Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000469234
• Subject: XM_006526614.3
• Aligned Length: 1857
• Identities: 1491
• Gaps: 210

Alignment

Query    1  ATGGACCCGGCCGAGGCGGTGCTGCAAGAGAAGGCACTCAAGTTTAT---------------------------  47
            |||||||||||.||||||||||||||.|||||.||.||.||||||||                           
Sbjct    1  ATGGACCCGGCAGAGGCGGTGCTGCAGGAGAAAGCGCTTAAGTTTATGGCTGCAGTTCCGGCTGGTGGATATTG  74

Query   48  ---------------GTGCTCTATGCCCAGGTCTCTGTGGCTGGGCTGCTCCAGCCTGGCGGACAGCATGCCTT  106
                           |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  GAGGAATAATAAAAAGTGCTCTATGCCCAGGTCTCTGTGGCTGGGCTGCTCCAGCCTGGCGGACAGCATGCCTT  148

Query  107  CGCTGCGATGCCTGTATAACCCAGGGACTGGCGCACTCACAGCTTTCCAGAATTCCTCAGAGAGAGAAGACTGT  180
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                        
Sbjct  149  CGCTGCGATGCCTGTATAACCCAGGGACTGGCGCACTCACAGCTTTCCAG------------------------  198

Query  181  AATAATGGCGAACCCCCTAGGAAGATAATACCAGAGAAGAATTCACTTAGACAGACATACAACAGCTGTGCCAG  254
                                                                                 |||  
Sbjct  199  ---------------------------------------------------------------------GCC--  201

Query  255  ACTCTGCTTAAACCAAGAAACAGTATGTTTAGCAAGCACTGCTATGAAGACTGAGAATTGTGTGGCCAAAACAA  328
                                                                                     |
Sbjct  202  -------------------------------------------------------------------------A  202

Query  329  AACTTGCCAATGGCACTTCCAGTATGATTGTGCCCAAGCAACGGAAACTCTCAGCAAGCTATGAAAAGGAAAAG  402
            ||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||
Sbjct  203  AACTTGCCAATGGCACTTCCAGCATGATTGTGCCCAAGCAGCGGAAACTCTCAGCAAGCTATGAGAAGGAAAAG  276

Query  403  GAACTGTGTGTCAAATACTTTGAGCAGTGGTCAGAGTCAGATCAAGTGGAATTTGTGGAACATCTTATATCCCA  476
            ||.|||||||||||.||.||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||.|||||||||||
Sbjct  277  GAGCTGTGTGTCAAGTATTTTGAGCAGTGGTCAGAGTCTGATCAAGTGGAATTTGTAGAACACCTTATATCCCA  350

Query  477  AATGTGTCATTACCAACATGGGCACATAAACTCGTATCTTAAACCTATGTTGCAGAGAGATTTCATAACTGCTC  550
            |||||||||.|||||.|||||||||||.|||||.||.||.|||||||||.|||||||.||||||||||||||.|
Sbjct  351  AATGTGTCACTACCAGCATGGGCACATCAACTCCTACCTAAAACCTATGCTGCAGAGGGATTTCATAACTGCAC  424

Query  551  TGCCAGCTCGGGGATTGGATCATATTGCTGAGAACATTCTGTCATACCTGGATGCCAAATCACTATGTGCTGCT  624
            |||||||.|||||..||||.||.||.|||||||||||||||||||||.||||.|||||.|||||.|||||||||
Sbjct  425  TGCCAGCACGGGGTCTGGACCACATCGCTGAGAACATTCTGTCATACTTGGACGCCAAGTCACTGTGTGCTGCT  498

Query  625  GAACTTGTGTGCAAGGAATGGTACCGAGTGACCTCTGATGGCATGCTGTGGAAGAAGCTTATCGAGAGAATGGT  698
            ||.||.||||||||||||||||||||.|||||.||.||.||||||||||||||.|||||.||||||||.|||||
Sbjct  499  GAGCTCGTGTGCAAGGAATGGTACCGCGTGACGTCGGACGGCATGCTGTGGAAAAAGCTCATCGAGAGGATGGT  572

Query  699  CAGGACAGATTCTCTGTGGAGAGGCCTGGCAGAACGAAGAGGATGGGGACAGTATTTATTCAAAAACAAACCTC  772
            ||||||.||.|||||||||.|||||||||||||.||.|||||.|||||||||||.|||||||||||||||||||
Sbjct  573  CAGGACGGACTCTCTGTGGCGAGGCCTGGCAGAGCGCAGAGGCTGGGGACAGTACTTATTCAAAAACAAACCTC  646

Query  773  CTGACGGGAATGCTCCTCCCAACTCTTTTTATAGAGCACTTTATCCTAAAATTATACAAGACATTGAGACAATA  846
            ||||.|.|||.||||||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||
Sbjct  647  CTGATGAGAACGCTCCTCCCAACTCCTTTTATAGAGCGCTTTATCCTAAAATCATACAAGACATTGAGACAATA  720

Query  847  GAATCTAATTGGAGATGTGGAAGACATAGTTTACAGAGAATTCACTGCCGAAGTGAAACAAGCAAAGGAGTTTA  920
            ||.||.||||||||||||||..|||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||.|||||.|||||
Sbjct  721  GAGTCCAATTGGAGATGTGGGCGACATAGTTTACAGAGAATCCACTGCCGGAGTGAAACAAGTAAAGGGGTTTA  794

