Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000469592
• Subject: NM_008696.2
• Aligned Length: 3730
• Identities: 3127
• Gaps: 261

Alignment

Query    1  ATGGCGAACGACTCCCCTGCAAAAAGTCTGGTGGACATCGACCTCTCCTCCCTGCGGGATCCTGCTGGGATTTT  74
            ||||||||||||||.||.||.||.||.|||||||||||.|||||.||.|||||||||||.||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGCGAACGACTCTCCCGCGAAGAGCCTGGTGGACATTGACCTGTCGTCCCTGCGGGACCCTGCTGGGATTTT  74

Query   75  TGAGCTGGTGGAAGTGGTTGGAAATGGCACCTATGGACAAGTCTATAAGGGTCGACATGTTAAAACGGGTCAGT  148
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.
Sbjct   75  TGAGCTGGTGGAAGTGGTTGGAAATGGCACCTATGGACAAGTCTATAAGGGTCGACATGTTAAAACGGGTCAGC  148

Query  149  TGGCAGCCATCAAAGTTATGGATGTCACTGAGGATGAAGAGGAAGAAATCAAACTGGAGATAAATATGCTAAAG  222
            ||||.||||||||.||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||
Sbjct  149  TGGCCGCCATCAAGGTTATGGACGTCACCGAGGATGAAGAGGAAGAAATCAAACTGGAGATAAATATGCTGAAG  222

Query  223  AAATACTCTCATCACAGAAACATTGCAACATATTATGGTGCTTTCATCAAAAAGAGCCCTCCAGGACATGATGA  296
            ||.||.||||||||..||||.|||||.||.||.||||||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  AAGTATTCTCATCATCGAAATATTGCCACGTACTATGGTGCTTTCATTAAGAAGAGCCCTCCAGGACATGATGA  296

Query  297  CCAACTCTGGCTTGTTATGGAGTTCTGTGGGGCTGGGTCCATTACAGACCTTGTGAAGAACACCAAAGGGAACA  370
            ||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  CCAACTCTGGCTTGTTATGGAGTTTTGTGGGGCTGGGTCCATCACAGACCTTGTGAAGAACACCAAAGGGAACA  370

Query  371  CACTCAAAGAAGACTGGATCGCTTACATCTCCAGAGAAATCCTGAGGGGACTGGCACATCTTCACATTCATCAT  444
            |.|||||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||.||||||.||||||||||.||.|||||.||.
Sbjct  371  CTCTCAAAGAAGACTGGATTGCTTACATCTCCAGGGAAATCCTCAGGGGATTGGCACATCTCCATATTCACCAC  444

Query  445  GTGATTCACCGGGATATCAAGGGCCAGAATGTGTTGCTGACTGAGAATGCAGAGGTGAAACTTGTTGACTTTGG  518
            ||.||||||||.||||||||||||||.||||||.|||||||.||||||||.|||||||||||||||||.|||||
Sbjct  445  GTTATTCACCGAGATATCAAGGGCCAAAATGTGCTGCTGACCGAGAATGCTGAGGTGAAACTTGTTGATTTTGG  518

Query  519  TGTGAGTGCTCAGCTGGACAGGACTGTGGGGCGGAGAAATACGTTCATAGGCACTCCCTACTGGATGGCTCCTG  592
            |||.||.|||||||||||||||||.||.||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.|
Sbjct  519  TGTAAGCGCTCAGCTGGACAGGACGGTTGGACGGAGAAATACGTTCATAGGCACACCCTACTGGATGGCTCCAG  592

Query  593  AGGTCATCGCCTGTGATGAGAACCCAGATGCCACCTATGATTACAGAAGTGATCTTTGGTCTTGTGGCATTACA  666
            ||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||.||.|||||||||||.||.|||||.||||||||.|||
Sbjct  593  AGGTCATCGCCTGTGATGAGAACCCAGACGCCACTTACGACTACAGAAGTGACCTCTGGTCCTGTGGCATCACA  666

Query  667  GCCATTGAGATGGCAGAA-GTGCTCCCCCTCTCTGTGACATGCATCCAATGAGAGCACTGTTTCTCATTCCCAG  739
            |||||.||||||||.||| |.||.||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||
Sbjct  667  GCCATCGAGATGGCTGAAGGGGCCCCCCCTCTCTGTGACATGCATCCAATGAGAGCGCTGTTTCTCATCCCCAG  740

