Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000469592
- Subject:
- XM_005264071.2
- Aligned Length:
- 3591
- Identities:
- 3461
- Gaps:
- 130
Alignment
Query 1 ATGGCGAACGACTCCCCTGCAAAAAGTCTGGTGGACATCGACCTCTCCTCCCTGCGGGATCCTGCTGGGATTTT 74
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGGCGAACGACTCCCCTGCAAAAAGTCTGGTGGACATCGACCTCTCCTCCCTGCGGGATCCTGCTGGGATTTT 74
Query 75 TGAGCTGGTGGAAGTGGTTGGAAATGGCACCTATGGACAAGTCTATAAGGGTCGACATGTTAAAACGGGTCAGT 148
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 TGAGCTGGTGGAAGTGGTTGGAAATGGCACCTATGGACAAGTCTATAAGGGTCGACATGTTAAAACGGGTCAGT 148
Query 149 TGGCAGCCATCAAAGTTATGGATGTCACTGAGGATGAAGAGGAAGAAATCAAACTGGAGATAAATATGCTAAAG 222
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149 TGGCAGCCATCAAAGTTATGGATGTCACTGAGGATGAAGAGGAAGAAATCAAACTGGAGATAAATATGCTAAAG 222
Query 223 AAATACTCTCATCACAGAAACATTGCAACATATTATGGTGCTTTCATCAAAAAGAGCCCTCCAGGACATGATGA 296
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 AAATACTCTCATCACAGAAACATTGCAACATATTATGGTGCTTTCATCAAAAAGAGCCCTCCAGGACATGATGA 296
Query 297 CCAACTCTGGCTTGTTATGGAGTTCTGTGGGGCTGGGTCCATTACAGACCTTGTGAAGAACACCAAAGGGAACA 370
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 CCAACTCTGGCTTGTTATGGAGTTCTGTGGGGCTGGGTCCATTACAGACCTTGTGAAGAACACCAAAGGGAACA 370
Query 371 CACTCAAAGAAGACTGGATCGCTTACATCTCCAGAGAAATCCTGAGGGGACTGGCACATCTTCACATTCATCAT 444
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371 CACTCAAAGAAGACTGGATCGCTTACATCTCCAGAGAAATCCTGAGGGGACTGGCACATCTTCACATTCATCAT 444
Query 445 GTGATTCACCGGGATATCAAGGGCCAGAATGTGTTGCTGACTGAGAATGCAGAGGTGAAACTTGTTGACTTTGG 518
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 GTGATTCACCGGGATATCAAGGGCCAGAATGTGTTGCTGACTGAGAATGCAGAGGTGAAACTTGTTGACTTTGG 518
Query 519 TGTGAGTGCTCAGCTGGACAGGACTGTGGGGCGGAGAAATACGTTCATAGGCACTCCCTACTGGATGGCTCCTG 592
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519 TGTGAGTGCTCAGCTGGACAGGACTGTGGGGCGGAGAAATACGTTCATAGGCACTCCCTACTGGATGGCTCCTG 592
Query 593 AGGTCATCGCCTGTGATGAGAACCCAGATGCCACCTATGATTACAGAAGTGATCTTTGGTCTTGTGGCATTACA 666
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593 AGGTCATCGCCTGTGATGAGAACCCAGATGCCACCTATGATTACAGAAGTGATCTTTGGTCTTGTGGCATTACA 666
Query 667 GCCATTGAGATGGCAGAA-GTGCTCCCCCTCTCTGTGACATGCATCCAATGAGAGCACTGTTTCTCATTCCCAG 739
|||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667 GCCATTGAGATGGCAGAAGGTGCTCCCCCTCTCTGTGACATGCATCCAATGAGAGCACTGTTTCTCATTCCCAG 740
Query 740 AAACCCTCCTCCCCGGCTGAAGTCAAAAAAATGGTCGAAGAAGTTTTTTAGTTTTATAGAAGGGTGCCTGGTGA 813
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741 AAACCCTCCTCCCCGGCTGAAGTCAAAAAAATGGTCGAAGAAGTTTTTTAGTTTTATAGAAGGGTGCCTGGTGA 814
Query 814 AGAATTACATGCAGCGGCCCTCTACAGAGCAGCTTTTGAAACATCCTTTTATAAGGGATCAGCCAAATGAAAGG 887
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 815 AGAATTACATGCAGCGGCCCTCTACAGAGCAGCTTTTGAAACATCCTTTTATAAGGGATCAGCCAAATGAAAGG 888
