Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000469733
- Subject:
- XM_006514964.3
- Aligned Length:
- 1492
- Identities:
- 1321
- Gaps:
- 74
Alignment
Query 1 ---------------------------------------------------------ATGGATGGATTTTATGA 17
.|||.|||.|||
Sbjct 1 ATGTCCACGATGAGTGCAAGAGGAGACGGAGGGCAGCAACAGCTGCACTCAAAGTTTGTGGCTGGGTTT----- 69
Query 18 CCAGCAAGTGCCTTACATGG----TCACCAATAGTCAGCGTGGGAGAAATTGTAACGAGAAACCAACAAATGTC 87
|..|||| ||||.| ..||.|| |||||||||||||||||.||||.|||||||||||||||||||
Sbjct 70 -----ATCTGCC--ACATTGAAAAGAACGAA-AGTCAGCGTGGGAGAAACTGTACCGAGAAACCAACAAATGTC 135
Query 88 AGGAAAAGAAAATTCATTAACAGAGATCTGGCTCATGATTCAGAAGAACTCTTTCAAGATCTAAGTCAATTACA 161
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||
Sbjct 136 AGGAAAAGAAAATTCATTAACAGAGATCTGGCTCATGATTCAGAAGAACTCTTTCAAGATCTGAGTCAGTTACA 209
Query 162 GGAAACATGGCTTGCAGAAGCTCAGGTACCTGACAATGATGAGCAGTTTGTACCAGACTATCAGGCTGAAAGTT 235
.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||
Sbjct 210 AGAAACATGGCTTGCTGAAGCTCAGGTACCTGACAATGATGAGCAGTTTGTTCCAGACTATCAGGCTGAAAGTT 283
Query 236 TGGCTTTTCATGGCCTGCCACTGAAAATCAAGAAAGAACCCCACAGTCCATGTTCAGAAATCAGCTCTGCCTGC 309
||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||.||.|.|||||.|||
Sbjct 284 TGGCTTTTCATGGCCTCCCACTGAAAATCAAGAAAGAACCCCACAGCCCATGTTCAGAACTCGGGTCTGCTTGC 357
Query 310 AGTCAAGAACAGCCCTTTAAATTCAGCTATGGAGAAAAGTGCCTGTACAATGTCAGTGCCTATGATCAGAAGCC 383
||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 358 AGTCAAGAGCAGCCCTTTAAATTCAGCTATGGAGAAAAGTGCCTGTACAATGTCAGTGCCTATGATCAGAAGCC 431
Query 384 ACAAGTGGGAATGAGGCCCTCCAACCCCCCCACACCATCCAGCACGCCAGTGTCCCCACTGCATCATGCATCTC 457
||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||.||||||||||||||.||.||||||||||
Sbjct 432 ACAAGTGGGAATGAGGCCCTCCAATCCCCCGACACCATCCAGCACTCCAGTGTCCCCACTACACCATGCATCTC 505
Query 458 CAAACTCAACTCATACACCGAAACCTGACCGGGCCTTCCCAGCTCACCTCCCTCCATCGCAGTCCATACCAGAT 531
|||||.||.|||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||.
