Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000469610
• Subject: XM_006520646.3
• Aligned Length: 1915
• Identities: 1521
• Gaps: 158

Alignment

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct    1  ATGGGCAGTGGGGTGTTCCTTGGGATGGATGACCTGGATCCCATAGCCATCTGTAGCCTGTTTGAGGAGTGGGA  74

Query    1  ----------------------------------------------------------------------ATGG  4
                                                                                  ||||
Sbjct   75  CCCTCAGACAGAGCGCTGCCAAGATGATCCGCCAGTTTACAGACCTGCAGGGGAGCCCGCCACTGCAGCCATGG  148

Query    5  CCTCGGAAGACATTGCCAAGCTGGCAGAGACACTTGCCAAGACTCAGGTGGCCGGGGGACAGCTGAGTTTCAAA  78
            ||||.||||||||||||||.|||||||||||.||.||.||.||||||||.|||||.||.|||||||||||.||.
Sbjct  149  CCTCTGAAGACATTGCCAAACTGGCAGAGACCCTGGCTAAAACTCAGGTAGCCGGAGGGCAGCTGAGTTTTAAG  222

Query   79  GGCAAGAGCCTCAAACTCAACACTGCAGAAGATGCTAAAGATGTGATTAAAGAGATTGAAGACTTTGACAGCTT  152
            ||||||.|.||||||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||.||.|
Sbjct  223  GGCAAGGGTCTCAAACTAAATACTGCAGAAGATGCTAAAGATGTGATTAAGGAGATTGAAGAGTTTGACGGCCT  296

Query  153  GGAGGCTCTGCGTCTGGAAGGCAACACAGTGGGCGTGGAAGCAGCCAGGGTCATCGCCAAGGCCTTAGAGAAGA  226
            .||.|||||.||..||||.||||||||.||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  CGAAGCTCTACGATTGGAGGGCAACACGGTGGGCGTGGAAGCGGCCAGAGTCATCGCCAAGGCCTTAGAGAAGA  370

Query  227  AGTCGGAGTTGAAGCGCTGCCACTGGAGTGACATGTTCACGGGAAGGCTGCGGACCGAGATCCCACCAGCCCTG  300
            ||||.|||.|||||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||.|||.|.||||||||||||||.|||
Sbjct  371  AGTCTGAGCTGAAGCGATGCCACTGGAGTGACATGTTCACAGGAAGGCTTCGGTCTGAGATCCCACCAGCTCTG  444

Query  301  ATCTCACTAGGGGAAGGACTCATCACAGCTGGGGCTCAGCTGGTGGAGCTGGACTTAAGCGACAACGCATTCGG  374
            ||||||||||||||.|||||||||||.||.||.||.|||||||||||.||||||.|.||.|||||||||||.||
Sbjct  445  ATCTCACTAGGGGAGGGACTCATCACTGCAGGAGCACAGCTGGTGGAACTGGACCTCAGTGACAACGCATTTGG  518

Query  375  GCCCGACGGTGTGCAAGGCTTCGAGGCCCTGCTCAAGAGCTCAGCCTGCTTCACCCTGCAGGAACTCAAGCTCA  448
            .|||||.||.||||.|||||||||||||||.|||||||||.||||||||||||||||.||||||||||||||.|
Sbjct  519  ACCCGATGGAGTGCGAGGCTTCGAGGCCCTCCTCAAGAGCCCAGCCTGCTTCACCCTACAGGAACTCAAGCTTA  592

Query  449  ACAACTGTGGCATGGGCATTGGCGGCGGCAAGATCCTGGCTGCAGCTCTGACCGAATGTCACCGGAAATCCAGT  522
            |||||||||||||||||||.||.||.||||||||.|||||.|||||||||||.||.||||||||.||.||||||
Sbjct  593  ACAACTGTGGCATGGGCATCGGGGGTGGCAAGATTCTGGCAGCAGCTCTGACTGAGTGTCACCGCAAGTCCAGT  666

