Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000469733
• Subject: NM_001163152.1
• Aligned Length: 1455
• Identities: 1094
• Gaps: 357

Alignment

Query    1  ATGGATGGATTTTATGACCAGCAAGTGCCTTACATGGTCACCAATAGTCAGCGTGGGAGAAATTGTAACGAGAA  74
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query   75  ACCAACAAATGTCAGGAAAAGAAAATTCATTAACAGAGATCTGGCTCATGATTCAGAAGAACTCTTTCAAGATC  148
                                                              ||.|           ||||||||.
Sbjct    1  --------------------------------------------------ATGC-----------TTCAAGATT  13

Query  149  TAAGT-CAA---------TTACAGGAAACATGGCTTG---------CAGA-----AGCTCAGGTACCTGACAAT  198
            ||||| |||         ||.||         .||||         ||||     |||||||||||||||||||
Sbjct   14  TAAGTGCAAGTGTCTTCTTTCCA---------CCTTGTTCACAACACAGAACGTTAGCTCAGGTACCTGACAAT  78

Query  199  GATGAGCAGTTTGTACCAGACTATCAGGCTGAAAGTTTGGCTTTTCATGGCCTGCCACTGAAAATCAAGAAAGA  272
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   79  GATGAGCAGTTTGTACCAGACTATCAGGCTGAAAGTTTGGCTTTTCATGGCCTGCCACTGAAAATCAAGAAAGA  152

Query  273  ACCCCACAGTCCATGTTCAGAAATCAGCTCTGCCTGCAGTCAAGAACAGCCCTTTAAATTCAGCTATGGAGAAA  346
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  153  ACCCCACAGTCCATGTTCAGAAATCAGCTCTGCCTGCAGTCAAGAACAGCCCTTTAAATTCAGCTATGGAGAAA  226

Query  347  AGTGCCTGTACAATGTCAGTGCCTATGATCAGAAGCCACAAGTGGGAATGAGGCCCTCCAACCCCCCCACACCA  420
            ||||||||||||||||                                                          
Sbjct  227  AGTGCCTGTACAATGT----------------------------------------------------------  242

Query  421  TCCAGCACGCCAGTGTCCCCACTGCATCATGCATCTCCAAACTCAACTCATACACCGAAACCTGACCGGGCCTT  494
                                                                                      
Sbjct  243  --------------------------------------------------------------------------  242

Query  495  CCCAGCTCACCTCCCTCCATCGCAGTCCATACCAGATAGCAGCTACCCCATGGACCACAGATTTCGCCGCCAGC  568
                                                                     |||||||||||||||||
Sbjct  243  ---------------------------------------------------------CAGATTTCGCCGCCAGC  259

Query  569  TTTCTGAACCCTGTAACTCCTTTCCTCCTTTGCCGACGATGCCAAGGGAAGGACGTCCTATGTACCAACGCCAG  642
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  260  TTTCTGAACCCTGTAACTCCTTTCCTCCTTTGCCGACGATGCCAAGGGAAGGACGTCCTATGTACCAACGCCAG  333

Query  643  ATGTCTGAGCCAAACATCCCCTTCCCACCACAAGGCTTTAAGCAGGAGTACCACGACCCAGTGTATGAACACAA  716
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  334  ATGTCTGAGCCAAACATCCCCTTCCCACCACAAGGCTTTAAGCAGGAGTACCACGACCCAGTGTATGAACACAA  407

Query  717  CACCATGGTTGGCAGTGCGGCCAGCCAAAGCTTTCCCCCTCCTCTGATGATTAAACAGGAACCCAGAGATTTTG  790
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  408  CACCATGGTTGGCAGTGCGGCCAGCCAAAGCTTTCCCCCTCCTCTGATGATTAAACAGGAACCCAGAGATTTTG  481

Query  791  CATATGACTCAGAAGTGCCTAGCTGCCACTCCATTTATATGAGGCAAGAAGGCTTCCTGGCTCATCCCAGCAGA  864
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  482  CATATGACTCAGAAGTGCCTAGCTGCCACTCCATTTATATGAGGCAAGAAGGCTTCCTGGCTCATCCCAGCAGA  555

Query  865  ACAGAAGGCTGTATGTTTGAAAAGGGCCCCAGGCAGTTTTATGATGACACCTGTGTTGTCCCAGAAAAATTCGA  938
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  556  ACAGAAGGCTGTATGTTTGAAAAGGGCCCCAGGCAGTTTTATGATGACACCTGTGTTGTCCCAGAAAAATTCGA  629

Query  939  TGGAGACATCAAACAAGAGCCAGGAATGTATCGGGAAGGACCCACATACCAACGGCGAGGATCACTTCAGCTCT  1012
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  630  TGGAGACATCAAACAAGAGCCAGGAATGTATCGGGAAGGACCCACATACCAACGGCGAGGATCACTTCAGCTCT  703

Query 1013  GGCAGTTTTTGGTAGCTCTTCTGGATGACCCTTCAAATTCTCATTTTATTGCCTGGACTGGTCGAGGCATGGAA  1086
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  704  GGCAGTTTTTGGTAGCTCTTCTGGATGACCCTTCAAATTCTCATTTTATTGCCTGGACTGGTCGAGGCATGGAA  777

Query 1087  TTTAAACTGATTGAGCCTGAAGAGGTGGCCCGACGTTGGGGCATTCAGAAAAACAGGCCAGCTATGAACTATGA  1160
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  778  TTTAAACTGATTGAGCCTGAAGAGGTGGCCCGACGTTGGGGCATTCAGAAAAACAGGCCAGCTATGAACTATGA  851

Query 1161  TAAACTTAGCCGTTCACTCCGCTATTACTATGAGAAAGGAATTATGCAAAAGGTGGCTGGAGAGAGATATGTCT  1234
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  852  TAAACTTAGCCGTTCACTCCGCTATTACTATGAGAAAGGAATTATGCAAAAGGTGGCTGGAGAGAGATATGTCT  925

Query 1235  ACAAGTTTGTGTGTGATCCAGAAGCCCTTTTCTCCATGGCCTTTCCAGATAATCAGCGTCCACTGCTGAAGACA  1308
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  926  ACAAGTTTGTGTGTGATCCAGAAGCCCTTTTCTCCATGGCCTTTCCAGATAATCAGCGTCCACTGCTGAAGACA  999

Query 1309  GACATGGAACGTCACATCAACGAGGAGGACACAGTGCCTCTTTCTCACTTTGATGAGAGCATGGCCTACATGCC  1382
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1000  GACATGGAACGTCACATCAACGAGGAGGACACAGTGCCTCTTTCTCACTTTGATGAGAGCATGGCCTACATGCC  1073

Query 1383  GGAAGGGGGCTGCTGCAACCCCCACCCCTACAACGAAGGCTACGTGTAT  1431
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1074  GGAAGGGGGCTGCTGCAACCCCCACCCCTACAACGAAGGCTACGTGTAT  1122