Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000469592
• Subject: NM_001252202.1
• Aligned Length: 3661
• Identities: 3120
• Gaps: 201

Alignment

Query    1  ATGGCGAACGACTCCCCTGCAAAAAGTCTGGTGGACATCGACCTCTCCTCCCTGCGGGATCCTGCTGGGATTTT  74
            ||||||||||||||.||.||.||.||.|||||||||||.|||||.||.|||||||||||.||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGCGAACGACTCTCCCGCGAAGAGCCTGGTGGACATTGACCTGTCGTCCCTGCGGGACCCTGCTGGGATTTT  74

Query   75  TGAGCTGGTGGAAGTGGTTGGAAATGGCACCTATGGACAAGTCTATAAGGGTCGACATGTTAAAACGGGTCAGT  148
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.
Sbjct   75  TGAGCTGGTGGAAGTGGTTGGAAATGGCACCTATGGACAAGTCTATAAGGGTCGACATGTTAAAACGGGTCAGC  148

Query  149  TGGCAGCCATCAAAGTTATGGATGTCACTGAGGATGAAGAGGAAGAAATCAAACTGGAGATAAATATGCTAAAG  222
            ||||.||||||||.||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||
Sbjct  149  TGGCCGCCATCAAGGTTATGGACGTCACCGAGGATGAAGAGGAAGAAATCAAACTGGAGATAAATATGCTGAAG  222

Query  223  AAATACTCTCATCACAGAAACATTGCAACATATTATGGTGCTTTCATCAAAAAGAGCCCTCCAGGACATGATGA  296
            ||.||.||||||||..||||.|||||.||.||.||||||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  AAGTATTCTCATCATCGAAATATTGCCACGTACTATGGTGCTTTCATTAAGAAGAGCCCTCCAGGACATGATGA  296

Query  297  CCAACTCTGGCTTGTTATGGAGTTCTGTGGGGCTGGGTCCATTACAGACCTTGTGAAGAACACCAAAGGGAACA  370
            ||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  CCAACTCTGGCTTGTTATGGAGTTTTGTGGGGCTGGGTCCATCACAGACCTTGTGAAGAACACCAAAGGGAACA  370

Query  371  CACTCAAAGAAGACTGGATCGCTTACATCTCCAGAGAAATCCTGAGGGGACTGGCACATCTTCACATTCATCAT  444
            |.|||||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||.||||||.||||||||||.||.|||||.||.
Sbjct  371  CTCTCAAAGAAGACTGGATTGCTTACATCTCCAGGGAAATCCTCAGGGGATTGGCACATCTCCATATTCACCAC  444

Query  445  GTGATTCACCGGGATATCAAGGGCCAGAATGTGTTGCTGACTGAGAATGCAGAGGTGAAACTTGTTGACTTTGG  518
            ||.||||||||.||||||||||||||.||||||.|||||||.||||||||.|||||||||||||||||.|||||
Sbjct  445  GTTATTCACCGAGATATCAAGGGCCAAAATGTGCTGCTGACCGAGAATGCTGAGGTGAAACTTGTTGATTTTGG  518

Query  519  TGTGAGTGCTCAGCTGGACAGGACTGTGGGGCGGAGAAATACGTTCATAGGCACTCCCTACTGGATGGCTCCTG  592
            |||.||.|||||||||||||||||.||.||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.|
Sbjct  519  TGTAAGCGCTCAGCTGGACAGGACGGTTGGACGGAGAAATACGTTCATAGGCACACCCTACTGGATGGCTCCAG  592

Query  593  AGGTCATCGCCTGTGATGAGAACCCAGATGCCACCTATGATTACAGAAGTGATCTTTGGTCTTGTGGCATTACA  666
            ||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||.||.|||||||||||.||.|||||.||||||||.|||
Sbjct  593  AGGTCATCGCCTGTGATGAGAACCCAGACGCCACTTACGACTACAGAAGTGACCTCTGGTCCTGTGGCATCACA  666

Query  667  GCCATTGAGATGGCAGAA-GTGCTCCCCCTCTCTGTGACATGCATCCAATGAGAGCACTGTTTCTCATTCCCAG  739
            |||||.||||||||.||| |.||.||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||
Sbjct  667  GCCATCGAGATGGCTGAAGGGGCCCCCCCTCTCTGTGACATGCATCCAATGAGAGCGCTGTTTCTCATCCCCAG  740

