Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000469234
• Subject: XM_011247121.2
• Aligned Length: 1829
• Identities: 1557
• Gaps: 91

Alignment

Query    1  -----ATGGACCCGGCCGAGGCGGTGCTGCAAGAGAAGGC-ACTCAAGTTTATGTGCTCTATGCCCAGGTCTCT  68
                 |||.|        |..|.||||.|| |.||||||| ||..||                           
Sbjct    1  ATGCAATGTA--------ATTCTGTGCAGC-ACAGAAGGCAACAGAA---------------------------  38

Query   69  GTGGCTGGGCTGCTCCAGCCTGGCG-------GACAGCATGCCTTC-GCTGCGATGCCTGTATAACCCAGGGAC  134
                   |.|.|.||.|||||||.|       ||.| ||..||||| ||                |||||    
Sbjct   39  -------GACAGATCAAGCCTGGAGCGAGGAAGATA-CACACCTTCAGC----------------CCCAG----  84

Query  135  TGGCGCACTCACAGCTTTCCAGAATTCCTCAGAGAGAGAAGACTGTAATAATGGCGAACCCCCTAGGAAGATAA  208
                     |||.|    ..|.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   85  ---------CACCG----AAAAAATTCCTCAGAGAGAGAAGACTGTAATAATGGCGAACCCCCTAGGAAGATAA  145

Query  209  TACCAGAGAAGAATTCACTTAGACAGACATACAACAGCTGTGCCAGACTCTGCTTAAACCAAGAAACAGTATGT  282
            ||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||.|||.||||||||||.|||||||||
Sbjct  146  TACCAGAGAAGAATTCACTTAGACAGACTTACAACAGCTGTGCCAGGCTTTGCATAAACCAAGAGACAGTATGT  219

Query  283  TTAGCAAGCACTGCTATGAAGACTGAGAATTGTGTGGCCAAAACAAAACTTGCCAATGGCACTTCCAGTATGAT  356
            .||.||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||.|.|||||||||||||||||||||||.|||||
Sbjct  220  CTAACAAGCACTGCTATGAAGACTGAAAATTGTGTGGCCAAAGCCAAACTTGCCAATGGCACTTCCAGCATGAT  293

Query  357  TGTGCCCAAGCAACGGAAACTCTCAGCAAGCTATGAAAAGGAAAAGGAACTGTGTGTCAAATACTTTGAGCAGT  430
            ||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||.||.||||||||||
Sbjct  294  TGTGCCCAAGCAGCGGAAACTCTCAGCAAGCTATGAGAAGGAAAAGGAGCTGTGTGTCAAGTATTTTGAGCAGT  367

Query  431  GGTCAGAGTCAGATCAAGTGGAATTTGTGGAACATCTTATATCCCAAATGTGTCATTACCAACATGGGCACATA  504
            ||||||||||.|||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||.
Sbjct  368  GGTCAGAGTCTGATCAAGTGGAATTTGTAGAACACCTTATATCCCAAATGTGTCACTACCAGCATGGGCACATC  441

Query  505  AACTCGTATCTTAAACCTATGTTGCAGAGAGATTTCATAACTGCTCTGCCAGCTCGGGGATTGGATCATATTGC  578
            |||||.||.||.|||||||||.|||||||.||||||||||||||.||||||||.|||||..||||.||.||.||
Sbjct  442  AACTCCTACCTAAAACCTATGCTGCAGAGGGATTTCATAACTGCACTGCCAGCACGGGGTCTGGACCACATCGC  515

Query  579  TGAGAACATTCTGTCATACCTGGATGCCAAATCACTATGTGCTGCTGAACTTGTGTGCAAGGAATGGTACCGAG  652
            |||||||||||||||||||.||||.|||||.|||||.|||||||||||.||.||||||||||||||||||||.|
Sbjct  516  TGAGAACATTCTGTCATACTTGGACGCCAAGTCACTGTGTGCTGCTGAGCTCGTGTGCAAGGAATGGTACCGCG  589

Query  653  TGACCTCTGATGGCATGCTGTGGAAGAAGCTTATCGAGAGAATGGTCAGGACAGATTCTCTGTGGAGAGGCCTG  726
            ||||.||.||.||||||||||||||.|||||.||||||||.|||||||||||.||.|||||||||.||||||||
Sbjct  590  TGACGTCGGACGGCATGCTGTGGAAAAAGCTCATCGAGAGGATGGTCAGGACGGACTCTCTGTGGCGAGGCCTG  663

Query  727  GCAGAACGAAGAGGATGGGGACAGTATTTATTCAAAAACAAACCTCCTGACGGGAATGCTCCTCCCAACTCTTT  800
            |||||.||.|||||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||.|.|||.||||||||||||||.||
Sbjct  664  GCAGAGCGCAGAGGCTGGGGACAGTACTTATTCAAAAACAAACCTCCTGATGAGAACGCTCCTCCCAACTCCTT  737

Query  801  TTATAGAGCACTTTATCCTAAAATTATACAAGACATTGAGACAATAGAATCTAATTGGAGATGTGGAAGACATA  874
            |||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||..||||||
Sbjct  738  TTATAGAGCGCTTTATCCTAAAATCATACAAGACATTGAGACAATAGAGTCCAATTGGAGATGTGGGCGACATA  811

Query  875  GTTTACAGAGAATTCACTGCCGAAGTGAAACAAGCAAAGGAGTTTACTGTTTACAGTATGATGATCAGAAAATA  948
            |||||||||||||.||||||||.|||||||||||.|||||.|||||||||||||||||.||.||.|||||.|||
Sbjct  812  GTTTACAGAGAATCCACTGCCGGAGTGAAACAAGTAAAGGGGTTTACTGTTTACAGTACGACGACCAGAAGATA  885