Query  740  AAACCCTCCTCCCCGGCTGAAGTCAAAAAAATGGTCGAAGAAGTTTTTTAGTTTTATAGAAGGGTGCCTGGTGA  813
            |||||||||||||.||||||||||||||||||||||.|||||.|||||.||.|||||||||||.||.|||||||
Sbjct  741  AAACCCTCCTCCCAGGCTGAAGTCAAAAAAATGGTCAAAGAAATTTTTCAGCTTTATAGAAGGCTGTCTGGTGA  814

Query  814  AGAATTACATGCAGCGGCCCTCTACAGAGCAGCTTTTGAAACATCCTTTTATAAGGGATCAGCCAAATGAAAGG  887
            |||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||.|||||.||||||||||||||.|||||||||
Sbjct  815  AGAATTACATGCAGCGGCCCTCTACAGAGCAACTTTTAAAACACCCTTTCATAAGGGATCAGCCCAATGAAAGG  888

Query  888  CAAGTTAGAATCCAGCTTAAGGATCATATAGATCGTACCAGGAAGAAGAGAGGCGAGAAAGATGAAACTGAGTA  961
            ||.|||.|||||||||||||||||||.|||||.||.|||||.|||||||||||||||||||||||.||.|||||
Sbjct  889  CAGGTTCGAATCCAGCTTAAGGATCACATAGACCGGACCAGAAAGAAGAGAGGCGAGAAAGATGAGACGGAGTA  962

Query  962  TGAGTACAGTGGGAGTGAGGAAGAAGAGGAGGAAGTGCCTGAACAGGAAGGAGAGCCAAGTTCCATTGTGAACG  1035
            .||||||||.|||||.|||||.||.|||||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||.||.||.|
Sbjct  963  CGAGTACAGCGGGAGCGAGGAGGAGGAGGAGGAAGTGCCTGAGCAGGAGGGAGAGCCAAGTTCCATCGTCAATG  1036

Query 1036  TGCCTGGTGAGTCTACTCTTCGCCGAGATTTCCTGAGACTGCAGCAGGAGAACAAGGAACGTTCCGAGGCTCTT  1109
            |||||||.|||||.|||||.||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||.||||||||.
Sbjct 1037  TGCCTGGAGAGTCAACTCTGCGACGTGATTTCCTGAGACTGCAGCAGGAGAACAAGGAGCGGTCTGAGGCTCTG  1110

Query 1110  CGGAGACAACAGTTACTACAGGAGCAACAGCTCCGGGAGCAGGAAGAATATAAAAGGCAACTGCTGGCAGAGAG  1183
            ||||||||.|||.|.||.||||||||.|||||||||||||||||.||.|||||.|||||.||||||||.|||||
Sbjct 1111  CGGAGACAGCAGCTTCTGCAGGAGCAGCAGCTCCGGGAGCAGGAGGAGTATAAGAGGCAGCTGCTGGCTGAGAG  1184

Query 1184  ACAGAAGCGGATTGAGCAGCAGAAAGAACAGAGGCGACGGCTAGAAGAGCAACAAAGGAGAGAGCGGGAAGCTA  1257
            .||||||||||||||.||||||||||||||||||.|.|||||.||||||||||||||.|||||.||||||||.|
Sbjct 1185  GCAGAAGCGGATTGAACAGCAGAAAGAACAGAGGAGGCGGCTGGAAGAGCAACAAAGAAGAGAACGGGAAGCCA  1258

Query 1258  GAAGGCAGCAGGAACGTGAACAGCGAAGGAGAGAACAAGAAGAAAAGAGGCGTCTAGAGGAGTTGGAGAGAAGG  1331
            |.|||||||||||.|||||.|||||..||.|.||||||||.||.|||||||||||.|||||..||||.||..||
Sbjct 1259  GGAGGCAGCAGGAGCGTGAGCAGCGGCGGCGTGAACAAGAGGAGAAGAGGCGTCTCGAGGAACTGGAAAGGCGG  1332

Query 1332  CGCAAAGAAGAAGAGGAGAGGAGACGGGCAGAAGAAGAAAAGAGGAGAGTTGAAAGAGAACAGGAGTATATCAG  1405
            ||.||||||||.||.||||||||||||||||||||.||.|||||||||||.||.||.|||||||||||.|||||
Sbjct 1333  CGTAAAGAAGAGGAAGAGAGGAGACGGGCAGAAGAGGAGAAGAGGAGAGTGGAGAGGGAACAGGAGTACATCAG  1406

