Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000469337
- Subject:
- NM_001207034.1
- Aligned Length:
- 3003
- Identities:
- 2703
- Gaps:
- 300
Alignment
Query 1 ATGTCTGGGCCAGGCAACAAACGCGCCGCCGGCGACGGGGGCTCAGGGCCCCCGGAAAAGAAGCTGAGTCGTGA 74
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGTCTGGGCCAGGCAACAAACGCGCCGCCGGCGACGGGGGCTCAGGGCCCCCGGAAAAGAAGCTGAGTCGTGA 74
Query 75 GGAGAAGACCACCACGACTCTTATCGAGCCCATTCGTCTTGGAGGCATCTCTTCCACGGAGGAGATGGACCTGA 148
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 GGAGAAGACCACCACGACTCTTATCGAGCCCATTCGTCTTGGAGGCATCTCTTCCACGGAGGAGATGGACCTGA 148
Query 149 AGGTACTACAGTTCAAGAACAAGAAACTGGCAGAGCGGCTGGAACAACGGCAGGCTTGTGAAGATGAACTCCGA 222
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149 AGGTACTACAGTTCAAGAACAAGAAACTGGCAGAGCGGCTGGAACAACGGCAGGCTTGTGAAGATGAACTCCGA 222
Query 223 GAACGAATTGAGAAGTTGGAGAAGCGGCAGGCCACAGATGATGCCACACTCCTCATCGTCAATCGCTACTGGGC 296
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 GAACGAATTGAGAAGTTGGAGAAGCGGCAGGCCACAGATGATGCCACACTCCTCATCGTCAATCGCTACTGGGC 296
Query 297 CCAGCTGGATGAAACTGTGGAAGCCCTTCTCCGATGCCATGAGAGCCAGGGGGAGCTGTCTTCAGCGCCTGAGG 370
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 CCAGCTGGATGAAACTGTGGAAGCCCTTCTCCGATGCCATGAGAGCCAGGGGGAGCTGTCTTCAGCGCCTGAGG 370
Query 371 CACCTGGGACCCAGGAGGGGCCAACATGTGATGGGACTCCTCTCCCAGAGCCGGGGACATCAGAGCTGAGAGAC 444
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371 CACCTGGGACCCAGGAGGGGCCAACATGTGATGGGACTCCTCTCCCAGAGCCGGGGACATCAGAGCTGAGAGAC 444
Query 445 CCCTTGCTGATGCAGCTGCGGCCCCCTCTCAGTGAGCCGGCCTTGGCTTTTGTGGTGGCACTGGGTGCCAGCAG 518
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 CCCTTGCTGATGCAGCTGCGGCCCCCTCTCAGTGAGCCGGCCTTGGCTTTTGTGGTGGCACTGGGTGCCAGCAG 518
Query 519 CAGTGAGGAGGTGGAGCTGGAGCTGCAAGGCCGAATGGAGTTCTCCAAGGCAGCTGTGTCTCGTGTGGTAGAGG 592
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519 CAGTGAGGAGGTGGAGCTGGAGCTGCAAGGCCGAATGGAGTTCTCCAAGGCAGCTGTGTCTCGTGTGGTAGAGG 592
Query 593 CCTCAGACCGCCTACAGCGCCGGGTGGAGGAACTCTGTCAGCGAGTGTACAGCCGAGGGGACAGTGAGCCCCTC 666
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593 CCTCAGACCGCCTACAGCGCCGGGTGGAGGAACTCTGTCAGCGAGTGTACAGCCGAGGGGACAGTGAGCCCCTC 666
Query 667 AGTGAGGCGGCTCAGGCACACACCCGAGAGCTGGGCCGTGAGAACCGGCGACTGCAGGACTTGGCCACTCAGCT 740
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667 AGTGAGGCGGCTCAGGCACACACCCGAGAGCTGGGCCGTGAGAACCGGCGACTGCAGGACTTGGCCACTCAGCT 740
Query 741 GCAGGAGAAACACCACCGCATCTCATTGGAGTACTCCGAGCTCCAGGATAAAGTGACATCGGCAGAGACCAAGG 814
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741 GCAGGAGAAACACCACCGCATCTCATTGGAGTACTCCGAGCTCCAGGATAAAGTGACATCGGCAGAGACCAAGG 814
Query 815 TGCTGGAGATGGAGACAACAGTGGAGGACTTGCAGTGGGACATCGAGAAGCTGCGGAAGCGAGAGCAAAAGCTC 888
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 815 TGCTGGAGATGGAGACAACAGTGGAGGACTTGCAGTGGGACATCGAGAAGCTGCGGAAGCGAGAGCAAAAGCTC 888
Query 889 AATAAGCACCTGGCAGAGGCCTTAGAGCAGCTTAACTCTGGCTACTATGTATCTGGGAGCTCCTCAGGCTTCCA 962
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 889 AATAAGCACCTGGCAGAGGCCTTAGAGCAGCTTAACTCTGGCTACTATGTATCTGGGAGCTCCTCAGGCTTCCA 962
