Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000469234
• Subject: XM_006526615.2
• Aligned Length: 1815
• Identities: 1364
• Gaps: 297

Alignment

Query    1  ATGGACCCGGCCGAGGCGGTGCTGCAAGAGAAGGCACTCAAGTTTATGTGCTCTATGCCCAGGTCTCTGTGGCT  74
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query   75  GGGCTGCTCCAGCCTGGCGGACAGCATGCCTTCGCTGCGATGCCTGTATAACCCAGGGACTGGCGCACTCACAG  148
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  149  CTTTCCAGAATTCCTCAGAGAGAGAAGACTGTAATAATGGCGAACCCCCTAGGAAGATAATACCAGAGAAGAAT  222
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  223  TCACTTAGACAGACATACAACAGCTGTGCCAGACTCTGCTTAAACCAAGAAACAGTATGTTTAGCAAGCACTGC  296
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  297  TATGAAGACTGAGAATTGTGTGGCCAAAACAAAACTTGCCAATGGCACTTCCAGTATGATTGTGCCCAAGCAAC  370
             |||||||||||.|||||||||||||||.|.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.|
Sbjct    1  -ATGAAGACTGAAAATTGTGTGGCCAAAGCCAAACTTGCCAATGGCACTTCCAGCATGATTGTGCCCAAGCAGC  73

Query  371  GGAAACTCTCAGCAAGCTATGAAAAGGAAAAGGAACTGTGTGTCAAATACTTTGAGCAGTGGTCAGAGTCAGAT  444
            ||||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||.||.||||||||||||||||||||.|||
Sbjct   74  GGAAACTCTCAGCAAGCTATGAGAAGGAAAAGGAGCTGTGTGTCAAGTATTTTGAGCAGTGGTCAGAGTCTGAT  147

Query  445  CAAGTGGAATTTGTGGAACATCTTATATCCCAAATGTGTCATTACCAACATGGGCACATAAACTCGTATCTTAA  518
            ||||||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||.|||||.||.||.||
Sbjct  148  CAAGTGGAATTTGTAGAACACCTTATATCCCAAATGTGTCACTACCAGCATGGGCACATCAACTCCTACCTAAA  221

Query  519  ACCTATGTTGCAGAGAGATTTCATAACTGCTCTGCCAGCTCGGGGATTGGATCATATTGCTGAGAACATTCTGT  592
            |||||||.|||||||.||||||||||||||.||||||||.|||||..||||.||.||.||||||||||||||||
Sbjct  222  ACCTATGCTGCAGAGGGATTTCATAACTGCACTGCCAGCACGGGGTCTGGACCACATCGCTGAGAACATTCTGT  295

Query  593  CATACCTGGATGCCAAATCACTATGTGCTGCTGAACTTGTGTGCAAGGAATGGTACCGAGTGACCTCTGATGGC  666
            |||||.||||.|||||.|||||.|||||||||||.||.||||||||||||||||||||.|||||.||.||.|||
Sbjct  296  CATACTTGGACGCCAAGTCACTGTGTGCTGCTGAGCTCGTGTGCAAGGAATGGTACCGCGTGACGTCGGACGGC  369

Query  667  ATGCTGTGGAAGAAGCTTATCGAGAGAATGGTCAGGACAGATTCTCTGTGGAGAGGCCTGGCAGAACGAAGAGG  740
            |||||||||||.|||||.||||||||.|||||||||||.||.|||||||||.|||||||||||||.||.|||||
Sbjct  370  ATGCTGTGGAAAAAGCTCATCGAGAGGATGGTCAGGACGGACTCTCTGTGGCGAGGCCTGGCAGAGCGCAGAGG  443

Query  741  ATGGGGACAGTATTTATTCAAAAACAAACCTCCTGACGGGAATGCTCCTCCCAACTCTTTTTATAGAGCACTTT  814
            .|||||||||||.|||||||||||||||||||||||.|.|||.||||||||||||||.|||||||||||.||||
Sbjct  444  CTGGGGACAGTACTTATTCAAAAACAAACCTCCTGATGAGAACGCTCCTCCCAACTCCTTTTATAGAGCGCTTT  517

Query  815  ATCCTAAAATTATACAAGACATTGAGACAATAGAATCTAATTGGAGATGTGGAAGACATAGTTTACAGAGAATT  888
            ||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||..|||||||||||||||||||.
Sbjct  518  ATCCTAAAATCATACAAGACATTGAGACAATAGAGTCCAATTGGAGATGTGGGCGACATAGTTTACAGAGAATC  591

Query  889  CACTGCCGAAGTGAAACAAGCAAAGGAGTTTACTGTTTACAGTATGATGATCAGAAAATAGTAAGCGGCCTTCG  962
            ||||||||.|||||||||||.|||||.|||||||||||||||||.||.||.|||||.|||||.|||||||||||
Sbjct  592  CACTGCCGGAGTGAAACAAGTAAAGGGGTTTACTGTTTACAGTACGACGACCAGAAGATAGTCAGCGGCCTTCG  665