Query  740  AAACCCTCCTCCCCGGCTGAAGTCAAAAAAATGGTCGAAGAAGTTTTTTAGTTTTATAGAAGGGTGCCTGGTGA  813
            |||||||||||||.||||||||||||||||||||||.|||||.|||||.||.|||||||||||.||.|||||||
Sbjct  741  AAACCCTCCTCCCAGGCTGAAGTCAAAAAAATGGTCAAAGAAATTTTTCAGCTTTATAGAAGGCTGTCTGGTGA  814

Query  814  AGAATTACATGCAGCGGCCCTCTACAGAGCAGCTTTTGAAACATCCTTTTATAAGGGATCAGCCAAATGAAAGG  887
            |||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||.|||||.||||||||||||||.|||||||||
Sbjct  815  AGAATTACATGCAGCGGCCCTCTACAGAGCAACTTTTAAAACACCCTTTCATAAGGGATCAGCCCAATGAAAGG  888

Query  888  CAAGTTAGAATCCAGCTTAAGGATCATATAGATCGTACCAGGAAGAAGAGAGGCGAGAAAGATGAAACTGAGTA  961
            ||.|||.|||||||||||||||||||.|||||.||.|||||.|||||||||||||||||||||||.||.|||||
Sbjct  889  CAGGTTCGAATCCAGCTTAAGGATCACATAGACCGGACCAGAAAGAAGAGAGGCGAGAAAGATGAGACGGAGTA  962

Query  962  TGAGTACAGTGGGAGTGAGGAAGAAGAGGAGGAAGTGCCTGAACAGGAAGGAGAGCCAAGTTCCATTGTGAACG  1035
            .||||||||.|||||.|||||.||.|||||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||.||.||.|
Sbjct  963  CGAGTACAGCGGGAGCGAGGAGGAGGAGGAGGAAGTGCCTGAGCAGGAGGGAGAGCCAAGTTCCATCGTCAATG  1036

Query 1036  TGCCTGGTGAGTCTACTCTTCGCCGAGATTTCCTGAGACTGCAGCAGGAGAACAAGGAACGTTCCGAGGCTCTT  1109
            |||||||.|||||.|||||.||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||.||||||||.
Sbjct 1037  TGCCTGGAGAGTCAACTCTGCGACGTGATTTCCTGAGACTGCAGCAGGAGAACAAGGAGCGGTCTGAGGCTCTG  1110

Query 1110  CGGAGACAACAGTTACTACAGGAGCAACAGCTCCGGGAGCAGGAAGAATATAAAAGGCAACTGCTGGCAGAGAG  1183
            ||||||||.|||.|.||.||||||||.|||||||||||||||||.||.|||||.|||||.||||||||.|||||
Sbjct 1111  CGGAGACAGCAGCTTCTGCAGGAGCAGCAGCTCCGGGAGCAGGAGGAGTATAAGAGGCAGCTGCTGGCTGAGAG  1184

Query 1184  ACAGAAGCGGATTGAGCAGCAGAAAGAACAGAGGCGACGGCTAGAAGAGCAACAAAGGAGAGAGCGGGAAGCTA  1257
            .||||||||||||||.||||||||||||||||||.|.|||||.||||||||||||||.|||||.||||||||.|
Sbjct 1185  GCAGAAGCGGATTGAACAGCAGAAAGAACAGAGGAGGCGGCTGGAAGAGCAACAAAGAAGAGAACGGGAAGCCA  1258

Query 1258  GAAGGCAGCAGGAACGTGAACAGCGAAGGAGAGAACAAGAAGAAAAGAGGCGTCTAGAGGAGTTGGAGAGAAGG  1331
            |.|||||||||||.|||||.|||||..||.|.||||||||.||.|||||||||||.|||||..||||.||..||
Sbjct 1259  GGAGGCAGCAGGAGCGTGAGCAGCGGCGGCGTGAACAAGAGGAGAAGAGGCGTCTCGAGGAACTGGAAAGGCGG  1332

Query 1332  CGCAAAGAAGAAGAGGAGAGGAGACGGGCAGAAGAAGAAAAGAGGAGAGTTGAAAGAGAACAGGAGTATATCAG  1405
            ||.||||||||.||.||||||||||||||||||||.||.|||||||||||.||.||.|||||||||||.|||||
Sbjct 1333  CGTAAAGAAGAGGAAGAGAGGAGACGGGCAGAAGAGGAGAAGAGGAGAGTGGAGAGGGAACAGGAGTACATCAG  1406

