Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000469592
• Subject: XM_017321013.1
• Aligned Length: 3922
• Identities: 3127
• Gaps: 453

Alignment

Query    1  ATGGCGAACGACTCCCCTGCAAAAAGTCTGGTGGACATCGACCTCTCCTCCCTGCGGGATCCTGCTGGGATTTT  74
            ||||||||||||||.||.||.||.||.|||||||||||.|||||.||.|||||||||||.||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGCGAACGACTCTCCCGCGAAGAGCCTGGTGGACATTGACCTGTCGTCCCTGCGGGACCCTGCTGGGATTTT  74

Query   75  TGAGCTGGTGGAAGTGGTTGGAAATGGCACCTATGGACAAGTCTATAAGGGTCGACATGTTAAAACGGGTCAGT  148
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.
Sbjct   75  TGAGCTGGTGGAAGTGGTTGGAAATGGCACCTATGGACAAGTCTATAAGGGTCGACATGTTAAAACGGGTCAGC  148

Query  149  TGGCAGCCATCAAAGTTATGGATGTCACTGAGGATGAAGAGGAAGAAATCAAACTGGAGATAAATATGCTAAAG  222
            ||||.||||||||.||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||
Sbjct  149  TGGCCGCCATCAAGGTTATGGACGTCACCGAGGATGAAGAGGAAGAAATCAAACTGGAGATAAATATGCTGAAG  222

Query  223  AAATACTCTCATCACAGAAACATTGCAACATATTATGGTGCTTTCATCAAAAAGAGCCCTCCAGGACATGATGA  296
            ||.||.||||||||..||||.|||||.||.||.||||||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  AAGTATTCTCATCATCGAAATATTGCCACGTACTATGGTGCTTTCATTAAGAAGAGCCCTCCAGGACATGATGA  296

Query  297  CCAACTCTGGCTTGTTATGGAGTTCTGTGGGGCTGGGTCCATTACAGACCTTGTGAAGAACACCAAAGGGAACA  370
            ||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  CCAACTCTGGCTTGTTATGGAGTTTTGTGGGGCTGGGTCCATCACAGACCTTGTGAAGAACACCAAAGGGAACA  370

Query  371  CACTCAAAGAAGACTGGATCGCTTACATCTCCAGAGAAATCCTGAGGGGACTGGCACATCTTCACATTCATCAT  444
            |.|||||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||.||||||.||||||||||.||.|||||.||.
Sbjct  371  CTCTCAAAGAAGACTGGATTGCTTACATCTCCAGGGAAATCCTCAGGGGATTGGCACATCTCCATATTCACCAC  444

Query  445  GTGATTCACCGGGATATCAAGGGCCAGAATGTGTTGCTGACTGAGAATGCAGAGGTGAAACTTGTTGACTTTGG  518
            ||.||||||||.||||||||||||||.||||||.|||||||.||||||||.|||||||||||||||||.|||||
Sbjct  445  GTTATTCACCGAGATATCAAGGGCCAAAATGTGCTGCTGACCGAGAATGCTGAGGTGAAACTTGTTGATTTTGG  518

Query  519  TGTGAGTGCTCAGCTGGACAGGACTGTGGGGCGGAGAAATACGTTCATAGGCACTCCCTACTGGATGGCTCCTG  592
            |||.||.|||||||||||||||||.||.||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.|
Sbjct  519  TGTAAGCGCTCAGCTGGACAGGACGGTTGGACGGAGAAATACGTTCATAGGCACACCCTACTGGATGGCTCCAG  592

Query  593  AGGTCATCGCCTGTGATGAGAACCCAGATGCCACCTATGATTACAGAAGTGATCTTTGGTCTTGTGGCATTACA  666
            ||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||.||.|||||||||||.||.|||||.||||||||.|||
Sbjct  593  AGGTCATCGCCTGTGATGAGAACCCAGACGCCACTTACGACTACAGAAGTGACCTCTGGTCCTGTGGCATCACA  666

