Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000469234
• Subject: XM_011247123.2
• Aligned Length: 1815
• Identities: 1498
• Gaps: 144

Alignment

Query    1  ATGGACCCGGCCGAGGCGGTGCTGCAAGAGAAGGCACTCAAGTTTATGTGCTCTATGCCCAGGTCTCTGTGGCT  74
            |||||||||||.||||||||||||||.|||||.||.||.||||||||| |||                      
Sbjct    1  ATGGACCCGGCAGAGGCGGTGCTGCAGGAGAAAGCGCTTAAGTTTATG-GCT----------------------  51

Query   75  GGGCTGCTCCAGCCTGGCGGACAGCATGCCTTCGCTGCGATGCCTGTATAACCCAGGGACTGGCGCACTCACAG  148
              ||.|.||| |.||||.||                                                      
Sbjct   52  --GCAGTTCC-GGCTGGTGG------------------------------------------------------  68

Query  149  CTTTCCAGAATTCCTCAGAGAGAGAAGACTGTAATAATGGCGAACCCCCTAGGAAGATAATACCAGAGAAGAAT  222
                                             |||.|||          ||||  ||||              
Sbjct   69  ---------------------------------ATATTGG----------AGGA--ATAA--------------  83

Query  223  TCACTTAGACAGACATACAACAGCTGTGCCAGACTCTGCTTAAACCAAGAAACAGTATGTTTAGCAAGCACTGC  296
                 ||.|.||||.|||||||||||||||||.||.|||.||||||||||.|||||||||.||.||||||||||
Sbjct   84  -----TAAAAAGACTTACAACAGCTGTGCCAGGCTTTGCATAAACCAAGAGACAGTATGTCTAACAAGCACTGC  152

Query  297  TATGAAGACTGAGAATTGTGTGGCCAAAACAAAACTTGCCAATGGCACTTCCAGTATGATTGTGCCCAAGCAAC  370
            ||||||||||||.|||||||||||||||.|.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.|
Sbjct  153  TATGAAGACTGAAAATTGTGTGGCCAAAGCCAAACTTGCCAATGGCACTTCCAGCATGATTGTGCCCAAGCAGC  226

Query  371  GGAAACTCTCAGCAAGCTATGAAAAGGAAAAGGAACTGTGTGTCAAATACTTTGAGCAGTGGTCAGAGTCAGAT  444
            ||||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||.||.||||||||||||||||||||.|||
Sbjct  227  GGAAACTCTCAGCAAGCTATGAGAAGGAAAAGGAGCTGTGTGTCAAGTATTTTGAGCAGTGGTCAGAGTCTGAT  300

Query  445  CAAGTGGAATTTGTGGAACATCTTATATCCCAAATGTGTCATTACCAACATGGGCACATAAACTCGTATCTTAA  518
            ||||||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||.|||||.||.||.||
Sbjct  301  CAAGTGGAATTTGTAGAACACCTTATATCCCAAATGTGTCACTACCAGCATGGGCACATCAACTCCTACCTAAA  374

Query  519  ACCTATGTTGCAGAGAGATTTCATAACTGCTCTGCCAGCTCGGGGATTGGATCATATTGCTGAGAACATTCTGT  592
            |||||||.|||||||.||||||||||||||.||||||||.|||||..||||.||.||.||||||||||||||||
Sbjct  375  ACCTATGCTGCAGAGGGATTTCATAACTGCACTGCCAGCACGGGGTCTGGACCACATCGCTGAGAACATTCTGT  448

Query  593  CATACCTGGATGCCAAATCACTATGTGCTGCTGAACTTGTGTGCAAGGAATGGTACCGAGTGACCTCTGATGGC  666
            |||||.||||.|||||.|||||.|||||||||||.||.||||||||||||||||||||.|||||.||.||.|||
Sbjct  449  CATACTTGGACGCCAAGTCACTGTGTGCTGCTGAGCTCGTGTGCAAGGAATGGTACCGCGTGACGTCGGACGGC  522

Query  667  ATGCTGTGGAAGAAGCTTATCGAGAGAATGGTCAGGACAGATTCTCTGTGGAGAGGCCTGGCAGAACGAAGAGG  740
            |||||||||||.|||||.||||||||.|||||||||||.||.|||||||||.|||||||||||||.||.|||||
Sbjct  523  ATGCTGTGGAAAAAGCTCATCGAGAGGATGGTCAGGACGGACTCTCTGTGGCGAGGCCTGGCAGAGCGCAGAGG  596

Query  741  ATGGGGACAGTATTTATTCAAAAACAAACCTCCTGACGGGAATGCTCCTCCCAACTCTTTTTATAGAGCACTTT  814
            .|||||||||||.|||||||||||||||||||||||.|.|||.||||||||||||||.|||||||||||.||||
Sbjct  597  CTGGGGACAGTACTTATTCAAAAACAAACCTCCTGATGAGAACGCTCCTCCCAACTCCTTTTATAGAGCGCTTT  670

Query  815  ATCCTAAAATTATACAAGACATTGAGACAATAGAATCTAATTGGAGATGTGGAAGACATAGTTTACAGAGAATT  888
            ||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||..|||||||||||||||||||.
Sbjct  671  ATCCTAAAATCATACAAGACATTGAGACAATAGAGTCCAATTGGAGATGTGGGCGACATAGTTTACAGAGAATC  744

Query  889  CACTGCCGAAGTGAAACAAGCAAAGGAGTTTACTGTTTACAGTATGATGATCAGAAAATAGTAAGCGGCCTTCG  962
            ||||||||.|||||||||||.|||||.|||||||||||||||||.||.||.|||||.|||||.|||||||||||
Sbjct  745  CACTGCCGGAGTGAAACAAGTAAAGGGGTTTACTGTTTACAGTACGACGACCAGAAGATAGTCAGCGGCCTTCG  818