Query 1406  GCGACAGCTAGAAGAGGAGCAGCGGCACTTGGAAGTCCTTCAGCAGCAGCTGCTCCAGGAGCAGGCCATGTTAC  1479
            |||.||||||||.|||||||||||||||.||||..||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  GCGGCAGCTAGAGGAGGAGCAGCGGCACCTGGAGATCCTGCAGCAGCAGCTGCTCCAGGAGCAGGCCATGTTAC  1480

Query 1480  TGCATGACCATAGGAGGCCGCACCCGCAGCACTCGCAGCAGCCGCCACCACCGCAGCAGGAAAGGAGCAAGCCA  1553
            ||||.|||||.||||||||||||.|.|||||   |||||.||||||.||.|.|||||||||.||||||||.||.
Sbjct 1481  TGCACGACCACAGGAGGCCGCACGCACAGCA---GCAGCCGCCGCCCCCGCAGCAGCAGGACAGGAGCAAACCG  1551

Query 1554  AGCTTCCATGCTCCCGAGCCCAAAGCC-CACTACGAGCCTGCTGACCGAGC-----------------------  1603
            |||||.||||||||.|||||| ||||| |||||.||.|||||||||.||||                       
Sbjct 1552  AGCTTTCATGCTCCAGAGCCC-AAGCCTCACTATGACCCTGCTGACAGAGCTCGGGAGGTGGAAGATAGATTTA  1624

Query 1604  --------------------------------------------------------------------------  1603
                                                                                      
Sbjct 1625  GAAAGACTAACCACAGCTCCCCTGAGGCCCAGGCTAAGCAAACGGGCAGAGGACTGGAGCCACCCGTGCCTTCC  1698

Query 1604  -----------------------------------------------------------------GCGAGAGGT  1612
                                                                             ||.|.||||
Sbjct 1699  CGGTCAGAGTCTTTTTCCAATGGCAACTCCGAGTCTGTGCACCCTGCCCTGCAGAGACCAGCGGAGCCACAGGT  1772

Query 1613  TCCTGTGAGAACAACATCTCGCTCCCCTGTTCTGTCCCGTCGAGATTCCCCACTGCAGGGCAGTGGGCAGCAGA  1686
            |||.||||||||.||.|||||.||||||||.||.||||||||.||||||||||||||||||.||||.|||||||
Sbjct 1773  TCCCGTGAGAACGACCTCTCGTTCCCCTGTCCTCTCCCGTCGGGATTCCCCACTGCAGGGCGGTGGACAGCAGA  1846

Query 1687  ATAGCCAGGCAGGACAGAGAAACTCCACCAGCAGTATTGAGCCCAGGCTTCTGTGGGAGAGAGTGGAGAAGCTG  1760
            |||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||.|||||||.||||||||||||||.||||||
Sbjct 1847  ATAGCCAAGCAGGACAGAGAAATTCCACCAGCAGTATTGAGCCCCGGCTTCTTTGGGAGAGAGTGGAAAAGCTG  1920

Query 1761  GTGCCCAGACCTGGCAGTGGCAGCTCCTCAGGGTCCAGCAACTCAGGATCCCAGCCCGGGTCTCACCCTGGGTC  1834
            ||.|||||.||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||.||.||.||||||||
Sbjct 1921  GTCCCCAGGCCAGGCAGTGGCAGCTCTTCAGGGTCCAGCAACTCAGGATCCCAGCCTGGCTCCCATCCTGGGTC  1994

Query 1835  TCAGAGTGGCTCCGGGGAACGCTTCAGAGTGAGATCATCATCCAAGTCTGAAGGCTCTCCATCTCAGCGCCTGG  1908
            ||||||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|..||||.||
Sbjct 1995  TCAGAGCGGCTCCGGTGAACGCTTCAGAGTGAGATCATCATCCAAGTCTGAAGGTTCTCCATCGCCACGCCAGG  2068

Query 1909  AAAATGCAGTGAAAAAACCTGAAGATAAAAAGGAAGTTTTCAGACCCCTCAAGCCTGCTGGCGAAGTGGATCTG  1982
            |||.|||||..|||||.|||||.|||||.||.|||||.|||.|.||.|||||||||||         |||..||
Sbjct 2069  AAAGTGCAGCCAAAAAGCCTGACGATAAGAAAGAAGTATTCCGGCCTCTCAAGCCTGC---------GGACTTG  2133