Query  921  CTGTTTACAGTATGATGATCAGAAAATAGTAAGCGGCCTTCGAGACAACACAATCAAGATCTGGGATAAAAACA  994
            ||||||||||||.||.||.|||||.|||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||.||
Sbjct  795  CTGTTTACAGTACGACGACCAGAAGATAGTCAGCGGCCTTCGAGACAACACCATCAAGATCTGGGATAAAAGCA  868

Query  995  CATTGGAATGCAAGCGAATTCTCACAGGCCATACAGGTTCAGTCCTCTGTCTCCAGTATGATGAGAGAGTGATC  1068
            ||.|||||||||||||.||||||||.|||||.||.||.||.|||||.|||||.|||||.||||||||.||||||
Sbjct  869  CACTGGAATGCAAGCGGATTCTCACGGGCCACACGGGCTCCGTCCTGTGTCTGCAGTACGATGAGAGGGTGATC  942

Query 1069  ATAACAGGATCATCGGATTCCACGGTCAGAGTGTGGGATGTAAATACAGGTGAAATGCTAAACACGTTGATTCA  1142
            ||.|||||.||.||.||.|||||.|||||||||||||||||||||.|||||||.|||||||||||.||||||||
Sbjct  943  ATCACAGGCTCCTCAGACTCCACCGTCAGAGTGTGGGATGTAAATGCAGGTGAGATGCTAAACACATTGATTCA  1016

Query 1143  CCATTGTGAAGCAGTTCTGCACTTGCGTTTCAATAATGGCATGATGGTGACCTGCTCCAAAGATCGTTCCATTG  1216
            |||.||||||||.|||||||||.||||.||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||.|
Sbjct 1017  CCACTGTGAAGCCGTTCTGCACCTGCGCTTCAATAATGGCATGATGGTGACCTGTTCCAAAGACCGTTCCATCG  1090

Query 1217  CTGTATGGGATATGGCCTCCCCAACTGACATTACCCTCCGGAGGGTGCTGGTCGGACACCGAGCTGCTGTCAAT  1290
            ||||.|||||||||||.||||||||||||||.||||||.|||||||||||||.||||||||||||||.||||||
Sbjct 1091  CTGTGTGGGATATGGCTTCCCCAACTGACATCACCCTCAGGAGGGTGCTGGTGGGACACCGAGCTGCGGTCAAT  1164

Query 1291  GTTGTAGACTTTGATGACAAGTACATTGTTTCTGCATCTGGGGATAGAACTATAAAGGTATGGAACACAAGTAC  1364
            ||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||.||||||||.||||||||.||||||||||||||
Sbjct 1165  GTTGTAGACTTTGATGACAAGTACATCGTTTCTGCCTCTGGAGATAGAACCATAAAGGTGTGGAACACAAGTAC  1238

Query 1365  TTGTGAATTTGTAAGGACCTTAAATGGACACAAACGAGGCATTGCCTGTTTGCAGTACAGGGACAGGCTGGTAG  1438
            .||||||||.|||||||||.|||||||.|||||.||.|||||.|||||||||||||||||.|||||||||||.|
Sbjct 1239  CTGTGAATTCGTAAGGACCCTAAATGGGCACAAGCGTGGCATCGCCTGTTTGCAGTACAGAGACAGGCTGGTGG  1312

Query 1439  TGAGTGGCTCATCTGACAACACTATCAGATTATGGGACATAGAATGTGGTGCATGTTTACGAGTGTTAGAAGGC  1512
            ||||.|||||.|||||||||||.|||||..|.|||||||||||.|||||.|||||..|.||||||||.||.|||
Sbjct 1313  TGAGCGGCTCCTCTGACAACACCATCAGGCTGTGGGACATAGAGTGTGGAGCATGCCTGCGAGTGTTGGAGGGC  1386

Query 1513  CATGAGGAATTGGTGCGTTGTATTCGATTTGATAACAAGAGGATAGTCAGTGGGGCCTATGATGGAAAAATTAA  1586
            ||||||||.|||||.||.||.|||||||||||||||||.||||||||.||.||.|||||||||||.||||||||
Sbjct 1387  CATGAGGAGTTGGTACGCTGCATTCGATTTGATAACAAAAGGATAGTGAGCGGAGCCTATGATGGGAAAATTAA  1460

Query 1587  AGTGTGGGATCTTGTGGCTGCTTTGGACCCCCGTGCTCCTGCAGGGACACTCTGTCTACGGACCCTTGTGGAGC  1660
            |||||||||||||.||||||||||||||||.||||||||.||||||||.||||||||.|||||.||||||||||
Sbjct 1461  AGTGTGGGATCTTATGGCTGCTTTGGACCCGCGTGCTCCAGCAGGGACTCTCTGTCTGCGGACACTTGTGGAGC  1534

Query 1661  ATTCCGGAAGAGTTTTTCGACTACAGTTTGATGAATTCCAGATTGTCAGTAGTTCACATGATGACACAATCCTC  1734
            ||||.|||||||||||.||.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||
Sbjct 1535  ATTCTGGAAGAGTTTTCCGCCTCCAGTTTGATGAATTCCAGATTGTCAGTAGTTCACATGATGACACAATTCTC  1608

Query 1735  ATCTGGGACTTCCTAAATGATCCAGCTGCCCAAGCTGAACCCCCCCGTTCCCCTTCTCGAACATACACCTACAT  1808
            ||||||||||||||.||||||||||||||.||.||||||||.|||||.|||||||||||.||||||||||||||
Sbjct 1609  ATCTGGGACTTCCTGAATGATCCAGCTGCTCACGCTGAACCGCCCCGCTCCCCTTCTCGGACATACACCTACAT  1682

Query 1809  CTCCAGA  1815
            |||||||
Sbjct 1683  CTCCAGA  1689