Query 963 GGGGGGCCAGATCACACTCAGCATGCAGAAGTTTGAGATGCTGAATGCAGAGTTAGAGGAAAACCAGGAACTGG 1036
|||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 963 GGGGGGCCAGATCACACTCAGCATGCAGA--------------------------------------------- 991
Query 1037 CCAACAGCCGTATGGCAGAGCTGGAGAAACTGCAGGCCGAACTTCAGGGGGCTGTGCGGACCAATGAGCGCCTC 1110
Sbjct 992 -------------------------------------------------------------------------- 991
Query 1111 AAGGTGGCCCTGCGGAGCCTTCCTGAGGAGGTAGTGCGGGAGACGGGGGAGTACCGCATGCTGCAGGCCCAATT 1184
Sbjct 992 -------------------------------------------------------------------------- 991
Query 1185 CTCACTGCTCTACAACGAGTCTCTGCAAGTGAAGACCCAGCTAGACGAGGCTCGGGGCCTGCTGCTGGCCACAA 1258
Sbjct 992 -------------------------------------------------------------------------- 991
Query 1259 AGAACTCCCACCTGCGACACATCGAGCACATGGAGAGCGACGAGCTGGGGCTGCAGAAGAAGCTACGCACAGAG 1332
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 992 ---------------------------------AGAGCGACGAGCTGGGGCTGCAGAAGAAGCTACGCACAGAG 1032
Query 1333 GTCATTCAGCTGGAGGACACGCTGGCCCAGGTACGCAAGGAGTATGAGATGCTGCGCATCGAGTTTGAGCAGAA 1406
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1033 GTCATTCAGCTGGAGGACACGCTGGCCCAGGTACGCAAGGAGTATGAGATGCTGCGCATCGAGTTTGAGCAGAA 1106
Query 1407 TCTGGCGGCCAACGAGCAGGCGGGGCCCATCAACCGTGAGATGCGCCACCTGATTAGTAGTCTTCAAAACCACA 1480
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1107 TCTGGCGGCCAACGAGCAGGCGGGGCCCATCAACCGTGAGATGCGCCACCTGATTAGTAGTCTTCAAAACCACA 1180
Query 1481 ACCACCAGCTAAAAGGGGACGCCCAGCGATACAAGCGGAAGCTTCGAGAAGTACAAGCTGAGATTGGCAAGCTC 1554
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1181 ACCACCAGCTAAAAGGGGACGCCCAGCGATACAAGCGGAAGCTTCGAGAAGTACAAGCTGAGATTGGCAAGCTC 1254
Query 1555 CGGGCCCAGGCCAGTGGCTCTGCCCACTCCACCCCCAACCTGGGCCACCCAGAGGATTCTGGCGTCAGTGCCCC 1628
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1255 CGGGCCCAGGCCAGTGGCTCTGCCCACTCCACCCCCAACCTGGGCCACCCAGAGGATTCTGGCGTCAGTGCCCC 1328
Query 1629 AGCCCCAGGGAAAGAGGAGGGTGGGCCAGGCCCTGTCAGTACCCCCGACAACAGAAAGGAGATGGCTCCAGTGC 1702
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1329 AGCCCCAGGGAAAGAGGAGGGTGGGCCAGGCCCTGTCAGTACCCCCGACAACAGAAAGGAGATGGCTCCAGTGC 1402
Query 1703 CTGGCACCACCACTACTACCACTTCAGTGAAGAAGGAGGAGCTGGTCCCCTCTGAAGAGGACTTCCAGGGTATA 1776
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1403 CTGGCACCACCACTACTACCACTTCAGTGAAGAAGGAGGAGCTGGTCCCCTCTGAAGAGGACTTCCAGGGTATA 1476
Query 1777 ACCCCTGGGGCCCAGGGCCCTTCCTCCCGGGGCCGAGAACCTGAGGCCAGGCCCAAGCGGGAGCTTCGGGAACG 1850
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1477 ACCCCTGGGGCCCAGGGCCCTTCCTCCCGGGGCCGAGAACCTGAGGCCAGGCCCAAGCGGGAGCTTCGGGAACG 1550
Query 1851 GGAAGGTCCCAGCCTAGGACCTCCACCTGTAGCCTCCGCTCTCTCAAGGGCTGATCGGGAGAAGGCCAAGGTGG 1924
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1551 GGAAGGTCCCAGCCTAGGACCTCCACCTGTAGCCTCCGCTCTCTCAAGGGCTGATCGGGAGAAGGCCAAGGTGG 1624
Query 1925 AAGAAACCAAGCGGAAGGAATCAGAACTCCTCAAGGGTCTCCGAGCAGAGCTCAAGAAGGCCCAGGAGAGCCAG 1998
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1625 AAGAAACCAAGCGGAAGGAATCAGAACTCCTCAAGGGTCTCCGAGCAGAGCTCAAGAAGGCCCAGGAGAGCCAG 1698
Query 1999 AAGGAGATGAAACTGCTGCTGGATATGTACAAGTCAGCGCCCAAGGAGCAGCGGGATAAGGTGCAGCTCATGGC 2072