Query  523  GCCCAAGGCAAGCCTCTGGCCCTGAAGGTCTTTGTGGCTGGCAGAAACCGTCTGGAGAATGATGGCGCCACTGC  596
            ||||||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||.||.|||||||||||.||.||||||||
Sbjct  667  GCCCAAGGCAAGCCCCTGGCCCTGAAGGTGTTTGTGGCTGGCAGAAATCGCCTGGAGAATGACGGAGCCACTGC  740

Query  597  CTTGGCAGAAGCTTTTAGGGTCATCGGGACCCTGGAGGAGGTCCACATGCCACAGAATGGGATCAACCACCCTG  670
            ..||||||||||||||.||.||||||||||.|||||.|||||.||.|||||||||||.||.||.|||||.||||
Sbjct  741  ACTGGCAGAAGCTTTTGGGATCATCGGGACTCTGGAAGAGGTGCATATGCCACAGAACGGAATTAACCATCCTG  814

Query  671  GCATCACTGCCCTGGCCCAGGCTTTCGCTGTCAACCCCCTGCTGCGGGTCATCAACCTGAATGACAACACCTTC  744
            |..||||.||||||||||||||.||.||..|||||||||||.||||.|||||||||||.|||||||||||||||
Sbjct  815  GTGTCACAGCCCTGGCCCAGGCCTTTGCCATCAACCCCCTGTTGCGAGTCATCAACCTAAATGACAACACCTTC  888

Query  745  ACTGAGAAGGGCGCCGTGGCCATGGCCGAGACCTTGAAGACCTTGCGGCAGGTGGAGGTGATTAATTTTGGGGA  818
            |||||||||||.|..|||||||||||.|||||..|||||||..||||.||.|||||.|||||.||||||||.||
Sbjct  889  ACTGAGAAGGGTGGGGTGGCCATGGCTGAGACTCTGAAGACTCTGCGACAAGTGGAAGTGATCAATTTTGGAGA  962

Query  819  CTGCCTGGTGCGCTCCAAGGGTGCAGTTGCCATTGCAGATGCCATCCGCGGCGGCCTGCCCAAGCTAAAGGAGC  892
            |||||||||||||||.||||||||.||||||||.||||||||..||||.||.||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  CTGCCTGGTGCGCTCTAAGGGTGCCGTTGCCATCGCAGATGCTGTCCGTGGTGGCCTGCCCAAGCTAAAGGAGC  1036

Query  893  TGAACTTGTCATTCTGTGAAATCAAGAGGGATGCTGCCCTGGCTGTTGCTGAGGCCATGGCAGACAAAGCTGAG  966
            ||||..||||.|||||.|||||||||||.|||||||||||||.||||||||||||..||||.|||||.||||||
Sbjct 1037  TGAATCTGTCGTTCTGCGAAATCAAGAGAGATGCTGCCCTGGTTGTTGCTGAGGCTGTGGCCGACAAGGCTGAG  1110

Query  967  CTGGAGAAGCTGGACCTGAATGGCAACACCCTGGGAGAAGAAGGCTGTGAACAGCTTCAGGAGGTGCTGGAGGG  1040
            |||||||||||||||||.||||||||..||||.||||||||.||||||||.|||||||||||||||.||||..|
Sbjct 1111  CTGGAGAAGCTGGACCTCAATGGCAATGCCCTCGGAGAAGAGGGCTGTGAGCAGCTTCAGGAGGTGATGGACAG  1184

Query 1041  CTTCAACATGGCCAAGGTGCTGGCGTCCCTCAGTGATGA------CGAGGACGAGGAGGAGGAGGAGGAAGGAG  1108
            ||||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||      .|||||.||.||.||||||||.|||||||
Sbjct 1185  CTTCAATATGGCCAAGGTGCTGGCATCCCTCAGTGATGATGAGGGAGAGGATGAAGATGAGGAGGAAGAAGGAG  1258

Query 1109  AAGAG---GAAGAAGAGGAAGCAGAAGAAGAGGAGGAGGAAGATGAGGAAGAGGAGGAAGAAGAGGAGGAGGAG  1179
            |||||   ||.||.|||||.|.|||.||||||||.|||||||||||.||.||||||   ||.||||||.|||||
Sbjct 1259  AAGAGGATGATGAGGAGGAGGAAGATGAAGAGGATGAGGAAGATGATGATGAGGAG---GAGGAGGAGCAGGAG  1329

