Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000469216
- Subject:
- NM_001258450.2
- Aligned Length:
- 1497
- Identities:
- 1286
- Gaps:
- 207
Alignment
Query 1 ATGCTAGAACGGCCTCCTGCACTGGCCATGCCCATGCCCACGGAGGGCACCCCGCCACCTCTGAGTGGCACCCC 74
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 75 CATCCCAGTCCCAGCCTACTTCCGCCACGCAGAACCTGGATTCTCCCTCAAGAGGCCCAGGGGGCTCAGCCGGA 148
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 149 GCCTCCCACCTCCGCCCCCTGCCAAGGGCAGCATTCCCATCAGCCGCCTCTTCCCTCCTCGGACCCCAGGCTGG 222
.|.||.|.|| |||||
Sbjct 1 ------------------------------------------------------ATGCTAGAAC-----GCTGG 15
Query 223 CACCAGCTGCAGCCCCGGCGGGTGTCATTCCGGGGCGAGGCCTCAGAGACTCTGCAGAGCCCTGGGTATGACCC 296
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 16 CACCAGCTGCAGCCCCGGCGGGTGTCATTCCGGGGCGAGGCCTCAGAGACTCTGCAGAGCCCTGGGTATGACCC 89
Query 297 AAGCCGGCCAGAGTCCTTCTTCCAGCAGAGCTTCCAGAGGCTCAGCCGCCTGGGCCATGGCTCCTACGGAGAGG 370
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 90 AAGCCGGCCAGAGTCCTTCTTCCAGCAGAGCTTCCAGAGGCTCAGCCGCCTGGGCCATGGCTCCTACGGAGAGG 163
Query 371 TCTTCAAGGTGCGCTCCAAGGAGGACGGCCGGCTCTATGCGGTAAAGCGTTCCATGTCACCATTCCGGGGCCCC 444
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 164 TCTTCAAGGTGCGCTCCAAGGAGGACGGCCGGCTCTATGCGGTAAAGCGTTCCATGTCACCATTCCGGGGCCCC 237
Query 445 AAGGACCGGGCCCGCAAGTTGGCCGAGGTGGGCAGCCACGAGAAGGTGGGGCAGCACCCATGCTGCGTGCGGCT 518
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 238 AAGGACCGGGCCCGCAAGTTGGCCGAGGTGGGCAGCCACGAGAAGGTGGGGCAGCACCCATGCTGCGTGCGGCT 311
Query 519 GGAGCAGGCCTGGGAGGAGGGCGGCATCCTGTACCTGCAGACGGAGCTGTGCGGGCCCAGCCTGCAGCAACACT 592
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 312 GGAGCAGGCCTGGGAGGAGGGCGGCATCCTGTACCTGCAGACGGAGCTGTGCGGGCCCAGCCTGCAGCAACACT 385
Query 593 GTGAGGCCTGGGGTGCCAGCCTGCCTGAGGCCCAGGTCTGGGGCTACCTGCGGGACACGCTGCTTGCCCTGGCC 666
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 386 GTGAGGCCTGGGGTGCCAGCCTGCCTGAGGCCCAGGTCTGGGGCTACCTGCGGGACACGCTGCTTGCCCTGGCC 459
Query 667 CATCTGCACAGCCAGGGCCTGGTGCACCTTGATGTCAAGCCTGCCAACATCTTCCTGGGGCCCCGGGGCCGCTG 740
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 460 CATCTGCACAGCCAGGGCCTGGTGCACCTTGATGTCAAGCCTGCCAACATCTTCCTGGGGCCCCGGGGCCGCTG 533
Query 741 CAAGCTGGGTGACTTCGGACTGCTGGTGGAGCTGGGTACAGCAGGAGCTGGTGAGGTCCAGGAGGGAGACCCCC 814
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 534 CAAGCTGGGTGACTTCGGACTGCTGGTGGAGCTGGGTACAGCAGGAGCTGGTGAGGTCCAGGAGGGAGACCCCC 607
Query 815 GCTACATGGCCCCCGAGCTGCTGCAGGGCTCCTATGGGACAGCAGCGGATGTGTTCAGTCTGGGCCTCACCATC 888
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 608 GCTACATGGCCCCCGAGCTGCTGCAGGGCTCCTATGGGACAGCAGCGGATGTGTTCAGTCTGGGCCTCACCATC 681
Query 889 CTGGAAGTGGCATGCAACATGGAGCTGCCCCACGGTGGGGAGGGCTGGCAGCAGCTGCGCCAGGGCTACCTGCC 962
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 682 CTGGAAGTGGCATGCAACATGGAGCTGCCCCACGGTGGGGAGGGCTGGCAGCAGCTGCGCCAGGGCTACCTGCC 755
Query 963 CCCTGAGTTCACTGCCGGTCTGTCTTCCGAGCTGCGTTCTGTCCTTGTCATGATGCTGGAGCCAGACCCCAAGC 1036
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 756 CCCTGAGTTCACTGCCGGTCTGTCTTCCGAGCTGCGTTCTGTCCTTGTCATGATGCTGGAGCCAGACCCCAAGC 829
Query 1037 TGCGGGCCACGGCCGAGGCCCTGCTGGCACTGCCTGTGTTGAGGCAGCCGCGGGCCTGGGGTGTGCTGTGGTGC 1110
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 830 TGCGGGCCACGGCCGAGGCCCTGCTGGCACTGCCTGTGTTGAGGCAGCCGCGGGCCTGGGGTGTGCTGTGGTGC 903
Query 1111 ATGGCAGCGGAGGCCCTGAGCCGAGGGTGGGCCCTGTGGCAGGCCCTGCTTGCCCTGCTCTGCTGGCTCTGGCA 1184
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 904 ATGGCAGCGGAGGCCCTGAGCCGAGGGTGGGCCCTGTGGCAGGCCCTGCTTGCCCTGCTCTGCTGGCTCTGGCA 977
Query 1185 TGGGCTGGCTCACCCTGCCAGCTGGCTACAGCCCCTGGGCCCGCCAGCCACCCCGCCTGGCTCACCACCCTGCA 1258
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 978 TGGGCTGGCTCACCCTGCCAGCTGGCTACAGCCCCTGGGCCCGCCAGCCACCCCGCCTGGCTCACCACCCTGCA 1051
Query 1259 GTTTGCTCCTGGACAGCAGCCTCTCCAGCAACTGGGATGACGACAGCCTAGGGCCTTCACTCTCCCCTGAGGCT 1332
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1052 GTTTGCTCCTGGACAGCAGCCTCTCCAGCAACTGGGATGACGACAGCCTAGGGCCTTCACTCTCCCCTGAGGCT 1125
Query 1333 GTCCTGGCCCGGACTGTGGGGAGCACCTCCACCCCCCGGAGCAGGTGCACACCCAGGGATGCCCTGGACCTAAG 1406
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1126 GTCCTGGCCCGGACTGTGGGGAGCACCTCCACCCCCCGGAGCAGGTGCACACCCAGGGATGCCCTGGACCTAAG 1199
Query 1407 TGACATCAACTCAGAGCCTCCTCGGGGCTCCTTCCCCTCCTTTGAGCCTCGGAACCTCCTCAGCCTGTTTGAGG 1480
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1200 TGACATCAACTCAGAGCCTCCTCGGGGCTCCTTCCCCTCCTTTGAGCCTCGGAACCTCCTCAGCCTGTTTGAGG 1273
Query 1481 ACACCCTAGACCCAACC 1497
|||||||||||||||||
Sbjct 1274 ACACCCTAGACCCAACC 1290