Query 1406  GCGACAGCTAGAAGAGGAGCAGCGGCACTTGGAAGTCCTTCAGCAGCAGCTGCTCCAGGAGCAGGCCATGTTAC  1479
            |||.||||||||.|||||||||||||||.||||..||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  GCGGCAGCTAGAGGAGGAGCAGCGGCACCTGGAGATCCTGCAGCAGCAGCTGCTCCAGGAGCAGGCCATGTTAC  1480

Query 1480  TGCATGACCATAGGAGGCCGCACCCGCAGCACTCGCAGCAGCCGCCACCACCGCAGCAGGAAAGGAGCAAGCCA  1553
            ||||.|||||.||||||||||||.|.|||||   |||||.||||||.||.|.|||||||||.||||||||.||.
Sbjct 1481  TGCACGACCACAGGAGGCCGCACGCACAGCA---GCAGCCGCCGCCCCCGCAGCAGCAGGACAGGAGCAAACCG  1551

Query 1554  AGCTTCCATGCTCCCGAGCCCAAAGCC-CACTACGAGCCTGCTGACCGAGCGCGAGA-----------------  1609
            |||||.||||||||.|||||| ||||| |||||.||.|||||||||.||||.||.||                 
Sbjct 1552  AGCTTTCATGCTCCAGAGCCC-AAGCCTCACTATGACCCTGCTGACAGAGCTCGGGAGGTACAGTGGTCCCACC  1624

Query 1610  --------------------------------------------------------------------------  1609
                                                                                      
Sbjct 1625  TGGCATCTCTCAAGAACAATGTCTCCCCTGTCTCGAGATCCCATTCCTTCAGTGACCCTTCTCCCAAATTCGCA  1698

Query 1610  --------------------------------------------------------------------------  1609
                                                                                      
Sbjct 1699  CACCACCATCTCCGCTCTCAGGACCCATGTCCACCTTCCCGCAGTGAGGGGCTCAGTCAGAGCTCTGACTCTAA  1772

Query 1610  ------------------------------------------------------------------GGTTCCTG  1617
                                                                              ||||||.|
Sbjct 1773  GTCGGAGGTGCCCGAGCCCACCCAAAAGGCTTGGTCTAGATCAGACAGTGACGAGGTGCCTCCAAGGGTTCCCG  1846

Query 1618  TGAGAACAACATCTCGCTCCCCTGTTCTGTCCCGTCGAGATTCCCCACTGCAGGGCAGTGGGCAGCAGAATAGC  1691
            |||||||.||.|||||.||||||||.||.||||||||.||||||||||||||||||.||||.||||||||||||
Sbjct 1847  TGAGAACGACCTCTCGTTCCCCTGTCCTCTCCCGTCGGGATTCCCCACTGCAGGGCGGTGGACAGCAGAATAGC  1920

Query 1692  CAGGCAGGACAGAGAAACTCCACCAGCAGTATTGAGCCCAGGCTTCTGTGGGAGAGAGTGGAGAAGCTGGTGCC  1765
            ||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||.|||||||.||||||||||||||.||||||||.||
Sbjct 1921  CAAGCAGGACAGAGAAATTCCACCAGCAGTATTGAGCCCCGGCTTCTTTGGGAGAGAGTGGAAAAGCTGGTCCC  1994

Query 1766  CAGACCTGGCAGTGGCAGCTCCTCAGGGTCCAGCAACTCAGGATCCCAGCCCGGGTCTCACCCTGGGTCTCAGA  1839
            |||.||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||.||.||.|||||||||||||
Sbjct 1995  CAGGCCAGGCAGTGGCAGCTCTTCAGGGTCCAGCAACTCAGGATCCCAGCCTGGCTCCCATCCTGGGTCTCAGA  2068

Query 1840  GTGGCTCCGGGGAACGCTTCAGAGTGAGATCATCATCCAAGTCTGAAGGCTCTCCATCTCAGCGCCTGGAAAAT  1913
            |.||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|..||||.|||||.|
Sbjct 2069  GCGGCTCCGGTGAACGCTTCAGAGTGAGATCATCATCCAAGTCTGAAGGTTCTCCATCGCCACGCCAGGAAAGT  2142

Query 1914  GCAGTGAAAAAACCTGAAGATAAAAAGGAAGTTTTCAGACCCCTCAAGCCTGCTGGCGAAGTGGATCTGACCGC  1987
            ||||..|||||.|||||.|||||.||.|||||.|||.|.||.|||||||||||.||.||||||||..||||.||
Sbjct 2143  GCAGCCAAAAAGCCTGACGATAAGAAAGAAGTATTCCGGCCTCTCAAGCCTGCGGGAGAAGTGGACTTGACTGC  2216