Sbjct 506 CAAACACAGCTCATACTCCGAAACCTGACCGGGCCTTCCCAGCTCACCTCCCTCCTTCTCAGTCCATACCAGAC 579
Query 532 AGCAGCTACCCCATGGACCACAGATTTCGCCGCCAGCTTTCTGAACCCTGTAACTCCTTTCCTCCTTTGCCGAC 605
||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||
Sbjct 580 AGCACCTACCCCATGGACCACAGATTTCGCCGCCAGCTTTCTGAACCCTGTAATTCTTTTCCTCCTTTGCCGAC 653
Query 606 GATGCCAAGGGAAGGACGTCCTATGTACCAACGCCAGATGTCTGAGCCAAACATCCCCTTCCCACCACAAGGCT 679
.||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 654 AATGCCAAGGGAAGGGCGTCCTATGTACCAACGCCAGATGTCTGAGCCAAACATCCCCTTCCCACCACAAGGCT 727
Query 680 TTAAGCAGGAGTACCACGACCCAGTGTATGAACACAACACCATGGTTGGCAGTGCGGCCAGCCAAAGCTTTCCC 753
|||||||||||||||||||||||||.||||||||.|.|||||||||||||.||||.||||||||||||||.|||
Sbjct 728 TTAAGCAGGAGTACCACGACCCAGTCTATGAACATACCACCATGGTTGGCGGTGCAGCCAGCCAAAGCTTCCCC 801
Query 754 CCTCCTCTGATGATTAAACAGGAACCCAGAGATTTTGCATATGACTCAGAAGTGCCTAGCTGCCACTCCATTTA 827
||||||.|||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 802 CCTCCTTTGATGATCAAACAGGAACCCAGAGATTTTGCATATGACTCAGAAGTGCCTAGCTGCCACTCCATTTA 875
Query 828 TATGAGGCAAGAAGGCTTCCTGGCTCATCCCAGCAGAACAGAAGGCTGTATGTTTGAAAAGGGCCCCAGGCAGT 901
||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||.|||||.||||||||||
Sbjct 876 TATGAGGCAAGAAGGCTTCCTGGCTCATCCAAGCAGAACAGAAGGCTGCATGTTTGAGAAGGGTCCCAGGCAGT 949
Query 902 TTTATGATGACACCTGTGTTGTCCCAGAAAAATTCGATGGAGACATCAAACAAGAGCCAGGAATGTATCGGGAA 975
|.|||||||||||||||||.|||||.||.||.||||||||.|||||.||.||||||||.||||||||.||||||
Sbjct 950 TCTATGATGACACCTGTGTGGTCCCGGAGAAGTTCGATGGGGACATTAAGCAAGAGCCTGGAATGTACCGGGAA 1023
Query 976 GGACCCACATACCAACGGCGAGGATCACTTCAGCTCTGGCAGTTTTTGGTAGCTCTTCTGGATGACCCTTCAAA 1049
||||||||.|||||..||||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1024 GGACCCACGTACCAGAGGCGAGGATCCCTCCAGCTCTGGCAGTTTTTGGTAGCTCTTCTGGATGACCCTTCAAA 1097
Query 1050 TTCTCATTTTATTGCCTGGACTGGTCGAGGCATGGAATTTAAACTGATTGAGCCTGAAGAGGTGGCCCGACGTT 1123
|||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||||
Sbjct 1098 TTCTCATTTCATTGCCTGGACTGGACGAGGCATGGAATTTAAACTGATTGAGCCCGAAGAGGTGGCCCGGCGTT 1171
Query 1124 GGGGCATTCAGAAAAACAGGCCAGCTATGAACTATGATAAACTTAGCCGTTCACTCCGCTATTACTATGAGAAA 1197
|||||||||||||.||||||||.||.|||||||||||.||||||||.|||||.|||||||||||.||||||||.
Sbjct 1172 GGGGCATTCAGAAGAACAGGCCGGCGATGAACTATGACAAACTTAGTCGTTCTCTCCGCTATTATTATGAGAAG 1245
Query 1198 GGAATTATGCAAAAGGTGGCTGGAGAGAGATATGTCTACAAGTTTGTGTGTGATCCAGAAGCCCTTTTCTCCAT 1271
|||||.||||||||||||||||||||.|||||.||.|||||.|||||||||||.||.||||||||||||||.||
Sbjct 1246 GGAATCATGCAAAAGGTGGCTGGAGAAAGATACGTGTACAAATTTGTGTGTGACCCGGAAGCCCTTTTCTCTAT 1319
Query 1272 GGCCTTTCCAGATAATCAGCGTCCACTGCTGAAGACAGACATGGAACGTCACATCAACGAGGAGGACACAGTGC 1345
|||||||||.|||||.|||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||||
Sbjct 1320 GGCCTTTCCGGATAACCAGCGCCCACTGCTGAAGACGGACATGGAACGTCACATCAACGAAGAGGACACAGTGC 1393
Query 1346 CTCTTTCTCACTTTGATGAGAGCATGGCCTACATGCCGGAAGGGGGCTGCTGCAACCCCCACCCCTACAACGAA 1419
||||.|||||||||||||||||||||.||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||||||
Sbjct 1394 CTCTGTCTCACTTTGATGAGAGCATGACCTACATGCCCGAAGGGGGCTGCTGCAACCCTCACCCCTACAACGAA 1467
Query 1420 GGCTACGTGTAT 1431
||.||||||||.
Sbjct 1468 GGATACGTGTAC 1479