Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000469733
- Subject:
- XM_006514971.3
- Aligned Length:
- 1434
- Identities:
- 1161
- Gaps:
- 180
Alignment
Query 1 ATGGATGGATTTTATGACCAGCAAGTGCCTTACATGGTCACCAATAGTCAGCGTGGGAGAAATTGTAACGAGAA 74
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 75 ACCAACAAATGTCAGGAAAAGAAAATTCATTAACAGAGATCTGGCTCATGATTCAGAAGAACTCTTTCAAGATC 148
||.| ||||||||.
Sbjct 1 --------------------------------------------------ATGC-----------TTCAAGATT 13
Query 149 TAAGTCAATTACAGGAAACATGGCTTGCAGAAGCTCAGGTACCTG---ACAATGATGAGCAGTTTGTACCAGAC 219
|||| |.||||...|.| |||.| ||| |.|| |||| || ||||.
Sbjct 14 TAAG-----TGCAGGCGTCTT--CTTCC-----CTC-----CTTGTTCACAA-------CA--------CAGAA 55
Query 220 TATCAGGCTGAAAGTTTGGCTTTTCATGGCCTGCCACTGAAAATCAAGAAAGAACCCCACAGTCCATGTTCAGA 293
.||.|| ||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||
Sbjct 56 CATTAG----------TGGCTTTTCATGGCCTCCCACTGAAAATCAAGAAAGAACCCCACAGCCCATGTTCAGA 119
Query 294 AATCAGCTCTGCCTGCAGTCAAGAACAGCCCTTTAAATTCAGCTATGGAGAAAAGTGCCTGTACAATGTCAGTG 367
|.||.|.|||||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 120 ACTCGGGTCTGCTTGCAGTCAAGAGCAGCCCTTTAAATTCAGCTATGGAGAAAAGTGCCTGTACAATGTCAGTG 193
Query 368 CCTATGATCAGAAGCCACAAGTGGGAATGAGGCCCTCCAACCCCCCCACACCATCCAGCACGCCAGTGTCCCCA 441
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||.||||||||||||
Sbjct 194 CCTATGATCAGAAGCCACAAGTGGGAATGAGGCCCTCCAATCCCCCGACACCATCCAGCACTCCAGTGTCCCCA 267
Query 442 CTGCATCATGCATCTCCAAACTCAACTCATACACCGAAACCTGACCGGGCCTTCCCAGCTCACCTCCCTCCATC 515
||.||.|||||||||||||||.||.|||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||
Sbjct 268 CTACACCATGCATCTCCAAACACAGCTCATACTCCGAAACCTGACCGGGCCTTCCCAGCTCACCTCCCTCCTTC 341
Query 516 GCAGTCCATACCAGATAGCAGCTACCCCATGGACCACAGATTTCGCCGCCAGCTTTCTGAACCCTGTAACTCCT 589
.||||||||||||||.||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|
Sbjct 342 TCAGTCCATACCAGACAGCACCTACCCCATGGACCACAGATTTCGCCGCCAGCTTTCTGAACCCTGTAATTCTT 415
Query 590 TTCCTCCTTTGCCGACGATGCCAAGGGAAGGACGTCCTATGTACCAACGCCAGATGTCTGAGCCAAACATCCCC 663
||||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 416 TTCCTCCTTTGCCGACAATGCCAAGGGAAGGGCGTCCTATGTACCAACGCCAGATGTCTGAGCCAAACATCCCC 489
Query 664 TTCCCACCACAAGGCTTTAAGCAGGAGTACCACGACCCAGTGTATGAACACAACACCATGGTTGGCAGTGCGGC 737
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|.|||||||||||||.||||.||
Sbjct 490 TTCCCACCACAAGGCTTTAAGCAGGAGTACCACGACCCAGTCTATGAACATACCACCATGGTTGGCGGTGCAGC 563
Query 738 CAGCCAAAGCTTTCCCCCTCCTCTGATGATTAAACAGGAACCCAGAGATTTTGCATATGACTCAGAAGTGCCTA 811
||||||||||||.|||||||||.|||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 564 CAGCCAAAGCTTCCCCCCTCCTTTGATGATCAAACAGGAACCCAGAGATTTTGCATATGACTCAGAAGTGCCTA 637
Query 812 GCTGCCACTCCATTTATATGAGGCAAGAAGGCTTCCTGGCTCATCCCAGCAGAACAGAAGGCTGTATGTTTGAA 885
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||.
