Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000469733
• Subject: NM_001163154.1
• Aligned Length: 1458
• Identities: 1198
• Gaps: 174

Alignment

Query    1  ATGGATGGATTTTATGACCAGCAAGTGCCTTACATGGTCACCAATAGTCAGCGTGGGAGAAATTGTAACGAGAA  74
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query   75  ACCAACAAATGTCAGGAAAAGAAAATTCATTAACAGAGATCTGGCTCATGATTCAGAAGAACTCTTTCAAGATC  148
                                                              ||.|           ||||||||.
Sbjct    1  --------------------------------------------------ATGC-----------TTCAAGATT  13

Query  149  TAAGT---------------------------CAATTACAGGAAACATGGCTTGCAGAAGCTCAGGTACCTGAC  195
            |||||                           ||| .||||  |||||         .||||||||||||||||
Sbjct   14  TAAGTGCAGGCGTCTTCTTCCCTCCTTGTTCACAA-CACAG--AACAT---------TAGCTCAGGTACCTGAC  75

Query  196  AATGATGAGCAGTTTGTACCAGACTATCAGGCTGAAAGTTTGGCTTTTCATGGCCTGCCACTGAAAATCAAGAA  269
            |||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||
Sbjct   76  AATGATGAGCAGTTTGTTCCAGACTATCAGGCTGAAAGTTTGGCTTTTCATGGCCTCCCACTGAAAATCAAGAA  149

Query  270  AGAACCCCACAGTCCATGTTCAGAAATCAGCTCTGCCTGCAGTCAAGAACAGCCCTTTAAATTCAGCTATGGAG  343
            ||||||||||||.||||||||||||.||.|.|||||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||||
Sbjct  150  AGAACCCCACAGCCCATGTTCAGAACTCGGGTCTGCTTGCAGTCAAGAGCAGCCCTTTAAATTCAGCTATGGAG  223

Query  344  AAAAGTGCCTGTACAATGTCAGTGCCTATGATCAGAAGCCACAAGTGGGAATGAGGCCCTCCAACCCCCCCACA  417
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||
Sbjct  224  AAAAGTGCCTGTACAATGTCAGTGCCTATGATCAGAAGCCACAAGTGGGAATGAGGCCCTCCAATCCCCCGACA  297

Query  418  CCATCCAGCACGCCAGTGTCCCCACTGCATCATGCATCTCCAAACTCAACTCATACACCGAAACCTGACCGGGC  491
            |||||||||||.||||||||||||||.||.|||||||||||||||.||.|||||||.|||||||||||||||||
Sbjct  298  CCATCCAGCACTCCAGTGTCCCCACTACACCATGCATCTCCAAACACAGCTCATACTCCGAAACCTGACCGGGC  371

Query  492  CTTCCCAGCTCACCTCCCTCCATCGCAGTCCATACCAGATAGCAGCTACCCCATGGACCACAGATTTCGCCGCC  565
            |||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||.||||.|||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  372  CTTCCCAGCTCACCTCCCTCCTTCTCAGTCCATACCAGACAGCACCTACCCCATGGACCACAGATTTCGCCGCC  445

Query  566  AGCTTTCTGAACCCTGTAACTCCTTTCCTCCTTTGCCGACGATGCCAAGGGAAGGACGTCCTATGTACCAACGC  639
            |||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||||||
Sbjct  446  AGCTTTCTGAACCCTGTAATTCTTTTCCTCCTTTGCCGACAATGCCAAGGGAAGGGCGTCCTATGTACCAACGC  519

Query  640  CAGATGTCTGAGCCAAACATCCCCTTCCCACCACAAGGCTTTAAGCAGGAGTACCACGACCCAGTGTATGAACA  713
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||
Sbjct  520  CAGATGTCTGAGCCAAACATCCCCTTCCCACCACAAGGCTTTAAGCAGGAGTACCACGACCCAGTCTATGAACA  593

Query  714  CAACACCATGGTTGGCAGTGCGGCCAGCCAAAGCTTTCCCCCTCCTCTGATGATTAAACAGGAACCCAGAGATT  787
            .|.|||||||||||||.||||.||||||||||||||.|||||||||.|||||||.|||||||||||||||||||
Sbjct  594  TACCACCATGGTTGGCGGTGCAGCCAGCCAAAGCTTCCCCCCTCCTTTGATGATCAAACAGGAACCCAGAGATT  667

