Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000469234
- Subject:
- XM_011247127.2
- Aligned Length:
- 1815
- Identities:
- 1364
- Gaps:
- 297
Alignment
Query 1 ATGGACCCGGCCGAGGCGGTGCTGCAAGAGAAGGCACTCAAGTTTATGTGCTCTATGCCCAGGTCTCTGTGGCT 74
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 75 GGGCTGCTCCAGCCTGGCGGACAGCATGCCTTCGCTGCGATGCCTGTATAACCCAGGGACTGGCGCACTCACAG 148
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 149 CTTTCCAGAATTCCTCAGAGAGAGAAGACTGTAATAATGGCGAACCCCCTAGGAAGATAATACCAGAGAAGAAT 222
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 223 TCACTTAGACAGACATACAACAGCTGTGCCAGACTCTGCTTAAACCAAGAAACAGTATGTTTAGCAAGCACTGC 296
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 297 TATGAAGACTGAGAATTGTGTGGCCAAAACAAAACTTGCCAATGGCACTTCCAGTATGATTGTGCCCAAGCAAC 370
|||||||||||.|||||||||||||||.|.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.|
Sbjct 1 -ATGAAGACTGAAAATTGTGTGGCCAAAGCCAAACTTGCCAATGGCACTTCCAGCATGATTGTGCCCAAGCAGC 73
Query 371 GGAAACTCTCAGCAAGCTATGAAAAGGAAAAGGAACTGTGTGTCAAATACTTTGAGCAGTGGTCAGAGTCAGAT 444
||||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||.||.||||||||||||||||||||.|||
Sbjct 74 GGAAACTCTCAGCAAGCTATGAGAAGGAAAAGGAGCTGTGTGTCAAGTATTTTGAGCAGTGGTCAGAGTCTGAT 147
Query 445 CAAGTGGAATTTGTGGAACATCTTATATCCCAAATGTGTCATTACCAACATGGGCACATAAACTCGTATCTTAA 518
||||||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||.|||||.||.||.||
Sbjct 148 CAAGTGGAATTTGTAGAACACCTTATATCCCAAATGTGTCACTACCAGCATGGGCACATCAACTCCTACCTAAA 221
Query 519 ACCTATGTTGCAGAGAGATTTCATAACTGCTCTGCCAGCTCGGGGATTGGATCATATTGCTGAGAACATTCTGT 592
|||||||.|||||||.||||||||||||||.||||||||.|||||..||||.||.||.||||||||||||||||
Sbjct 222 ACCTATGCTGCAGAGGGATTTCATAACTGCACTGCCAGCACGGGGTCTGGACCACATCGCTGAGAACATTCTGT 295
Query 593 CATACCTGGATGCCAAATCACTATGTGCTGCTGAACTTGTGTGCAAGGAATGGTACCGAGTGACCTCTGATGGC 666
|||||.||||.|||||.|||||.|||||||||||.||.||||||||||||||||||||.|||||.||.||.|||
Sbjct 296 CATACTTGGACGCCAAGTCACTGTGTGCTGCTGAGCTCGTGTGCAAGGAATGGTACCGCGTGACGTCGGACGGC 369
Query 667 ATGCTGTGGAAGAAGCTTATCGAGAGAATGGTCAGGACAGATTCTCTGTGGAGAGGCCTGGCAGAACGAAGAGG 740
|||||||||||.|||||.||||||||.|||||||||||.||.|||||||||.|||||||||||||.||.|||||
Sbjct 370 ATGCTGTGGAAAAAGCTCATCGAGAGGATGGTCAGGACGGACTCTCTGTGGCGAGGCCTGGCAGAGCGCAGAGG 443
Query 741 ATGGGGACAGTATTTATTCAAAAACAAACCTCCTGACGGGAATGCTCCTCCCAACTCTTTTTATAGAGCACTTT 814
.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||.|.|||.||||||||||||||.|||||||||||.||||
Sbjct 444 CTGGGGACAGTACTTATTCAAAAACAAACCTCCTGATGAGAACGCTCCTCCCAACTCCTTTTATAGAGCGCTTT 517
Query 815 ATCCTAAAATTATACAAGACATTGAGACAATAGAATCTAATTGGAGATGTGGAAGACATAGTTTACAGAGAATT 888
||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||..|||||||||||||||||||.