Query 888 CAAGTTAGAATCCAGCTTAAGGATCATATAGATCGTACCAGGAAGAAGAGAGGCGAGAAAGATGAAACTGAGTA 961
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 889 CAAGTTAGAATCCAGCTTAAGGATCATATAGATCGTACCAGGAAGAAGAGAGGCGAGAAAGATGAAACTGAGTA 962
Query 962 TGAGTACAGTGGGAGTGAGGAAGAAGAGGAGGAAGTGCCTGAACAGGAAGGAGAGCCAAGTTCCATTGTGAACG 1035
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 963 TGAGTACAGTGGGAGTGAGGAAGAAGAGGAGGAAGTGCCTGAACAGGAAGGAGAGCCAAGTTCCATTGTGAACG 1036
Query 1036 TGCCTGGTGAGTCTACTCTTCGCCGAGATTTCCTGAGACTGCAGCAGGAGAACAAGGAACGTTCCGAGGCTCTT 1109
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037 TGCCTGGTGAGTCTACTCTTCGCCGAGATTTCCTGAGACTGCAGCAGGAGAACAAGGAACGTTCCGAGGCTCTT 1110
Query 1110 CGGAGACAACAGTTACTACAGGAGCAACAGCTCCGGGAGCAGGAAGAATATAAAAGGCAACTGCTGGCAGAGAG 1183
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111 CGGAGACAACAGTTACTACAGGAGCAACAGCTCCGGGAGCAGGAAGAATATAAAAGGCAACTGCTGGCAGAGAG 1184
Query 1184 ACAGAAGCGGATTGAGCAGCAGAAAGAACAGAGGCGACGGCTAGAAGAGCAACAAAGGAGAGAGCGGGAAGCTA 1257
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185 ACAGAAGCGGATTGAGCAGCAGAAAGAACAGAGGCGACGGCTAGAAGAGCAACAAAGGAGAGAGCGGGAAGCTA 1258
Query 1258 GAAGGCAGCAGGAACGTGAACAGCGAAGGAGAGAACAAGAAGAAAAGAGGCGTCTAGAGGAGTTGGAGAGAAGG 1331
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259 GAAGGCAGCAGGAACGTGAACAGCGAAGGAGAGAACAAGAAGAAAAGAGGCGTCTAGAGGAGTTGGAGAGAAGG 1332
Query 1332 CGCAAAGAAGAAGAGGAGAGGAGACGGGCAGAAGAAGAAAAGAGGAGAGTTGAAAGAGAACAGGAGTATATCAG 1405
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333 CGCAAAGAAGAAGAGGAGAGGAGACGGGCAGAAGAAGAAAAGAGGAGAGTTGAAAGAGAACAGGAGTATATCAG 1406
Query 1406 GCGACAGCTAGAAGAGGAGCAGCGGCACTTGGAAGTCCTTCAGCAGCAGCTGCTCCAGGAGCAGGCCATGTTAC 1479
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407 GCGACAGCTAGAAGAGGAGCAGCGGCACTTGGAAGTCCTTCAGCAGCAGCTGCTCCAGGAGCAGGCCATGTTAC 1480
Query 1480 T------------------------------------------------------------------------- 1480
|
Sbjct 1481 TGGAGTGCCGATGGCGGGAGATGGAGGAGCACCGGCAGGCAGAGAGGCTCCAGAGGCAGTTGCAACAAGAACAA 1554
Query 1481 --------------------GCATGACCATAGGAGGCCGCACCCGCAGCACTCGCAGCAGCCGCCACCACCGCA 1534
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555 GCATATCTCCTGTCTCTACAGCATGACCATAGGAGGCCGCACCCGCAGCACTCGCAGCAGCCGCCACCACCGCA 1628
Query 1535 GCAGGAAAGGAGCAAGCCAAGCTTCCATGCTCCCGAGCCCAAAGCCCACTACGAGCCTGCTGACCGAGCGCGAG 1608
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629 GCAGGAAAGGAGCAAGCCAAGCTTCCATGCTCCCGAGCCCAAAGCCCACTACGAGCCTGCTGACCGAGCGCGAG 1702
Query 1609 AGGTTCCTGTGAGAACAACATCTCGCTCCCCTGTTCTGTCCCGTCGAGATTCCCCACTGCAGGGCAGTGGGCAG 1682
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703 AGGTTCCTGTGAGAACAACATCTCGCTCCCCTGTTCTGTCCCGTCGAGATTCCCCACTGCAGGGCAGTGGGCAG 1776
Query 1683 CAGAATAGCCAGGCAGGACAGAGAAACTCCACCAGCAGTATTGAGCCCAGGCTTCTGTGGGAGAGAGTGGAGAA 1756