Query 1988  ACTGGCCAAAGAGCTTCGAGCAGTGGAAGATGTACGGCCACCTCACAAAGTAACGGACTACTCCTCATCCAGTG  2061
            ..|||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||.||.|||||||
Sbjct 2217  GTTGGCCAAAGAGCTTCGAGCAGTGGAAGATGTTCGGCCACCTCACAAAGTAACAGACTACTCATCCTCCAGTG  2290

Query 2062  AGGAGTCGGGGACGACGGATGAGGAGGACGACGATGTGGAGCAGGAAGGGGCTGACGAGTCCACCTCAGGACCA  2135
            |||||||.|||||.||.|||||||||||.||.||.|||||.|||||.||||||||.||.||.|||||.||||||
Sbjct 2291  AGGAGTCTGGGACCACAGATGAGGAGGAGGAGGACGTGGAACAGGAGGGGGCTGATGATTCTACCTCGGGACCA  2364

Query 2136  GAGGACACCAGAGCAGCGTCATCTCTGAATTTGAGCAATGGTGAAACGGAATCTGTGAAAACCATGATTGTCCA  2209
            ||.||||||||||||||||||||||.|||..|||||||.||||||||.||||||||||||||.|||||.||.||
Sbjct 2365  GAAGACACCAGAGCAGCGTCATCTCCGAACCTGAGCAACGGTGAAACAGAATCTGTGAAAACAATGATCGTTCA  2438

Query 2210  TGATGATGTAGAAAGTGAGCCGGCCATGACCCCATCCAAGGAGGGCACTCTAATCGTCCGCCAGACTCAGTCCG  2283
            |||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||||
Sbjct 2439  TGATGATGTAGAAAGTGAGCCAGCCATGACCCCGTCCAAGGAGGGCACCCTCATCGTCCGCCAGACTCAGTCCG  2512

Query 2284  CTAGTAGCACACTCCAGAAACACAAATCTTCCTCCTCCTTTACACCTTTTATAGACCCCAGATTACTACAGATT  2357
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.
Sbjct 2513  CTAGTAGCACACTCCAGAAACACAAATCTTCCTCCTCCTTTACACCTTTTATAGACCCCAGGTTACTACAGATC  2586

Query 2358  TCTCCATCTAGCGGAACAACAGTGACATCTGTGGTGGGATTTTCCTGTGATGGGATGAGACCAGAAGCCATAAG  2431
            |||||||||||.||.||.||||||||.||.||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||
Sbjct 2587  TCTCCATCTAGTGGGACGACAGTGACTTCCGTGGTGGGATTTTCCTGTGATGGGCTGAGACCAGAAGCCATAAG  2660

Query 2432  GCAAGATCCTACCCGGAAAGGCTCAGTGGTCAATGTGAATCCTACCAACACTAGGCCACAGAGTGACACCCCGG  2505
            ||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.||.||.||||||||||||||||||||.|||||.|
Sbjct 2661  GCAAGATCCTACTCGGAAAGGCTCAGTGGTCAATGTGAACCCCACGAACACTAGGCCACAGAGTGATACCCCCG  2734

Query 2506  AGATTCGTAAATACAAGAAGAGGTTTAACTCTGAGATTCTGTGTGCTGCCTTATGGGGAGTGAATTTGCTAGTG  2579
            ||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||.||.
Sbjct 2735  AGATTCGTAAATACAAGAAGAGATTTAACTCAGAGATCCTGTGTGCTGCCTTATGGGGAGTGAACTTGCTGGTT  2808

Query 2580  GGTACAGAGAGTGGCCTGATGCTGCTGGACAGAAGTGGCCAAGGGAAGGTCTATCCTCTTATCAACCGAAGACG  2653
            |||||||||||.||.||||||||..||||||||||||||||||||||.||.||.|||||.||||.|||||||||
Sbjct 2809  GGTACAGAGAGCGGTCTGATGCTCTTGGACAGAAGTGGCCAAGGGAAAGTATACCCTCTGATCAGCCGAAGACG  2882

Query 2654  ATTTCAACAAATGGACGTACTTGAGGGCTTGAATGTCTTGGTGACAATATCTGGCAAAAAGGATAAGTTACGTG  2727
            .||.||.||||||||.||.||.||.|||.|.||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2883  GTTCCAGCAAATGGATGTGCTCGAAGGCCTAAATGTCCTGGTGACAATATCTGGCAAAAAGGATAAGTTACGTG  2956

