbjct 1261 CAGAATGCACAGTATTTGCTGCAGAACAGTGTGAAGCAGTATGCAGATGTTGAAGGATTC-- 1320