|||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777 CAGAATAGCCAGGCAGGACAGAGAAACTCCAC---CAGTATTGAGCCCAGGCTTCTGTGGGAGAGAGTGGAGAA 1847
Query 1757 GCTGGTGCCCAGACCTGGCAGTGGCAGCTCCTCAGGGTCCAGCAACTCAGGATCCCAGCCCGGGTCTCACCCTG 1830
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1848 GCTGGTGCCCAGACCTGGCAGTGGCAGCTCCTCAGGGTCCAGCAACTCAGGATCCCAGCCCGGGTCTCACCCTG 1921
Query 1831 GGTCTCAGAGTGGCTCCGGGGAACGCTTCAGAGTGAGATCATCATCCAAGTCTGAAGGCTCTCCATCTCAGCGC 1904
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1922 GGTCTCAGAGTGGCTCCGGGGAACGCTTCAGAGTGAGATCATCATCCAAGTCTGAAGGCTCTCCATCTCAGCGC 1995
Query 1905 CTGGAAAATGCAGTGAAAAAACCTGAAGATAAAAAGGAAGTTTTCAGACCCCTCAAGCCTGCTGGCGAAGTGGA 1978
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 1996 CTGGAAAATGCAGTGAAAAAACCTGAAGATAAAAAGGAAGTTTTCAGACCCCTCAAGCCTGCT---------GA 2060
Query 1979 TCTGACCGCACTGGCCAAAGAGCTTCGAGCAGTGGAAGATGTACGGCCACCTCACAAAGTAACGGACTACTCCT 2052
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2061 TCTGACCGCACTGGCCAAAGAGCTTCGAGCAGTGGAAGATGTACGGCCACCTCACAAAGTAACGGACTACTCCT 2134
Query 2053 CATCCAGTGAGGAGTCGGGGACGACGGATGAGGAGGACGACGATGTGGAGCAGGAAGGGGCTGACGAGTCCACC 2126
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2135 CATCCAGTGAGGAGTCGGGGACGACGGATGAGGAGGACGACGATGTGGAGCAGGAAGGGGCTGACGAGTCCACC 2208
Query 2127 TCAGGACCAGAGGACACCAGAGCAGCGTCATCTCTGAATTTGAGCAATGGTGAAACGGAATCTGTGAAAACCAT 2200
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2209 TCAGGACCAGAGGACACCAGAGCAGCGTCATCTCTGAATTTGAGCAATGGTGAAACGGAATCTGTGAAAACCAT 2282
Query 2201 GATTGTCCATGATGATGTAGAAAGTGAGCCGGCCATGACCCCATCCAAGGAGGGCACTCTAATCGTCCGCCAGA 2274
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2283 GATTGTCCATGATGATGTAGAAAGTGAGCCGGCCATGACCCCATCCAAGGAGGGCACTCTAATCGTCCGCCAGA 2356
Query 2275 CTCAGTCCGCTAGTAGCACACTCCAGAAACACAAATCTTCCTCCTCCTTTACACCTTTTATAGACCCCAGATTA 2348
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2357 CTCAGTCCGCTAGTAGCACACTCCAGAAACACAAATCTTCCTCCTCCTTTACACCTTTTATAGACCCCAGATTA 2430
Query 2349 CTACAGATTTCTCCATCTAGCGGAACAACAGTGACATCTGTGGTGGGATTTTCCTGTGATGGGATGAGACCAGA 2422
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2431 CTACAGATTTCTCCATCTAGCGGAACAACAGTGACATCTGTGGTGGGATTTTCCTGTGATGGGATGAGACCAGA 2504
Query 2423 AGCCATAAGGCAAGATCCTACCCGGAAAGGCTCAGTGGTCAATGTGAATCCTACCAACACTAGGCCACAGAGTG 2496
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2505 AGCCATAAGGCAAGATCCTACCCGGAAAGGCTCAGTGGTCAATGTGAATCCTACCAACACTAGGCCACAGAGTG 2578
Query 2497 ACACCCCGGAGATTCGTAAATACAAGAAGAGGTTTAACTCTGAGATTCTGTGTGCTGCCTTATGGGGAGTGAAT 2570
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2579 ACACCCCGGAGATTCGTAAATACAAGAAGAGGTTTAACTCTGAGATTCTGTGTGCTGCCTTATGGGGAGTGAAT 2652
Query 2571 TTGCTAGTGGGTACAGAGAGTGGCCTGATGCTGCTGGACAGAAGTGGCCAAGGGAAGGTCTATCCTCTTATCAA 2644