Query  949  GTAAGCGGCCTTCGAGACAACACAATCAAGATCTGGGATAAAAACACATTGGAATGCAAGCGAATTCTCACAGG  1022
            ||.||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||.||||.|||||||||||||.||||||||.||
Sbjct  886  GTCAGCGGCCTTCGAGACAACACCATCAAGATCTGGGATAAAAGCACACTGGAATGCAAGCGGATTCTCACGGG  959

Query 1023  CCATACAGGTTCAGTCCTCTGTCTCCAGTATGATGAGAGAGTGATCATAACAGGATCATCGGATTCCACGGTCA  1096
            |||.||.||.||.|||||.|||||.|||||.||||||||.||||||||.|||||.||.||.||.|||||.||||
Sbjct  960  CCACACGGGCTCCGTCCTGTGTCTGCAGTACGATGAGAGGGTGATCATCACAGGCTCCTCAGACTCCACCGTCA  1033

Query 1097  GAGTGTGGGATGTAAATACAGGTGAAATGCTAAACACGTTGATTCACCATTGTGAAGCAGTTCTGCACTTGCGT  1170
            |||||||||||||||||.|||||||.|||||||||||.|||||||||||.||||||||.|||||||||.||||.
Sbjct 1034  GAGTGTGGGATGTAAATGCAGGTGAGATGCTAAACACATTGATTCACCACTGTGAAGCCGTTCTGCACCTGCGC  1107

Query 1171  TTCAATAATGGCATGATGGTGACCTGCTCCAAAGATCGTTCCATTGCTGTATGGGATATGGCCTCCCCAACTGA  1244
            ||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||.|||||.|||||||||||.|||||||||||
Sbjct 1108  TTCAATAATGGCATGATGGTGACCTGTTCCAAAGACCGTTCCATCGCTGTGTGGGATATGGCTTCCCCAACTGA  1181

Query 1245  CATTACCCTCCGGAGGGTGCTGGTCGGACACCGAGCTGCTGTCAATGTTGTAGACTTTGATGACAAGTACATTG  1318
            |||.||||||.|||||||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.|
Sbjct 1182  CATCACCCTCAGGAGGGTGCTGGTGGGACACCGAGCTGCGGTCAATGTTGTAGACTTTGATGACAAGTACATCG  1255

Query 1319  TTTCTGCATCTGGGGATAGAACTATAAAGGTATGGAACACAAGTACTTGTGAATTTGTAAGGACCTTAAATGGA  1392
            |||||||.|||||.||||||||.||||||||.||||||||||||||.||||||||.|||||||||.|||||||.
Sbjct 1256  TTTCTGCCTCTGGAGATAGAACCATAAAGGTGTGGAACACAAGTACCTGTGAATTCGTAAGGACCCTAAATGGG  1329

Query 1393  CACAAACGAGGCATTGCCTGTTTGCAGTACAGGGACAGGCTGGTAGTGAGTGGCTCATCTGACAACACTATCAG  1466
            |||||.||.|||||.|||||||||||||||||.|||||||||||.|||||.|||||.|||||||||||.|||||
Sbjct 1330  CACAAGCGTGGCATCGCCTGTTTGCAGTACAGAGACAGGCTGGTGGTGAGCGGCTCCTCTGACAACACCATCAG  1403

Query 1467  ATTATGGGACATAGAATGTGGTGCATGTTTACGAGTGTTAGAAGGCCATGAGGAATTGGTGCGTTGTATTCGAT  1540
            ..|.|||||||||||.|||||.|||||..|.||||||||.||.|||||||||||.|||||.||.||.|||||||
Sbjct 1404  GCTGTGGGACATAGAGTGTGGAGCATGCCTGCGAGTGTTGGAGGGCCATGAGGAGTTGGTACGCTGCATTCGAT  1477

Query 1541  TTGATAACAAGAGGATAGTCAGTGGGGCCTATGATGGAAAAATTAAAGTGTGGGATCTTGTGGCTGCTTTGGAC  1614
            ||||||||||.||||||||.||.||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||.||||||||||||||
Sbjct 1478  TTGATAACAAAAGGATAGTGAGCGGAGCCTATGATGGGAAAATTAAAGTGTGGGATCTTATGGCTGCTTTGGAC  1551

Query 1615  CCCCGTGCTCCTGCAGGGACACTCTGTCTACGGACCCTTGTGGAGCATTCCGGAAGAGTTTTTCGACTACAGTT  1688
            ||.||||||||.||||||||.||||||||.|||||.||||||||||||||.|||||||||||.||.||.|||||
Sbjct 1552  CCGCGTGCTCCAGCAGGGACTCTCTGTCTGCGGACACTTGTGGAGCATTCTGGAAGAGTTTTCCGCCTCCAGTT  1625

Query 1689  TGATGAATTCCAGATTGTCAGTAGTTCACATGATGACACAATCCTCATCTGGGACTTCCTAAATGATCCAGCTG  1762
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||||
Sbjct 1626  TGATGAATTCCAGATTGTCAGTAGTTCACATGATGACACAATTCTCATCTGGGACTTCCTGAATGATCCAGCTG  1699

Query 1763  CCCAAGCTGAACCCCCCCGTTCCCCTTCTCGAACATACACCTACATCTCCAGA  1815
            |.||.||||||||.|||||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||
Sbjct 1700  CTCACGCTGAACCGCCCCGCTCCCCTTCTCGGACATACACCTACATCTCCAGA  1752