Sbjct 638 GCTGCCACTCCATTTATATGAGGCAAGAAGGCTTCCTGGCTCATCCAAGCAGAACAGAAGGCTGCATGTTTGAG 711
Query 886 AAGGGCCCCAGGCAGTTTTATGATGACACCTGTGTTGTCCCAGAAAAATTCGATGGAGACATCAAACAAGAGCC 959
|||||.|||||||||||.|||||||||||||||||.|||||.||.||.||||||||.|||||.||.||||||||
Sbjct 712 AAGGGTCCCAGGCAGTTCTATGATGACACCTGTGTGGTCCCGGAGAAGTTCGATGGGGACATTAAGCAAGAGCC 785
Query 960 AGGAATGTATCGGGAAGGACCCACATACCAACGGCGAGGATCACTTCAGCTCTGGCAGTTTTTGGTAGCTCTTC 1033
.||||||||.||||||||||||||.|||||..||||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 786 TGGAATGTACCGGGAAGGACCCACGTACCAGAGGCGAGGATCCCTCCAGCTCTGGCAGTTTTTGGTAGCTCTTC 859
Query 1034 TGGATGACCCTTCAAATTCTCATTTTATTGCCTGGACTGGTCGAGGCATGGAATTTAAACTGATTGAGCCTGAA 1107
|||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||
Sbjct 860 TGGATGACCCTTCAAATTCTCATTTCATTGCCTGGACTGGACGAGGCATGGAATTTAAACTGATTGAGCCCGAA 933
Query 1108 GAGGTGGCCCGACGTTGGGGCATTCAGAAAAACAGGCCAGCTATGAACTATGATAAACTTAGCCGTTCACTCCG 1181
|||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||.||.|||||||||||.||||||||.|||||.|||||
Sbjct 934 GAGGTGGCCCGGCGTTGGGGCATTCAGAAGAACAGGCCGGCGATGAACTATGACAAACTTAGTCGTTCTCTCCG 1007
Query 1182 CTATTACTATGAGAAAGGAATTATGCAAAAGGTGGCTGGAGAGAGATATGTCTACAAGTTTGTGTGTGATCCAG 1255
||||||.||||||||.|||||.||||||||||||||||||||.|||||.||.|||||.|||||||||||.||.|
Sbjct 1008 CTATTATTATGAGAAGGGAATCATGCAAAAGGTGGCTGGAGAAAGATACGTGTACAAATTTGTGTGTGACCCGG 1081
Query 1256 AAGCCCTTTTCTCCATGGCCTTTCCAGATAATCAGCGTCCACTGCTGAAGACAGACATGGAACGTCACATCAAC 1329
|||||||||||||.|||||||||||.|||||.|||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||
Sbjct 1082 AAGCCCTTTTCTCTATGGCCTTTCCGGATAACCAGCGCCCACTGCTGAAGACGGACATGGAACGTCACATCAAC 1155
Query 1330 GAGGAGGACACAGTGCCTCTTTCTCACTTTGATGAGAGCATGGCCTACATGCCGGAAGGGGGCTGCTGCAACCC 1403
||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||.||||||||||.||||||||||||||||||||
Sbjct 1156 GAAGAGGACACAGTGCCTCTGTCTCACTTTGATGAGAGCATGACCTACATGCCCGAAGGGGGCTGCTGCAACCC 1229
Query 1404 CCACCCCTACAACGAAGGCTACGTGTAT 1431
.|||||||||||||||||.||||||||.
Sbjct 1230 TCACCCCTACAACGAAGGATACGTGTAC 1257