Query  788  TTGCATATGACTCAGAAGTGCCTAGCTGCCACTCCATTTATATGAGGCAAGAAGGCTTCCTGGCTCATCCCAGC  861
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||
Sbjct  668  TTGCATATGACTCAGAAGTGCCTAGCTGCCACTCCATTTATATGAGGCAAGAAGGCTTCCTGGCTCATCCAAGC  741

Query  862  AGAACAGAAGGCTGTATGTTTGAAAAGGGCCCCAGGCAGTTTTATGATGACACCTGTGTTGTCCCAGAAAAATT  935
            ||||||||||||||.||||||||.|||||.|||||||||||.|||||||||||||||||.|||||.||.||.||
Sbjct  742  AGAACAGAAGGCTGCATGTTTGAGAAGGGTCCCAGGCAGTTCTATGATGACACCTGTGTGGTCCCGGAGAAGTT  815

Query  936  CGATGGAGACATCAAACAAGAGCCAGGAATGTATCGGGAAGGACCCACATACCAACGGCGAGGATCACTTCAGC  1009
            ||||||.|||||.||.||||||||.||||||||.||||||||||||||.|||||..||||||||||.||.||||
Sbjct  816  CGATGGGGACATTAAGCAAGAGCCTGGAATGTACCGGGAAGGACCCACGTACCAGAGGCGAGGATCCCTCCAGC  889

Query 1010  TCTGGCAGTTTTTGGTAGCTCTTCTGGATGACCCTTCAAATTCTCATTTTATTGCCTGGACTGGTCGAGGCATG  1083
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||||||
Sbjct  890  TCTGGCAGTTTTTGGTAGCTCTTCTGGATGACCCTTCAAATTCTCATTTCATTGCCTGGACTGGACGAGGCATG  963

Query 1084  GAATTTAAACTGATTGAGCCTGAAGAGGTGGCCCGACGTTGGGGCATTCAGAAAAACAGGCCAGCTATGAACTA  1157
            ||||||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||.||.||||||||
Sbjct  964  GAATTTAAACTGATTGAGCCCGAAGAGGTGGCCCGGCGTTGGGGCATTCAGAAGAACAGGCCGGCGATGAACTA  1037

Query 1158  TGATAAACTTAGCCGTTCACTCCGCTATTACTATGAGAAAGGAATTATGCAAAAGGTGGCTGGAGAGAGATATG  1231
            |||.||||||||.|||||.|||||||||||.||||||||.|||||.||||||||||||||||||||.|||||.|
Sbjct 1038  TGACAAACTTAGTCGTTCTCTCCGCTATTATTATGAGAAGGGAATCATGCAAAAGGTGGCTGGAGAAAGATACG  1111

Query 1232  TCTACAAGTTTGTGTGTGATCCAGAAGCCCTTTTCTCCATGGCCTTTCCAGATAATCAGCGTCCACTGCTGAAG  1305
            |.|||||.|||||||||||.||.||||||||||||||.|||||||||||.|||||.|||||.||||||||||||
Sbjct 1112  TGTACAAATTTGTGTGTGACCCGGAAGCCCTTTTCTCTATGGCCTTTCCGGATAACCAGCGCCCACTGCTGAAG  1185

Query 1306  ACAGACATGGAACGTCACATCAACGAGGAGGACACAGTGCCTCTTTCTCACTTTGATGAGAGCATGGCCTACAT  1379
            ||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||.|||||||
Sbjct 1186  ACGGACATGGAACGTCACATCAACGAAGAGGACACAGTGCCTCTGTCTCACTTTGATGAGAGCATGACCTACAT  1259

Query 1380  GCCGGAAGGGGGCTGCTGCAACCCCCACCCCTACAACGAAGGCTACGTGTAT  1431
            |||.||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||.
Sbjct 1260  GCCCGAAGGGGGCTGCTGCAACCCTCACCCCTACAACGAAGGATACGTGTAC  1311