Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000469234
• Subject: NM_009771.3
• Aligned Length: 1815
• Identities: 1541
• Gaps: 108

Alignment

Query    1  ATGGACCCGGCCGAGGCGGTGCTGCAAGAGAAGGCACTCAAGTTTATGTGCTCTATGCCCAGGTCTCTGTGGCT  74
            |||||||||||.||||||||||||||.|||||.||.||.||||||||                           
Sbjct    1  ATGGACCCGGCAGAGGCGGTGCTGCAGGAGAAAGCGCTTAAGTTTAT---------------------------  47

Query   75  GGGCTGCTCCAGCCTGGCGGACAGCATGCCTTCGCTGCGATGCCTGTATAACCCAGGGACTGGCGCACTCACAG  148
                                                                                      
Sbjct   48  --------------------------------------------------------------------------  47

Query  149  CTTTCCAGAATTCCTCAGAGAGAGAAGACTGTAATAATGGCGAACCCCCTAGGAAGATAATACCAGAGAAGAAT  222
                   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   48  -------GAATTCCTCAGAGAGAGAAGACTGTAATAATGGCGAACCCCCTAGGAAGATAATACCAGAGAAGAAT  114

Query  223  TCACTTAGACAGACATACAACAGCTGTGCCAGACTCTGCTTAAACCAAGAAACAGTATGTTTAGCAAGCACTGC  296
            ||||||||||||||.|||||||||||||||||.||.|||.||||||||||.|||||||||.||.||||||||||
Sbjct  115  TCACTTAGACAGACTTACAACAGCTGTGCCAGGCTTTGCATAAACCAAGAGACAGTATGTCTAACAAGCACTGC  188

Query  297  TATGAAGACTGAGAATTGTGTGGCCAAAACAAAACTTGCCAATGGCACTTCCAGTATGATTGTGCCCAAGCAAC  370
            ||||||||||||.|||||||||||||||.|.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.|
Sbjct  189  TATGAAGACTGAAAATTGTGTGGCCAAAGCCAAACTTGCCAATGGCACTTCCAGCATGATTGTGCCCAAGCAGC  262

Query  371  GGAAACTCTCAGCAAGCTATGAAAAGGAAAAGGAACTGTGTGTCAAATACTTTGAGCAGTGGTCAGAGTCAGAT  444
            ||||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||.||.||||||||||||||||||||.|||
Sbjct  263  GGAAACTCTCAGCAAGCTATGAGAAGGAAAAGGAGCTGTGTGTCAAGTATTTTGAGCAGTGGTCAGAGTCTGAT  336

Query  445  CAAGTGGAATTTGTGGAACATCTTATATCCCAAATGTGTCATTACCAACATGGGCACATAAACTCGTATCTTAA  518
            ||||||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||.|||||.||.||.||
Sbjct  337  CAAGTGGAATTTGTAGAACACCTTATATCCCAAATGTGTCACTACCAGCATGGGCACATCAACTCCTACCTAAA  410

Query  519  ACCTATGTTGCAGAGAGATTTCATAACTGCTCTGCCAGCTCGGGGATTGGATCATATTGCTGAGAACATTCTGT  592
            |||||||.|||||||.||||||||||||||.||||||||.|||||..||||.||.||.||||||||||||||||
Sbjct  411  ACCTATGCTGCAGAGGGATTTCATAACTGCACTGCCAGCACGGGGTCTGGACCACATCGCTGAGAACATTCTGT  484

Query  593  CATACCTGGATGCCAAATCACTATGTGCTGCTGAACTTGTGTGCAAGGAATGGTACCGAGTGACCTCTGATGGC  666
            |||||.||||.|||||.|||||.|||||||||||.||.||||||||||||||||||||.|||||.||.||.|||
Sbjct  485  CATACTTGGACGCCAAGTCACTGTGTGCTGCTGAGCTCGTGTGCAAGGAATGGTACCGCGTGACGTCGGACGGC  558

Query  667  ATGCTGTGGAAGAAGCTTATCGAGAGAATGGTCAGGACAGATTCTCTGTGGAGAGGCCTGGCAGAACGAAGAGG  740
            |||||||||||.|||||.||||||||.|||||||||||.||.|||||||||.|||||||||||||.||.|||||
Sbjct  559  ATGCTGTGGAAAAAGCTCATCGAGAGGATGGTCAGGACGGACTCTCTGTGGCGAGGCCTGGCAGAGCGCAGAGG  632

Query  741  ATGGGGACAGTATTTATTCAAAAACAAACCTCCTGACGGGAATGCTCCTCCCAACTCTTTTTATAGAGCACTTT  814
            .|||||||||||.|||||||||||||||||||||||.|.|||.||||||||||||||.|||||||||||.||||
Sbjct  633  CTGGGGACAGTACTTATTCAAAAACAAACCTCCTGATGAGAACGCTCCTCCCAACTCCTTTTATAGAGCGCTTT  706

Query  815  ATCCTAAAATTATACAAGACATTGAGACAATAGAATCTAATTGGAGATGTGGAAGACATAGTTTACAGAGAATT  888
            ||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||..|||||||||||||||||||.
Sbjct  707  ATCCTAAAATCATACAAGACATTGAGACAATAGAGTCCAATTGGAGATGTGGGCGACATAGTTTACAGAGAATC  780

Query  889  CACTGCCGAAGTGAAACAAGCAAAGGAGTTTACTGTTTACAGTATGATGATCAGAAAATAGTAAGCGGCCTTCG  962
            ||||||||.|||||||||||.|||||.|||||||||||||||||.||.||.|||||.|||||.|||||||||||
Sbjct  781  CACTGCCGGAGTGAAACAAGTAAAGGGGTTTACTGTTTACAGTACGACGACCAGAAGATAGTCAGCGGCCTTCG  854