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2653 TTGCTAGTGGGTACAGAGAGTGGCCTGATGCTGCTGGACAGAAGTGGCCAAGGGAAGGTCTATCCTCTTATCAA 2726
Query 2645 CCGAAGACGATTTCAACAAATGGACGTACTTGAGGGCTTGAATGTCTTGGTGACAATATCTGGCAAAAAGGATA 2718
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2727 CCGAAGACGATTTCAACAAATGGACGTACTTGAGGGCTTGAATGTCTTGGTGACAATATCTGGCAAAAAGGATA 2800
Query 2719 AGTTACGTGTCTACTATTTGTCCTGGTTAAGAAATAAAATACTTCACAATGATCCAGAAGTTGAGAAGAAGCAG 2792
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2801 AGTTACGTGTCTACTATTTGTCCTGGTTAAGAAATAAAATACTTCACAATGATCCAGAAGTTGAGAAGAAGCAG 2874
Query 2793 GGATGGACAACCGTAGGGGATTTGGAAGGATGTGTACATTATAAAGTTGTAAAATATGAAAGAATCAAATTTCT 2866
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2875 GGATGGACAACCGTAGGGGATTTGGAAGGATGTGTACATTATAAAGTTGTAAAATATGAAAGAATCAAATTTCT 2948
Query 2867 GGTGATTGCTTTGAAGAGTTCTGTGGAAGTCTATGCGTGGGCACCAAAGCCATATCACAAATTTATGGCCTTTA 2940
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2949 GGTGATTGCTTTGAAGAGTTCTGTGGAAGTCTATGCGTGGGCACCAAAGCCATATCACAAATTTATGGCCTTTA 3022
Query 2941 AGTCATTTGGAGAATTGGTACATAAGCCATTACTGGTGGATCTCACTGTTGAGGAAGGCCAGAGGTTGAAAGTG 3014
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3023 AGTCATTTGGAGAATTGGTACATAAGCCATTACTGGTGGATCTCACTGTTGAGGAAGGCCAGAGGTTGAAAGTG 3096
Query 3015 ATCTATGGATCCTGTGCTGGATTCCATGCTGTTGATGTGGATTCAGGATCAGTCTATGACATTTATCTACCAAC 3088
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3097 ATCTATGGATCCTGTGCTGGATTCCATGCTGTTGATGTGGATTCAGGATCAGTCTATGACATTTATCTACCAAC 3170
Query 3089 ACATGTAAGAAAGAACCCACACTCTATGATCCAGTGTAGCATCAAACCCCATGCAATCATCATCCTCCCCAATA 3162
|||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3171 ACAT------------------------ATCCAGTGTAGCATCAAACCCCATGCAATCATCATCCTCCCCAATA 3220
Query 3163 CAGATGGAATGGAGCTTCTGGTGTGCTATGAAGATGAGGGGGTTTATGTAAACACATATGGAAGGATCACCAAG 3236
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3221 CAGATGGAATGGAGCTTCTGGTGTGCTATGAAGATGAGGGGGTTTATGTAAACACATATGGAAGGATCACCAAG 3294
Query 3237 GATGTAGTTCTACAGTGGGGAGAGATGCCTACATCAGTAGCATATATTCGATCCAATCAGACAATGGGCTGGGG 3310
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3295 GATGTAGTTCTACAGTGGGGAGAGATGCCTACATCAGTAGCATATATTCGATCCAATCAGACAATGGGCTGGGG 3368
Query 3311 AGAGAAGGCCATAGAGATCCGATCTGTGGAAACTGGTCACTTGGATGGTGTGTTCATGCACAAAAGGGCTCAAA 3384
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3369 AGAGAAGGCCATAGAGATCCGATCTGTGGAAACTGGTCACTTGGATGGTGTGTTCATGCACAAAAGGGCTCAAA 3442
Query 3385 GACTAAAATTCTTGTGTGAACGCAATGACAAGGTGTTCTTTGCCTCTGTTCGGTCTGGTGGCAGCAGTCAGGTT 3458
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3443 GACTAAAATTCTTGTGTGAACGCAATGACAAGGTGTTCTTTGCCTCTGTTCGGTCTGGTGGCAGCAGTCAGGTT 3516
Query 3459 TATTTCATGACCTTAGGCAGGACTTCTCTTCTGAGCTGG 3497
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3517 TATTTCATGACCTTAGGCAGGACTTCTCTTCTGAGCTGG 3555