Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000469198
- Subject:
- NM_001044388.2
- Aligned Length:
- 1296
- Identities:
- 1018
- Gaps:
- 117
Alignment
Query 1 ATGGCGGCTGTCATCCTGCCCTCGACTGCTGCTCCGTCTTCCCTGTTCCCAGCCTCTCAGCAAAAAGGACACAC 74
||||||||||||.||||||||.|.|||| |.||||||||||.|.||||||||||
Sbjct 1 ATGGCGGCTGTCGTCCTGCCCCCAACTG---------------------CCGCCTCTCAGCGAGAAGGACACAC 53
Query 75 ACAGGGCGGAGAGCTGGTTAATGAGCTCCTGACAAGCTGGCTACGGGGCTTGGTAACCTTCGAGGATGTGGCCG 148
|.||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||..|||||||||.|||||.|||||||||||||
Sbjct 54 AGAGGGCGGAGAGCTGGTTAATGAGCTCCTGAAAAGCTGGCTAAAGGGCTTGGTGACCTTTGAGGATGTGGCCG 127
Query 149 TGGAGTTCACCCAGGAGGAGTGGGCGTTGCTGGACCCTGCCCAAAGGACACTGTACAGGGATGTGATGCTGGAG 222
|||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||
Sbjct 128 TGGAGTTCACCCAGGAGGAGTGGGCATTGCTGGACCCTGCCCAAAGGACACTGTACAGGGACGTGATGCTGGAG 201
Query 223 AACTGCAGGAACCTGGCCTCACTAGGGTGTCGTGTTAATAAACCCAGTCTGATATCCCAGTTGGAACAAGACAA 296
|||||||||||||||||||||||.|||...|..|||.|||||||.||.|||||.||||||.||||.|||||..|
Sbjct 202 AACTGCAGGAACCTGGCCTCACTGGGGAACCAAGTTGATAAACCTAGGCTGATCTCCCAGCTGGAGCAAGAAGA 275
Query 297 GAAGGTGGTGACAGAGGAAAGAGGAATTCTACCAAGCACCTGTCCAGATTTGGAGACTCTACTTAAAGCCAAAT 370
.||.|||.|||||||.||.|||||||||||..||.|.||||||||||||.||||||.||.|.|||||||||||.
Sbjct 276 TAAAGTGATGACAGAAGAGAGAGGAATTCTCTCAGGTACCTGTCCAGATGTGGAGAATCCATTTAAAGCCAAAG 349
Query 371 GGTTAACTCCTAAGAAGAATGTTTTCAGAAAAGAACAGTCTAAAGGTGTAAAAACGGAAAGAAGTCATCGTGGA 444
||||||||||||||..|.|||||||..||||||||||.||||.|..|.|.||||.|||.||.|.|||||.||||
Sbjct 350 GGTTAACTCCTAAGCTGCATGTTTTTCGAAAAGAACAATCTAGAAATATGAAAATGGAGAGGAATCATCTTGGA 423
Query 445 GTGAAACTCAATGAATGTAATCAGTGTTTTAAAGTCTTCAGCACGAAATCTAACCTAACTCAGCACAAGAGAAT 518
|..|.||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||..|||.||.|.|||||.||..||
Sbjct 424 GCAACACTCAACGAATGTAATCAGTGTTTTAAAGTCTTCAGCACAAAATCTTCCCTTACACGGCACAGGAAGAT 497
Query 519 TCATACTGGAGAAAAACCCTATGACTGTAGTCAATGTGGGAAGT------------------------------ 562
||||||||||||||.||||||||.|||.|||.||||||||||.|
Sbjct 498 TCATACTGGAGAAAGACCCTATGGCTGCAGTGAATGTGGGAAATCCTACAGCAGTAGATCTTACCTTGCTGTTC 571
Query 563 ------------------------------------------------------CCTTCAGTAGCAGATCTTAC 582
|||||||.||||||||||||
