Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000469733
• Subject: NM_001347379.1
• Aligned Length: 1431
• Identities: 1288
• Gaps: 54

Alignment

Query    1  ATGGATGGATTTTATGACCAGCAAGTGCCTTACATGGTCACCAATAGTCAGCGTGGGAGAAATTGTAACGAGAA  74
            |||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||.|||||||||||||||||.||||.||||||
Sbjct    1  ATGGATGGATTTTATGACCAGCAAGTGCCTTACGTGGTCACCAACAGTCAGCGTGGGAGAAACTGTACCGAGAA  74

Query   75  ACCAACAAATGTCAGGAAAAGAAAATTCATTAACAGAGATCTGGCTCATGATTCAGAAGAACTCTTTCAAGATC  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  ACCAACAAATGTCAGGAAAAGAAAATTCATTAACAGAGATCTGGCTCATGATTCAGAAGAACTCTTTCAAGATC  148

Query  149  TAAGTCAATTACAGGAAACATGGCTTGCAGAAGCTCAGGTACCTGACAATGATGAGCAGTTTGTACCAGACTAT  222
            |.|||||.|||||.||||||||||||||.||||                                         
Sbjct  149  TGAGTCAGTTACAAGAAACATGGCTTGCTGAAG-----------------------------------------  181

Query  223  CAGGCTGAAAGTTTGGCTTTTCATGGCCTGCCACTGAAAATCAAGAAAGAACCCCACAGTCCATGTTCAGAAAT  296
                         ||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||.|
Sbjct  182  -------------TGGCTTTTCATGGCCTCCCACTGAAAATCAAGAAAGAACCCCACAGCCCATGTTCAGAACT  242

Query  297  CAGCTCTGCCTGCAGTCAAGAACAGCCCTTTAAATTCAGCTATGGAGAAAAGTGCCTGTACAATGTCAGTGCCT  370
            |.|.|||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  243  CGGGTCTGCTTGCAGTCAAGAGCAGCCCTTTAAATTCAGCTATGGAGAAAAGTGCCTGTACAATGTCAGTGCCT  316

Query  371  ATGATCAGAAGCCACAAGTGGGAATGAGGCCCTCCAACCCCCCCACACCATCCAGCACGCCAGTGTCCCCACTG  444
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||.||||||||||||||.
Sbjct  317  ATGATCAGAAGCCACAAGTGGGAATGAGGCCCTCCAATCCCCCGACACCATCCAGCACTCCAGTGTCCCCACTA  390

Query  445  CATCATGCATCTCCAAACTCAACTCATACACCGAAACCTGACCGGGCCTTCCCAGCTCACCTCCCTCCATCGCA  518
            ||.|||||||||||||||.||.|||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||
Sbjct  391  CACCATGCATCTCCAAACACAGCTCATACTCCGAAACCTGACCGGGCCTTCCCAGCTCACCTCCCTCCTTCTCA  464

Query  519  GTCCATACCAGATAGCAGCTACCCCATGGACCACAGATTTCGCCGCCAGCTTTCTGAACCCTGTAACTCCTTTC  592
            ||||||||||||.||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||||
Sbjct  465  GTCCATACCAGACAGCACCTACCCCATGGACCACAGATTTCGCCGCCAGCTTTCTGAACCCTGTAATTCTTTTC  538

Query  593  CTCCTTTGCCGACGATGCCAAGGGAAGGACGTCCTATGTACCAACGCCAGATGTCTGAGCCAAACATCCCCTTC  666
            |||||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  539  CTCCTTTGCCGACAATGCCAAGGGAAGGGCGTCCTATGTACCAACGCCAGATGTCTGAGCCAAACATCCCCTTC  612

Query  667  CCACCACAAGGCTTTAAGCAGGAGTACCACGACCCAGTGTATGAACACAACACCATGGTTGGCAGTGCGGCCAG  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|.|||||||||||||.||||.|||||
Sbjct  613  CCACCACAAGGCTTTAAGCAGGAGTACCACGACCCAGTCTATGAACATACCACCATGGTTGGCGGTGCAGCCAG  686

