Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000469234
• Subject: XM_024448246.1
• Aligned Length: 1815
• Identities: 1518
• Gaps: 297

Alignment

Query    1  ATGGACCCGGCCGAGGCGGTGCTGCAAGAGAAGGCACTCAAGTTTATGTGCTCTATGCCCAGGTCTCTGTGGCT  74
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query   75  GGGCTGCTCCAGCCTGGCGGACAGCATGCCTTCGCTGCGATGCCTGTATAACCCAGGGACTGGCGCACTCACAG  148
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  149  CTTTCCAGAATTCCTCAGAGAGAGAAGACTGTAATAATGGCGAACCCCCTAGGAAGATAATACCAGAGAAGAAT  222
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  223  TCACTTAGACAGACATACAACAGCTGTGCCAGACTCTGCTTAAACCAAGAAACAGTATGTTTAGCAAGCACTGC  296
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  297  TATGAAGACTGAGAATTGTGTGGCCAAAACAAAACTTGCCAATGGCACTTCCAGTATGATTGTGCCCAAGCAAC  370
             |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  -ATGAAGACTGAGAATTGTGTGGCCAAAACAAAACTTGCCAATGGCACTTCCAGTATGATTGTGCCCAAGCAAC  73

Query  371  GGAAACTCTCAGCAAGCTATGAAAAGGAAAAGGAACTGTGTGTCAAATACTTTGAGCAGTGGTCAGAGTCAGAT  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   74  GGAAACTCTCAGCAAGCTATGAAAAGGAAAAGGAACTGTGTGTCAAATACTTTGAGCAGTGGTCAGAGTCAGAT  147

Query  445  CAAGTGGAATTTGTGGAACATCTTATATCCCAAATGTGTCATTACCAACATGGGCACATAAACTCGTATCTTAA  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  148  CAAGTGGAATTTGTGGAACATCTTATATCCCAAATGTGTCATTACCAACATGGGCACATAAACTCGTATCTTAA  221

Query  519  ACCTATGTTGCAGAGAGATTTCATAACTGCTCTGCCAGCTCGGGGATTGGATCATATTGCTGAGAACATTCTGT  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  222  ACCTATGTTGCAGAGAGATTTCATAACTGCTCTGCCAGCTCGGGGATTGGATCATATTGCTGAGAACATTCTGT  295

Query  593  CATACCTGGATGCCAAATCACTATGTGCTGCTGAACTTGTGTGCAAGGAATGGTACCGAGTGACCTCTGATGGC  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  296  CATACCTGGATGCCAAATCACTATGTGCTGCTGAACTTGTGTGCAAGGAATGGTACCGAGTGACCTCTGATGGC  369

Query  667  ATGCTGTGGAAGAAGCTTATCGAGAGAATGGTCAGGACAGATTCTCTGTGGAGAGGCCTGGCAGAACGAAGAGG  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  370  ATGCTGTGGAAGAAGCTTATCGAGAGAATGGTCAGGACAGATTCTCTGTGGAGAGGCCTGGCAGAACGAAGAGG  443

Query  741  ATGGGGACAGTATTTATTCAAAAACAAACCTCCTGACGGGAATGCTCCTCCCAACTCTTTTTATAGAGCACTTT  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  444  ATGGGGACAGTATTTATTCAAAAACAAACCTCCTGACGGGAATGCTCCTCCCAACTCTTTTTATAGAGCACTTT  517

Query  815  ATCCTAAAATTATACAAGACATTGAGACAATAGAATCTAATTGGAGATGTGGAAGACATAGTTTACAGAGAATT  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  518  ATCCTAAAATTATACAAGACATTGAGACAATAGAATCTAATTGGAGATGTGGAAGACATAGTTTACAGAGAATT  591

Query  889  CACTGCCGAAGTGAAACAAGCAAAGGAGTTTACTGTTTACAGTATGATGATCAGAAAATAGTAAGCGGCCTTCG  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  592  CACTGCCGAAGTGAAACAAGCAAAGGAGTTTACTGTTTACAGTATGATGATCAGAAAATAGTAAGCGGCCTTCG  665