Sbjct 518 ATCCTAAAATCATACAAGACATTGAGACAATAGAGTCCAATTGGAGATGTGGGCGACATAGTTTACAGAGAATC 591
Query 889 CACTGCCGAAGTGAAACAAGCAAAGGAGTTTACTGTTTACAGTATGATGATCAGAAAATAGTAAGCGGCCTTCG 962
||||||||.|||||||||||.|||||.|||||||||||||||||.||.||.|||||.|||||.|||||||||||
Sbjct 592 CACTGCCGGAGTGAAACAAGTAAAGGGGTTTACTGTTTACAGTACGACGACCAGAAGATAGTCAGCGGCCTTCG 665
Query 963 AGACAACACAATCAAGATCTGGGATAAAAACACATTGGAATGCAAGCGAATTCTCACAGGCCATACAGGTTCAG 1036
|||||||||.|||||||||||||||||||.||||.|||||||||||||.||||||||.|||||.||.||.||.|
Sbjct 666 AGACAACACCATCAAGATCTGGGATAAAAGCACACTGGAATGCAAGCGGATTCTCACGGGCCACACGGGCTCCG 739
Query 1037 TCCTCTGTCTCCAGTATGATGAGAGAGTGATCATAACAGGATCATCGGATTCCACGGTCAGAGTGTGGGATGTA 1110
||||.|||||.|||||.||||||||.||||||||.|||||.||.||.||.|||||.||||||||||||||||||
Sbjct 740 TCCTGTGTCTGCAGTACGATGAGAGGGTGATCATCACAGGCTCCTCAGACTCCACCGTCAGAGTGTGGGATGTA 813
Query 1111 AATACAGGTGAAATGCTAAACACGTTGATTCACCATTGTGAAGCAGTTCTGCACTTGCGTTTCAATAATGGCAT 1184
|||.|||||||.|||||||||||.|||||||||||.||||||||.|||||||||.||||.||||||||||||||
Sbjct 814 AATGCAGGTGAGATGCTAAACACATTGATTCACCACTGTGAAGCCGTTCTGCACCTGCGCTTCAATAATGGCAT 887
Query 1185 GATGGTGACCTGCTCCAAAGATCGTTCCATTGCTGTATGGGATATGGCCTCCCCAACTGACATTACCCTCCGGA 1258
||||||||||||.||||||||.||||||||.|||||.|||||||||||.||||||||||||||.||||||.|||
Sbjct 888 GATGGTGACCTGTTCCAAAGACCGTTCCATCGCTGTGTGGGATATGGCTTCCCCAACTGACATCACCCTCAGGA 961
Query 1259 GGGTGCTGGTCGGACACCGAGCTGCTGTCAATGTTGTAGACTTTGATGACAAGTACATTGTTTCTGCATCTGGG 1332
||||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||.
Sbjct 962 GGGTGCTGGTGGGACACCGAGCTGCGGTCAATGTTGTAGACTTTGATGACAAGTACATCGTTTCTGCCTCTGGA 1035
Query 1333 GATAGAACTATAAAGGTATGGAACACAAGTACTTGTGAATTTGTAAGGACCTTAAATGGACACAAACGAGGCAT 1406
||||||||.||||||||.||||||||||||||.||||||||.|||||||||.|||||||.|||||.||.|||||
Sbjct 1036 GATAGAACCATAAAGGTGTGGAACACAAGTACCTGTGAATTCGTAAGGACCCTAAATGGGCACAAGCGTGGCAT 1109
Query 1407 TGCCTGTTTGCAGTACAGGGACAGGCTGGTAGTGAGTGGCTCATCTGACAACACTATCAGATTATGGGACATAG 1480
.|||||||||||||||||.|||||||||||.|||||.|||||.|||||||||||.|||||..|.||||||||||
Sbjct 1110 CGCCTGTTTGCAGTACAGAGACAGGCTGGTGGTGAGCGGCTCCTCTGACAACACCATCAGGCTGTGGGACATAG 1183
Query 1481 AATGTGGTGCATGTTTACGAGTGTTAGAAGGCCATGAGGAATTGGTGCGTTGTATTCGATTTGATAACAAGAGG 1554
|.|||||.|||||..|.||||||||.||.|||||||||||.|||||.||.||.|||||||||||||||||.|||
Sbjct 1184 AGTGTGGAGCATGCCTGCGAGTGTTGGAGGGCCATGAGGAGTTGGTACGCTGCATTCGATTTGATAACAAAAGG 1257
Query 1555 ATAGTCAGTGGGGCCTATGATGGAAAAATTAAAGTGTGGGATCTTGTGGCTGCTTTGGACCCCCGTGCTCCTGC 1628
|||||.||.||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||.||||||||||||||||.||||||||.||
Sbjct 1258 ATAGTGAGCGGAGCCTATGATGGGAAAATTAAAGTGTGGGATCTTATGGCTGCTTTGGACCCGCGTGCTCCAGC 1331
Query 1629 AGGGACACTCTGTCTACGGACCCTTGTGGAGCATTCCGGAAGAGTTTTTCGACTACAGTTTGATGAATTCCAGA 1702
||||||.||||||||.|||||.||||||||||||||.|||||||||||.||.||.|||||||||||||||||||
Sbjct 1332 AGGGACTCTCTGTCTGCGGACACTTGTGGAGCATTCTGGAAGAGTTTTCCGCCTCCAGTTTGATGAATTCCAGA 1405
Query 1703 TTGTCAGTAGTTCACATGATGACACAATCCTCATCTGGGACTTCCTAAATGATCCAGCTGCCCAAGCTGAACCC 1776
||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||.||.||||||||.
Sbjct 1406 TTGTCAGTAGTTCACATGATGACACAATTCTCATCTGGGACTTCCTGAATGATCCAGCTGCTCACGCTGAACCG 1479
Query 1777 CCCCGTTCCCCTTCTCGAACATACACCTACATCTCCAGA 1815
|||||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||
Sbjct 1480 CCCCGCTCCCCTTCTCGGACATACACCTACATCTCCAGA 1518