Query  741  CCAAAGCTTTCCCCCTCCTCTGATGATTAAACAGGAACCCAGAGATTTTGCATATGACTCAGAAGTGCCTAGCT  814
            |||||||||.|||||||||.|||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  687  CCAAAGCTTCCCCCCTCCTTTGATGATCAAACAGGAACCCAGAGATTTTGCATATGACTCAGAAGTGCCTAGCT  760

Query  815  GCCACTCCATTTATATGAGGCAAGAAGGCTTCCTGGCTCATCCCAGCAGAACAGAAGGCTGTATGTTTGAAAAG  888
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||.|||
Sbjct  761  GCCACTCCATTTATATGAGGCAAGAAGGCTTCCTGGCTCATCCAAGCAGAACAGAAGGCTGCATGTTTGAGAAG  834

Query  889  GGCCCCAGGCAGTTTTATGATGACACCTGTGTTGTCCCAGAAAAATTCGATGGAGACATCAAACAAGAGCCAGG  962
            ||.|||||||||||.|||||||||||||||||.|||||.||.||.||||||||.|||||.||.||||||||.||
Sbjct  835  GGTCCCAGGCAGTTCTATGATGACACCTGTGTGGTCCCGGAGAAGTTCGATGGGGACATTAAGCAAGAGCCTGG  908

Query  963  AATGTATCGGGAAGGACCCACATACCAACGGCGAGGATCACTTCAGCTCTGGCAGTTTTTGGTAGCTCTTCTGG  1036
            ||||||.||||||||||||||.|||||..||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  909  AATGTACCGGGAAGGACCCACGTACCAGAGGCGAGGATCCCTCCAGCTCTGGCAGTTTTTGGTAGCTCTTCTGG  982

Query 1037  ATGACCCTTCAAATTCTCATTTTATTGCCTGGACTGGTCGAGGCATGGAATTTAAACTGATTGAGCCTGAAGAG  1110
            ||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||
Sbjct  983  ATGACCCTTCAAATTCTCATTTCATTGCCTGGACTGGACGAGGCATGGAATTTAAACTGATTGAGCCCGAAGAG  1056

Query 1111  GTGGCCCGACGTTGGGGCATTCAGAAAAACAGGCCAGCTATGAACTATGATAAACTTAGCCGTTCACTCCGCTA  1184
            ||||||||.|||||||||||||||||.||||||||.||.|||||||||||.||||||||.|||||.||||||||
Sbjct 1057  GTGGCCCGGCGTTGGGGCATTCAGAAGAACAGGCCGGCGATGAACTATGACAAACTTAGTCGTTCTCTCCGCTA  1130

Query 1185  TTACTATGAGAAAGGAATTATGCAAAAGGTGGCTGGAGAGAGATATGTCTACAAGTTTGTGTGTGATCCAGAAG  1258
            |||.||||||||.|||||.||||||||||||||||||||.|||||.||.|||||.|||||||||||.||.||||
Sbjct 1131  TTATTATGAGAAGGGAATCATGCAAAAGGTGGCTGGAGAAAGATACGTGTACAAATTTGTGTGTGACCCGGAAG  1204

Query 1259  CCCTTTTCTCCATGGCCTTTCCAGATAATCAGCGTCCACTGCTGAAGACAGACATGGAACGTCACATCAACGAG  1332
            ||||||||||.|||||||||||.|||||.|||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.
Sbjct 1205  CCCTTTTCTCTATGGCCTTTCCGGATAACCAGCGCCCACTGCTGAAGACGGACATGGAACGTCACATCAACGAA  1278

Query 1333  GAGGACACAGTGCCTCTTTCTCACTTTGATGAGAGCATGGCCTACATGCCGGAAGGGGGCTGCTGCAACCCCCA  1406
            |||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||.||||||||||.||||||||||||||||||||.||
Sbjct 1279  GAGGACACAGTGCCTCTGTCTCACTTTGATGAGAGCATGACCTACATGCCCGAAGGGGGCTGCTGCAACCCTCA  1352

Query 1407  CCCCTACAACGAAGGCTACGTGTAT  1431
            |||||||||||||||.||||||||.
Sbjct 1353  CCCCTACAACGAAGGATACGTGTAC  1377