Query  667  GCCATTGAGATGGCAGAA-GTGCTCCCCCTCTCTGTGACATGCATCCAATGAGAGCACTGTTTCTCATTCCCAG  739
            |||||.||||||||.||| |.||.||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||
Sbjct  667  GCCATCGAGATGGCTGAAGGGGCCCCCCCTCTCTGTGACATGCATCCAATGAGAGCGCTGTTTCTCATCCCCAG  740

Query  740  AAACCCTCCTCCCCGGCTGAAGTCAAAAAAATGGTCGAAGAAGTTTTTTAGTTTTATAGAAGGGTGCCTGGTGA  813
            |||||||||||||.||||||||||||||||||||||.|||||.|||||.||.|||||||||||.||.|||||||
Sbjct  741  AAACCCTCCTCCCAGGCTGAAGTCAAAAAAATGGTCAAAGAAATTTTTCAGCTTTATAGAAGGCTGTCTGGTGA  814

Query  814  AGAATTACATGCAGCGGCCCTCTACAGAGCAGCTTTTGAAACATCCTTTTATAAGGGATCAGCCAAATGAAAGG  887
            |||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||.|||||.||||||||||||||.|||||||||
Sbjct  815  AGAATTACATGCAGCGGCCCTCTACAGAGCAACTTTTAAAACACCCTTTCATAAGGGATCAGCCCAATGAAAGG  888

Query  888  CAAGTTAGAATCCAGCTTAAGGATCATATAGATCGTACCAGGAAGAAGAGAGGCGAGAAAGATGAAACTGAGTA  961
            ||.|||.|||||||||||||||||||.|||||.||.|||||.|||||||||||||||||||||||.||.|||||
Sbjct  889  CAGGTTCGAATCCAGCTTAAGGATCACATAGACCGGACCAGAAAGAAGAGAGGCGAGAAAGATGAGACGGAGTA  962

Query  962  TGAGTACAGTGGGAGTGAGGAAGAAGAGGAGGAAGTGCCTGAACAGGAAGGAGAGCCAAGTTCCATTGTGAACG  1035
            .||||||||.|||||.|||||.||.|||||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||.||.||.|
Sbjct  963  CGAGTACAGCGGGAGCGAGGAGGAGGAGGAGGAAGTGCCTGAGCAGGAGGGAGAGCCAAGTTCCATCGTCAATG  1036

Query 1036  TGCCTGGTGAGTCTACTCTTCGCCGAGATTTCCTGAGACTGCAGCAGGAGAACAAGGAACGTTCCGAGGCTCTT  1109
            |||||||.|||||.|||||.||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||.||||||||.
Sbjct 1037  TGCCTGGAGAGTCAACTCTGCGACGTGATTTCCTGAGACTGCAGCAGGAGAACAAGGAGCGGTCTGAGGCTCTG  1110

Query 1110  CGGAGACAACAGTTACTACAGGAGCAACAGCTCCGGGAGCAGGAAGAATATAAAAGGCAACTGCTGGCAGAGAG  1183
            ||||||||.|||.|.||.||||||||.|||||||||||||||||.||.|||||.|||||.||||||||.|||||
Sbjct 1111  CGGAGACAGCAGCTTCTGCAGGAGCAGCAGCTCCGGGAGCAGGAGGAGTATAAGAGGCAGCTGCTGGCTGAGAG  1184

Query 1184  ACAGAAGCGGATTGAGCAGCAGAAAGAACAGAGGCGACGGCTAGAAGAGCAACAAAGGAGAGAGCGGGAAGCTA  1257
            .||||||||||||||.||||||||||||||||||.|.|||||.||||||||||||||.|||||.||||||||.|
Sbjct 1185  GCAGAAGCGGATTGAACAGCAGAAAGAACAGAGGAGGCGGCTGGAAGAGCAACAAAGAAGAGAACGGGAAGCCA  1258