Query 1983  ACCGCACTGGCCAAAGAGCTTCGAGCAGTGGAAGATGTACGGCCACCTCACAAAGTAACGGACTACTCCTCATC  2056
            ||.||..|||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||.||.||
Sbjct 2134  ACTGCGTTGGCCAAAGAGCTTCGAGCAGTGGAAGATGTTCGGCCACCTCACAAAGTAACAGACTACTCATCCTC  2207

Query 2057  CAGTGAGGAGTCGGGGACGACGGATGAGGAGGACGACGATGTGGAGCAGGAAGGGGCTGACGAGTCCACCTCAG  2130
            ||||||||||||.|||||.||.|||||||||||.||.||.|||||.|||||.||||||||.||.||.|||||.|
Sbjct 2208  CAGTGAGGAGTCTGGGACCACAGATGAGGAGGAGGAGGACGTGGAACAGGAGGGGGCTGATGATTCTACCTCGG  2281

Query 2131  GACCAGAGGACACCAGAGCAGCGTCATCTCTGAATTTGAGCAATGGTGAAACGGAATCTGTGAAAACCATGATT  2204
            |||||||.||||||||||||||||||||||.|||..|||||||.||||||||.||||||||||||||.|||||.
Sbjct 2282  GACCAGAAGACACCAGAGCAGCGTCATCTCCGAACCTGAGCAACGGTGAAACAGAATCTGTGAAAACAATGATC  2355

Query 2205  GTCCATGATGATGTAGAAAGTGAGCCGGCCATGACCCCATCCAAGGAGGGCACTCTAATCGTCCGCCAGACTCA  2278
            ||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||.||.|||||||||||||||||
Sbjct 2356  GTTCATGATGATGTAGAAAGTGAGCCAGCCATGACCCCGTCCAAGGAGGGCACCCTCATCGTCCGCCAGACTCA  2429

Query 2279  GTCCGCTAGTAGCACACTCCAGAAACACAAATCTTCCTCCTCCTTTACACCTTTTATAGACCCCAGATTACTAC  2352
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||
Sbjct 2430  GTCCGCTAGTAGCACACTCCAGAAACACAAATCTTCCTCCTCCTTTACACCTTTTATAGACCCCAGGTTACTAC  2503

Query 2353  AGATTTCTCCATCTAGCGGAACAACAGTGACATCTGTGGTGGGATTTTCCTGTGATGGGATGAGACCAGAAGCC  2426
            ||||.|||||||||||.||.||.||||||||.||.||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||
Sbjct 2504  AGATCTCTCCATCTAGTGGGACGACAGTGACTTCCGTGGTGGGATTTTCCTGTGATGGGCTGAGACCAGAAGCC  2577

Query 2427  ATAAGGCAAGATCCTACCCGGAAAGGCTCAGTGGTCAATGTGAATCCTACCAACACTAGGCCACAGAGTGACAC  2500
            |||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.||.||.||||||||||||||||||||.||
Sbjct 2578  ATAAGGCAAGATCCTACTCGGAAAGGCTCAGTGGTCAATGTGAACCCCACGAACACTAGGCCACAGAGTGATAC  2651

Query 2501  CCCGGAGATTCGTAAATACAAGAAGAGGTTTAACTCTGAGATTCTGTGTGCTGCCTTATGGGGAGTGAATTTGC  2574
            |||.|||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||.||||
Sbjct 2652  CCCCGAGATTCGTAAATACAAGAAGAGATTTAACTCAGAGATCCTGTGTGCTGCCTTATGGGGAGTGAACTTGC  2725

Query 2575  TAGTGGGTACAGAGAGTGGCCTGATGCTGCTGGACAGAAGTGGCCAAGGGAAGGTCTATCCTCTTATCAACCGA  2648
            |.||.|||||||||||.||.||||||||..||||||||||||||||||||||.||.||.|||||.||||.||||
Sbjct 2726  TGGTTGGTACAGAGAGCGGTCTGATGCTCTTGGACAGAAGTGGCCAAGGGAAAGTATACCCTCTGATCAGCCGA  2799

Query 2649  AGACGATTTCAACAAATGGACGTACTTGAGGGCTTGAATGTCTTGGTGACAATATCTGGCAAAAAGGATAAGTT  2722
            |||||.||.||.||||||||.||.||.||.|||.|.||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2800  AGACGGTTCCAGCAAATGGATGTGCTCGAAGGCCTAAATGTCCTGGTGACAATATCTGGCAAAAAGGATAAGTT  2873

