Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000469234
- Subject:
- XM_006526607.3
- Aligned Length:
- 1857
- Identities:
- 1649
- Gaps:
- 42
Alignment
Query 1 ATGGACCCGGCCGAGGCGGTGCTGCAAGAGAAGGCACTCAAGTTTAT--------------------------- 47
|||||||||||.||||||||||||||.|||||.||.||.||||||||
Sbjct 1 ATGGACCCGGCAGAGGCGGTGCTGCAGGAGAAAGCGCTTAAGTTTATGGCTGCAGTTCCGGCTGGTGGATATTG 74
Query 48 ---------------GTGCTCTATGCCCAGGTCTCTGTGGCTGGGCTGCTCCAGCCTGGCGGACAGCATGCCTT 106
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 GAGGAATAATAAAAAGTGCTCTATGCCCAGGTCTCTGTGGCTGGGCTGCTCCAGCCTGGCGGACAGCATGCCTT 148
Query 107 CGCTGCGATGCCTGTATAACCCAGGGACTGGCGCACTCACAGCTTTCCAGAATTCCTCAGAGAGAGAAGACTGT 180
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149 CGCTGCGATGCCTGTATAACCCAGGGACTGGCGCACTCACAGCTTTCCAGAATTCCTCAGAGAGAGAAGACTGT 222
Query 181 AATAATGGCGAACCCCCTAGGAAGATAATACCAGAGAAGAATTCACTTAGACAGACATACAACAGCTGTGCCAG 254
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||
Sbjct 223 AATAATGGCGAACCCCCTAGGAAGATAATACCAGAGAAGAATTCACTTAGACAGACTTACAACAGCTGTGCCAG 296
Query 255 ACTCTGCTTAAACCAAGAAACAGTATGTTTAGCAAGCACTGCTATGAAGACTGAGAATTGTGTGGCCAAAACAA 328
.||.|||.||||||||||.|||||||||.||.||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||.|.|
Sbjct 297 GCTTTGCATAAACCAAGAGACAGTATGTCTAACAAGCACTGCTATGAAGACTGAAAATTGTGTGGCCAAAGCCA 370
Query 329 AACTTGCCAATGGCACTTCCAGTATGATTGTGCCCAAGCAACGGAAACTCTCAGCAAGCTATGAAAAGGAAAAG 402
||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||
Sbjct 371 AACTTGCCAATGGCACTTCCAGCATGATTGTGCCCAAGCAGCGGAAACTCTCAGCAAGCTATGAGAAGGAAAAG 444
Query 403 GAACTGTGTGTCAAATACTTTGAGCAGTGGTCAGAGTCAGATCAAGTGGAATTTGTGGAACATCTTATATCCCA 476
||.|||||||||||.||.||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||.|||||||||||
Sbjct 445 GAGCTGTGTGTCAAGTATTTTGAGCAGTGGTCAGAGTCTGATCAAGTGGAATTTGTAGAACACCTTATATCCCA 518
Query 477 AATGTGTCATTACCAACATGGGCACATAAACTCGTATCTTAAACCTATGTTGCAGAGAGATTTCATAACTGCTC 550
|||||||||.|||||.|||||||||||.|||||.||.||.|||||||||.|||||||.||||||||||||||.|
Sbjct 519 AATGTGTCACTACCAGCATGGGCACATCAACTCCTACCTAAAACCTATGCTGCAGAGGGATTTCATAACTGCAC 592
Query 551 TGCCAGCTCGGGGATTGGATCATATTGCTGAGAACATTCTGTCATACCTGGATGCCAAATCACTATGTGCTGCT 624
|||||||.|||||..||||.||.||.|||||||||||||||||||||.||||.|||||.|||||.|||||||||
Sbjct 593 TGCCAGCACGGGGTCTGGACCACATCGCTGAGAACATTCTGTCATACTTGGACGCCAAGTCACTGTGTGCTGCT 666
Query 625 GAACTTGTGTGCAAGGAATGGTACCGAGTGACCTCTGATGGCATGCTGTGGAAGAAGCTTATCGAGAGAATGGT 698
||.||.||||||||||||||||||||.|||||.||.||.||||||||||||||.|||||.||||||||.|||||
Sbjct 667 GAGCTCGTGTGCAAGGAATGGTACCGCGTGACGTCGGACGGCATGCTGTGGAAAAAGCTCATCGAGAGGATGGT 740
Query 699 CAGGACAGATTCTCTGTGGAGAGGCCTGGCAGAACGAAGAGGATGGGGACAGTATTTATTCAAAAACAAACCTC 772
||||||.||.|||||||||.|||||||||||||.||.|||||.|||||||||||.|||||||||||||||||||
Sbjct 741 CAGGACGGACTCTCTGTGGCGAGGCCTGGCAGAGCGCAGAGGCTGGGGACAGTACTTATTCAAAAACAAACCTC 814
Query 773 CTGACGGGAATGCTCCTCCCAACTCTTTTTATAGAGCACTTTATCCTAAAATTATACAAGACATTGAGACAATA 846
||||.|.|||.||||||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||
Sbjct 815 CTGATGAGAACGCTCCTCCCAACTCCTTTTATAGAGCGCTTTATCCTAAAATCATACAAGACATTGAGACAATA 888
Query 847 GAATCTAATTGGAGATGTGGAAGACATAGTTTACAGAGAATTCACTGCCGAAGTGAAACAAGCAAAGGAGTTTA 920
||.||.||||||||||||||..|||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||.|||||.|||||