Query 1258  GAAGGCAGCAGGAACGTGAACAGCGAAGGAGAGAACAAGAAGAAAAGAGGCGTCTAGAGGAGTTGGAGAGAAGG  1331
            |.|||||||||||.|||||.|||||..||.|.||||||||.||.|||||||||||.|||||..||||.||..||
Sbjct 1259  GGAGGCAGCAGGAGCGTGAGCAGCGGCGGCGTGAACAAGAGGAGAAGAGGCGTCTCGAGGAACTGGAAAGGCGG  1332

Query 1332  CGCAAAGAAGAAGAGGAGAGGAGACGGGCAGAAGAAGAAAAGAGGAGAGTTGAAAGAGAACAGGAGTATATCAG  1405
            ||.||||||||.||.||||||||||||||||||||.||.|||||||||||.||.||.|||||||||||.|||||
Sbjct 1333  CGTAAAGAAGAGGAAGAGAGGAGACGGGCAGAAGAGGAGAAGAGGAGAGTGGAGAGGGAACAGGAGTACATCAG  1406

Query 1406  GCGACAGCTAGAAGAGGAGCAGCGGCACTTGGAAGTCCTTCAGCAGCAGCTGCTCCAGGAGCAGGCCATGTTAC  1479
            |||.||||||||.|||||||||||||||.||||..||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  GCGGCAGCTAGAGGAGGAGCAGCGGCACCTGGAGATCCTGCAGCAGCAGCTGCTCCAGGAGCAGGCCATGTTAC  1480

Query 1480  TGCATGACCATAGGAGGCCGCACCCGCAGCACTCGCAGCAGCCGCCACCACCGCAGCAGGAAAGGAGCAAGCCA  1553
            ||||.|||||.||||||||||||.|.|||||   |||||.||||||.||.|.|||||||||.||||||||.||.
Sbjct 1481  TGCACGACCACAGGAGGCCGCACGCACAGCA---GCAGCCGCCGCCCCCGCAGCAGCAGGACAGGAGCAAACCG  1551

Query 1554  AGCTTCCATGCTCCCGAGCCCAAAGCC-CACTACGAGCCTGCTGACCGAGCGCGAGA-----------------  1609
            |||||.||||||||.|||||| ||||| |||||.||.|||||||||.||||.||.||                 
Sbjct 1552  AGCTTTCATGCTCCAGAGCCC-AAGCCTCACTATGACCCTGCTGACAGAGCTCGGGAGGTACAGTGGTCCCACC  1624

Query 1610  --------------------------------------------------------------------------  1609
                                                                                      
Sbjct 1625  TGGCATCTCTCAAGAACAATGTCTCCCCTGTCTCGAGATCCCATTCCTTCAGTGACCCTTCTCCCAAATTCGCA  1698

Query 1610  --------------------------------------------------------------------------  1609
                                                                                      
Sbjct 1699  CACCACCATCTCCGCTCTCAGGACCCATGTCCACCTTCCCGCAGTGAGGGGCTCAGTCAGAGCTCTGACTCTAA  1772

Query 1610  ------------------------------------------------------------------GGTTCCTG  1617
                                                                              ||||||.|
Sbjct 1773  GTCGGAGGTGCCCGAGCCCACCCAAAAGGCTTGGTCTAGATCAGACAGTGACGAGGTGCCTCCAAGGGTTCCCG  1846

Query 1618  TGAGAACAACATCTCGCTCCCCTGTTCTGTCCCGTCGAGATTCCCCACTGCAGGGCAGTGGGCAGCAGAATAGC  1691
            |||||||.||.|||||.||||||||.||.||||||||.||||||||||||||||||.||||.||||||||||||
Sbjct 1847  TGAGAACGACCTCTCGTTCCCCTGTCCTCTCCCGTCGGGATTCCCCACTGCAGGGCGGTGGACAGCAGAATAGC  1920