Query  963  AGACAACACAATCAAGATCTGGGATAAAAACACATTGGAATGCAAGCGAATTCTCACAGGCCATACAGGTTCAG  1036
            |||||||||.|||||||||||||||||||.||||.|||||||||||||.||||||||.|||||.||.||.||.|
Sbjct  855  AGACAACACCATCAAGATCTGGGATAAAAGCACACTGGAATGCAAGCGGATTCTCACGGGCCACACGGGCTCCG  928

Query 1037  TCCTCTGTCTCCAGTATGATGAGAGAGTGATCATAACAGGATCATCGGATTCCACGGTCAGAGTGTGGGATGTA  1110
            ||||.|||||.|||||.||||||||.||||||||.|||||.||.||.||.|||||.||||||||||||||||||
Sbjct  929  TCCTGTGTCTGCAGTACGATGAGAGGGTGATCATCACAGGCTCCTCAGACTCCACCGTCAGAGTGTGGGATGTA  1002

Query 1111  AATACAGGTGAAATGCTAAACACGTTGATTCACCATTGTGAAGCAGTTCTGCACTTGCGTTTCAATAATGGCAT  1184
            |||.|||||||.|||||||||||.|||||||||||.||||||||.|||||||||.||||.||||||||||||||
Sbjct 1003  AATGCAGGTGAGATGCTAAACACATTGATTCACCACTGTGAAGCCGTTCTGCACCTGCGCTTCAATAATGGCAT  1076

Query 1185  GATGGTGACCTGCTCCAAAGATCGTTCCATTGCTGTATGGGATATGGCCTCCCCAACTGACATTACCCTCCGGA  1258
            ||||||||||||.||||||||.||||||||.|||||.|||||||||||.||||||||||||||.||||||.|||
Sbjct 1077  GATGGTGACCTGTTCCAAAGACCGTTCCATCGCTGTGTGGGATATGGCTTCCCCAACTGACATCACCCTCAGGA  1150

Query 1259  GGGTGCTGGTCGGACACCGAGCTGCTGTCAATGTTGTAGACTTTGATGACAAGTACATTGTTTCTGCATCTGGG  1332
            ||||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||.
Sbjct 1151  GGGTGCTGGTGGGACACCGAGCTGCGGTCAATGTTGTAGACTTTGATGACAAGTACATCGTTTCTGCCTCTGGA  1224

Query 1333  GATAGAACTATAAAGGTATGGAACACAAGTACTTGTGAATTTGTAAGGACCTTAAATGGACACAAACGAGGCAT  1406
            ||||||||.||||||||.||||||||||||||.||||||||.|||||||||.|||||||.|||||.||.|||||
Sbjct 1225  GATAGAACCATAAAGGTGTGGAACACAAGTACCTGTGAATTCGTAAGGACCCTAAATGGGCACAAGCGTGGCAT  1298

Query 1407  TGCCTGTTTGCAGTACAGGGACAGGCTGGTAGTGAGTGGCTCATCTGACAACACTATCAGATTATGGGACATAG  1480
            .|||||||||||||||||.|||||||||||.|||||.|||||.|||||||||||.|||||..|.||||||||||
Sbjct 1299  CGCCTGTTTGCAGTACAGAGACAGGCTGGTGGTGAGCGGCTCCTCTGACAACACCATCAGGCTGTGGGACATAG  1372

Query 1481  AATGTGGTGCATGTTTACGAGTGTTAGAAGGCCATGAGGAATTGGTGCGTTGTATTCGATTTGATAACAAGAGG  1554
            |.|||||.|||||..|.||||||||.||.|||||||||||.|||||.||.||.|||||||||||||||||.|||
Sbjct 1373  AGTGTGGAGCATGCCTGCGAGTGTTGGAGGGCCATGAGGAGTTGGTACGCTGCATTCGATTTGATAACAAAAGG  1446

Query 1555  ATAGTCAGTGGGGCCTATGATGGAAAAATTAAAGTGTGGGATCTTGTGGCTGCTTTGGACCCCCGTGCTCCTGC  1628
            |||||.||.||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||.||||||||||||||||.||||||||.||
Sbjct 1447  ATAGTGAGCGGAGCCTATGATGGGAAAATTAAAGTGTGGGATCTTATGGCTGCTTTGGACCCGCGTGCTCCAGC  1520

Query 1629  AGGGACACTCTGTCTACGGACCCTTGTGGAGCATTCCGGAAGAGTTTTTCGACTACAGTTTGATGAATTCCAGA  1702
            ||||||.||||||||.|||||.||||||||||||||.|||||||||||.||.||.|||||||||||||||||||
Sbjct 1521  AGGGACTCTCTGTCTGCGGACACTTGTGGAGCATTCTGGAAGAGTTTTCCGCCTCCAGTTTGATGAATTCCAGA  1594

Query 1703  TTGTCAGTAGTTCACATGATGACACAATCCTCATCTGGGACTTCCTAAATGATCCAGCTGCCCAAGCTGAACCC  1776
            ||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||.||.||||||||.
Sbjct 1595  TTGTCAGTAGTTCACATGATGACACAATTCTCATCTGGGACTTCCTGAATGATCCAGCTGCTCACGCTGAACCG  1668

Query 1777  CCCCGTTCCCCTTCTCGAACATACACCTACATCTCCAGA  1815
            |||||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||
Sbjct 1669  CCCCGCTCCCCTTCTCGGACATACACCTACATCTCCAGA  1707