Query 2728  TCTACTATTTGTCCTGGTTAAGAAATAAAATACTTCACAATGATCCAGAAGTTGAGAAGAAGCAGGGATGGACA  2801
            ||||||||||.||||||.||||||||||.||.|||||.|||||||||||.|||||||||||||||||.|||||.
Sbjct 2957  TCTACTATTTATCCTGGCTAAGAAATAAGATTCTTCATAATGATCCAGAGGTTGAGAAGAAGCAGGGGTGGACC  3030

Query 2802  ACCGTAGGGGATTTGGAAGGATGTGTACATTATAAAGTTGTAAAATATGAAAGAATCAAATTTCTGGTGATTGC  2875
            ||.||.||.||.||||||||.||.||.||.||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||.|||||
Sbjct 3031  ACTGTGGGCGACTTGGAAGGGTGCGTGCACTATAAAGTCGTAAAATATGAAAGAATCAAGTTTCTGGTAATTGC  3104

Query 2876  TTTGAAGAGTTCTGTGGAAGTCTATGCGTGGGCACCAAAGCCATATCACAAATTTATGGCCTTTAAGTCATTTG  2949
            |||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3105  TTTGAAGAGTTCTGTGGAAGTCTATGCATGGGCACCGAAGCCATATCACAAATTTATGGCCTTTAAGTCATTTG  3178

Query 2950  GAGAATTGGTACATAAGCCATTACTGGTGGATCTCACTGTTGAGGAAGGCCAGAGGTTGAAAGTGATCTATGGA  3023
            |||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3179  GAGAACTGCTACATAAGCCATTACTGGTGGATCTCACTGTGGAGGAAGGCCAGAGGTTGAAAGTGATCTATGGA  3252

Query 3024  TCCTGTGCTGGATTCCATGCTGTTGATGTGGATTCAGGATCAGTCTATGACATTTATCTACCAACACATGTAAG  3097
            ||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||     
Sbjct 3253  TCCTGTGCGGGATTCCATGCTGTTGATGTGGATTCAGGCTCAGTCTATGACATTTATCTACCAACACAT-----  3321

Query 3098  AAAGAACCCACACTCTATGATCCAGTGTAGCATCAAACCCCATGCAATCATCATCCTCCCCAATACAGATGGAA  3171
                               ||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||.|||||.|
Sbjct 3322  -------------------ATTCAGTGTAGCATCAAACCCCATGCAATCATTATCCTCCCCAACACGGATGGGA  3376

Query 3172  TGGAGCTTCTGGTGTGCTATGAAGATGAGGGGGTTTATGTAAACACATATGGAAGGATCACCAAGGATGTAGTT  3245
            |||||||.|||||||||||.|||||.|||||||||||.||.|||||.||.|||||||||||||||||.||.|||
Sbjct 3377  TGGAGCTGCTGGTGTGCTACGAAGACGAGGGGGTTTACGTTAACACGTACGGAAGGATCACCAAGGACGTGGTT  3450

Query 3246  CTACAGTGGGGAGAGATGCCTACATCAGTAGCATATATTCGATCCAATCAGACAATGGGCTGGGGAGAGAAGGC  3319
            ||.|||||||||||||||||.|||||.|||||||||||.||.||.|||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3451  CTGCAGTGGGGAGAGATGCCGACATCTGTAGCATATATCCGGTCGAATCAGACAATGGGCTGGGGAGAGAAGGC  3524

Query 3320  CATAGAGATCCGATCTGTGGAAACTGGTCACTTGGATGGTGTGTTCATGCACAAAAGGGCTCAAAGACTAAAAT  3393
            .||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||.||||||||.|
Sbjct 3525  AATAGAGATACGATCTGTGGAAACTGGTCACTTGGATGGTGTATTTATGCACAAAAGGGCTCAGAGACTAAAGT  3598

Query 3394  TCTTGTGTGAACGCAATGACAAGGTGTTCTTTGCCTCTGTTCGGTCTGGTGGCAGCAGTCAGGTTTATTTCATG  3467
            ||.||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||.||||||||||||||.|||||.|||||||||
Sbjct 3599  TCCTGTGTGAACGCAATGACAAGGTGTTCTTTGCCTCCGTCCGCTCTGGTGGCAGCAGCCAGGTCTATTTCATG  3672

Query 3468  ACCTTAGGCAGGACTTCTCTTCTGAGCTGG  3497
            ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3673  ACCTTAGGCAGGACTTCTCTTCTGAGCTGG  3702