Query  963  AGACAACACAATCAAGATCTGGGATAAAAACACATTGGAATGCAAGCGAATTCTCACAGGCCATACAGGTTCAG  1036
            |||||||||.|||||||||||||||||||.||||.|||||||||||||.||||||||.|||||.||.||.||.|
Sbjct  819  AGACAACACCATCAAGATCTGGGATAAAAGCACACTGGAATGCAAGCGGATTCTCACGGGCCACACGGGCTCCG  892

Query 1037  TCCTCTGTCTCCAGTATGATGAGAGAGTGATCATAACAGGATCATCGGATTCCACGGTCAGAGTGTGGGATGTA  1110
            ||||.|||||.|||||.||||||||.||||||||.|||||.||.||.||.|||||.||||||||||||||||||
Sbjct  893  TCCTGTGTCTGCAGTACGATGAGAGGGTGATCATCACAGGCTCCTCAGACTCCACCGTCAGAGTGTGGGATGTA  966

Query 1111  AATACAGGTGAAATGCTAAACACGTTGATTCACCATTGTGAAGCAGTTCTGCACTTGCGTTTCAATAATGGCAT  1184
            |||.|||||||.|||||||||||.|||||||||||.||||||||.|||||||||.||||.||||||||||||||
Sbjct  967  AATGCAGGTGAGATGCTAAACACATTGATTCACCACTGTGAAGCCGTTCTGCACCTGCGCTTCAATAATGGCAT  1040

Query 1185  GATGGTGACCTGCTCCAAAGATCGTTCCATTGCTGTATGGGATATGGCCTCCCCAACTGACATTACCCTCCGGA  1258
            ||||||||||||.||||||||.||||||||.|||||.|||||||||||.||||||||||||||.||||||.|||
Sbjct 1041  GATGGTGACCTGTTCCAAAGACCGTTCCATCGCTGTGTGGGATATGGCTTCCCCAACTGACATCACCCTCAGGA  1114

Query 1259  GGGTGCTGGTCGGACACCGAGCTGCTGTCAATGTTGTAGACTTTGATGACAAGTACATTGTTTCTGCATCTGGG  1332
            ||||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||.
Sbjct 1115  GGGTGCTGGTGGGACACCGAGCTGCGGTCAATGTTGTAGACTTTGATGACAAGTACATCGTTTCTGCCTCTGGA  1188

Query 1333  GATAGAACTATAAAGGTATGGAACACAAGTACTTGTGAATTTGTAAGGACCTTAAATGGACACAAACGAGGCAT  1406
            ||||||||.||||||||.||||||||||||||.||||||||.|||||||||.|||||||.|||||.||.|||||
Sbjct 1189  GATAGAACCATAAAGGTGTGGAACACAAGTACCTGTGAATTCGTAAGGACCCTAAATGGGCACAAGCGTGGCAT  1262

Query 1407  TGCCTGTTTGCAGTACAGGGACAGGCTGGTAGTGAGTGGCTCATCTGACAACACTATCAGATTATGGGACATAG  1480
            .|||||||||||||||||.|||||||||||.|||||.|||||.|||||||||||.|||||..|.||||||||||
Sbjct 1263  CGCCTGTTTGCAGTACAGAGACAGGCTGGTGGTGAGCGGCTCCTCTGACAACACCATCAGGCTGTGGGACATAG  1336

Query 1481  AATGTGGTGCATGTTTACGAGTGTTAGAAGGCCATGAGGAATTGGTGCGTTGTATTCGATTTGATAACAAGAGG  1554
            |.|||||.|||||..|.||||||||.||.|||||||||||.|||||.||.||.|||||||||||||||||.|||
Sbjct 1337  AGTGTGGAGCATGCCTGCGAGTGTTGGAGGGCCATGAGGAGTTGGTACGCTGCATTCGATTTGATAACAAAAGG  1410

Query 1555  ATAGTCAGTGGGGCCTATGATGGAAAAATTAAAGTGTGGGATCTTGTGGCTGCTTTGGACCCCCGTGCTCCTGC  1628
            |||||.||.||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||.||||||||||||||||.||||||||.||
Sbjct 1411  ATAGTGAGCGGAGCCTATGATGGGAAAATTAAAGTGTGGGATCTTATGGCTGCTTTGGACCCGCGTGCTCCAGC  1484

Query 1629  AGGGACACTCTGTCTACGGACCCTTGTGGAGCATTCCGGAAGAGTTTTTCGACTACAGTTTGATGAATTCCAGA  1702
            ||||||.||||||||.|||||.||||||||||||||.|||||||||||.||.||.|||||||||||||||||||
Sbjct 1485  AGGGACTCTCTGTCTGCGGACACTTGTGGAGCATTCTGGAAGAGTTTTCCGCCTCCAGTTTGATGAATTCCAGA  1558

Query 1703  TTGTCAGTAGTTCACATGATGACACAATCCTCATCTGGGACTTCCTAAATGATCCAGCTGCCCAAGCTGAACCC  1776
            ||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||.||.||||||||.
Sbjct 1559  TTGTCAGTAGTTCACATGATGACACAATTCTCATCTGGGACTTCCTGAATGATCCAGCTGCTCACGCTGAACCG  1632

Query 1777  CCCCGTTCCCCTTCTCGAACATACACCTACATCTCCAGA  1815
            |||||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||
Sbjct 1633  CCCCGCTCCCCTTCTCGGACATACACCTACATCTCCAGA  1671