Sbjct 572 ATAAGAGAATCCACAATGGGGAGAAACCCTATGAATGCAATGACTGTGGGAAAACCTTCAGCAGCAGATCTTAC 645
Query 583 CTTACTATTCATAAGAGAATCCATAATGGGGAGAAACCCTATGAATGCAATCACTGTGGGAAAGCATTTAGTGA 656
||||||.||||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||||.|.|||||||||||.|.||.||..|
Sbjct 646 CTTACTGTTCATAAGAGAATCCACAATGGGGAGAAACCCTACGAATGCAGTGACTGTGGGAAAACCTTCAGCAA 719
Query 657 TCCCTCATCCCTTAGACTGCATTTGAGAATTCACACTGGAGAAAAACCCTATGAATGTAACCAGTGTTTTCACG 730
|.||||||.|||.||||.|||.||||||||||||||||||||||||||.||..||||||||||||||||||..|
Sbjct 720 TTCCTCATACCTCAGACCGCACTTGAGAATTCACACTGGAGAAAAACCGTACAAATGTAACCAGTGTTTTCGTG 793
Query 731 TTTTCCGCAC-CAGTTGTAA-CCTCAAAAGCCACAAGAGGATTCACACGGGGGAGAATCACCATGAATGTAATC 802
..|||||||| |||| .|| |.|||.|||.||||||||..||||.|||||||||..|||..|||.||||||||
Sbjct 794 AGTTCCGCACTCAGT--CAATCTTCACAAGGCACAAGAGAGTTCATACGGGGGAGGGTCATTATGTATGTAATC 865
Query 803 AGTGTGGAAAAGCTTTCAGCACAAGGTCCTCTCTCACTGGGCACAATAGCATTCATACAGGGGAGAAACCTTAT 876
||||||||||.||||||.||||.|||||.|||||..||..||||.||||||||||||||||||||.|.|||||.
Sbjct 866 AGTGTGGAAAGGCTTTCGGCACGAGGTCATCTCTTTCTTCGCACTATAGCATTCATACAGGGGAGTACCCTTAC 939
Query 877 GAATGTCACGATTGTGGGAAAACCTTCAGGAAGAGCTCCTATCTGACACAGCACGTAAGAACTCATACTGGAGA 950
|||||.|||||||||||||.|||||||||||.|||.||..||||||||||||||.|||||||||||||||||||
Sbjct 940 GAATGCCACGATTGTGGGAGAACCTTCAGGAGGAGGTCGAATCTGACACAGCACATAAGAACTCATACTGGAGA 1013
Query 951 AAAACCCTATGAATGTAACGAGTGTGGGAAATCCTTCAGCAGTAGCTTTTCTCTTACTGTGCACAAGAGAATAC 1024
|||||||||...||||||.|||||||||||||||||.|.||.|||||||||||||||..|.||||.||||||||
Sbjct 1014 AAAACCCTACACATGTAATGAGTGTGGGAAATCCTTTACCAATAGCTTTTCTCTTACAATTCACAGGAGAATAC 1087
Query 1025 ATACCGGAGAGAAACCCTACGAGTGCAGTGACTGTGGAAAAGCCTTTAATAATCTCTCAGCTGTGAAGAAACAC 1098
|||..|||||||||.||||.|||||||||||.|||||||||.||||||||..|||||||.|.||.|||||||||
Sbjct 1088 ATAATGGAGAGAAATCCTATGAGTGCAGTGATTGTGGAAAATCCTTTAATGTTCTCTCATCCGTTAAGAAACAC 1161
Query 1099 TTAAGAACTCACACTGGAGAAAAACCCTATGAATGTAATCATTGTGGGAAATCCTTCACAAGTAACTCCTATCT 1172
.|.|||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||||.||||||||||||||||||||||||||.||
Sbjct 1162 ATGAGAACTCACACTGGAAAAAAACCCTATGAATGTAATTATTGCGGGAAATCCTTCACAAGTAACTCCTACCT 1235
Query 1173 TTCTGTGCACAAGAGAATACATAATAG----ATGGATA 1206
|||||||||.|.||||||.|||||||| |||
Sbjct 1236 TTCTGTGCATACGAGAATGCATAATAGGCAAATG---- 1269