Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000469733
- Subject:
- XM_006514970.3
- Aligned Length:
- 1432
- Identities:
- 1177
- Gaps:
- 170
Alignment
Query 1 ATGGATGGATTTTATGACCAGCAAGTGCCTTACATGGTCACCAATAGTCAGCGTGGGAGAAATTGTAACGAGAA 74
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 75 ACCAACAAATGTCAGGAAAAGAAAATTCATTAACAGAGATCTGGCTCATGATTCAGAAGAACTCTTTCAAGATC 148
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 149 TAAGTCAATTACAGGAAACATGGCTTGCAGAA-GCTCAGGTACCTGACAATGATGAGCAGTTTGTACCAGACTA 221
||| ||...||| ||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||
Sbjct 1 -------------------ATG--TTAATGAATGCTCAGGTACCTGACAATGATGAGCAGTTTGTTCCAGACTA 53
Query 222 TCAGGCTGAAAGTTTGGCTTTTCATGGCCTGCCACTGAAAATCAAGAAAGAACCCCACAGTCCATGTTCAGAAA 295
||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||.
Sbjct 54 TCAGGCTGAAAGTTTGGCTTTTCATGGCCTCCCACTGAAAATCAAGAAAGAACCCCACAGCCCATGTTCAGAAC 127
Query 296 TCAGCTCTGCCTGCAGTCAAGAACAGCCCTTTAAATTCAGCTATGGAGAAAAGTGCCTGTACAATGTCAGTGCC 369
||.|.|||||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 128 TCGGGTCTGCTTGCAGTCAAGAGCAGCCCTTTAAATTCAGCTATGGAGAAAAGTGCCTGTACAATGTCAGTGCC 201
Query 370 TATGATCAGAAGCCACAAGTGGGAATGAGGCCCTCCAACCCCCCCACACCATCCAGCACGCCAGTGTCCCCACT 443
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||.||||||||||||||
Sbjct 202 TATGATCAGAAGCCACAAGTGGGAATGAGGCCCTCCAATCCCCCGACACCATCCAGCACTCCAGTGTCCCCACT 275
Query 444 GCATCATGCATCTCCAAACTCAACTCATACACCGAAACCTGACCGGGCCTTCCCAGCTCACCTCCCTCCATCGC 517
.||.|||||||||||||||.||.|||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|
Sbjct 276 ACACCATGCATCTCCAAACACAGCTCATACTCCGAAACCTGACCGGGCCTTCCCAGCTCACCTCCCTCCTTCTC 349
Query 518 AGTCCATACCAGATAGCAGCTACCCCATGGACCACAGATTTCGCCGCCAGCTTTCTGAACCCTGTAACTCCTTT 591
|||||||||||||.||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||
Sbjct 350 AGTCCATACCAGACAGCACCTACCCCATGGACCACAGATTTCGCCGCCAGCTTTCTGAACCCTGTAATTCTTTT 423
Query 592 CCTCCTTTGCCGACGATGCCAAGGGAAGGACGTCCTATGTACCAACGCCAGATGTCTGAGCCAAACATCCCCTT 665
||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 424 CCTCCTTTGCCGACAATGCCAAGGGAAGGGCGTCCTATGTACCAACGCCAGATGTCTGAGCCAAACATCCCCTT 497
Query 666 CCCACCACAAGGCTTTAAGCAGGAGTACCACGACCCAGTGTATGAACACAACACCATGGTTGGCAGTGCGGCCA 739
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|.|||||||||||||.||||.||||
Sbjct 498 CCCACCACAAGGCTTTAAGCAGGAGTACCACGACCCAGTCTATGAACATACCACCATGGTTGGCGGTGCAGCCA 571