Query 2723  ACGTGTCTACTATTTGTCCTGGTTAAGAAATAAAATACTTCACAATGATCCAGAAGTTGAGAAGAAGCAGGGAT  2796
            |||||||||||||||.||||||.||||||||||.||.|||||.|||||||||||.|||||||||||||||||.|
Sbjct 2874  ACGTGTCTACTATTTATCCTGGCTAAGAAATAAGATTCTTCATAATGATCCAGAGGTTGAGAAGAAGCAGGGGT  2947

Query 2797  GGACAACCGTAGGGGATTTGGAAGGATGTGTACATTATAAAGTTGTAAAATATGAAAGAATCAAATTTCTGGTG  2870
            ||||.||.||.||.||.||||||||.||.||.||.||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||.
Sbjct 2948  GGACCACTGTGGGCGACTTGGAAGGGTGCGTGCACTATAAAGTCGTAAAATATGAAAGAATCAAGTTTCTGGTA  3021

Query 2871  ATTGCTTTGAAGAGTTCTGTGGAAGTCTATGCGTGGGCACCAAAGCCATATCACAAATTTATGGCCTTTAAGTC  2944
            ||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3022  ATTGCTTTGAAGAGTTCTGTGGAAGTCTATGCATGGGCACCGAAGCCATATCACAAATTTATGGCCTTTAAGTC  3095

Query 2945  ATTTGGAGAATTGGTACATAAGCCATTACTGGTGGATCTCACTGTTGAGGAAGGCCAGAGGTTGAAAGTGATCT  3018
            ||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3096  ATTTGGAGAACTGCTACATAAGCCATTACTGGTGGATCTCACTGTGGAGGAAGGCCAGAGGTTGAAAGTGATCT  3169

Query 3019  ATGGATCCTGTGCTGGATTCCATGCTGTTGATGTGGATTCAGGATCAGTCTATGACATTTATCTACCAACACAT  3092
            |||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3170  ATGGATCCTGTGCGGGATTCCATGCTGTTGATGTGGATTCAGGCTCAGTCTATGACATTTATCTACCAACACAT  3243

Query 3093  GTAAGAAAGAACCCACACTCTATGATCCAGTGTAGCATCAAACCCCATGCAATCATCATCCTCCCCAATACAGA  3166
                                    ||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||.||
Sbjct 3244  ------------------------ATTCAGTGTAGCATCAAACCCCATGCAATCATTATCCTCCCCAACACGGA  3293

Query 3167  TGGAATGGAGCTTCTGGTGTGCTATGAAGATGAGGGGGTTTATGTAAACACATATGGAAGGATCACCAAGGATG  3240
            |||.||||||||.|||||||||||.|||||.|||||||||||.||.|||||.||.|||||||||||||||||.|
Sbjct 3294  TGGGATGGAGCTGCTGGTGTGCTACGAAGACGAGGGGGTTTACGTTAACACGTACGGAAGGATCACCAAGGACG  3367

Query 3241  TAGTTCTACAGTGGGGAGAGATGCCTACATCAGTAGCATATATTCGATCCAATCAGACAATGGGCTGGGGAGAG  3314
            |.|||||.|||||||||||||||||.|||||.|||||||||||.||.||.||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3368  TGGTTCTGCAGTGGGGAGAGATGCCGACATCTGTAGCATATATCCGGTCGAATCAGACAATGGGCTGGGGAGAG  3441

Query 3315  AAGGCCATAGAGATCCGATCTGTGGAAACTGGTCACTTGGATGGTGTGTTCATGCACAAAAGGGCTCAAAGACT  3388
            |||||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||.|||||
Sbjct 3442  AAGGCAATAGAGATACGATCTGTGGAAACTGGTCACTTGGATGGTGTATTTATGCACAAAAGGGCTCAGAGACT  3515

Query 3389  AAAATTCTTGTGTGAACGCAATGACAAGGTGTTCTTTGCCTCTGTTCGGTCTGGTGGCAGCAGTCAGGTTTATT  3462
            |||.|||.||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||.||||||||||||||.|||||.||||
Sbjct 3516  AAAGTTCCTGTGTGAACGCAATGACAAGGTGTTCTTTGCCTCCGTCCGCTCTGGTGGCAGCAGCCAGGTCTATT  3589

Query 3463  TCATGACCTTAGGCAGGACTTCTCTTCTGAGCTGG  3497
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3590  TCATGACCTTAGGCAGGACTTCTCTTCTGAGCTGG  3624