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1699 AAGGAGATGAAACTGCTGCTGGATATGTACAAGTCAGCGCCCAAGGAGCAGCGGGATAAGGTGCAGCTCATGGC 1772
Query 2073 AGCGGAACGCAAGGCTAAGGCCGAGGTTGATGAGCTGCGGAGCCGCATCCGGGAATTGGAGGAGAGGGATCGAA 2146
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1773 AGCGGAACGCAAGGCTAAGGCCGAGGTTGATGAGCTGCGGAGCCGCATCCGGGAATTGGAGGAGAGGGATCGAA 1846
Query 2147 GGGAGAGCAAGAAGATCGCGGATGAGGATGCCCTGCGGCGCATTCGGCAGGCAGAGGAGCAGATAGAACACCTG 2220
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1847 GGGAGAGCAAGAAGATCGCGGATGAGGATGCCCTGCGGCGCATTCGGCAGGCAGAGGAGCAGATAGAACACCTG 1920
Query 2221 CAGCGCAAGCTGGGTGCCACCAAGCAGGAGGAGGAGGCTCTGCTCTCAGAGATGGATGTGACAGGTCAGGCTTT 2294
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1921 CAGCGCAAGCTGGGTGCCACCAAGCAGGAGGAGGAGGCTCTGCTCTCAGAGATGGATGTGACAGGTCAGGCTTT 1994
Query 2295 TGAGGACATGCAGGAACAGAACGGGCGGCTGCTACAGCAGTTGCGGGAAAAGGATGATGCCAACTTTAAGCTAA 2368
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1995 TGAGGACATGCAGGAACAGAACGGGCGGCTGCTACAGCAGTTGCGGGAAAAGGATGATGCCAACTTTAAGCTAA 2068
Query 2369 TGTCAGAGCGGATCAAGGCCAACCAGATTCACAAGCTGCTGCGGGAGGAGAAGGATGAGTTGGGCGAGCAGGTC 2442
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2069 TGTCAGAGCGGATCAAGGCCAACCAGATTCACAAGCTGCTGCGGGAGGAGAAGGATGAGTTGGGCGAGCAGGTC 2142
Query 2443 CTTGGCCTCAAGTCCCAGGTGGATGCCCAGCTGCTGACTGTGCAGAAGCTGGAGGAGAAGGAGCGAGCCTTGCA 2516
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2143 CTTGGCCTCAAGTCCCAGGTGGATGCCCAGCTGCTGACTGTGCAGAAGCTGGAGGAGAAGGAGCGAGCCTTGCA 2216
Query 2517 GGGCAGCCTCGGGGGTGTGGAGAAGGAGCTGACGCTGCGCAGCCAAGCCCTGGAGCTCAACAAGCGGAAGGCTG 2590
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2217 GGGCAGCCTCGGGGGTGTGGAGAAGGAGCTGACGCTGCGCAGCCAAGCCCTGGAGCTCAACAAGCGGAAGGCTG 2290
Query 2591 TAGAAGCCGCCCAGCTGGCCGAGGACCTGAAGGTGCAGCTGGAGCACGTGCAGACTCGGCTGCGGGAGATCCAG 2664
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2291 TAGAAGCCGCCCAGCTGGCCGAGGACCTGAAGGTGCAGCTGGAGCACGTGCAGACTCGGCTGCGGGAGATCCAG 2364
Query 2665 CCCTGCCTGGCAGAGAGCCGGGCTGCTCGTGAGAAAGAGAGCTTCAACCTCAAGAGGGCTCAGGAGGACATCTC 2738
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2365 CCCTGCCTGGCAGAGAGCCGGGCTGCTCGTGAGAAAGAGAGCTTCAACCTCAAGAGGGCTCAGGAGGACATCTC 2438
Query 2739 ACGGCTGCGGCGCAAGCTGGAAAAGCAGAGGAAGGTGGAGGTCTACGCAGATGCCGACGAAATCCTCCAGGAGG 2812
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2439 ACGGCTGCGGCGCAAGCTGGAAAAGCAGAGGAAGGTGGAGGTCTACGCAGATGCCGACGAAATCCTCCAGGAGG 2512
Query 2813 AGATCAAGGAGTACAAGGCGCGGTTGACCTGCCCCTGCTGTAACACCCGCAAGAAGGATGCAGTCCTTACCAAG 2886
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2513 AGATCAAGGAGTACAAGGCGCGGTTGACCTGCCCCTGCTGTAACACCCGCAAGAAGGATGCAGTCCTTACCAAG 2586
Query 2887 TGCTTCCACGTTTTCTGCTTCGAGTGCGTGCGGGGCCGCTATGAGGCCCGCCAGAGGAAGTGCCCCAAGTGCAA 2960
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2587 TGCTTCCACGTTTTCTGCTTCGAGTGCGTGCGGGGCCGCTATGAGGCCCGCCAGAGGAAGTGCCCCAAGTGCAA 2660
Query 2961 CGCGGCCTTTGGTGCCCACGACTTCCATCGTATCTACATCAGC 3003
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2661 CGCGGCCTTTGGTGCCCACGACTTCCATCGTATCTACATCAGC 2703