Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000469234
• Subject: XM_017016872.1
• Aligned Length: 1815
• Identities: 1761
• Gaps: 54

Alignment

Query    1  ATGGACCCGGCCGAGGCGGTGCTGCAAGAGAAGGCACTCAAGTTTATGTGCTCTATGCCCAGGTCTCTGTGGCT  74
                                                                  ||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ------------------------------------------------------ATGCCCAGGTCTCTGTGGCT  20

Query   75  GGGCTGCTCCAGCCTGGCGGACAGCATGCCTTCGCTGCGATGCCTGTATAACCCAGGGACTGGCGCACTCACAG  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   21  GGGCTGCTCCAGCCTGGCGGACAGCATGCCTTCGCTGCGATGCCTGTATAACCCAGGGACTGGCGCACTCACAG  94

Query  149  CTTTCCAGAATTCCTCAGAGAGAGAAGACTGTAATAATGGCGAACCCCCTAGGAAGATAATACCAGAGAAGAAT  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   95  CTTTCCAGAATTCCTCAGAGAGAGAAGACTGTAATAATGGCGAACCCCCTAGGAAGATAATACCAGAGAAGAAT  168

Query  223  TCACTTAGACAGACATACAACAGCTGTGCCAGACTCTGCTTAAACCAAGAAACAGTATGTTTAGCAAGCACTGC  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  169  TCACTTAGACAGACATACAACAGCTGTGCCAGACTCTGCTTAAACCAAGAAACAGTATGTTTAGCAAGCACTGC  242

Query  297  TATGAAGACTGAGAATTGTGTGGCCAAAACAAAACTTGCCAATGGCACTTCCAGTATGATTGTGCCCAAGCAAC  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  243  TATGAAGACTGAGAATTGTGTGGCCAAAACAAAACTTGCCAATGGCACTTCCAGTATGATTGTGCCCAAGCAAC  316

Query  371  GGAAACTCTCAGCAAGCTATGAAAAGGAAAAGGAACTGTGTGTCAAATACTTTGAGCAGTGGTCAGAGTCAGAT  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  317  GGAAACTCTCAGCAAGCTATGAAAAGGAAAAGGAACTGTGTGTCAAATACTTTGAGCAGTGGTCAGAGTCAGAT  390

Query  445  CAAGTGGAATTTGTGGAACATCTTATATCCCAAATGTGTCATTACCAACATGGGCACATAAACTCGTATCTTAA  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  391  CAAGTGGAATTTGTGGAACATCTTATATCCCAAATGTGTCATTACCAACATGGGCACATAAACTCGTATCTTAA  464

Query  519  ACCTATGTTGCAGAGAGATTTCATAACTGCTCTGCCAGCTCGGGGATTGGATCATATTGCTGAGAACATTCTGT  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  465  ACCTATGTTGCAGAGAGATTTCATAACTGCTCTGCCAGCTCGGGGATTGGATCATATTGCTGAGAACATTCTGT  538

Query  593  CATACCTGGATGCCAAATCACTATGTGCTGCTGAACTTGTGTGCAAGGAATGGTACCGAGTGACCTCTGATGGC  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  539  CATACCTGGATGCCAAATCACTATGTGCTGCTGAACTTGTGTGCAAGGAATGGTACCGAGTGACCTCTGATGGC  612

Query  667  ATGCTGTGGAAGAAGCTTATCGAGAGAATGGTCAGGACAGATTCTCTGTGGAGAGGCCTGGCAGAACGAAGAGG  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  613  ATGCTGTGGAAGAAGCTTATCGAGAGAATGGTCAGGACAGATTCTCTGTGGAGAGGCCTGGCAGAACGAAGAGG  686

Query  741  ATGGGGACAGTATTTATTCAAAAACAAACCTCCTGACGGGAATGCTCCTCCCAACTCTTTTTATAGAGCACTTT  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  687  ATGGGGACAGTATTTATTCAAAAACAAACCTCCTGACGGGAATGCTCCTCCCAACTCTTTTTATAGAGCACTTT  760

Query  815  ATCCTAAAATTATACAAGACATTGAGACAATAGAATCTAATTGGAGATGTGGAAGACATAGTTTACAGAGAATT  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  761  ATCCTAAAATTATACAAGACATTGAGACAATAGAATCTAATTGGAGATGTGGAAGACATAGTTTACAGAGAATT  834