Query 1180  GAGGAAGAAGAGCCTCAGCAGCGAGGG-CAGGGAGAGAAGTCAGCCACGCCCTCACGGAAGATTCTGGACCCTA  1252
            ||.||.||||||||||.||||.||||| ||||| |||.||.|.||.||.|||||..|||||||.||||||||||
Sbjct 1330  GAAGAGGAAGAGCCTCCGCAGAGAGGGTCAGGG-GAGGAGCCGGCTACACCCTCGAGGAAGATCCTGGACCCTA  1402

Query 1253  ACACTGGGGAGCCAGCTCCCGTGCTGTCCTCCCCACCTCCTGCAGACGTCTCCACCTTCCTGGCTTTTCCCTCT  1326
            |||.||||||||||||||||||||||||||||||..||||..|||||.||||||||||||||.|.||.|||||.
Sbjct 1403  ACAGTGGGGAGCCAGCTCCCGTGCTGTCCTCCCCGACTCCCACAGACCTCTCCACCTTCCTGTCATTCCCCTCC  1476

Query 1327  CCAGAGAAGCTGCTGCGCCTAGGGCCCAAGAGCTCCGTGCTGATAGCCCAGCAGACTGACACGTCTGACCCCGA  1400
            |||||||||||||||||.||.||.||||||..|||.||||||||||.||||||||||||.||.||.|||||.||
Sbjct 1477  CCAGAGAAGCTGCTGCGTCTGGGTCCCAAGGTCTCGGTGCTGATAGTCCAGCAGACTGATACCTCCGACCCAGA  1550

Query 1401  GAAGGTGGTCTCTGCCTTCCTAAAGGTGTCATCTGTGTTCAAGGACGAAGCTACTGTGAGGATGGCAGTGCAGG  1474
            ||||||.||.||.||||||||.||||||.||||||||||||.|||.||.||..|.||.|.||..|||||||.||
Sbjct 1551  GAAGGTTGTTTCAGCCTTCCTGAAGGTGGCATCTGTGTTCAGGGATGACGCCTCAGTAAAGACCGCAGTGCTGG  1624

Query 1475  ATGCAGTAGATGCCCTGATGCAGAAGGCTTTCAACTCCTCGTCCTTCAACTCCAACACCTTCCTCACCAGGCTC  1548
            ||||..|.||||||||.|||.|||||||.||||.||.|||.||.|||||.||||||||||||||.||||||||.
Sbjct 1625  ATGCCATCGATGCCCTCATGAAGAAGGCCTTCAGCTGCTCCTCTTTCAATTCCAACACCTTCCTTACCAGGCTG  1698

Query 1549  CTCGTGCACATGGGTCTGCTCAAGAGTGAAGACAAGGTCAAGGCCATTGCCAACCTGTACGGCCCCCTGATGGC  1622
            |||.|.||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||..|||.||||.|.|||||||||||||.
Sbjct 1699  CTCATCCACATGGGTCTGCTCAAGAGTGAAGACAAGATCAAGGCCATACCCAGCCTGCATGGCCCCCTGATGGT  1772

Query 1623  GCTGAACCACATGGTGCAGCAGGACTATTTCCCCAAGGCCCTTGCACCCCTGCTGCTGGCGTTCGTGACCAAGC  1696
            |.||||||||.|||||..||||||||||||||||||||||||||||||||||||..||||.||.|||||.||||
Sbjct 1773  GTTGAACCACGTGGTGAGGCAGGACTATTTCCCCAAGGCCCTTGCACCCCTGCTCTTGGCATTTGTGACAAAGC  1846

Query 1697  CCAACAGCGCCCTGGAATCCTGCTCCTTCGCCCGCCACAGTCTGCTGCAGACGCTGTACAAGGTC  1761
            ||||..||||.||||||.||||||||||.||||||||||.|||||||||||||||.|||||..||
Sbjct 1847  CCAATGGCGCGCTGGAAACCTGCTCCTTTGCCCGCCACAATCTGCTGCAGACGCTATACAACATC  1911