Query 1692  CAGGCAGGACAGAGAAACTCCACCAGCAGTATTGAGCCCAGGCTTCTGTGGGAGAGAGTGGAGAAGCTGGTGCC  1765
            ||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||.|||||||.||||||||||||||.||||||||.||
Sbjct 1921  CAAGCAGGACAGAGAAATTCCACCAGCAGTATTGAGCCCCGGCTTCTTTGGGAGAGAGTGGAAAAGCTGGTCCC  1994

Query 1766  CAGACCTGGCAGTGGCAGCTCCTCAGGGTCCAGCAACTCAGGATCCCAGCCCGGGTCTCACCCTGGGTCTCAGA  1839
            |||.||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||.||.||.|||||||||||||
Sbjct 1995  CAGGCCAGGCAGTGGCAGCTCTTCAGGGTCCAGCAACTCAGGATCCCAGCCTGGCTCCCATCCTGGGTCTCAGA  2068

Query 1840  GTGGCTCCGGGGAACGCTTCAGAGTGAGATCATCATCCAAGTCTGAAGGCTCTCCATCTCAGCGCCTGGAAAAT  1913
            |.||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|..||||.|||||.|
Sbjct 2069  GCGGCTCCGGTGAACGCTTCAGAGTGAGATCATCATCCAAGTCTGAAGGTTCTCCATCGCCACGCCAGGAAAGT  2142

Query 1914  GCAGTGAAAAAACCTGAAGATAAAAAGGAAGTTTTCAGACCCCTCAAGCCTGCTGGCGAAGTGGATCTGACCGC  1987
            ||||..|||||.|||||.|||||.||.|||||.|||.|.||.|||||||||||.||.||||||||..||||.||
Sbjct 2143  GCAGCCAAAAAGCCTGACGATAAGAAAGAAGTATTCCGGCCTCTCAAGCCTGCGGGAGAAGTGGACTTGACTGC  2216

Query 1988  ACTGGCCAAAGAGCTTCGAGCAGTGGAAGATGTACGGCCACCTCACAAAGTAACGGACTACTCCTCATCCAGTG  2061
            ..|||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||.||.|||||||
Sbjct 2217  GTTGGCCAAAGAGCTTCGAGCAGTGGAAGATGTTCGGCCACCTCACAAAGTAACAGACTACTCATCCTCCAGTG  2290

Query 2062  AGGAGTCGGGGACGACGGATGAGGAGGACGACGATGTGGAGCAGGAAGGGGCTGACGAGTCCACCTCAGGACCA  2135
            |||||||.|||||.||.|||||||||||.||.||.|||||.|||||.||||||||.||.||.|||||.||||||
Sbjct 2291  AGGAGTCTGGGACCACAGATGAGGAGGAGGAGGACGTGGAACAGGAGGGGGCTGATGATTCTACCTCGGGACCA  2364

Query 2136  GAGGACACCAGAGCAGCGTCATCTCTGAATTTGAGCAATGGTGAAACGGAATCTGTGAAAACCATGATTGTCCA  2209
            ||.||||||||||||||||||||||.|||..|||||||.||||||||.||||||||||||||.|||||.||.||
Sbjct 2365  GAAGACACCAGAGCAGCGTCATCTCCGAACCTGAGCAACGGTGAAACAGAATCTGTGAAAACAATGATCGTTCA  2438

Query 2210  TGATGATGTAGAAAGTGAGCCGGCCATGACCCCATCCAAGGAGGGCACTCTAATCGTCCGCC------------  2271
            |||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||.||.||||||||||            
Sbjct 2439  TGATGATGTAGAAAGTGAGCCAGCCATGACCCCGTCCAAGGAGGGCACCCTCATCGTCCGCCAGAGTACAGTTG  2512

Query 2272  --------------------------------------------------------------------------  2271
                                                                                      
