Nucleotide Global Alignment

Description

Query:
TRCN0000469407
Subject:
XM_005263557.4
Aligned Length:
644
Identities:
554
Gaps:
76

Alignment

Query   1  ATGGCAAAGCAACCTTCTGATGTAAGTTCTGAGTGTGACCGAGAAGGTAGACAATTGCAGCCTGCGGAGAGGCC  74
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   1  ATGGCAAAGCAACCTTCTGATGTAAGTTCTGAGTGTGACCGAGAAGGTAGACAATTGCAGCCTGCGGAGAGGCC  74

Query  75  TCCCCAGCTCAGACCTGGGGCCCCTACCTCCCTACAGACAGAGCCACAAGGTAATCCTGAAGGCAATCACGGAG  148
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  75  TCCCCAGCTCAGACCTGGGGCCCCTACCTCCCTACAGACAGAGCCACAAGGTAATCCTGAAGGCAATCACGGAG  148

Query 149  GTGAAGGGGACAGCTGCCCCCACGGCAGCCCTCAGGGCCCGCTGGCCCCACCTGCCAGCCCTGGCCCTTTTGCT  222
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149  GTGAAGGGGACAGCTGCCCCCACGGCAGCCCTCAGGGCCCGCTGGCCCCACCTGCCAGCCCTGGCCCTTTTGCT  222

Query 223  ACCAGATCCCCGCTTTTCATCTTTATGAGAAGATCCTCCCTGCTGTCTCGATCCTCCAGTGGGTATTTCTCTTT  296
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223  ACCAGATCCCCGCTTTTCATCTTTATGAGAAGATCCTCCCTGCTGTCTCGATCCTCCAGTGGGTATTTCTCTTT  296

Query 297  TGACACAGACAGGAGCCCAGCACCCATGAGTTGTGACAAATCAACACAAACCCCAAGTCCTCCTTGCCAGGCCT  370
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297  TGACACAGACAGGAGCCCAGCACCCATGAGTTGTGACAAATCAACACAAACCCCAAGTCCTCCTTGCCAGGCCT  370

Query 371  TCAACCACTATCTCAGTGCAATGGCTTCCATGAGGCAGGCTGAACCTGCAGATATGCGCCCAGAGATATGGATC  444
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371  TCAACCACTATCTCAGTGCAATGGCTTCCATGAGGCAGGCTGAACCTGCAGATATGCGCCCAGAGATATGGATC  444

Query 445  GCCCAAGAGTTGCGGCGTATTGGAGACGAGTTTAACGCTTACTATGCAAGGAGGGT----ATTTTTGAATAATT  514
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||.|||   |..||
Sbjct 445  GCCCAAGAGTTGCGGCGTATTGGAGACGAGTTTAACGCTTACTATGCAAGGAGGGTAATGATGTTT---TCTTT  515

Query 515  ACCAAGCAGCCGAAGAC-----------CACC-----------CACGAATGGTTATCTT------ACGACTGTT  560
           ||       |||    |           ||||           |||.|     |||.||      |.|||.||.
Sbjct 516  AC-------CCG----CTTTTCTGCTCACACCCTCCCCTTCCACACTA-----TATTTTTTTAAAAAGACAGTG  573

Query 561  ACGT--------TACATTGTCCGCCTGGTGTGGAGAATGCAT----------  594
           ||.|        |||||     ||....|.|||| |||| ||          
Sbjct 574  ACTTCTTGTAACTACAT-----GCTAATTCTGGA-AATG-ATTACTGTTGCC  618