Query  963  AGACAACACAATCAAGATCTGGGATAAAAACACATTGGAATGCAAGCGAATTCTCACAGGCCATACAGGTTCAG  1036
            |||||||||.|||||||||||||||||||.||||.|||||||||||||.||||||||.|||||.||.||.||.|
Sbjct  666  AGACAACACCATCAAGATCTGGGATAAAAGCACACTGGAATGCAAGCGGATTCTCACGGGCCACACGGGCTCCG  739

Query 1037  TCCTCTGTCTCCAGTATGATGAGAGAGTGATCATAACAGGATCATCGGATTCCACGGTCAGAGTGTGGGATGTA  1110
            ||||.|||||.|||||.||||||||.||||||||.|||||.||.||.||.|||||.||||||||||||||||||
Sbjct  740  TCCTGTGTCTGCAGTACGATGAGAGGGTGATCATCACAGGCTCCTCAGACTCCACCGTCAGAGTGTGGGATGTA  813

Query 1111  AATACAGGTGAAATGCTAAACACGTTGATTCACCATTGTGAAGCAGTTCTGCACTTGCGTTTCAATAATGGCAT  1184
            |||.|||||||.|||||||||||.|||||||||||.||||||||.|||||||||.||||.||||||||||||||
Sbjct  814  AATGCAGGTGAGATGCTAAACACATTGATTCACCACTGTGAAGCCGTTCTGCACCTGCGCTTCAATAATGGCAT  887

Query 1185  GATGGTGACCTGCTCCAAAGATCGTTCCATTGCTGTATGGGATATGGCCTCCCCAACTGACATTACCCTCCGGA  1258
            ||||||||||||.||||||||.||||||||.|||||.|||||||||||.||||||||||||||.||||||.|||
Sbjct  888  GATGGTGACCTGTTCCAAAGACCGTTCCATCGCTGTGTGGGATATGGCTTCCCCAACTGACATCACCCTCAGGA  961

Query 1259  GGGTGCTGGTCGGACACCGAGCTGCTGTCAATGTTGTAGACTTTGATGACAAGTACATTGTTTCTGCATCTGGG  1332
            ||||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||.
Sbjct  962  GGGTGCTGGTGGGACACCGAGCTGCGGTCAATGTTGTAGACTTTGATGACAAGTACATCGTTTCTGCCTCTGGA  1035

Query 1333  GATAGAACTATAAAGGTATGGAACACAAGTACTTGTGAATTTGTAAGGACCTTAAATGGACACAAACGAGGCAT  1406
            ||||||||.||||||||.||||||||||||||.||||||||.|||||||||.|||||||.|||||.||.|||||
Sbjct 1036  GATAGAACCATAAAGGTGTGGAACACAAGTACCTGTGAATTCGTAAGGACCCTAAATGGGCACAAGCGTGGCAT  1109

Query 1407  TGCCTGTTTGCAGTACAGGGACAGGCTGGTAGTGAGTGGCTCATCTGACAACACTATCAGATTATGGGACATAG  1480
            .|||||||||||||||||.|||||||||||.|||||.|||||.|||||||||||.|||||..|.||||||||||
Sbjct 1110  CGCCTGTTTGCAGTACAGAGACAGGCTGGTGGTGAGCGGCTCCTCTGACAACACCATCAGGCTGTGGGACATAG  1183

Query 1481  AATGTGGTGCATGTTTACGAGTGTTAGAAGGCCATGAGGAATTGGTGCGTTGTATTCGATTTGATAACAAGAGG  1554
            |.|||||.|||||..|.||||||||.||.|||||||||||.|||||.||.||.|||||||||||||||||.|||
Sbjct 1184  AGTGTGGAGCATGCCTGCGAGTGTTGGAGGGCCATGAGGAGTTGGTACGCTGCATTCGATTTGATAACAAAAGG  1257

Query 1555  ATAGTCAGTGGGGCCTATGATGGAAAAATTAAAGTGTGGGATCTTGTGGCTGCTTTGGACCCCCGTGCTCCTGC  1628
            |||||.||.||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||.||||||||||||||||.||||||||.||
Sbjct 1258  ATAGTGAGCGGAGCCTATGATGGGAAAATTAAAGTGTGGGATCTTATGGCTGCTTTGGACCCGCGTGCTCCAGC  1331

Query 1629  AGGGACACTCTGTCTACGGACCCTTGTGGAGCATTCCGGAAGAGTTTTTCGACTACAGTTTGATGAATTCCAGA  1702
            ||||||.||||||||.|||||.||||||||||||||.|||||||||||.||.||.|||||||||||||||||||
Sbjct 1332  AGGGACTCTCTGTCTGCGGACACTTGTGGAGCATTCTGGAAGAGTTTTCCGCCTCCAGTTTGATGAATTCCAGA  1405

Query 1703  TTGTCAGTAGTTCACATGATGACACAATCCTCATCTGGGACTTCCTAAATGATCCAGCTGCCCAAGCTGAACCC  1776
            ||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||.||.||||||||.
Sbjct 1406  TTGTCAGTAGTTCACATGATGACACAATTCTCATCTGGGACTTCCTGAATGATCCAGCTGCTCACGCTGAACCG  1479

Query 1777  CCCCGTTCCCCTTCTCGAACATACACCTACATCTCCAGA  1815
            |||||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||
Sbjct 1480  CCCCGCTCCCCTTCTCGGACATACACCTACATCTCCAGA  1518