Sbjct 889 GAGTCCAATTGGAGATGTGGGCGACATAGTTTACAGAGAATCCACTGCCGGAGTGAAACAAGTAAAGGGGTTTA 962
Query 921 CTGTTTACAGTATGATGATCAGAAAATAGTAAGCGGCCTTCGAGACAACACAATCAAGATCTGGGATAAAAACA 994
||||||||||||.||.||.|||||.|||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||.||
Sbjct 963 CTGTTTACAGTACGACGACCAGAAGATAGTCAGCGGCCTTCGAGACAACACCATCAAGATCTGGGATAAAAGCA 1036
Query 995 CATTGGAATGCAAGCGAATTCTCACAGGCCATACAGGTTCAGTCCTCTGTCTCCAGTATGATGAGAGAGTGATC 1068
||.|||||||||||||.||||||||.|||||.||.||.||.|||||.|||||.|||||.||||||||.||||||
Sbjct 1037 CACTGGAATGCAAGCGGATTCTCACGGGCCACACGGGCTCCGTCCTGTGTCTGCAGTACGATGAGAGGGTGATC 1110
Query 1069 ATAACAGGATCATCGGATTCCACGGTCAGAGTGTGGGATGTAAATACAGGTGAAATGCTAAACACGTTGATTCA 1142
||.|||||.||.||.||.|||||.|||||||||||||||||||||.|||||||.|||||||||||.||||||||
Sbjct 1111 ATCACAGGCTCCTCAGACTCCACCGTCAGAGTGTGGGATGTAAATGCAGGTGAGATGCTAAACACATTGATTCA 1184
Query 1143 CCATTGTGAAGCAGTTCTGCACTTGCGTTTCAATAATGGCATGATGGTGACCTGCTCCAAAGATCGTTCCATTG 1216
|||.||||||||.|||||||||.||||.||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||.|
Sbjct 1185 CCACTGTGAAGCCGTTCTGCACCTGCGCTTCAATAATGGCATGATGGTGACCTGTTCCAAAGACCGTTCCATCG 1258
Query 1217 CTGTATGGGATATGGCCTCCCCAACTGACATTACCCTCCGGAGGGTGCTGGTCGGACACCGAGCTGCTGTCAAT 1290
||||.|||||||||||.||||||||||||||.||||||.|||||||||||||.||||||||||||||.||||||
Sbjct 1259 CTGTGTGGGATATGGCTTCCCCAACTGACATCACCCTCAGGAGGGTGCTGGTGGGACACCGAGCTGCGGTCAAT 1332
Query 1291 GTTGTAGACTTTGATGACAAGTACATTGTTTCTGCATCTGGGGATAGAACTATAAAGGTATGGAACACAAGTAC 1364
||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||.||||||||.||||||||.||||||||||||||
Sbjct 1333 GTTGTAGACTTTGATGACAAGTACATCGTTTCTGCCTCTGGAGATAGAACCATAAAGGTGTGGAACACAAGTAC 1406
Query 1365 TTGTGAATTTGTAAGGACCTTAAATGGACACAAACGAGGCATTGCCTGTTTGCAGTACAGGGACAGGCTGGTAG 1438
.||||||||.|||||||||.|||||||.|||||.||.|||||.|||||||||||||||||.|||||||||||.|
Sbjct 1407 CTGTGAATTCGTAAGGACCCTAAATGGGCACAAGCGTGGCATCGCCTGTTTGCAGTACAGAGACAGGCTGGTGG 1480
Query 1439 TGAGTGGCTCATCTGACAACACTATCAGATTATGGGACATAGAATGTGGTGCATGTTTACGAGTGTTAGAAGGC 1512
||||.|||||.|||||||||||.|||||..|.|||||||||||.|||||.|||||..|.||||||||.||.|||
Sbjct 1481 TGAGCGGCTCCTCTGACAACACCATCAGGCTGTGGGACATAGAGTGTGGAGCATGCCTGCGAGTGTTGGAGGGC 1554
Query 1513 CATGAGGAATTGGTGCGTTGTATTCGATTTGATAACAAGAGGATAGTCAGTGGGGCCTATGATGGAAAAATTAA 1586
||||||||.|||||.||.||.|||||||||||||||||.||||||||.||.||.|||||||||||.||||||||
Sbjct 1555 CATGAGGAGTTGGTACGCTGCATTCGATTTGATAACAAAAGGATAGTGAGCGGAGCCTATGATGGGAAAATTAA 1628
Query 1587 AGTGTGGGATCTTGTGGCTGCTTTGGACCCCCGTGCTCCTGCAGGGACACTCTGTCTACGGACCCTTGTGGAGC 1660
|||||||||||||.||||||||||||||||.||||||||.||||||||.||||||||.|||||.||||||||||
Sbjct 1629 AGTGTGGGATCTTATGGCTGCTTTGGACCCGCGTGCTCCAGCAGGGACTCTCTGTCTGCGGACACTTGTGGAGC 1702
Query 1661 ATTCCGGAAGAGTTTTTCGACTACAGTTTGATGAATTCCAGATTGTCAGTAGTTCACATGATGACACAATCCTC 1734
||||.|||||||||||.||.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||
Sbjct 1703 ATTCTGGAAGAGTTTTCCGCCTCCAGTTTGATGAATTCCAGATTGTCAGTAGTTCACATGATGACACAATTCTC 1776
Query 1735 ATCTGGGACTTCCTAAATGATCCAGCTGCCCAAGCTGAACCCCCCCGTTCCCCTTCTCGAACATACACCTACAT 1808
||||||||||||||.||||||||||||||.||.||||||||.|||||.|||||||||||.||||||||||||||
Sbjct 1777 ATCTGGGACTTCCTGAATGATCCAGCTGCTCACGCTGAACCGCCCCGCTCCCCTTCTCGGACATACACCTACAT 1850
Query 1809 CTCCAGA 1815
|||||||
Sbjct 1851 CTCCAGA 1857