Query 740 GCCAAAGCTTTCCCCCTCCTCTGATGATTAAACAGGAACCCAGAGATTTTGCATATGACTCAGAAGTGCCTAGC 813
||||||||||.|||||||||.|||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 572 GCCAAAGCTTCCCCCCTCCTTTGATGATCAAACAGGAACCCAGAGATTTTGCATATGACTCAGAAGTGCCTAGC 645
Query 814 TGCCACTCCATTTATATGAGGCAAGAAGGCTTCCTGGCTCATCCCAGCAGAACAGAAGGCTGTATGTTTGAAAA 887
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||.||
Sbjct 646 TGCCACTCCATTTATATGAGGCAAGAAGGCTTCCTGGCTCATCCAAGCAGAACAGAAGGCTGCATGTTTGAGAA 719
Query 888 GGGCCCCAGGCAGTTTTATGATGACACCTGTGTTGTCCCAGAAAAATTCGATGGAGACATCAAACAAGAGCCAG 961
|||.|||||||||||.|||||||||||||||||.|||||.||.||.||||||||.|||||.||.||||||||.|
Sbjct 720 GGGTCCCAGGCAGTTCTATGATGACACCTGTGTGGTCCCGGAGAAGTTCGATGGGGACATTAAGCAAGAGCCTG 793
Query 962 GAATGTATCGGGAAGGACCCACATACCAACGGCGAGGATCACTTCAGCTCTGGCAGTTTTTGGTAGCTCTTCTG 1035
|||||||.||||||||||||||.|||||..||||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 794 GAATGTACCGGGAAGGACCCACGTACCAGAGGCGAGGATCCCTCCAGCTCTGGCAGTTTTTGGTAGCTCTTCTG 867
Query 1036 GATGACCCTTCAAATTCTCATTTTATTGCCTGGACTGGTCGAGGCATGGAATTTAAACTGATTGAGCCTGAAGA 1109
|||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||
Sbjct 868 GATGACCCTTCAAATTCTCATTTCATTGCCTGGACTGGACGAGGCATGGAATTTAAACTGATTGAGCCCGAAGA 941
Query 1110 GGTGGCCCGACGTTGGGGCATTCAGAAAAACAGGCCAGCTATGAACTATGATAAACTTAGCCGTTCACTCCGCT 1183
|||||||||.|||||||||||||||||.||||||||.||.|||||||||||.||||||||.|||||.|||||||
Sbjct 942 GGTGGCCCGGCGTTGGGGCATTCAGAAGAACAGGCCGGCGATGAACTATGACAAACTTAGTCGTTCTCTCCGCT 1015
Query 1184 ATTACTATGAGAAAGGAATTATGCAAAAGGTGGCTGGAGAGAGATATGTCTACAAGTTTGTGTGTGATCCAGAA 1257
||||.||||||||.|||||.||||||||||||||||||||.|||||.||.|||||.|||||||||||.||.|||
Sbjct 1016 ATTATTATGAGAAGGGAATCATGCAAAAGGTGGCTGGAGAAAGATACGTGTACAAATTTGTGTGTGACCCGGAA 1089
Query 1258 GCCCTTTTCTCCATGGCCTTTCCAGATAATCAGCGTCCACTGCTGAAGACAGACATGGAACGTCACATCAACGA 1331
|||||||||||.|||||||||||.|||||.|||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||
Sbjct 1090 GCCCTTTTCTCTATGGCCTTTCCGGATAACCAGCGCCCACTGCTGAAGACGGACATGGAACGTCACATCAACGA 1163
Query 1332 GGAGGACACAGTGCCTCTTTCTCACTTTGATGAGAGCATGGCCTACATGCCGGAAGGGGGCTGCTGCAACCCCC 1405
.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||.||||||||||.||||||||||||||||||||.|
Sbjct 1164 AGAGGACACAGTGCCTCTGTCTCACTTTGATGAGAGCATGACCTACATGCCCGAAGGGGGCTGCTGCAACCCTC 1237
Query 1406 ACCCCTACAACGAAGGCTACGTGTAT 1431
||||||||||||||||.||||||||.
Sbjct 1238 ACCCCTACAACGAAGGATACGTGTAC 1263