Query  963  AGACAACACAATCAAGATCTGGGATAAAAACACATTGGAATGCAAGCGAATTCTCACAGGCCATACAGGTTCAG  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  666  AGACAACACAATCAAGATCTGGGATAAAAACACATTGGAATGCAAGCGAATTCTCACAGGCCATACAGGTTCAG  739

Query 1037  TCCTCTGTCTCCAGTATGATGAGAGAGTGATCATAACAGGATCATCGGATTCCACGGTCAGAGTGTGGGATGTA  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  740  TCCTCTGTCTCCAGTATGATGAGAGAGTGATCATAACAGGATCATCGGATTCCACGGTCAGAGTGTGGGATGTA  813

Query 1111  AATACAGGTGAAATGCTAAACACGTTGATTCACCATTGTGAAGCAGTTCTGCACTTGCGTTTCAATAATGGCAT  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  814  AATACAGGTGAAATGCTAAACACGTTGATTCACCATTGTGAAGCAGTTCTGCACTTGCGTTTCAATAATGGCAT  887

Query 1185  GATGGTGACCTGCTCCAAAGATCGTTCCATTGCTGTATGGGATATGGCCTCCCCAACTGACATTACCCTCCGGA  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  888  GATGGTGACCTGCTCCAAAGATCGTTCCATTGCTGTATGGGATATGGCCTCCCCAACTGACATTACCCTCCGGA  961

Query 1259  GGGTGCTGGTCGGACACCGAGCTGCTGTCAATGTTGTAGACTTTGATGACAAGTACATTGTTTCTGCATCTGGG  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  962  GGGTGCTGGTCGGACACCGAGCTGCTGTCAATGTTGTAGACTTTGATGACAAGTACATTGTTTCTGCATCTGGG  1035

Query 1333  GATAGAACTATAAAGGTATGGAACACAAGTACTTGTGAATTTGTAAGGACCTTAAATGGACACAAACGAGGCAT  1406
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1036  GATAGAACTATAAAGGTATGGAACACAAGTACTTGTGAATTTGTAAGGACCTTAAATGGACACAAACGAGGCAT  1109

Query 1407  TGCCTGTTTGCAGTACAGGGACAGGCTGGTAGTGAGTGGCTCATCTGACAACACTATCAGATTATGGGACATAG  1480
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1110  TGCCTGTTTGCAGTACAGGGACAGGCTGGTAGTGAGTGGCTCATCTGACAACACTATCAGATTATGGGACATAG  1183

Query 1481  AATGTGGTGCATGTTTACGAGTGTTAGAAGGCCATGAGGAATTGGTGCGTTGTATTCGATTTGATAACAAGAGG  1554
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1184  AATGTGGTGCATGTTTACGAGTGTTAGAAGGCCATGAGGAATTGGTGCGTTGTATTCGATTTGATAACAAGAGG  1257

Query 1555  ATAGTCAGTGGGGCCTATGATGGAAAAATTAAAGTGTGGGATCTTGTGGCTGCTTTGGACCCCCGTGCTCCTGC  1628
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1258  ATAGTCAGTGGGGCCTATGATGGAAAAATTAAAGTGTGGGATCTTGTGGCTGCTTTGGACCCCCGTGCTCCTGC  1331

Query 1629  AGGGACACTCTGTCTACGGACCCTTGTGGAGCATTCCGGAAGAGTTTTTCGACTACAGTTTGATGAATTCCAGA  1702
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1332  AGGGACACTCTGTCTACGGACCCTTGTGGAGCATTCCGGAAGAGTTTTTCGACTACAGTTTGATGAATTCCAGA  1405

Query 1703  TTGTCAGTAGTTCACATGATGACACAATCCTCATCTGGGACTTCCTAAATGATCCAGCTGCCCAAGCTGAACCC  1776
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1406  TTGTCAGTAGTTCACATGATGACACAATCCTCATCTGGGACTTCCTAAATGATCCAGCTGCCCAAGCTGAACCC  1479

Query 1777  CCCCGTTCCCCTTCTCGAACATACACCTACATCTCCAGA  1815
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1480  CCCCGTTCCCCTTCTCGAACATACACCTACATCTCCAGA  1518