Query  889  CACTGCCGAAGTGAAACAAGCAAAGGAGTTTACTGTTTACAGTATGATGATCAGAAAATAGTAAGCGGCCTTCG  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  835  CACTGCCGAAGTGAAACAAGCAAAGGAGTTTACTGTTTACAGTATGATGATCAGAAAATAGTAAGCGGCCTTCG  908

Query  963  AGACAACACAATCAAGATCTGGGATAAAAACACATTGGAATGCAAGCGAATTCTCACAGGCCATACAGGTTCAG  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  909  AGACAACACAATCAAGATCTGGGATAAAAACACATTGGAATGCAAGCGAATTCTCACAGGCCATACAGGTTCAG  982

Query 1037  TCCTCTGTCTCCAGTATGATGAGAGAGTGATCATAACAGGATCATCGGATTCCACGGTCAGAGTGTGGGATGTA  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  983  TCCTCTGTCTCCAGTATGATGAGAGAGTGATCATAACAGGATCATCGGATTCCACGGTCAGAGTGTGGGATGTA  1056

Query 1111  AATACAGGTGAAATGCTAAACACGTTGATTCACCATTGTGAAGCAGTTCTGCACTTGCGTTTCAATAATGGCAT  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1057  AATACAGGTGAAATGCTAAACACGTTGATTCACCATTGTGAAGCAGTTCTGCACTTGCGTTTCAATAATGGCAT  1130

Query 1185  GATGGTGACCTGCTCCAAAGATCGTTCCATTGCTGTATGGGATATGGCCTCCCCAACTGACATTACCCTCCGGA  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1131  GATGGTGACCTGCTCCAAAGATCGTTCCATTGCTGTATGGGATATGGCCTCCCCAACTGACATTACCCTCCGGA  1204

Query 1259  GGGTGCTGGTCGGACACCGAGCTGCTGTCAATGTTGTAGACTTTGATGACAAGTACATTGTTTCTGCATCTGGG  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1205  GGGTGCTGGTCGGACACCGAGCTGCTGTCAATGTTGTAGACTTTGATGACAAGTACATTGTTTCTGCATCTGGG  1278

Query 1333  GATAGAACTATAAAGGTATGGAACACAAGTACTTGTGAATTTGTAAGGACCTTAAATGGACACAAACGAGGCAT  1406
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1279  GATAGAACTATAAAGGTATGGAACACAAGTACTTGTGAATTTGTAAGGACCTTAAATGGACACAAACGAGGCAT  1352

Query 1407  TGCCTGTTTGCAGTACAGGGACAGGCTGGTAGTGAGTGGCTCATCTGACAACACTATCAGATTATGGGACATAG  1480
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1353  TGCCTGTTTGCAGTACAGGGACAGGCTGGTAGTGAGTGGCTCATCTGACAACACTATCAGATTATGGGACATAG  1426

Query 1481  AATGTGGTGCATGTTTACGAGTGTTAGAAGGCCATGAGGAATTGGTGCGTTGTATTCGATTTGATAACAAGAGG  1554
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1427  AATGTGGTGCATGTTTACGAGTGTTAGAAGGCCATGAGGAATTGGTGCGTTGTATTCGATTTGATAACAAGAGG  1500

Query 1555  ATAGTCAGTGGGGCCTATGATGGAAAAATTAAAGTGTGGGATCTTGTGGCTGCTTTGGACCCCCGTGCTCCTGC  1628
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1501  ATAGTCAGTGGGGCCTATGATGGAAAAATTAAAGTGTGGGATCTTGTGGCTGCTTTGGACCCCCGTGCTCCTGC  1574

Query 1629  AGGGACACTCTGTCTACGGACCCTTGTGGAGCATTCCGGAAGAGTTTTTCGACTACAGTTTGATGAATTCCAGA  1702
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1575  AGGGACACTCTGTCTACGGACCCTTGTGGAGCATTCCGGAAGAGTTTTTCGACTACAGTTTGATGAATTCCAGA  1648

Query 1703  TTGTCAGTAGTTCACATGATGACACAATCCTCATCTGGGACTTCCTAAATGATCCAGCTGCCCAAGCTGAACCC  1776
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1649  TTGTCAGTAGTTCACATGATGACACAATCCTCATCTGGGACTTCCTAAATGATCCAGCTGCCCAAGCTGAACCC  1722

Query 1777  CCCCGTTCCCCTTCTCGAACATACACCTACATCTCCAGA  1815
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1723  CCCCGTTCCCCTTCTCGAACATACACCTACATCTCCAGA  1761