Sbjct 2513  ACCAAAAGCGTGCCAGCCATCATGAGAGCAATGGCTTTGCGGGTCGCATTCACCTCTTGCCAGATCTCTTACAG  2586

Query 2272  --------------------------------------------------------------------------  2271
                                                                                      
Sbjct 2587  CAAAGCCATTCCTCCTCCACTTCCTCCACCTCTTCCTCCCCATCCTCCAGCCAGCCGACACCCACCATGTCCCC  2660

Query 2272  --------------------------------AGACTCAGTCCGCTAGTAGCACACTCCAGAAACACAAATCTT  2313
                                            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2661  ACAGACACCCCAGGACAAGCTCACTGCTAATGAGACTCAGTCCGCTAGTAGCACACTCCAGAAACACAAATCTT  2734

Query 2314  CCTCCTCCTTTACACCTTTTATAGACCCCAGATTACTACAGATTTCTCCATCTAGCGGAACAACAGTGACATCT  2387
            |||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||.||.||.||||||||.||.
Sbjct 2735  CCTCCTCCTTTACACCTTTTATAGACCCCAGGTTACTACAGATCTCTCCATCTAGTGGGACGACAGTGACTTCC  2808

Query 2388  GTGGTGGGATTTTCCTGTGATGGGATGAGACCAGAAGCCATAAGGCAAGATCCTACCCGGAAAGGCTCAGTGGT  2461
            ||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||
Sbjct 2809  GTGGTGGGATTTTCCTGTGATGGGCTGAGACCAGAAGCCATAAGGCAAGATCCTACTCGGAAAGGCTCAGTGGT  2882

Query 2462  CAATGTGAATCCTACCAACACTAGGCCACAGAGTGACACCCCGGAGATTCGTAAATACAAGAAGAGGTTTAACT  2535
            |||||||||.||.||.||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||.|||||||
Sbjct 2883  CAATGTGAACCCCACGAACACTAGGCCACAGAGTGATACCCCCGAGATTCGTAAATACAAGAAGAGATTTAACT  2956

Query 2536  CTGAGATTCTGTGTGCTGCCTTATGGGGAGTGAATTTGCTAGTGGGTACAGAGAGTGGCCTGATGCTGCTGGAC  2609
            |.|||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||.||.|||||||||||.||.||||||||..|||||
Sbjct 2957  CAGAGATCCTGTGTGCTGCCTTATGGGGAGTGAACTTGCTGGTTGGTACAGAGAGCGGTCTGATGCTCTTGGAC  3030

Query 2610  AGAAGTGGCCAAGGGAAGGTCTATCCTCTTATCAACCGAAGACGATTTCAACAAATGGACGTACTTGAGGGCTT  2683
            |||||||||||||||||.||.||.|||||.||||.|||||||||.||.||.||||||||.||.||.||.|||.|
Sbjct 3031  AGAAGTGGCCAAGGGAAAGTATACCCTCTGATCAGCCGAAGACGGTTCCAGCAAATGGATGTGCTCGAAGGCCT  3104

Query 2684  GAATGTCTTGGTGACAATATCTGGCAAAAAGGATAAGTTACGTGTCTACTATTTGTCCTGGTTAAGAAATAAAA  2757
            .||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||.||||||||||.|
Sbjct 3105  AAATGTCCTGGTGACAATATCTGGCAAAAAGGATAAGTTACGTGTCTACTATTTATCCTGGCTAAGAAATAAGA  3178

Query 2758  TACTTCACAATGATCCAGAAGTTGAGAAGAAGCAGGGATGGACAACCGTAGGGGATTTGGAAGGATGTGTACAT  2831
            |.|||||.|||||||||||.|||||||||||||||||.|||||.||.||.||.||.||||||||.||.||.||.
Sbjct 3179  TTCTTCATAATGATCCAGAGGTTGAGAAGAAGCAGGGGTGGACCACTGTGGGCGACTTGGAAGGGTGCGTGCAC  3252

Query 2832  TATAAAGTTGTAAAATATGAAAGAATCAAATTTCTGGTGATTGCTTTGAAGAGTTCTGTGGAAGTCTATGCGTG  2905
            ||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||
Sbjct 3253  TATAAAGTCGTAAAATATGAAAGAATCAAGTTTCTGGTAATTGCTTTGAAGAGTTCTGTGGAAGTCTATGCATG  3326

Query 2906  GGCACCAAAGCCATATCACAAATTTATGGCCTTTAAGTCATTTGGAGAATTGGTACATAAGCCATTACTGGTGG  2979
            ||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||||||
Sbjct 3327  GGCACCGAAGCCATATCACAAATTTATGGCCTTTAAGTCATTTGGAGAACTGCTACATAAGCCATTACTGGTGG  3400

Query 2980  ATCTCACTGTTGAGGAAGGCCAGAGGTTGAAAGTGATCTATGGATCCTGTGCTGGATTCCATGCTGTTGATGTG  3053
            ||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||
Sbjct 3401  ATCTCACTGTGGAGGAAGGCCAGAGGTTGAAAGTGATCTATGGATCCTGTGCGGGATTCCATGCTGTTGATGTG  3474

Query 3054  GATTCAGGATCAGTCTATGACATTTATCTACCAACACATGTAAGAAAGAACCCACACTCTATGATCCAGTGTAG  3127
            ||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||                        ||.||||||||
Sbjct 3475  GATTCAGGCTCAGTCTATGACATTTATCTACCAACACAT------------------------ATTCAGTGTAG  3524

Query 3128  CATCAAACCCCATGCAATCATCATCCTCCCCAATACAGATGGAATGGAGCTTCTGGTGTGCTATGAAGATGAGG  3201
            |||||||||||||||||||||.|||||||||||.||.|||||.||||||||.|||||||||||.|||||.||||
Sbjct 3525  CATCAAACCCCATGCAATCATTATCCTCCCCAACACGGATGGGATGGAGCTGCTGGTGTGCTACGAAGACGAGG  3598

Query 3202  GGGTTTATGTAAACACATATGGAAGGATCACCAAGGATGTAGTTCTACAGTGGGGAGAGATGCCTACATCAGTA  3275
            |||||||.||.|||||.||.|||||||||||||||||.||.|||||.|||||||||||||||||.|||||.|||
Sbjct 3599  GGGTTTACGTTAACACGTACGGAAGGATCACCAAGGACGTGGTTCTGCAGTGGGGAGAGATGCCGACATCTGTA  3672

Query 3276  GCATATATTCGATCCAATCAGACAATGGGCTGGGGAGAGAAGGCCATAGAGATCCGATCTGTGGAAACTGGTCA  3349
            ||||||||.||.||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||
Sbjct 3673  GCATATATCCGGTCGAATCAGACAATGGGCTGGGGAGAGAAGGCAATAGAGATACGATCTGTGGAAACTGGTCA  3746

Query 3350  CTTGGATGGTGTGTTCATGCACAAAAGGGCTCAAAGACTAAAATTCTTGTGTGAACGCAATGACAAGGTGTTCT  3423
            ||||||||||||.||.|||||||||||||||||.||||||||.|||.|||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3747  CTTGGATGGTGTATTTATGCACAAAAGGGCTCAGAGACTAAAGTTCCTGTGTGAACGCAATGACAAGGTGTTCT  3820

Query 3424  TTGCCTCTGTTCGGTCTGGTGGCAGCAGTCAGGTTTATTTCATGACCTTAGGCAGGACTTCTCTTCTGAGCTGG  3497
            |||||||.||.||.||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3821  TTGCCTCCGTCCGCTCTGGTGGCAGCAGCCAGGTCTATTTCATGACCTTAGGCAGGACTTCTCTTCTGAGCTGG  3894